111 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_1452 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_1452  hypothetical protein  100 
 
 		 164 aa  335  9.999999999999999e-92  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.311216  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1599  protein of unknown function DUF892  34.64 
 
 		 164 aa  99.4  2e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0568744  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4547  hypothetical protein  35.1 
 
 		 183 aa  87.8  6e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4845  protein of unknown function DUF892  35.37 
 
 		 167 aa  85.5  3e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00641789  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1033  hypothetical protein  35.37 
 
 		 168 aa  83.6  0.000000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.665565  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4780  hypothetical protein  32.9 
 
 		 183 aa  83.6  0.000000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.786292 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2282  protein of unknown function DUF892  40.5 
 
 		 179 aa  82.8  0.000000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3623  hypothetical protein  33.33 
 
 		 169 aa  82.4  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0183446 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2857  hypothetical protein  29.03 
 
 		 197 aa  82.8  0.000000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3730  protein of unknown function DUF892  34.01 
 
 		 169 aa  82  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4071  hypothetical protein  33.8 
 
 		 168 aa  80.5  0.000000000000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0479613  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1711  hypothetical protein  34.38 
 
 		 183 aa  79.7  0.00000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4465  protein of unknown function DUF892  31.97 
 
 		 168 aa  80.1  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3586  protein of unknown function DUF892  31.41 
 
 		 154 aa  77.8  0.00000000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5401  protein of unknown function DUF892  36.05 
 
 		 167 aa  77  0.0000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.949113 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4862  hypothetical protein  36.62 
 
 		 177 aa  75.5  0.0000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2773  protein of unknown function DUF892  28.75 
 
 		 165 aa  75.5  0.0000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5347  protein of unknown function DUF892  36.62 
 
 		 167 aa  75.5  0.0000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0036  hypothetical protein  32.43 
 
 		 175 aa  75.1  0.0000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0130409 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1919  hypothetical protein  30.67 
 
 		 167 aa  74.3  0.0000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.137818  hitchhiker  0.0000284113 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1861  protein YciF  30.67 
 
 		 167 aa  74.3  0.0000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.919479 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1599  hypothetical protein  30.67 
 
 		 167 aa  74.3  0.0000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.154464 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2256  hypothetical protein  30.61 
 
 		 169 aa  73.9  0.0000000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.949168  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1470  hypothetical protein  29.93 
 
 		 168 aa  73.6  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0321654  normal  0.306321 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1856  hypothetical protein  30.67 
 
 		 167 aa  73.2  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.542717 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1417  protein YciF  30.67 
 
 		 167 aa  73.2  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.341518  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1657  hypothetical protein  31.97 
 
 		 168 aa  72.4  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0448276  normal  0.877202 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3832  hypothetical protein  31.97 
 
 		 168 aa  71.6  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.148177  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3186  hypothetical protein  32.03 
 
 		 174 aa  71.6  0.000000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0196  hypothetical protein  29.03 
 
 		 169 aa  70.9  0.000000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3218  hypothetical protein  33.1 
 
 		 167 aa  70.9  0.000000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.708155  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0601  protein of unknown function DUF892  32.67 
 
 		 268 aa  70.5  0.000000000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.578011  normal  0.0901394 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6464  hypothetical protein  34.69 
 
 		 167 aa  69.3  0.00000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.255827  normal  0.636279 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5097  hypothetical protein  33.61 
 
 		 165 aa  68.9  0.00000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0289  protein of unknown function DUF892  28.29 
 
 		 162 aa  68.6  0.00000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.302406 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5546  hypothetical protein  30 
 
 		 168 aa  68.2  0.00000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.376366  normal  0.380191 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1647  YciF protein  30 
 
 		 166 aa  68.2  0.00000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0993  protein of unknown function DUF892  33.09 
 
 		 217 aa  67.8  0.00000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2545  hypothetical protein  30.56 
 
 		 168 aa  66.6  0.0000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4247  hypothetical protein  33.12 
 
 		 158 aa  67  0.0000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0753724 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2659  hypothetical protein  30.43 
 
 		 217 aa  66.6  0.0000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3294  hypothetical protein  31.47 
 
 		 163 aa  65.9  0.0000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.335875 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2487  protein of unknown function DUF892  32.87 
 
 		 247 aa  65.5  0.0000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.48482  normal  0.272149 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2287  hypothetical protein  30.99 
 
 		 168 aa  65.1  0.0000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2984  hypothetical protein  32.85 
 
 		 164 aa  64.7  0.0000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.602458 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1370  protein of unknown function DUF892  29.93 
 
 		 168 aa  64.7  0.0000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3024  protein of unknown function DUF892  32.37 
 
 		 170 aa  63.9  0.0000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.281762  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3127  hypothetical protein  29.33 
 
 		 164 aa  63.5  0.000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.136423 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3526  hypothetical protein  30.07 
 
 		 164 aa  62.8  0.000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4158  protein of unknown function DUF892  30.7 
 
