54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_2257 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_2257  hypothetical protein  100 
 
 		 169 aa  348  1e-95  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0390342  normal  0.0993659 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3115  hypothetical protein  73.96 
 
 		 169 aa  262  2e-69  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11100  hypothetical protein  63.31 
 
 		 169 aa  235  2e-61  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1349  hypothetical protein  63.31 
 
 		 290 aa  205  2e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.932547  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3123  YciE  63.31 
 
 		 169 aa  205  2e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.220644  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4046  hypothetical protein  59.12 
 
 		 168 aa  204  3e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2998  YciE  63.31 
 
 		 289 aa  204  4e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.272257  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5519  hypothetical protein  55.49 
 
 		 173 aa  192  1e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.445596 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3829  hypothetical protein  55.9 
 
 		 168 aa  190  7e-48  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1857  hypothetical protein  56.36 
 
 		 168 aa  188  4e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.53745 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1920  hypothetical protein  56.36 
 
 		 168 aa  188  4e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0252481  hitchhiker  0.0000515566 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1862  YciE  56.36 
 
 		 168 aa  188  4e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.898538 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1416  YciE  56.36 
 
 		 168 aa  188  4e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.182105  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1598  hypothetical protein  56.36 
 
 		 168 aa  188  4e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.299464 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3795  hypothetical protein  55.97 
 
 		 167 aa  187  5e-47  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.139146  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0330  hypothetical protein  54.17 
 
 		 169 aa  187  8e-47  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.600353  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3128  hypothetical protein  55 
 
 		 168 aa  177  8e-44  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.137847 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1646  protein YciE  53.75 
 
 		 168 aa  176  1e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4157  hypothetical protein  52.5 
 
 		 168 aa  176  1e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3516  hypothetical protein  51.48 
 
 		 169 aa  172  1.9999999999999998e-42  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1353  hypothetical protein  54.44 
 
 		 169 aa  172  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6476  hypothetical protein  54.44 
 
 		 169 aa  172  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.110313  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1888  hypothetical protein  53.12 
 
 		 168 aa  170  6.999999999999999e-42  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0168584 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2370  hypothetical protein  52.5 
 
 		 168 aa  168  3e-41  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.454918  hitchhiker  0.000000143978 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2391  protein of unknown function DUF892  52.5 
 
 		 168 aa  168  3e-41  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0373261  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01231  hypothetical protein  52.5 
 
 		 168 aa  168  3e-41  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01241  hypothetical protein  52.5 
 
 		 168 aa  168  3e-41  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1455  hypothetical protein  52.5 
 
 		 168 aa  168  3e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000609485  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1366  hypothetical protein  52.5 
 
 		 168 aa  168  3e-41  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0778822  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5471  hypothetical protein  53.85 
 
 		 169 aa  162  2.0000000000000002e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0019699 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1355  hypothetical protein  45.16 
 
 		 164 aa  141  4e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6066  hypothetical protein  50.91 
 
 		 152 aa  124  5e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.184002  normal  0.0421173 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0605  hypothetical protein  40 
 
 		 168 aa  124  5e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1759  hypothetical protein  40.67 
 
 		 169 aa  108  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1900  hypothetical protein  37.67 
 
 		 164 aa  108  4.0000000000000004e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0688  hypothetical protein  40.4 
 
 		 169 aa  106  2e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0583127  normal  0.153854 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1493  protein of unknown function DUF892  39.07 
 
 		 169 aa  103  1e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3554  protein of unknown function DUF892  40 
 
 		 161 aa  102  2e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0494833  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2899  protein of unknown function DUF892  36.31 
 
 		 169 aa  101  4e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.405335  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1875  hypothetical protein  53.33 
 
 		 92 aa  99.8  2e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000212933 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3003  protein of unknown function DUF892  35.67 
 
 		 169 aa  99.4  2e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.349145  normal  0.119787 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2776  hypothetical protein  35.03 
 
 		 169 aa  97.1  1e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.27949  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5805  protein of unknown function DUF892  36.36 
 
 		 151 aa  94.7  6e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0300343  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0139  protein of unknown function DUF892  27.89 
 
 		 170 aa  70.9  0.000000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.207704  normal  0.0800225 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5650  hypothetical protein  30.92 
 
 		 169 aa  68.2  0.00000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.784305  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3797  protein of unknown function DUF892  28.57 
 
 		 170 aa  65.5  0.0000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.728089 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3460  hypothetical protein  27.72 
 
 		 319 aa  49.3  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0231952  normal  0.0650388 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4547  hypothetical protein  31.36 
 
 		 183 aa  45.8  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2256  hypothetical protein  31.25 
 
 		 169 aa  45.1  0.0005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.949168  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3730  protein of unknown function DUF892  31.25 
 
 		 169 aa  44.7  0.0006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4780  hypothetical protein  30.83 
 
 		 183 aa  43.9  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.786292 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4845  protein of unknown function DUF892  29.37 
 
 		 167 aa  42.4  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00641789  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3623  hypothetical protein  31.97 
 
 		 169 aa  42  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0183446 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5592  protein of unknown function DUF892  32.33 
 
 		 166 aa  41.6  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.544575  hitchhiker  0.00495302 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>