50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_4157 on replicon NC_007959
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007959  Nham_4157  hypothetical protein  100 
 
 		 168 aa  341  2.9999999999999997e-93  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3795  hypothetical protein  76.83 
 
 		 167 aa  263  7e-70  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.139146  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3829  hypothetical protein  56.6 
 
 		 168 aa  195  3e-49  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4046  hypothetical protein  54.66 
 
 		 168 aa  191  4e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5519  hypothetical protein  58.86 
 
 		 173 aa  190  1e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.445596 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2257  hypothetical protein  52.5 
 
 		 169 aa  176  1e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0390342  normal  0.0993659 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11100  hypothetical protein  49.38 
 
 		 169 aa  174  4e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0330  hypothetical protein  50.32 
 
 		 169 aa  171  5e-42  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.600353  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3115  hypothetical protein  51.57 
 
 		 169 aa  164  4e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3123  YciE  48.21 
 
 		 169 aa  153  1e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.220644  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1862  YciE  47.47 
 
 		 168 aa  152  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.898538 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1857  hypothetical protein  47.47 
 
 		 168 aa  152  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.53745 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1920  hypothetical protein  47.47 
 
 		 168 aa  152  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0252481  hitchhiker  0.0000515566 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1416  YciE  47.47 
 
 		 168 aa  152  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.182105  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1598  hypothetical protein  47.47 
 
 		 168 aa  152  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.299464 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1646  protein YciE  44.64 
 
 		 168 aa  151  4e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2998  YciE  48.21 
 
 		 289 aa  150  8.999999999999999e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.272257  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1349  hypothetical protein  48.21 
 
 		 290 aa  150  1e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.932547  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3516  hypothetical protein  45.73 
 
 		 169 aa  148  3e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3128  hypothetical protein  46.84 
 
 		 168 aa  148  3e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.137847 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1888  hypothetical protein  45.24 
 
 		 168 aa  146  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0168584 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2391  protein of unknown function DUF892  44.64 
 
 		 168 aa  142  2e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0373261  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2370  hypothetical protein  44.64 
 
 		 168 aa  142  2e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.454918  hitchhiker  0.000000143978 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01241  hypothetical protein  44.64 
 
 		 168 aa  142  2e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01231  hypothetical protein  44.64 
 
 		 168 aa  142  2e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1366  hypothetical protein  44.64 
 
 		 168 aa  142  2e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0778822  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1455  hypothetical protein  44.64 
 
 		 168 aa  142  2e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000609485  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1355  hypothetical protein  43.04 
 
 		 164 aa  133  9e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1353  hypothetical protein  47.62 
 
 		 169 aa  133  9e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6476  hypothetical protein  47.62 
 
 		 169 aa  133  9e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.110313  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5471  hypothetical protein  43.45 
 
 		 169 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0019699 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1900  hypothetical protein  39.24 
 
 		 164 aa  109  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3554  protein of unknown function DUF892  40.13 
 
 		 161 aa  103  2e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0494833  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6066  hypothetical protein  44.55 
 
 		 152 aa  100  1e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.184002  normal  0.0421173 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0605  hypothetical protein  34.16 
 
 		 168 aa  89.7  2e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5805  protein of unknown function DUF892  38.41 
 
 		 151 aa  88.6  4e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0300343  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1875  hypothetical protein  42.86 
 
 		 92 aa  81.3  0.000000000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000212933 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1759  hypothetical protein  33.57 
 
 		 169 aa  72.4  0.000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1493  protein of unknown function DUF892  33.56 
 
 		 169 aa  72.4  0.000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0688  hypothetical protein  33.56 
 
 		 169 aa  70.1  0.00000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0583127  normal  0.153854 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2899  protein of unknown function DUF892  30 
 
 		 169 aa  66.6  0.0000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.405335  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3003  protein of unknown function DUF892  31.85 
 
 		 169 aa  64.7  0.0000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.349145  normal  0.119787 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2776  hypothetical protein  31.85 
 
 		 169 aa  64.7  0.0000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.27949  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5650  hypothetical protein  30.07 
 
 		 169 aa  63.9  0.0000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.784305  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0139  protein of unknown function DUF892  30.14 
 
 		 170 aa  58.2  0.00000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.207704  normal  0.0800225 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3797  protein of unknown function DUF892  28.77 
 
 		 170 aa  50.8  0.000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.728089 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4547  hypothetical protein  27.78 
 
 		 183 aa  47.8  0.00008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1370  protein of unknown function DUF892  29.23 
 
 		 168 aa  42.4  0.003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3460  hypothetical protein  29.7 
 
 		 319 aa  42.4  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0231952  normal  0.0650388 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1033  hypothetical protein  28.46 
 
 		 168 aa  40.4  0.01  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.665565  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>