74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECH74115_1888 on replicon NC_011353
Organism: Escherichia coli O157:H7 str. EC4115



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011353  ECH74115_1888  hypothetical protein  100 
 
 		 168 aa  347  5e-95  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0168584 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2391  protein of unknown function DUF892  98.81 
 
 		 168 aa  343  5e-94  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0373261  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01231  hypothetical protein  98.81 
 
 		 168 aa  343  5e-94  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2370  hypothetical protein  98.81 
 
 		 168 aa  343  5e-94  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.454918  hitchhiker  0.000000143978 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1455  hypothetical protein  98.81 
 
 		 168 aa  343  5e-94  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000609485  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1366  hypothetical protein  98.81 
 
 		 168 aa  343  5e-94  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0778822  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01241  hypothetical protein  98.81 
 
 		 168 aa  343  5e-94  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1646  protein YciE  89.29 
 
 		 168 aa  321  3e-87  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1862  YciE  85.71 
 
 		 168 aa  306  8e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.898538 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1857  hypothetical protein  85.71 
 
 		 168 aa  306  8e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.53745 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1416  YciE  85.71 
 
 		 168 aa  306  8e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.182105  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1598  hypothetical protein  85.71 
 
 		 168 aa  306  8e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.299464 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1920  hypothetical protein  85.71 
 
 		 168 aa  306  8e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0252481  hitchhiker  0.0000515566 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3128  hypothetical protein  85.71 
 
 		 168 aa  303  5.0000000000000004e-82  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.137847 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1875  hypothetical protein  97.83 
 
 		 92 aa  187  9e-47  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000212933 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3115  hypothetical protein  51.22 
 
 		 169 aa  177  4e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11100  hypothetical protein  51.22 
 
 		 169 aa  177  4.999999999999999e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2257  hypothetical protein  53.12 
 
 		 169 aa  170  6.999999999999999e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0390342  normal  0.0993659 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4046  hypothetical protein  50.63 
 
 		 168 aa  165  2.9999999999999998e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3829  hypothetical protein  48.7 
 
 		 168 aa  161  4.0000000000000004e-39  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3123  YciE  50 
 
 		 169 aa  154  4e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.220644  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1349  hypothetical protein  50 
 
 		 290 aa  154  4e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.932547  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2998  YciE  50 
 
 		 289 aa  154  5.0000000000000005e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.272257  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3516  hypothetical protein  45.73 
 
 		 169 aa  151  4e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0330  hypothetical protein  47.37 
 
 		 169 aa  151  5e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.600353  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3795  hypothetical protein  49.06 
 
 		 167 aa  150  5.9999999999999996e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.139146  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5519  hypothetical protein  45.73 
 
 		 173 aa  148  3e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.445596 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4157  hypothetical protein  45.24 
 
 		 168 aa  146  1.0000000000000001e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1355  hypothetical protein  42.95 
 
 		 164 aa  136  2e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6476  hypothetical protein  44.91 
 
 		 169 aa  134  8e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.110313  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1353  hypothetical protein  44.91 
 
 		 169 aa  134  8e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0605  hypothetical protein  39.61 
 
 		 168 aa  120  6e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5471  hypothetical protein  39.88 
 
 		 169 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0019699 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1900  hypothetical protein  41.33 
 
 		 164 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5805  protein of unknown function DUF892  40.65 
 
 		 151 aa  99.8  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0300343  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6066  hypothetical protein  42.59 
 
 		 152 aa  98.2  5e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.184002  normal  0.0421173 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3554  protein of unknown function DUF892  33.12 
 
 		 161 aa  86.7  2e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0494833  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1759  hypothetical protein  32.74 
 
 		 169 aa  85.5  3e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2899  protein of unknown function DUF892  32.89 
 
 		 169 aa  84.7  5e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.405335  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0688  hypothetical protein  33.77 
 
 		 169 aa  84  9e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0583127  normal  0.153854 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3003  protein of unknown function DUF892  32.89 
 
 		 169 aa  84  9e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.349145  normal  0.119787 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2776  hypothetical protein  32.67 
 
 		 169 aa  84  0.000000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.27949  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1493  protein of unknown function DUF892  32.26 
 
 		 169 aa  79  0.00000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5650  hypothetical protein  31.06 
 
 		 169 aa  79  0.00000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.784305  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0139  protein of unknown function DUF892  27.81 
 
 		 170 aa  70.9  0.000000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.207704  normal  0.0800225 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3797  protein of unknown function DUF892  27.81 
 
 		 170 aa  64.3  0.0000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.728089 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3365  hypothetical protein  31.54 
 
 		 198 aa  57.8  0.00000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.430964  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4780  hypothetical protein  31.69 
 
 		 183 aa  57  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.786292 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4547  hypothetical protein  30.51 
 
 		 183 aa  53.1  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1370  protein of unknown function DUF892  28.37 
 
 		 168 aa  50.8  0.000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0289  protein of unknown function DUF892  28.79 
 
 		 162 aa  49.7  0.00002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.302406 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1727  protein of unknown function DUF892  28.99 
 
 		 184 aa  50.1  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.403983  hitchhiker  0.000459015 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3491  hypothetical protein  26.12 
 
 		 163 aa  47.8  0.00007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5592  protein of unknown function DUF892  29.94 
 
 		 166 aa  47.4  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.544575  hitchhiker  0.00495302 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3526  hypothetical protein  30.22 
 
 		 164 aa  45.8  0.0003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2984  hypothetical protein  28.67 
 
 		 164 aa  45.4  0.0003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.602458 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2664  hypothetical protein  28.67 
 
 		 165 aa  45.4  0.0004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.104786  normal  0.942807 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5614  protein of unknown function DUF892  29.1 
 
 		 168 aa  44.7  0.0007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.255585 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4845  protein of unknown function DUF892  25.95 
 
 		 167 aa  44.3  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00641789  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1599  hypothetical protein  25.62 
 
 		 167 aa  43.9  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.154464 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1861  protein YciF  25.62 
 
 		 167 aa  43.9  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.919479 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1919  hypothetical protein  25.62 
 
 		 167 aa  43.9  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.137818  hitchhiker  0.0000284113 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4247  hypothetical protein  29.41 
 
 		 158 aa  43.1  0.002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0753724 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7975  protein of unknown function DUF892  26.21 
 
 		 179 aa  43.1  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1417  protein YciF  25.62 
 
 		 167 aa  43.5  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.341518  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1856  hypothetical protein  25.62 
 
 		 167 aa  43.5  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.542717 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5574  protein of unknown function DUF892  30.52 
 
 		 183 aa  42.7  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0993  protein of unknown function DUF892  26.32 
 
 		 217 aa  42  0.004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2287  hypothetical protein  26.35 
 
 		 168 aa  41.6  0.006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0196  hypothetical protein  27.04 
 
 		 169 aa  41.2  0.006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2646  hypothetical protein  26.97 
 
 		 189 aa  41.2  0.008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0740  hypothetical protein  25.85 
 
 		 192 aa  40.8  0.008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5347  protein of unknown function DUF892  26.72 
 
 		 167 aa  40.8  0.009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4862  hypothetical protein  26.72 
 
 		 177 aa  40.8  0.009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>