74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_1759 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_1759  hypothetical protein  100 
 
 
169 aa  345  1e-94  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2899  protein of unknown function DUF892  82.84 
 
 
169 aa  289  1e-77  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.405335  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3003  protein of unknown function DUF892  83.43 
 
 
169 aa  289  1e-77  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.349145  normal  0.119787 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2776  hypothetical protein  82.84 
 
 
169 aa  286  8e-77  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.27949  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1493  protein of unknown function DUF892  72.19 
 
 
169 aa  254  3e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0688  hypothetical protein  71.6 
 
 
169 aa  253  1.0000000000000001e-66  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0583127  normal  0.153854 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1900  hypothetical protein  50 
 
 
164 aa  162  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0605  hypothetical protein  48.5 
 
 
168 aa  154  8e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0139  protein of unknown function DUF892  47.31 
 
 
170 aa  150  8.999999999999999e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.207704  normal  0.0800225 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3797  protein of unknown function DUF892  46.71 
 
 
170 aa  144  7.0000000000000006e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.728089 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5650  hypothetical protein  47.02 
 
 
169 aa  139  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.784305  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5805  protein of unknown function DUF892  49.66 
 
 
151 aa  137  7.999999999999999e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0300343  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2257  hypothetical protein  40.67 
 
 
169 aa  108  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0390342  normal  0.0993659 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3115  hypothetical protein  39.07 
 
 
169 aa  99.8  1e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1355  hypothetical protein  32.91 
 
 
164 aa  95.9  2e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1857  hypothetical protein  37.18 
 
 
168 aa  95.1  5e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.53745 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1920  hypothetical protein  37.18 
 
 
168 aa  95.1  5e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0252481  hitchhiker  0.0000515566 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1862  YciE  37.18 
 
 
168 aa  95.1  5e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.898538 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1416  YciE  37.18 
 
 
168 aa  95.1  5e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.182105  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1598  hypothetical protein  37.18 
 
 
168 aa  95.1  5e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.299464 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3128  hypothetical protein  35.26 
 
 
168 aa  90.5  1e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.137847 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1646  protein YciE  34.62 
 
 
168 aa  89.7  2e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11100  hypothetical protein  31.97 
 
 
169 aa  89  3e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4046  hypothetical protein  34.18 
 
 
168 aa  89  3e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3516  hypothetical protein  36.73 
 
 
169 aa  88.2  5e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0330  hypothetical protein  33.33 
 
 
169 aa  87.8  6e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.600353  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3829  hypothetical protein  33.12 
 
 
168 aa  85.9  2e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2370  hypothetical protein  32.74 
 
 
168 aa  85.9  3e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.454918  hitchhiker  0.000000143978 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1455  hypothetical protein  32.74 
 
 
168 aa  85.9  3e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000609485  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1366  hypothetical protein  32.74 
 
 
168 aa  85.9  3e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0778822  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1888  hypothetical protein  32.74 
 
 
168 aa  85.5  3e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0168584 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2391  protein of unknown function DUF892  32.74 
 
 
168 aa  85.9  3e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0373261  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01241  hypothetical protein  32.74 
 
 
168 aa  85.9  3e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01231  hypothetical protein  32.74 
 
 
168 aa  85.9  3e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3554  protein of unknown function DUF892  31.21 
 
 
161 aa  80.9  0.000000000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0494833  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5519  hypothetical protein  35.11 
 
 
173 aa  79  0.00000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.445596 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3123  YciE  34.09 
 
 
169 aa  76.6  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.220644  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1349  hypothetical protein  34.09 
 
 
290 aa  75.5  0.0000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.932547  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2998  YciE  34.09 
 
 
289 aa  75.1  0.0000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.272257  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3795  hypothetical protein  31.79 
 
 
167 aa  73.9  0.000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.139146  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4157  hypothetical protein  33.57 
 
 
168 aa  72.4  0.000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1353  hypothetical protein  35.56 
 
 
169 aa  65.5  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6476  hypothetical protein  35.56 
 
 
169 aa  65.5  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.110313  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5471  hypothetical protein  34.21 
 
 
169 aa  65.5  0.0000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0019699 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6066  hypothetical protein  33.98 
 
 
152 aa  64.3  0.0000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.184002  normal  0.0421173 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2857  hypothetical protein  29.03 
 
 
197 aa  59.3  0.00000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1875  hypothetical protein  38.75 
 
 
92 aa  53.1  0.000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000212933 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3526  hypothetical protein  28.57 
 
 
164 aa  50.8  0.000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1599  protein of unknown function DUF892  30 
 
 
164 aa  49.7  0.00002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0568744  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2256  hypothetical protein  28.67 
 
 
169 aa  49.7  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.949168  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0993  protein of unknown function DUF892  26.95 
 
 
217 aa  47.8  0.00007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4780  hypothetical protein  24.16 
 
 
183 aa  47  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.786292 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0740  hypothetical protein  29.86 
 
 
192 aa  46.6  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4275  protein of unknown function DUF892  25.68 
 
 
165 aa  45.1  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1874  YciF protein  25.5 
 
 
173 aa  43.5  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000112449 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1889  YciF protein  25.5 
 
 
173 aa  43.5  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0111142 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4845  protein of unknown function DUF892  24.48 
 
 
167 aa  43.5  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00641789  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01242  hypothetical protein  25.5 
 
 
166 aa  43.1  0.002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3586  protein of unknown function DUF892  28.95 
 
 
154 aa  43.1  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2390  protein of unknown function DUF892  25.5 
 
 
166 aa  43.1  0.002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0588252  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4540  protein of unknown function DUF892  26.35 
 
 
165 aa  42.7  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.369842 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01232  hypothetical protein  25.5 
 
 
166 aa  43.1  0.002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2220  protein of unknown function DUF892  26.95 
 
 
175 aa  43.5  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1647  YciF protein  23.97 
 
 
166 aa  43.5  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2297  hypothetical protein  26.98 
 
 
161 aa  42.7  0.002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1367  YciF protein  25.5 
 
 
166 aa  43.1  0.002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.177269  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1456  YciF protein  25.5 
 
 
166 aa  43.1  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000775316  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2369  hypothetical protein  25.5 
 
 
166 aa  43.1  0.002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.820184  hitchhiker  0.000000156892 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3186  hypothetical protein  25.79 
 
 
174 aa  42.4  0.003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4465  protein of unknown function DUF892  23.78 
 
 
168 aa  42.4  0.003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3344  protein of unknown function DUF892  27.97 
 
 
212 aa  42.4  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0480671 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7975  protein of unknown function DUF892  26.24 
 
 
179 aa  42  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2487  protein of unknown function DUF892  28.86 
 
 
247 aa  42  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.48482  normal  0.272149 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3218  hypothetical protein  26.09 
 
 
167 aa  40.8  0.009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.708155  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>