56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_3829 on replicon NC_010580
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010580  Bind_3829  hypothetical protein  100 
 
 		 168 aa  345  2e-94  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4046  hypothetical protein  58.93 
 
 		 168 aa  207  6e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11100  hypothetical protein  59.12 
 
 		 169 aa  196  1.0000000000000001e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4157  hypothetical protein  56.6 
 
 		 168 aa  195  3e-49  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5519  hypothetical protein  58.97 
 
 		 173 aa  193  9e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.445596 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3795  hypothetical protein  56.6 
 
 		 167 aa  193  1e-48  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.139146  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2257  hypothetical protein  55.9 
 
 		 169 aa  190  7e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0390342  normal  0.0993659 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3115  hypothetical protein  55 
 
 		 169 aa  184  4e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0330  hypothetical protein  52.23 
 
 		 169 aa  177  7e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.600353  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3516  hypothetical protein  53.42 
 
 		 169 aa  172  1.9999999999999998e-42  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1857  hypothetical protein  50.65 
 
 		 168 aa  170  9e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.53745 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1920  hypothetical protein  50.65 
 
 		 168 aa  170  9e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0252481  hitchhiker  0.0000515566 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1862  YciE  50.65 
 
 		 168 aa  170  9e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.898538 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1416  YciE  50.65 
 
 		 168 aa  170  9e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.182105  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1598  hypothetical protein  50.65 
 
 		 168 aa  170  9e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.299464 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3123  YciE  52.17 
 
 		 169 aa  167  5e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.220644  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3128  hypothetical protein  48.7 
 
 		 168 aa  165  2.9999999999999998e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.137847 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2998  YciE  52.17 
 
 		 289 aa  164  4e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.272257  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1349  hypothetical protein  52.17 
 
 		 290 aa  164  4e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.932547  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1646  protein YciE  49.35 
 
 		 168 aa  164  6.9999999999999995e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1888  hypothetical protein  48.7 
 
 		 168 aa  161  4.0000000000000004e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0168584 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2391  protein of unknown function DUF892  48.05 
 
 		 168 aa  159  2e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0373261  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2370  hypothetical protein  48.05 
 
 		 168 aa  159  2e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.454918  hitchhiker  0.000000143978 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1366  hypothetical protein  48.05 
 
 		 168 aa  159  2e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0778822  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01231  hypothetical protein  48.05 
 
 		 168 aa  159  2e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1455  hypothetical protein  48.05 
 
 		 168 aa  159  2e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000609485  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01241  hypothetical protein  48.05 
 
 		 168 aa  159  2e-38  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1355  hypothetical protein  47.1 
 
 		 164 aa  149  2e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6476  hypothetical protein  50 
 
 		 169 aa  142  3e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.110313  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1353  hypothetical protein  50 
 
 		 169 aa  142  3e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5471  hypothetical protein  47.53 
 
 		 169 aa  129  3e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0019699 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3554  protein of unknown function DUF892  40.54 
 
 		 161 aa  116  9.999999999999999e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0494833  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0605  hypothetical protein  34.42 
 
 		 168 aa  105  3e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6066  hypothetical protein  45.45 
 
 		 152 aa  104  6e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.184002  normal  0.0421173 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1900  hypothetical protein  34.19 
 
 		 164 aa  103  1e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5805  protein of unknown function DUF892  37.41 
 
 		 151 aa  102  3e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0300343  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1759  hypothetical protein  33.12 
 
 		 169 aa  85.9  2e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1875  hypothetical protein  46.25 
 
 		 92 aa  82  0.000000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000212933 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2899  protein of unknown function DUF892  30.87 
 
 		 169 aa  78.6  0.00000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.405335  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3003  protein of unknown function DUF892  30.87 
 
 		 169 aa  76.6  0.0000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.349145  normal  0.119787 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2776  hypothetical protein  30.2 
 
 		 169 aa  74.3  0.0000000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.27949  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1493  protein of unknown function DUF892  29.53 
 
 		 169 aa  67  0.0000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0688  hypothetical protein  28.86 
 
 		 169 aa  62.8  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0583127  normal  0.153854 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5650  hypothetical protein  26.35 
 
 		 169 aa  58.9  0.00000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.784305  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0139  protein of unknown function DUF892  27.21 
 
 		 170 aa  56.6  0.0000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.207704  normal  0.0800225 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3797  protein of unknown function DUF892  27.21 
 
 		 170 aa  50.4  0.00001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.728089 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4780  hypothetical protein  35.34 
 
 		 183 aa  48.5  0.00004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.786292 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4547  hypothetical protein  30.51 
 
 		 183 aa  46.2  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3460  hypothetical protein  28.31 
 
 		 319 aa  45.1  0.0005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0231952  normal  0.0650388 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0740  hypothetical protein  27.7 
 
 		 192 aa  42.7  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4845  protein of unknown function DUF892  26.81 
 
 		 167 aa  42  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00641789  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1370  protein of unknown function DUF892  27.74 
 
 		 168 aa  41.2  0.008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3730  protein of unknown function DUF892  29.84 
 
 		 169 aa  40.8  0.008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1599  hypothetical protein  30.6 
 
 		 167 aa  40.4  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.154464 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1861  protein YciF  30.6 
 
 		 167 aa  40.4  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.919479 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1919  hypothetical protein  30.6 
 
 		 167 aa  40.4  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.137818  hitchhiker  0.0000284113 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>