50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_0139 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_0139  protein of unknown function DUF892  100 
 
 		 170 aa  334  2.9999999999999997e-91  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.207704  normal  0.0800225 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3797  protein of unknown function DUF892  88.24 
 
 		 170 aa  301  3.0000000000000004e-81  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.728089 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5650  hypothetical protein  64.29 
 
 		 169 aa  214  4e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.784305  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1493  protein of unknown function DUF892  47.88 
 
 		 169 aa  154  5.0000000000000005e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0688  hypothetical protein  48.48 
 
 		 169 aa  154  8e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0583127  normal  0.153854 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2899  protein of unknown function DUF892  47.88 
 
 		 169 aa  153  1e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.405335  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2776  hypothetical protein  47.27 
 
 		 169 aa  152  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.27949  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3003  protein of unknown function DUF892  47.27 
 
 		 169 aa  151  4e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.349145  normal  0.119787 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1759  hypothetical protein  47.31 
 
 		 169 aa  150  8.999999999999999e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0605  hypothetical protein  39.38 
 
 		 168 aa  117  7.999999999999999e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1900  hypothetical protein  40 
 
 		 164 aa  114  5e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5805  protein of unknown function DUF892  35.62 
 
 		 151 aa  100  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0300343  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1920  hypothetical protein  30.46 
 
 		 168 aa  79.3  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0252481  hitchhiker  0.0000515566 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1857  hypothetical protein  30.46 
 
 		 168 aa  79.3  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.53745 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1862  YciE  30.46 
 
 		 168 aa  79.3  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.898538 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1416  YciE  30.46 
 
 		 168 aa  79.3  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.182105  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1598  hypothetical protein  30.46 
 
 		 168 aa  79.3  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.299464 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0330  hypothetical protein  30.52 
 
 		 169 aa  78.6  0.00000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.600353  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1646  protein YciE  27.81 
 
 		 168 aa  74.3  0.0000000000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2391  protein of unknown function DUF892  27.81 
 
 		 168 aa  71.6  0.000000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0373261  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2370  hypothetical protein  27.81 
 
 		 168 aa  71.6  0.000000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.454918  hitchhiker  0.000000143978 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01241  hypothetical protein  27.81 
 
 		 168 aa  71.6  0.000000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1455  hypothetical protein  27.81 
 
 		 168 aa  71.6  0.000000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000609485  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1366  hypothetical protein  27.81 
 
 		 168 aa  71.6  0.000000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0778822  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01231  hypothetical protein  27.81 
 
 		 168 aa  71.6  0.000000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1888  hypothetical protein  27.81 
 
 		 168 aa  70.9  0.000000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0168584 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3128  hypothetical protein  28.48 
 
 		 168 aa  71.2  0.000000000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.137847 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2257  hypothetical protein  27.89 
 
 		 169 aa  70.9  0.000000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0390342  normal  0.0993659 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3115  hypothetical protein  28.08 
 
 		 169 aa  70.1  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3516  hypothetical protein  30.61 
 
 		 169 aa  63.9  0.000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4046  hypothetical protein  24.49 
 
 		 168 aa  60.8  0.000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4157  hypothetical protein  30.14 
 
 		 168 aa  58.2  0.00000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5519  hypothetical protein  28.57 
 
 		 173 aa  57.8  0.00000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.445596 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1355  hypothetical protein  27.27 
 
 		 164 aa  56.2  0.0000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3829  hypothetical protein  27.21 
 
 		 168 aa  56.6  0.0000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3795  hypothetical protein  30.41 
 
 		 167 aa  56.2  0.0000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.139146  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3123  YciE  27.89 
 
 		 169 aa  54.3  0.0000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.220644  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11100  hypothetical protein  26.72 
 
 		 169 aa  53.9  0.000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3554  protein of unknown function DUF892  27.88 
 
 		 161 aa  53.1  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0494833  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2998  YciE  27.89 
 
 		 289 aa  53.1  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.272257  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6066  hypothetical protein  33.33 
 
 		 152 aa  52.4  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.184002  normal  0.0421173 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1349  hypothetical protein  27.89 
 
 		 290 aa  52.4  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.932547  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1353  hypothetical protein  32.98 
 
 		 169 aa  48.5  0.00004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6476  hypothetical protein  32.98 
 
 		 169 aa  48.5  0.00004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.110313  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4780  hypothetical protein  28.47 
 
 		 183 aa  45.8  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.786292 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2282  protein of unknown function DUF892  27.33 
 
 		 179 aa  42  0.004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5471  hypothetical protein  29.03 
 
 		 169 aa  41.2  0.007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0019699 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1599  hypothetical protein  29.6 
 
 		 167 aa  40.8  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.154464 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1861  protein YciF  29.6 
 
 		 167 aa  40.8  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.919479 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1919  hypothetical protein  29.6 
 
 		 167 aa  40.8  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.137818  hitchhiker  0.0000284113 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>