51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1106A_A2998 on replicon NC_009078
Organism: Burkholderia pseudomallei 1106a



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009078  BURPS1106A_A2998  YciE  100 
 
 		 289 aa  573  1.0000000000000001e-163  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.272257  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1349  hypothetical protein  96.92 
 
 		 290 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.932547  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3123  YciE  100 
 
 		 169 aa  345  4e-94  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.220644  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2257  hypothetical protein  63.31 
 
 		 169 aa  219  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0390342  normal  0.0993659 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3115  hypothetical protein  59.17 
 
 		 169 aa  205  8e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6476  hypothetical protein  65.09 
 
 		 169 aa  199  6e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.110313  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1353  hypothetical protein  65.09 
 
 		 169 aa  199  6e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5471  hypothetical protein  60.95 
 
 		 169 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0019699 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4046  hypothetical protein  55.97 
 
 		 168 aa  189  4e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11100  hypothetical protein  52.07 
 
 		 169 aa  184  1.0000000000000001e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3829  hypothetical protein  52.17 
 
 		 168 aa  172  5e-42  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1646  protein YciE  49.39 
 
 		 168 aa  168  8e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5519  hypothetical protein  49.39 
 
 		 173 aa  168  1e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.445596 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1888  hypothetical protein  50 
 
 		 168 aa  166  4e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0168584 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3128  hypothetical protein  50.61 
 
 		 168 aa  166  5e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.137847 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2370  hypothetical protein  49.39 
 
 		 168 aa  164  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.454918  hitchhiker  0.000000143978 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2391  protein of unknown function DUF892  49.39 
 
 		 168 aa  164  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0373261  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1455  hypothetical protein  49.39 
 
 		 168 aa  164  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000609485  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1366  hypothetical protein  49.39 
 
 		 168 aa  164  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0778822  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01241  hypothetical protein  49.39 
 
 		 168 aa  164  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01231  hypothetical protein  49.39 
 
 		 168 aa  164  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1598  hypothetical protein  47.56 
 
 		 168 aa  163  3e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.299464 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1416  YciE  47.56 
 
 		 168 aa  163  3e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.182105  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1862  YciE  47.56 
 
 		 168 aa  163  3e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.898538 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1920  hypothetical protein  47.56 
 
 		 168 aa  163  3e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0252481  hitchhiker  0.0000515566 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1857  hypothetical protein  47.56 
 
 		 168 aa  163  3e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.53745 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4157  hypothetical protein  48.21 
 
 		 168 aa  162  5.0000000000000005e-39  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3516  hypothetical protein  49.11 
 
 		 169 aa  155  5.0000000000000005e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3795  hypothetical protein  46.54 
 
 		 167 aa  153  2.9999999999999998e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.139146  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0330  hypothetical protein  46.58 
 
 		 169 aa  151  1e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.600353  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1355  hypothetical protein  47.1 
 
 		 164 aa  144  2e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6066  hypothetical protein  60.91 
 
 		 152 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.184002  normal  0.0421173 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0605  hypothetical protein  34 
 
 		 168 aa  96.3  5e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1900  hypothetical protein  34.93 
 
 		 164 aa  95.1  1e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3554  protein of unknown function DUF892  37.93 
 
 		 161 aa  92.8  5e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0494833  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3124  YciE  63.64 
 
 		 68 aa  92.8  6e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0601404  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1875  hypothetical protein  47.25 
 
 		 92 aa  86.7  4e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000212933 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5805  protein of unknown function DUF892  31.21 
 
 		 151 aa  85.1  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0300343  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1759  hypothetical protein  33.82 
 
 		 169 aa  76.6  0.0000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5650  hypothetical protein  31.13 
 
 		 169 aa  72.8  0.000000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.784305  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3003  protein of unknown function DUF892  34.19 
 
 		 169 aa  71.2  0.00000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.349145  normal  0.119787 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2776  hypothetical protein  34.19 
 
 		 169 aa  71.2  0.00000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.27949  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0688  hypothetical protein  32.08 
 
 		 169 aa  70.5  0.00000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0583127  normal  0.153854 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2899  protein of unknown function DUF892  32.48 
 
 		 169 aa  68.2  0.0000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.405335  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1493  protein of unknown function DUF892  30.32 
 
 		 169 aa  66.2  0.0000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0139  protein of unknown function DUF892  27.89 
 
 		 170 aa  57.4  0.0000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.207704  normal  0.0800225 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4547  hypothetical protein  32.5 
 
 		 183 aa  50.1  0.00005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3797  protein of unknown function DUF892  24.49 
 
 		 170 aa  47  0.0003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.728089 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0036  hypothetical protein  31.72 
 
 		 175 aa  45.4  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0130409 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4780  hypothetical protein  30.46 
 
 		 183 aa  43.1  0.005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.786292 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1308  protein of unknown function DUF892  27.36 
 
 		 191 aa  43.1  0.006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.758326  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>