110 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_0330 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008254  Meso_0330  hypothetical protein  100 
 
 
169 aa  346  1e-94  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.600353  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4046  hypothetical protein  56.8 
 
 
168 aa  195  2.0000000000000003e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3795  hypothetical protein  55.06 
 
 
167 aa  190  1e-47  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.139146  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2257  hypothetical protein  54.17 
 
 
169 aa  187  8e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0390342  normal  0.0993659 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3829  hypothetical protein  52.23 
 
 
168 aa  177  7e-44  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11100  hypothetical protein  49.4 
 
 
169 aa  173  8e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5519  hypothetical protein  52.15 
 
 
173 aa  173  9e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.445596 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3516  hypothetical protein  53.57 
 
 
169 aa  171  3.9999999999999995e-42  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4157  hypothetical protein  50.32 
 
 
168 aa  171  5e-42  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3115  hypothetical protein  54.78 
 
 
169 aa  170  6.999999999999999e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1857  hypothetical protein  48.03 
 
 
168 aa  156  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.53745 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1920  hypothetical protein  48.03 
 
 
168 aa  156  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0252481  hitchhiker  0.0000515566 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1862  YciE  48.03 
 
 
168 aa  156  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.898538 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1416  YciE  48.03 
 
 
168 aa  156  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.182105  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1598  hypothetical protein  48.03 
 
 
168 aa  156  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.299464 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1888  hypothetical protein  47.37 
 
 
168 aa  151  5e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0168584 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01231  hypothetical protein  47.37 
 
 
168 aa  150  8e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2391  protein of unknown function DUF892  47.37 
 
 
168 aa  150  8e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0373261  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1366  hypothetical protein  47.37 
 
 
168 aa  150  8e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0778822  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1455  hypothetical protein  47.37 
 
 
168 aa  150  8e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000609485  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2370  hypothetical protein  47.37 
 
 
168 aa  150  8e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.454918  hitchhiker  0.000000143978 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01241  hypothetical protein  47.37 
 
 
168 aa  150  8e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3128  hypothetical protein  46.71 
 
 
168 aa  150  1e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.137847 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1646  protein YciE  45.39 
 
 
168 aa  149  1e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3123  YciE  45.83 
 
 
169 aa  143  1e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.220644  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2998  YciE  46.58 
 
 
289 aa  141  4e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.272257  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1349  hypothetical protein  46.58 
 
 
290 aa  141  5e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.932547  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1355  hypothetical protein  43.4 
 
 
164 aa  133  9.999999999999999e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1353  hypothetical protein  43.45 
 
 
169 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6476  hypothetical protein  43.45 
 
 
169 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.110313  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5471  hypothetical protein  42.26 
 
 
169 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0019699 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1900  hypothetical protein  39.04 
 
 
164 aa  107  6e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0605  hypothetical protein  36.54 
 
 
168 aa  106  1e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5805  protein of unknown function DUF892  39.46 
 
 
151 aa  103  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0300343  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3554  protein of unknown function DUF892  36.73 
 
 
161 aa  99.4  2e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0494833  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6066  hypothetical protein  40 
 
 
152 aa  92  4e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.184002  normal  0.0421173 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1493  protein of unknown function DUF892  34.62 
 
 
169 aa  89.7  2e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0688  hypothetical protein  35.26 
 
 
169 aa  89  3e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0583127  normal  0.153854 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1759  hypothetical protein  33.33 
 
 
169 aa  87.8  6e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2899  protein of unknown function DUF892  32.26 
 
 
169 aa  84.7  6e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.405335  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2776  hypothetical protein  31.61 
 
 
169 aa  81.3  0.000000000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.27949  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5650  hypothetical protein  31.41 
 
 
169 aa  81.3  0.000000000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.784305  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3003  protein of unknown function DUF892  31.61 
 
 
169 aa  80.9  0.000000000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.349145  normal  0.119787 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1875  hypothetical protein  47.5 
 
 
92 aa  79.7  0.00000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000212933 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0139  protein of unknown function DUF892  30.52 
 
 
170 aa  78.6  0.00000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.207704  normal  0.0800225 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3797  protein of unknown function DUF892  31.82 
 
 
170 aa  73.6  0.000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.728089 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4780  hypothetical protein  32.62 
 
 
183 aa  58.9  0.00000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.786292 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1033  hypothetical protein  30.43 
 
 
168 aa  55.5  0.0000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.665565  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4845  protein of unknown function DUF892  30.07 
 
 
167 aa  55.1  0.0000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00641789  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2297  hypothetical protein  32 
 
 
161 aa  54.3  0.0000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1446  hypothetical protein  32.82 
 
