57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ent638_3128 on replicon NC_009436
Organism: Enterobacter sp. 638



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009436  Ent638_3128  hypothetical protein  100 
 
 
168 aa  348  3e-95  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.137847 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1598  hypothetical protein  85.71 
 
 
168 aa  309  1e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.299464 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1416  YciE  85.71 
 
 
168 aa  309  1e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.182105  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1862  YciE  85.71 
 
 
168 aa  309  1e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.898538 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1920  hypothetical protein  85.71 
 
 
168 aa  309  1e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0252481  hitchhiker  0.0000515566 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1857  hypothetical protein  85.71 
 
 
168 aa  309  1e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.53745 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1888  hypothetical protein  85.71 
 
 
168 aa  303  5.0000000000000004e-82  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0168584 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2391  protein of unknown function DUF892  85.12 
 
 
168 aa  302  2.0000000000000002e-81  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0373261  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1366  hypothetical protein  85.12 
 
 
168 aa  302  2.0000000000000002e-81  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0778822  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1455  hypothetical protein  85.12 
 
 
168 aa  302  2.0000000000000002e-81  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000609485  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2370  hypothetical protein  85.12 
 
 
168 aa  302  2.0000000000000002e-81  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.454918  hitchhiker  0.000000143978 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01231  hypothetical protein  85.12 
 
 
168 aa  302  2.0000000000000002e-81  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01241  hypothetical protein  85.12 
 
 
168 aa  302  2.0000000000000002e-81  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1646  protein YciE  79.76 
 
 
168 aa  291  2e-78  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3115  hypothetical protein  52.44 
 
 
169 aa  184  6e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2257  hypothetical protein  55 
 
 
169 aa  177  8e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0390342  normal  0.0993659 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11100  hypothetical protein  50.61 
 
 
169 aa  172  9.999999999999999e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3829  hypothetical protein  48.7 
 
 
168 aa  165  2.9999999999999998e-40  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1875  hypothetical protein  83.7 
 
 
92 aa  163  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000212933 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4046  hypothetical protein  50.31 
 
 
168 aa  159  1e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3123  YciE  50.61 
 
 
169 aa  155  3e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.220644  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1349  hypothetical protein  50.61 
 
 
290 aa  154  5.0000000000000005e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.932547  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2998  YciE  50.61 
 
 
289 aa  154  6e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.272257  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5519  hypothetical protein  46.95 
 
 
173 aa  152  2e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.445596 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3795  hypothetical protein  49.35 
 
 
167 aa  152  2e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.139146  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0330  hypothetical protein  46.71 
 
 
169 aa  150  1e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.600353  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4157  hypothetical protein  46.84 
 
 
168 aa  148  3e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3516  hypothetical protein  43.9 
 
 
169 aa  142  2e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1355  hypothetical protein  44.3 
 
 
164 aa  140  9.999999999999999e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1353  hypothetical protein  43.71 
 
 
169 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6476  hypothetical protein  43.71 
 
 
169 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.110313  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0605  hypothetical protein  40 
 
 
168 aa  118  3.9999999999999996e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1900  hypothetical protein  40.67 
 
 
164 aa  110  7.000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5805  protein of unknown function DUF892  41.29 
 
 
151 aa  107  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0300343  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5471  hypothetical protein  38.65 
 
 
169 aa  105  4e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0019699 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6066  hypothetical protein  41.67 
 
 
152 aa  97.1  1e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.184002  normal  0.0421173 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1759  hypothetical protein  35.26 
 
 
169 aa  90.5  1e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3003  protein of unknown function DUF892  34.21 
 
 
169 aa  89  3e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.349145  normal  0.119787 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2776  hypothetical protein  34.21 
 
 
169 aa  88.6  4e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.27949  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2899  protein of unknown function DUF892  33.55 
 
 
169 aa  87.8  7e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.405335  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0688  hypothetical protein  33.77 
 
 
169 aa  84.7  6e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0583127  normal  0.153854 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3554  protein of unknown function DUF892  32.89 
 
 
161 aa  84  9e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0494833  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1493  protein of unknown function DUF892  31.82 
 
 
169 aa  81.3  0.000000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5650  hypothetical protein  28.85 
 
 
169 aa  73.6  0.000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.784305  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0139  protein of unknown function DUF892  28.48 
 
 
170 aa  71.2  0.000000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.207704  normal  0.0800225 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3797  protein of unknown function DUF892  28.03 
 
 
170 aa  68.2  0.00000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.728089 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4780  hypothetical protein  28.87 
 
 
183 aa  51.6  0.000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.786292 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3365  hypothetical protein  28.86 
 
 
198 aa  49.7  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.430964  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4547  hypothetical protein  28.46 
 
 
183 aa  48.1  0.00006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5592  protein of unknown function DUF892  29.49 
 
 
166 aa  47  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.544575  hitchhiker  0.00495302 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5614  protein of unknown function DUF892  28.67 
 
 
168 aa  45.8  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.255585 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1033  hypothetical protein  25 
 
 
168 aa  42.4  0.003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.665565  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4845  protein of unknown function DUF892  25 
 
 
167 aa  42.4  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00641789  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2664  hypothetical protein  27.27 
 
 
165 aa  42.4  0.003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.104786  normal  0.942807 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1727  protein of unknown function DUF892  26.62 
 
 
184 aa  42.4  0.003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.403983  hitchhiker  0.000459015 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1370  protein of unknown function DUF892  28.68 
 
 
168 aa  42  0.004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5574  protein of unknown function DUF892  30.26 
 
 
183 aa  40.8  0.009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>