52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_3795 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_3795  hypothetical protein  100 
 
 		 167 aa  343  5e-94  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.139146  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4157  hypothetical protein  76.83 
 
 		 168 aa  263  7e-70  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4046  hypothetical protein  58.49 
 
 		 168 aa  204  5e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5519  hypothetical protein  58.75 
 
 		 173 aa  195  3e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.445596 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3829  hypothetical protein  56.6 
 
 		 168 aa  193  1e-48  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0330  hypothetical protein  55.06 
 
 		 169 aa  190  9e-48  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.600353  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2257  hypothetical protein  55.97 
 
 		 169 aa  187  5e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0390342  normal  0.0993659 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11100  hypothetical protein  51.57 
 
 		 169 aa  182  2.0000000000000003e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3115  hypothetical protein  56.6 
 
 		 169 aa  181  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1920  hypothetical protein  50.65 
 
 		 168 aa  157  5e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0252481  hitchhiker  0.0000515566 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1857  hypothetical protein  50.65 
 
 		 168 aa  157  5e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.53745 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1862  YciE  50.65 
 
 		 168 aa  157  5e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.898538 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1416  YciE  50.65 
 
 		 168 aa  157  5e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.182105  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1598  hypothetical protein  50.65 
 
 		 168 aa  157  5e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.299464 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3516  hypothetical protein  48.43 
 
 		 169 aa  154  6e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3128  hypothetical protein  49.35 
 
 		 168 aa  152  2e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.137847 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1888  hypothetical protein  49.06 
 
 		 168 aa  150  5.9999999999999996e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0168584 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1646  protein YciE  47.17 
 
 		 168 aa  150  8e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1455  hypothetical protein  48.43 
 
 		 168 aa  146  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000609485  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2391  protein of unknown function DUF892  48.43 
 
 		 168 aa  146  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0373261  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2370  hypothetical protein  48.43 
 
 		 168 aa  146  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.454918  hitchhiker  0.000000143978 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01241  hypothetical protein  48.43 
 
 		 168 aa  146  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1366  hypothetical protein  48.43 
 
 		 168 aa  146  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0778822  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01231  hypothetical protein  48.43 
 
 		 168 aa  146  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3123  YciE  46.54 
 
 		 169 aa  143  9e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.220644  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1349  hypothetical protein  46.54 
 
 		 290 aa  141  5e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.932547  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2998  YciE  46.54 
 
 		 289 aa  141  5e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.272257  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1353  hypothetical protein  48.43 
 
 		 169 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6476  hypothetical protein  48.43 
 
 		 169 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.110313  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1355  hypothetical protein  42.76 
 
 		 164 aa  128  4.0000000000000003e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1900  hypothetical protein  38.82 
 
 		 164 aa  108  3e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5471  hypothetical protein  42.77 
 
 		 169 aa  107  6e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0019699 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3554  protein of unknown function DUF892  38.82 
 
 		 161 aa  100  1e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0494833  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6066  hypothetical protein  42.73 
 
 		 152 aa  95.9  2e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.184002  normal  0.0421173 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0605  hypothetical protein  32.91 
 
 		 168 aa  94  8e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1493  protein of unknown function DUF892  36.3 
 
 		 169 aa  85.5  3e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5805  protein of unknown function DUF892  33.79 
 
 		 151 aa  82  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0300343  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0688  hypothetical protein  36.3 
 
 		 169 aa  81.6  0.000000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0583127  normal  0.153854 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1875  hypothetical protein  48.78 
 
 		 92 aa  81.3  0.000000000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000212933 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2899  protein of unknown function DUF892  31.13 
 
 		 169 aa  74.7  0.0000000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.405335  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1759  hypothetical protein  31.79 
 
 		 169 aa  73.9  0.000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2776  hypothetical protein  30.46 
 
 		 169 aa  71.6  0.000000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.27949  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3003  protein of unknown function DUF892  30.46 
 
 		 169 aa  71.6  0.000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.349145  normal  0.119787 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5650  hypothetical protein  28.19 
 
 		 169 aa  63.9  0.000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.784305  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0139  protein of unknown function DUF892  30.41 
 
 		 170 aa  56.2  0.0000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.207704  normal  0.0800225 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4547  hypothetical protein  30.58 
 
 		 183 aa  52.4  0.000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3797  protein of unknown function DUF892  29.05 
 
 		 170 aa  48.9  0.00003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.728089 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4780  hypothetical protein  30.15 
 
 		 183 aa  44.7  0.0006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.786292 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4845  protein of unknown function DUF892  26.32 
 
 		 167 aa  42.4  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00641789  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3186  hypothetical protein  27.5 
 
 		 174 aa  42.4  0.003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1033  hypothetical protein  25.33 
 
 		 168 aa  41.2  0.007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.665565  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0289  protein of unknown function DUF892  31.82 
 
 		 162 aa  40.8  0.009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.302406 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>