85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECH74115_1646 on replicon NC_011353
Organism: Escherichia coli O157:H7 str. EC4115



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011353  ECH74115_1646  protein YciE  100 
 
 
168 aa  348  3e-95  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1888  hypothetical protein  89.29 
 
 
168 aa  321  3e-87  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0168584 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2391  protein of unknown function DUF892  88.1 
 
 
168 aa  317  6e-86  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0373261  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2370  hypothetical protein  88.1 
 
 
168 aa  317  6e-86  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.454918  hitchhiker  0.000000143978 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1455  hypothetical protein  88.1 
 
 
168 aa  317  6e-86  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000609485  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1366  hypothetical protein  88.1 
 
 
168 aa  317  6e-86  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0778822  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01231  hypothetical protein  88.1 
 
 
168 aa  317  6e-86  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01241  hypothetical protein  88.1 
 
 
168 aa  317  6e-86  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1857  hypothetical protein  82.74 
 
 
168 aa  299  1e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.53745 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1920  hypothetical protein  82.74 
 
 
168 aa  299  1e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0252481  hitchhiker  0.0000515566 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1862  YciE  82.74 
 
 
168 aa  299  1e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.898538 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1416  YciE  82.74 
 
 
168 aa  299  1e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.182105  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1598  hypothetical protein  82.74 
 
 
168 aa  299  1e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.299464 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3128  hypothetical protein  79.76 
 
 
168 aa  291  2e-78  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.137847 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11100  hypothetical protein  53.05 
 
 
169 aa  183  1.0000000000000001e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3115  hypothetical protein  51.22 
 
 
169 aa  180  8.000000000000001e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2257  hypothetical protein  53.75 
 
 
169 aa  176  1e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0390342  normal  0.0993659 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1875  hypothetical protein  86.96 
 
 
92 aa  172  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000212933 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3829  hypothetical protein  49.35 
 
 
168 aa  164  6.9999999999999995e-40  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4046  hypothetical protein  50.31 
 
 
168 aa  163  1.0000000000000001e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3123  YciE  49.39 
 
 
169 aa  155  3e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.220644  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1349  hypothetical protein  49.39 
 
 
290 aa  155  3e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.932547  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3516  hypothetical protein  45.73 
 
 
169 aa  154  4e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2998  YciE  49.39 
 
 
289 aa  154  5.0000000000000005e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.272257  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5519  hypothetical protein  46.95 
 
 
173 aa  153  1e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.445596 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4157  hypothetical protein  44.64 
 
 
168 aa  151  4e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3795  hypothetical protein  47.17 
 
 
167 aa  150  8e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.139146  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0330  hypothetical protein  45.39 
 
 
169 aa  149  1e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.600353  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1353  hypothetical protein  44.31 
 
 
169 aa  138  3e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6476  hypothetical protein  44.31 
 
 
169 aa  138  3e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.110313  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1355  hypothetical protein  41.03 
 
 
164 aa  135  4e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5471  hypothetical protein  40.49 
 
 
169 aa  122  3e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0019699 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0605  hypothetical protein  37.66 
 
 
168 aa  114  3.9999999999999997e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1900  hypothetical protein  38.67 
 
 
164 aa  107  5e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6066  hypothetical protein  41.67 
 
 
152 aa  101  5e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.184002  normal  0.0421173 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5805  protein of unknown function DUF892  40.65 
 
 
151 aa  99.8  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0300343  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1759  hypothetical protein  34.62 
 
 
169 aa  89.7  2e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3554  protein of unknown function DUF892  32.5 
 
 
161 aa  88.6  3e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0494833  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0688  hypothetical protein  33.77 
 
 
169 aa  88.2  4e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0583127  normal  0.153854 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3003  protein of unknown function DUF892  33.55 
 
 
169 aa  86.7  1e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.349145  normal  0.119787 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2899  protein of unknown function DUF892  33.55 
 
 
169 aa  87  1e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.405335  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2776  hypothetical protein  33.33 
 
 
169 aa  86.3  2e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.27949  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1493  protein of unknown function DUF892  31.61 
 
