50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_3516 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008254  Meso_3516  hypothetical protein  100 
 
 		 169 aa  346  1e-94  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11100  hypothetical protein  54.44 
 
 		 169 aa  186  9e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2257  hypothetical protein  51.48 
 
 		 169 aa  172  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0390342  normal  0.0993659 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3829  hypothetical protein  53.42 
 
 		 168 aa  172  1.9999999999999998e-42  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0330  hypothetical protein  53.57 
 
 		 169 aa  171  3.9999999999999995e-42  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.600353  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4046  hypothetical protein  55.35 
 
 		 168 aa  169  2e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3115  hypothetical protein  50.3 
 
 		 169 aa  166  2e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5519  hypothetical protein  49.4 
 
 		 173 aa  166  2e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.445596 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1646  protein YciE  45.73 
 
 		 168 aa  154  4e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3795  hypothetical protein  48.43 
 
 		 167 aa  154  6e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.139146  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3123  YciE  49.11 
 
 		 169 aa  152  2.9999999999999998e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.220644  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1888  hypothetical protein  45.73 
 
 		 168 aa  151  4e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0168584 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4157  hypothetical protein  45.73 
 
 		 168 aa  148  3e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2998  YciE  49.11 
 
 		 289 aa  148  3e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.272257  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1349  hypothetical protein  49.11 
 
 		 290 aa  149  3e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.932547  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2370  hypothetical protein  45.12 
 
 		 168 aa  148  4e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.454918  hitchhiker  0.000000143978 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01241  hypothetical protein  45.12 
 
 		 168 aa  148  4e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1455  hypothetical protein  45.12 
 
 		 168 aa  148  4e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000609485  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2391  protein of unknown function DUF892  45.12 
 
 		 168 aa  148  4e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0373261  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1366  hypothetical protein  45.12 
 
 		 168 aa  148  4e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0778822  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01231  hypothetical protein  45.12 
 
 		 168 aa  148  4e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1920  hypothetical protein  45.12 
 
 		 168 aa  147  6e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0252481  hitchhiker  0.0000515566 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1857  hypothetical protein  45.12 
 
 		 168 aa  147  6e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.53745 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1862  YciE  45.12 
 
 		 168 aa  147  6e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.898538 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1416  YciE  45.12 
 
 		 168 aa  147  6e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.182105  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1598  hypothetical protein  45.12 
 
 		 168 aa  147  6e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.299464 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3128  hypothetical protein  43.9 
 
 		 168 aa  142  2e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.137847 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1353  hypothetical protein  49.11 
 
 		 169 aa  134  5e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6476  hypothetical protein  49.11 
 
 		 169 aa  134  5e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.110313  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1355  hypothetical protein  38.56 
 
 		 164 aa  123  1e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5471  hypothetical protein  43.2 
 
 		 169 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0019699 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6066  hypothetical protein  48.18 
 
 		 152 aa  106  1e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.184002  normal  0.0421173 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1900  hypothetical protein  34.93 
 
 		 164 aa  101  4e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0605  hypothetical protein  35.62 
 
 		 168 aa  98.2  4e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5805  protein of unknown function DUF892  39.13 
 
 		 151 aa  98.2  5e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0300343  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1759  hypothetical protein  36.73 
 
 		 169 aa  88.2  5e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3554  protein of unknown function DUF892  37.86 
 
 		 161 aa  84.7  6e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0494833  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0688  hypothetical protein  36 
 
 		 169 aa  84.3  8e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0583127  normal  0.153854 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3003  protein of unknown function DUF892  37.4 
 
 		 169 aa  81.6  0.000000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.349145  normal  0.119787 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2776  hypothetical protein  37.4 
 
 		 169 aa  81.6  0.000000000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.27949  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2899  protein of unknown function DUF892  37.4 
 
 		 169 aa  81.3  0.000000000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.405335  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1493  protein of unknown function DUF892  34.67 
 
 		 169 aa  80.1  0.00000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1875  hypothetical protein  41.11 
 
 		 92 aa  77.4  0.00000000000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000212933 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5650  hypothetical protein  32.3 
 
 		 169 aa  73.2  0.000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.784305  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0139  protein of unknown function DUF892  30.61 
 
 		 170 aa  63.9  0.000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.207704  normal  0.0800225 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3797  protein of unknown function DUF892  30.61 
 
 		 170 aa  57.8  0.00000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.728089 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4845  protein of unknown function DUF892  28.57 
 
 		 167 aa  45.1  0.0005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00641789  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3460  hypothetical protein  29.17 
 
 		 319 aa  42.7  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0231952  normal  0.0650388 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3730  protein of unknown function DUF892  29.25 
 
 		 169 aa  40.8  0.009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2297  hypothetical protein  28.07 
 
 		 161 aa  40.8  0.01  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>