56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A1355 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A1355  hypothetical protein  100 
 
 		 164 aa  332  1e-90  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3829  hypothetical protein  47.1 
 
 		 168 aa  149  2e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3115  hypothetical protein  45.16 
 
 		 169 aa  144  8.000000000000001e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2257  hypothetical protein  45.16 
 
 		 169 aa  141  3e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0390342  normal  0.0993659 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4046  hypothetical protein  47.1 
 
 		 168 aa  141  5e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3123  YciE  47.1 
 
 		 169 aa  140  6e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.220644  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11100  hypothetical protein  43.4 
 
 		 169 aa  140  8e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5519  hypothetical protein  44.74 
 
 		 173 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.445596 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1349  hypothetical protein  47.1 
 
 		 290 aa  139  9.999999999999999e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.932547  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3128  hypothetical protein  44.3 
 
 		 168 aa  140  9.999999999999999e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.137847 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2998  YciE  47.1 
 
 		 289 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.272257  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2391  protein of unknown function DUF892  42.95 
 
 		 168 aa  135  2e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0373261  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2370  hypothetical protein  42.95 
 
 		 168 aa  135  2e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.454918  hitchhiker  0.000000143978 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1455  hypothetical protein  42.95 
 
 		 168 aa  135  2e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000609485  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1366  hypothetical protein  42.95 
 
 		 168 aa  135  2e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0778822  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01231  hypothetical protein  42.95 
 
 		 168 aa  135  2e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01241  hypothetical protein  42.95 
 
 		 168 aa  135  2e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1888  hypothetical protein  42.95 
 
 		 168 aa  136  2e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0168584 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1646  protein YciE  41.03 
 
 		 168 aa  135  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4157  hypothetical protein  43.04 
 
 		 168 aa  133  8e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0330  hypothetical protein  43.4 
 
 		 169 aa  133  9.999999999999999e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.600353  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1862  YciE  42.31 
 
 		 168 aa  132  3e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.898538 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1416  YciE  42.31 
 
 		 168 aa  132  3e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.182105  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1598  hypothetical protein  42.31 
 
 		 168 aa  132  3e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.299464 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1920  hypothetical protein  42.31 
 
 		 168 aa  132  3e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0252481  hitchhiker  0.0000515566 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1857  hypothetical protein  42.31 
 
 		 168 aa  132  3e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.53745 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3795  hypothetical protein  42.76 
 
 		 167 aa  128  4.0000000000000003e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.139146  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3554  protein of unknown function DUF892  39.38 
 
 		 161 aa  124  6e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0494833  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3516  hypothetical protein  38.56 
 
 		 169 aa  123  1e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1900  hypothetical protein  36.71 
 
 		 164 aa  119  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0605  hypothetical protein  39.22 
 
 		 168 aa  117  9e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1353  hypothetical protein  44.08 
 
 		 169 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6476  hypothetical protein  44.08 
 
 		 169 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.110313  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0688  hypothetical protein  34.81 
 
 		 169 aa  100  7e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0583127  normal  0.153854 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1493  protein of unknown function DUF892  35.44 
 
 		 169 aa  99.8  1e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3003  protein of unknown function DUF892  36.02 
 
 		 169 aa  99.8  1e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.349145  normal  0.119787 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2899  protein of unknown function DUF892  35.4 
 
 		 169 aa  99  3e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.405335  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2776  hypothetical protein  35.4 
 
 		 169 aa  97.1  1e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.27949  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1759  hypothetical protein  32.91 
 
 		 169 aa  95.9  2e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5471  hypothetical protein  38.71 
 
 		 169 aa  94.7  4e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0019699 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5805  protein of unknown function DUF892  33.81 
 
 		 151 aa  94.4  6e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0300343  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6066  hypothetical protein  40 
 
 		 152 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.184002  normal  0.0421173 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1875  hypothetical protein  43.04 
 
 		 92 aa  72.4  0.000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000212933 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5650  hypothetical protein  27.4 
 
 		 169 aa  58.2  0.00000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.784305  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0139  protein of unknown function DUF892  27.27 
 
 		 170 aa  56.2  0.0000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.207704  normal  0.0800225 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3797  protein of unknown function DUF892  25.97 
 
 		 170 aa  51.6  0.000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.728089 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3730  protein of unknown function DUF892  28.87 
 
 		 169 aa  48.5  0.00004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4780  hypothetical protein  30.61 
 
 		 183 aa  45.4  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.786292 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4845  protein of unknown function DUF892  28.03 
 
 		 167 aa  43.9  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00641789  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0036  hypothetical protein  30 
 
 		 175 aa  42.7  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0130409 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2256  hypothetical protein  28.87 
 
 		 169 aa  42.4  0.003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.949168  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3623  hypothetical protein  27.94 
 
 		 169 aa  42  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0183446 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1727  protein of unknown function DUF892  26.53 
 
 		 184 aa  42  0.004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.403983  hitchhiker  0.000459015 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2773  protein of unknown function DUF892  24.48 
 
 		 165 aa  41.2  0.007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1452  hypothetical protein  25.85 
 
 		 164 aa  41.2  0.007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.311216  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3460  hypothetical protein  27.44 
 
 		 319 aa  40.8  0.008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0231952  normal  0.0650388 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>