 
169 aa  81.6  0.000000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5650  hypothetical protein  29.22 
 
 
169 aa  78.2  0.00000000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.784305  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0139  protein of unknown function DUF892  27.81 
 
 
170 aa  74.3  0.0000000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.207704  normal  0.0800225 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3797  protein of unknown function DUF892  27.15 
 
 
170 aa  64.3  0.0000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.728089 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4780  hypothetical protein  31.69 
 
 
183 aa  59.3  0.00000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.786292 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3365  hypothetical protein  30.87 
 
 
198 aa  57.8  0.00000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.430964  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4547  hypothetical protein  30.51 
 
 
183 aa  53.5  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0289  protein of unknown function DUF892  29.55 
 
 
162 aa  53.1  0.000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.302406 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1370  protein of unknown function DUF892  26.53 
 
 
168 aa  51.6  0.000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1727  protein of unknown function DUF892  27.86 
 
 
184 aa  50.8  0.000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.403983  hitchhiker  0.000459015 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2984  hypothetical protein  29.08 
 
 
164 aa  49.7  0.00002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.602458 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3491  hypothetical protein  26.87 
 
 
163 aa  50.1  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5592  protein of unknown function DUF892  30.38 
 
 
166 aa  48.5  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.544575  hitchhiker  0.00495302 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3526  hypothetical protein  29.93 
 
 
164 aa  47.4  0.0001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5574  protein of unknown function DUF892  31.17 
 
 
183 aa  47  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7975  protein of unknown function DUF892  27.45 
 
 
179 aa  47.4  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5614  protein of unknown function DUF892  29.1 
 
 
168 aa  46.2  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.255585 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4845  protein of unknown function DUF892  25.19 
 
 
167 aa  46.2  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00641789  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0993  protein of unknown function DUF892  27.63 
 
 
217 aa  44.7  0.0006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0740  hypothetical protein  26.53 
 
 
192 aa  44.7  0.0007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4247  hypothetical protein  27.94 
 
 
158 aa  44.3  0.0008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0753724 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2664  hypothetical protein  27.08 
 
 
165 aa  43.9  0.001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.104786  normal  0.942807 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2220  protein of unknown function DUF892  25.5 
 
 
175 aa  43.5  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5347  protein of unknown function DUF892  25.95 
 
 
167 aa  43.5  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4862  hypothetical protein  25.95 
 
 
177 aa  43.5  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1308  protein of unknown function DUF892  27.14 
 
 
191 aa  42.7  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.758326  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2646  hypothetical protein  28.29 
 
 
189 aa  42.7  0.003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1919  hypothetical protein  26.95 
 
 
167 aa  42  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.137818  hitchhiker  0.0000284113 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1599  hypothetical protein  26.95 
 
 
167 aa  42  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.154464 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1657  hypothetical protein  25.71 
 
 
168 aa  42  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0448276  normal  0.877202 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1730  hypothetical protein  26.47 
 
 
165 aa  42  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.666521  decreased coverage  0.00187959 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1861  protein YciF  26.95 
 
 
167 aa  42  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.919479 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5596  hypothetical protein  29.41 
 
 
166 aa  42  0.005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.756785  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3218  hypothetical protein  24.43 
 
 
167 aa  41.6  0.005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.708155  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3832  hypothetical protein  25 
 
 
168 aa  41.2  0.006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.148177  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4540  protein of unknown function DUF892  24.63 
 
 
165 aa  41.2  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.369842 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4465  protein of unknown function DUF892  23.66 
 
 
168 aa  41.2  0.006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1856  hypothetical protein  26.95 
 
 
167 aa  41.6  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.542717 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1417  protein YciF  26.95 
 
 
167 aa  41.6  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.341518  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2659  hypothetical protein  31.45 
 
 
217 aa  41.2  0.006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5401  protein of unknown function DUF892  25.95 
 
 
167 aa  41.2  0.007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.949113 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1033  hypothetical protein  25.36 
 
 
168 aa  41.2  0.007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.665565  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2287  hypothetical protein  26.45 
 
 
168 aa  40.8  0.008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>