 		 162 aa  62.8  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4833  protein of unknown function DUF892  31.94 
 
 		 180 aa  62.8  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01232  hypothetical protein  28.67 
 
 		 166 aa  62  0.000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2390  protein of unknown function DUF892  28.67 
 
 		 166 aa  62  0.000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0588252  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1367  YciF protein  28.67 
 
 		 166 aa  62  0.000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.177269  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1456  YciF protein  28.67 
 
 		 166 aa  62  0.000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000775316  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2369  hypothetical protein  28.67 
 
 		 166 aa  62  0.000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.820184  hitchhiker  0.000000156892 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1874  YciF protein  28.67 
 
 		 173 aa  62  0.000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000112449 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1889  YciF protein  28.67 
 
 		 173 aa  62  0.000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0111142 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01242  hypothetical protein  28.67 
 
 		 166 aa  62  0.000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5596  hypothetical protein  31.54 
 
 		 166 aa  62  0.000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.756785  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1727  protein of unknown function DUF892  32.17 
 
 		 184 aa  60.5  0.000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.403983  hitchhiker  0.000459015 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3141  hypothetical protein  28.26 
 
 		 189 aa  60.1  0.00000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.51971  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5257  protein of unknown function DUF892  29.5 
 
 		 162 aa  60.1  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5592  protein of unknown function DUF892  30.82 
 
 		 166 aa  60.5  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.544575  hitchhiker  0.00495302 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1026  hypothetical protein  30.2 
 
 		 187 aa  59.7  0.00000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.158329  hitchhiker  0.000105516 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5614  protein of unknown function DUF892  31.61 
 
 		 168 aa  59.7  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.255585 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5857  protein of unknown function DUF892  29.58 
 
 		 174 aa  59.7  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0615276  normal  0.702479 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2646  hypothetical protein  26.81 
 
 		 189 aa  58.2  0.00000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2664  hypothetical protein  30.94 
 
 		 165 aa  57.8  0.00000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.104786  normal  0.942807 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1678  hypothetical protein  28 
 
 		 166 aa  57.8  0.00000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.108531  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2489  non-heme manganese-containing catalase  26.09 
 
 		 421 aa  57.4  0.00000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3365  hypothetical protein  30.28 
 
 		 198 aa  55.8  0.0000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.430964  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1308  protein of unknown function DUF892  32.87 
 
 		 191 aa  56.2  0.0000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.758326  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1999  protein of unknown function DUF892  27.46 
 
 		 175 aa  55.5  0.0000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4295  hypothetical protein  28.97 
 
 		 167 aa  54.7  0.0000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4540  protein of unknown function DUF892  29.86 
 
 		 165 aa  54.3  0.0000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.369842 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0088  ycfI, putative structural proteins  27.59 
 
 		 166 aa  53.9  0.0000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.136593  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1724  hypothetical protein  27.59 
 
 		 166 aa  53.9  0.0000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4912  hypothetical protein  28.99 
 
 		 164 aa  53.9  0.0000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.550913 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1730  hypothetical protein  28.26 
 
 		 165 aa  52.8  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.666521  decreased coverage  0.00187959 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2390  protein of unknown function DUF892  29.29 
 
 		 196 aa  53.1  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.421917  normal  0.147329 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3491  hypothetical protein  28.37 
 
 		 163 aa  52  0.000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4791  hypothetical protein  27.59 
 
 		 165 aa  52.4  0.000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3827  hypothetical protein  31.4 
 
 		 149 aa  52.4  0.000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4275  protein of unknown function DUF892  29.66 
 
 		 165 aa  52.4  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9043  hypothetical protein  27.97 
 
 		 165 aa  52  0.000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.034068  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2066  hypothetical protein  28.57 
 
 		 195 aa  52  0.000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0139243 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7975  protein of unknown function DUF892  27.97 
 
 		 179 aa  51.2  0.000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1820  hypothetical protein  30.07 
 
 		 169 aa  51.2  0.000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.418457  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1737  hypothetical protein  29.71 
 
 		 166 aa  50.8  0.000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.997374  normal  0.0699743 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0468  hypothetical protein  30.07 
 
 		 165 aa  50.8  0.000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.53229  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1136  hypothetical protein  28.17 
 
 		 165 aa  50.1  0.00001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3057  hypothetical protein  28.68 
 
 		 165 aa  50.4  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.460854  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0740  hypothetical protein  27.4 
 
 		 192 aa  50.4  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1446  hypothetical protein  26.75 
 
 		 165 aa  49.3  0.00002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.187122  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2670  hypothetical protein  27.46 
 
 		 167 aa  49.7  0.00002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0525668  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2220  protein of unknown function DUF892  28.08 
 
 		 175 aa  49.7  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4247  protein of unknown function DUF892  27.59 
 
 		 166 aa  48.1  0.00006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3563  hypothetical protein  27.59 
 
 		 166 aa  47  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.892765  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3344  protein of unknown function DUF892  28.24 
 
 		 212 aa  46.2  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0480671 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>