 
165 aa  53.5  0.000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.187122  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4247  hypothetical protein  36.5 
 
 
158 aa  52  0.000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0753724 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4275  protein of unknown function DUF892  30.26 
 
 
165 aa  52  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4540  protein of unknown function DUF892  31.58 
 
 
165 aa  51.2  0.000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.369842 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3460  hypothetical protein  27.32 
 
 
319 aa  50.4  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0231952  normal  0.0650388 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7975  protein of unknown function DUF892  31.21 
 
 
179 aa  50.1  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0740  hypothetical protein  30.5 
 
 
192 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1647  YciF protein  32.43 
 
 
166 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0289  protein of unknown function DUF892  30.34 
 
 
162 aa  49.7  0.00002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.302406 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1730  hypothetical protein  29.81 
 
 
165 aa  49.3  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.666521  decreased coverage  0.00187959 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2773  protein of unknown function DUF892  29.03 
 
 
165 aa  48.9  0.00003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4833  protein of unknown function DUF892  30.99 
 
 
180 aa  48.9  0.00003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3186  hypothetical protein  30.06 
 
 
174 aa  48.5  0.00004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1919  hypothetical protein  29.45 
 
 
167 aa  47.8  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.137818  hitchhiker  0.0000284113 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1861  protein YciF  29.45 
 
 
167 aa  47.8  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.919479 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1599  hypothetical protein  29.45 
 
 
167 aa  47.8  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.154464 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1370  protein of unknown function DUF892  28.08 
 
 
168 aa  47.8  0.00007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5614  protein of unknown function DUF892  30.29 
 
 
168 aa  47.4  0.00009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.255585 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01232  hypothetical protein  30.19 
 
 
166 aa  47  0.0001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2390  protein of unknown function DUF892  30.19 
 
 
166 aa  47  0.0001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0588252  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01242  hypothetical protein  30.19 
 
 
166 aa  47  0.0001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3832  hypothetical protein  25.88 
 
 
168 aa  47  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.148177  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3526  hypothetical protein  27.71 
 
 
164 aa  47.4  0.0001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1367  YciF protein  30.19 
 
 
166 aa  47  0.0001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.177269  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1456  YciF protein  30.19 
 
 
166 aa  47  0.0001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000775316  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2369  hypothetical protein  30.19 
 
 
166 aa  47  0.0001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.820184  hitchhiker  0.000000156892 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1874  YciF protein  30.19 
 
 
173 aa  47.4  0.0001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000112449 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1889  YciF protein  30.19 
 
 
173 aa  47.4  0.0001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0111142 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5592  protein of unknown function DUF892  30.86 
 
 
166 aa  47  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.544575  hitchhiker  0.00495302 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1657  hypothetical protein  26.97 
 
 
168 aa  46.2  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0448276  normal  0.877202 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2646  hypothetical protein  28.77 
 
 
189 aa  46.2  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1856  hypothetical protein  28.77 
 
 
167 aa  46.2  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.542717 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1417  protein YciF  28.77 
 
 
167 aa  46.2  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.341518  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5596  hypothetical protein  29.76 
 
 
166 aa  46.6  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.756785  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1470  hypothetical protein  27.06 
 
 
168 aa  45.8  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0321654  normal  0.306321 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3563  hypothetical protein  27.21 
 
 
166 aa  45.8  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.892765  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2220  protein of unknown function DUF892  29.08 
 
 
175 aa  45.8  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2287  hypothetical protein  28.22 
 
 
168 aa  45.4  0.0004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3127  hypothetical protein  28.67 
 
 
164 aa  44.7  0.0006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.136423 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0196  hypothetical protein  27.74 
 
 
169 aa  44.7  0.0007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2256  hypothetical protein  29.71 
 
 
169 aa  44.3  0.0008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.949168  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3365  hypothetical protein  31.65 
 
 
198 aa  44.3  0.0008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.430964  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5574  protein of unknown function DUF892  30.56 
 
 
183 aa  44.3  0.0009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1599  protein of unknown function DUF892  31.33 
 
 
164 aa  43.9  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0568744  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4862  hypothetical protein  28.1 
 
 
177 aa  43.9  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6464  hypothetical protein  27.21 
 
 
167 aa  43.9  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.255827  normal  0.636279 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2984  hypothetical protein  30.66 
 
 
164 aa  43.9  0.001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.602458 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5347  protein of unknown function DUF892  28.1 
 
 
167 aa  43.9  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3218  hypothetical protein  26.81 
 
 
167 aa  42.7  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.708155  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2664  hypothetical protein  25.61 
 
 
165 aa  42.7  0.003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.104786  normal  0.942807 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>