45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_3797 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_3797  protein of unknown function DUF892  100 
 
 		 170 aa  335  9.999999999999999e-92  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.728089 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0139  protein of unknown function DUF892  88.24 
 
 		 170 aa  301  3.0000000000000004e-81  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.207704  normal  0.0800225 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5650  hypothetical protein  60.71 
 
 		 169 aa  201  3e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.784305  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1493  protein of unknown function DUF892  47.27 
 
 		 169 aa  150  1e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2776  hypothetical protein  47.88 
 
 		 169 aa  149  2e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.27949  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3003  protein of unknown function DUF892  47.88 
 
 		 169 aa  148  3e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.349145  normal  0.119787 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2899  protein of unknown function DUF892  47.88 
 
 		 169 aa  148  3e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.405335  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0688  hypothetical protein  47.88 
 
 		 169 aa  148  4e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0583127  normal  0.153854 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1759  hypothetical protein  46.71 
 
 		 169 aa  144  7.0000000000000006e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0605  hypothetical protein  38.75 
 
 		 168 aa  112  3e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1900  hypothetical protein  38.71 
 
 		 164 aa  105  3e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5805  protein of unknown function DUF892  36.91 
 
 		 151 aa  94  8e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0300343  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1857  hypothetical protein  32.03 
 
 		 168 aa  75.5  0.0000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.53745 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1920  hypothetical protein  32.03 
 
 		 168 aa  75.5  0.0000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0252481  hitchhiker  0.0000515566 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1862  YciE  32.03 
 
 		 168 aa  75.5  0.0000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.898538 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1416  YciE  32.03 
 
 		 168 aa  75.5  0.0000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.182105  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1598  hypothetical protein  32.03 
 
 		 168 aa  75.5  0.0000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.299464 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0330  hypothetical protein  31.82 
 
 		 169 aa  73.6  0.000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.600353  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3128  hypothetical protein  28.03 
 
 		 168 aa  68.2  0.00000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.137847 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2257  hypothetical protein  28.57 
 
 		 169 aa  65.5  0.0000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0390342  normal  0.0993659 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2391  protein of unknown function DUF892  27.81 
 
 		 168 aa  64.7  0.0000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0373261  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01241  hypothetical protein  27.81 
 
 		 168 aa  64.7  0.0000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2370  hypothetical protein  27.81 
 
 		 168 aa  64.7  0.0000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.454918  hitchhiker  0.000000143978 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1455  hypothetical protein  27.81 
 
 		 168 aa  64.7  0.0000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000609485  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1366  hypothetical protein  27.81 
 
 		 168 aa  64.7  0.0000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0778822  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01231  hypothetical protein  27.81 
 
 		 168 aa  64.7  0.0000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1888  hypothetical protein  27.81 
 
 		 168 aa  64.3  0.0000000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0168584 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1646  protein YciE  27.15 
 
 		 168 aa  64.3  0.0000000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3115  hypothetical protein  27.4 
 
 		 169 aa  61.6  0.000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3516  hypothetical protein  30.61 
 
 		 169 aa  57.8  0.00000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4046  hypothetical protein  25.17 
 
 		 168 aa  56.2  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1355  hypothetical protein  25.97 
 
 		 164 aa  51.6  0.000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3554  protein of unknown function DUF892  26.45 
 
 		 161 aa  50.4  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0494833  normal  1 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3829  hypothetical protein  27.21 
 
 		 168 aa  50.4  0.00001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4157  hypothetical protein  28.77 
 
 		 168 aa  50.8  0.00001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11100  hypothetical protein  24.49 
 
 		 169 aa  49.3  0.00002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5519  hypothetical protein  27.89 
 
 		 173 aa  48.9  0.00003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.445596 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3795  hypothetical protein  29.05 
 
 		 167 aa  48.9  0.00003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.139146  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3123  YciE  24.03 
 
 		 169 aa  45.1  0.0005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.220644  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6066  hypothetical protein  31.31 
 
 		 152 aa  45.1  0.0005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.184002  normal  0.0421173 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2998  YciE  24.03 
 
 		 289 aa  43.1  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.272257  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1353  hypothetical protein  30.85 
 
 		 169 aa  42.4  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6476  hypothetical protein  30.85 
 
 		 169 aa  42.4  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.110313  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1349  hypothetical protein  24.03 
 
 		 290 aa  42.4  0.003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.932547  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4780  hypothetical protein  26.47 
 
 		 183 aa  41.6  0.005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.786292 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>