69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECD_01231 on replicon CP001509
Organism: Escherichia coli BL21(DE3)



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001637  EcDH1_2391  protein of unknown function DUF892  100 
 
 
168 aa  348  2e-95  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0373261  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2370  hypothetical protein  100 
 
 
168 aa  348  2e-95  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.454918  hitchhiker  0.000000143978 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1455  hypothetical protein  100 
 
 
168 aa  348  2e-95  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000609485  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1366  hypothetical protein  100 
 
 
168 aa  348  2e-95  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0778822  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01231  hypothetical protein  100 
 
 
168 aa  348  2e-95  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01241  hypothetical protein  100 
 
 
168 aa  348  2e-95  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1888  hypothetical protein  98.81 
 
 
168 aa  343  5e-94  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0168584 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1646  protein YciE  88.1 
 
 
168 aa  317  6e-86  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1920  hypothetical protein  85.71 
 
 
168 aa  306  6.999999999999999e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0252481  hitchhiker  0.0000515566 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1857  hypothetical protein  85.71 
 
 
168 aa  306  6.999999999999999e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.53745 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1862  YciE  85.71 
 
 
168 aa  306  6.999999999999999e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.898538 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1416  YciE  85.71 
 
 
168 aa  306  6.999999999999999e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.182105  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1598  hypothetical protein  85.71 
 
 
168 aa  306  6.999999999999999e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.299464 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3128  hypothetical protein  85.12 
 
 
168 aa  302  2.0000000000000002e-81  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.137847 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1875  hypothetical protein  97.83 
 
 
92 aa  186  1e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000212933 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3115  hypothetical protein  50.61 
 
 
169 aa  176  2e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11100  hypothetical protein  50 
 
 
169 aa  172  1.9999999999999998e-42  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2257  hypothetical protein  52.5 
 
 
169 aa  168  3e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0390342  normal  0.0993659 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4046  hypothetical protein  50 
 
 
168 aa  161  3e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3829  hypothetical protein  48.05 
 
 
168 aa  159  2e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1349  hypothetical protein  49.39 
 
 
290 aa  152  2e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.932547  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3123  YciE  49.39 
 
 
169 aa  152  2e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.220644  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2998  YciE  49.39 
 
 
289 aa  152  2.9999999999999998e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.272257  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0330  hypothetical protein  47.37 
 
 
169 aa  150  8e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.600353  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5519  hypothetical protein  45.73 
 
 
173 aa  149  2e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.445596 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3516  hypothetical protein  45.12 
 
 
169 aa  148  4e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3795  hypothetical protein  48.43 
 
 
167 aa  146  1.0000000000000001e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.139146  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4157  hypothetical protein  44.64 
 
 
168 aa  142  2e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1355  hypothetical protein  42.95 
 
 
164 aa  135  2e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6476  hypothetical protein  44.31 
 
 
169 aa  131  3.9999999999999996e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.110313  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1353  hypothetical protein  44.31 
 
 
169 aa  131  3.9999999999999996e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0605  hypothetical protein  38.96 
 
 
168 aa  117  9.999999999999999e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5471  hypothetical protein  39.88 
 
 
169 aa  114  6.9999999999999995e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0019699 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1900  hypothetical protein  42 
 
 
164 aa  114  8.999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5805  protein of unknown function DUF892  41.29 
 
 
151 aa  102  3e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0300343  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6066  hypothetical protein  42.59 
 
 
152 aa  98.6  4e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.184002  normal  0.0421173 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3554  protein of unknown function DUF892  33.12 
 
 
161 aa  87.8  7e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0494833  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1759  hypothetical protein  32.74 
 
 
169 aa  85.9  3e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2899  protein of unknown function DUF892  32.89 
 
 
169 aa  85.5  3e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.405335  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3003  protein of unknown function DUF892  32.89 
 
 
169 aa  84.7  5e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.349145  normal  0.119787 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2776  hypothetical protein  32.67 
 
 
169 aa  84.7  5e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.27949  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0688  hypothetical protein  33.77 
 
 
169 aa  84.3  6e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0583127  normal  0.153854 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1493  protein of unknown function DUF892  32.26 
 
 
169 aa  79.7  0.00000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5650  hypothetical protein  31.71 
 
 
169 aa  77.8  0.00000000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.784305  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0139  protein of unknown function DUF892  27.81 
 
 
170 aa  71.6  0.000000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.207704  normal  0.0800225 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3797  protein of unknown function DUF892  27.81 
 
 
170 aa  64.7  0.0000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.728089 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3365  hypothetical protein  31.54 
 
 
198 aa  55.8  0.0000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.430964  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4780  hypothetical protein  32.35 
 
 
183 aa  55.8  0.0000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.786292 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1370  protein of unknown function DUF892  30.07 
 
 
168 aa  48.9  0.00003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1727  protein of unknown function DUF892  28.99 
 
 
184 aa  48.5  0.00004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.403983  hitchhiker  0.000459015 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4547  hypothetical protein  29.66 
 
 
183 aa  48.9  0.00004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0289  protein of unknown function DUF892  28.79 
 
 
162 aa  48.5  0.00004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.302406 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3491  hypothetical protein  26.12 
 
 
163 aa  46.6  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5592  protein of unknown function DUF892  29.94 
 
 
166 aa  45.8  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.544575  hitchhiker  0.00495302 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1861  protein YciF  26.25 
 
 
167 aa  44.7  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.919479 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1599  hypothetical protein  26.25 
 
 
167 aa  44.7  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.154464 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1919  hypothetical protein  26.25 
 
 
167 aa  44.7  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.137818  hitchhiker  0.0000284113 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3526  hypothetical protein  30.22 
 
 
164 aa  44.3  0.0007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2664  hypothetical protein  28.67 
 
 
165 aa  44.3  0.0008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.104786  normal  0.942807 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2984  hypothetical protein  28.67 
 
 
164 aa  44.3  0.0008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.602458 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1417  protein YciF  26.25 
 
 
167 aa  44.3  0.0009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.341518  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1856  hypothetical protein  26.25 
 
 
167 aa  44.3  0.0009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.542717 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5614  protein of unknown function DUF892  29.1 
 
 
168 aa  43.5  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.255585 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4845  protein of unknown function DUF892  25.95 
 
 
167 aa  42.7  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00641789  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4247  hypothetical protein  29.41 
 
 
158 aa  42.4  0.003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0753724 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5574  protein of unknown function DUF892  29.3 
 
 
183 aa  42  0.004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7975  protein of unknown function DUF892  26.21 
 
 
179 aa  41.6  0.005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1446  hypothetical protein  26.47 
 
 
165 aa  41.2  0.006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.187122  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2646  hypothetical protein  26.97 
 
 
189 aa  40.8  0.01  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>