83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_2899 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010725  Mpop_2899  protein of unknown function DUF892  100 
 
 
169 aa  342  1e-93  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.405335  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3003  protein of unknown function DUF892  96.45 
 
 
169 aa  335  1.9999999999999998e-91  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.349145  normal  0.119787 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2776  hypothetical protein  95.86 
 
 
169 aa  333  7.999999999999999e-91  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.27949  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1759  hypothetical protein  82.84 
 
 
169 aa  289  1e-77  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1493  protein of unknown function DUF892  71.6 
 
 
169 aa  255  2e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0688  hypothetical protein  69.82 
 
 
169 aa  249  1e-65  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0583127  normal  0.153854 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1900  hypothetical protein  46.34 
 
 
164 aa  158  4e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0139  protein of unknown function DUF892  47.88 
 
 
170 aa  153  1e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.207704  normal  0.0800225 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3797  protein of unknown function DUF892  47.88 
 
 
170 aa  148  3e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.728089 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0605  hypothetical protein  46.01 
 
 
168 aa  146  2.0000000000000003e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5650  hypothetical protein  48.21 
 
 
169 aa  140  8e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.784305  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5805  protein of unknown function DUF892  47.65 
 
 
151 aa  135  4e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0300343  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2257  hypothetical protein  36.31 
 
 
169 aa  101  4e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0390342  normal  0.0993659 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1355  hypothetical protein  35.4 
 
 
164 aa  99  3e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3115  hypothetical protein  36.31 
 
 
169 aa  98.2  4e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4046  hypothetical protein  35.71 
 
 
168 aa  91.3  7e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3128  hypothetical protein  33.55 
 
 
168 aa  87.8  7e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.137847 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1920  hypothetical protein  32.69 
 
 
168 aa  87  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0252481  hitchhiker  0.0000515566 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1862  YciE  32.69 
 
 
168 aa  87  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.898538 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1857  hypothetical protein  32.69 
 
 
168 aa  87  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.53745 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1416  YciE  32.69 
 
 
168 aa  87  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.182105  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1598  hypothetical protein  32.69 
 
 
168 aa  87  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.299464 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1646  protein YciE  33.55 
 
 
168 aa  87  1e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1366  hypothetical protein  32.89 
 
 
168 aa  85.5  3e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0778822  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1455  hypothetical protein  32.89 
 
 
168 aa  85.5  3e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000609485  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2370  hypothetical protein  32.89 
 
 
168 aa  85.5  3e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.454918  hitchhiker  0.000000143978 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01231  hypothetical protein  32.89 
 
 
168 aa  85.5  3e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2391  protein of unknown function DUF892  32.89 
 
 
168 aa  85.5  3e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0373261  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01241  hypothetical protein  32.89 
 
 
168 aa  85.5  3e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0330  hypothetical protein  32.26 
 
 
169 aa  84.7  6e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.600353  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1888  hypothetical protein  32.89 
 
 
168 aa  84.7  6e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0168584 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11100  hypothetical protein  32.06 
 
 
169 aa  82  0.000000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3516  hypothetical protein  37.4 
 
 
169 aa  81.3  0.000000000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3554  protein of unknown function DUF892  30.28 
 
 
161 aa  80.9  0.000000000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0494833  normal 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3829  hypothetical protein  30.87 
 
 
168 aa  78.6  0.00000000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3795  hypothetical protein  31.13 
 
 
167 aa  74.7  0.0000000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.139146  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5471  hypothetical protein  38.83 
 
 
169 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0019699 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5519  hypothetical protein  29.45 
 
 
173 aa  69.7  0.00000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.445596 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3123  YciE  31.3 
 
 
169 aa  68.9  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.220644  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1349  hypothetical protein  31.3 
 
 
290 aa  67.4  0.00000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.932547  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4157  hypothetical protein  30 
 
 
168 aa  66.6  0.0000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2998  YciE  31.3 
 
 
289 aa  67  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.272257  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6066  hypothetical protein  34.95 
 
 
152 aa  67  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.184002  normal  0.0421173 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6476  hypothetical protein  35.29 
 
 
169 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.110313  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1353  hypothetical protein  35.29 
 
 
169 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2857  hypothetical protein  26.39 
 
 
197 aa  53.9  0.0000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2256  hypothetical protein  29.55 
 
 
169 aa  52.4  0.000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.949168  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1875  hypothetical protein  36.25 
 
 
92 aa  51.2  0.000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000212933 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2487  protein of unknown function DUF892  27.92 
 
 
247 aa  50.1  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.48482  normal  0.272149 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4845  protein of unknown function DUF892  23.78 
 
 
167 aa  48.9  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00641789  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1599  protein of unknown function DUF892  26.8 
 
 
164 aa  48.1  0.00005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0568744  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4780  hypothetical protein  24.82 
 
 
183 aa  48.5  0.00005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.786292 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3526  hypothetical protein  27.7 
 
 
164 aa  47.8  0.00007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1370  protein of unknown function DUF892  26.35 
 
 
168 aa  46.2  0.0002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4465  protein of unknown function DUF892  23.29 
 
 
168 aa  45.8  0.0003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4275  protein of unknown function DUF892  25.68 
 
 
165 aa  45.4  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2297  hypothetical protein  29.2 
 
 
161 aa  43.5  0.001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3294  hypothetical protein  27.15 
 
 
163 aa  43.9  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.335875 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3218  hypothetical protein  26.09 
 
 
167 aa  42.7  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.708155  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4547  hypothetical protein  28.3 
 
 
183 aa  42.7  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1647  YciF protein  22.73 
 
 
166 aa  43.1  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4540  protein of unknown function DUF892  26.35 
 
 
165 aa  42.7  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.369842 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3730  protein of unknown function DUF892  25.36 
 
 
169 aa  42.4  0.003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3623  hypothetical protein  26.09 
 
 
169 aa  42.4  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0183446 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01242  hypothetical protein  22.84 
 
 
166 aa  42  0.004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01232  hypothetical protein  22.84 
 
 
166 aa  42  0.004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1033  hypothetical protein  24.66 
 
 
168 aa  42  0.004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.665565  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2390  protein of unknown function DUF892  22.84 
 
 
166 aa  42  0.004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0588252  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5546  hypothetical protein  22.6 
 
 
168 aa  42  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.376366  normal  0.380191 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1367  YciF protein  22.84 
 
 
166 aa  42  0.004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.177269  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1456  YciF protein  22.84 
 
 
166 aa  42  0.004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000775316  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2369  hypothetical protein  22.84 
 
 
166 aa  42  0.004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.820184  hitchhiker  0.000000156892 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1889  YciF protein  22.73 
 
 
173 aa  41.6  0.005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0111142 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6464  hypothetical protein  24.48 
 
 
167 aa  41.6  0.005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.255827  normal  0.636279 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1874  YciF protein  22.73 
 
 
173 aa  41.6  0.005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000112449 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3460  hypothetical protein  27.82 
 
 
319 aa  41.6  0.005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0231952  normal  0.0650388 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1599  hypothetical protein  22.73 
 
 
167 aa  41.2  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.154464 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1861  protein YciF  22.73 
 
 
167 aa  41.2  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.919479 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1919  hypothetical protein  22.73 
 
 
167 aa  41.2  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.137818  hitchhiker  0.0000284113 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0740  hypothetical protein  25.66 
 
 
192 aa  41.6  0.006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2282  protein of unknown function DUF892  27.15 
 
 
179 aa  40.8  0.008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1417  protein YciF  22.73 
 
 
167 aa  40.8  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.341518  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1856  hypothetical protein  22.73 
 
 
167 aa  40.8  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.542717 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>