123 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_2220 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011894  Mnod_2220  protein of unknown function DUF892  100 
 
 
175 aa  349  1e-95  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7975  protein of unknown function DUF892  89.44 
 
 
179 aa  297  5e-80  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0740  hypothetical protein  88.34 
 
 
192 aa  294  5e-79  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3614  hypothetical protein  87.93 
 
 
180 aa  283  9e-76  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3906  protein of unknown function DUF892  87.36 
 
 
180 aa  282  2.0000000000000002e-75  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4293  protein of unknown function DUF892  85.63 
 
 
180 aa  281  4.0000000000000003e-75  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1633  hypothetical protein  81.87 
 
 
181 aa  238  2e-62  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.351952 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2862  protein of unknown function DUF892  68.79 
 
 
168 aa  220  6e-57  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.217094  normal  0.674493 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4275  protein of unknown function DUF892  62.5 
 
 
165 aa  195  3e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4540  protein of unknown function DUF892  61.84 
 
 
165 aa  191  5e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.369842 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1730  hypothetical protein  57.58 
 
 
165 aa  187  4e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.666521  decreased coverage  0.00187959 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1136  hypothetical protein  59.21 
 
 
165 aa  187  8e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5596  hypothetical protein  61.84 
 
 
166 aa  186  2e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.756785  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3491  hypothetical protein  59.21 
 
 
163 aa  183  1.0000000000000001e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5614  protein of unknown function DUF892  59.24 
 
 
168 aa  180  9.000000000000001e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.255585 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4791  hypothetical protein  57.52 
 
 
165 aa  179  2e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5592  protein of unknown function DUF892  58.28 
 
 
166 aa  179  2e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.544575  hitchhiker  0.00495302 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4247  protein of unknown function DUF892  58.79 
 
 
166 aa  177  9e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3563  hypothetical protein  57.93 
 
 
166 aa  177  1e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.892765  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3526  hypothetical protein  53.21 
 
 
164 aa  174  4e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1446  hypothetical protein  55.84 
 
 
165 aa  172  1.9999999999999998e-42  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.187122  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1737  hypothetical protein  58.02 
 
 
166 aa  172  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.997374  normal  0.0699743 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4295  hypothetical protein  58.06 
 
 
167 aa  167  6e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4912  hypothetical protein  55 
 
 
164 aa  164  6.9999999999999995e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.550913 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2984  hypothetical protein  54.36 
 
 
164 aa  162  3e-39  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.602458 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2664  hypothetical protein  55.76 
 
 
165 aa  160  1e-38  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.104786  normal  0.942807 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2670  hypothetical protein  50.91 
 
 
167 aa  156  1e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0525668  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9043  hypothetical protein  53.33 
 
 
165 aa  155  3e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.034068  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0468  hypothetical protein  56.58 
 
 
165 aa  154  7e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.53229  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1820  hypothetical protein  56.58 
 
 
169 aa  154  8e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.418457  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3057  hypothetical protein  56.58 
 
 
165 aa  153  1e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.460854  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0289  protein of unknown function DUF892  53.33 
 
 
162 aa  151  4e-36  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.302406 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0993  protein of unknown function DUF892  51.57 
 
 
217 aa  148  5e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3294  hypothetical protein  52.32 
 
 
163 aa  147  7e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.335875 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5257  protein of unknown function DUF892  51.66 
 
 
162 aa  145  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4780  hypothetical protein  48.39 
 
 
183 aa  140  9e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.786292 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1470  hypothetical protein  46.54 
 
 
168 aa  139  3e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0321654  normal  0.306321 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2066  hypothetical protein  48.41 
 
 
195 aa  137  1e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0139243 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3827  hypothetical protein  50.72 
 
 
149 aa  137  1e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4247  hypothetical protein  50 
 
 
158 aa  133  9.999999999999999e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0753724 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4845  protein of unknown function DUF892  44.65 
 
 
167 aa  132  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00641789  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1874  YciF protein  51.32 
 
 
173 aa  132  3e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000112449 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1889  YciF protein  51.32 
 
 
173 aa  132  3e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0111142 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01232  hypothetical protein  51.32 
 
 
166 aa  131  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2390  protein of unknown function DUF892  51.32 
 
 
166 aa  131  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0588252  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1367  YciF protein  51.32 
 
 
166 aa  131  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.177269  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1456  YciF protein  51.32 
 
 
166 aa  131  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000775316  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2369  hypothetical protein  51.32 
 
 
166 aa  131  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.820184  hitchhiker  0.000000156892 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01242  hypothetical protein  51.32 
 
 
166 aa  131  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4465  protein of unknown function DUF892  44.65 
 
 
168 aa  131  5e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5546  hypothetical protein  45 
 
 
168 aa  130  1.0000000000000001e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.376366  normal  0.380191 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2545  hypothetical protein  42.42 
 
 
168 aa  129  2.0000000000000002e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2659  hypothetical protein  44.87 
 
 
217 aa  129  2.0000000000000002e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1919  hypothetical protein  49.01 
 
 
167 aa  129  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.137818  hitchhiker  0.0000284113 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1861  protein YciF  49.01 
 
 
167 aa  129  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.919479 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1599  hypothetical protein  49.01 
 
 
167 aa  129  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.154464 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1856  hypothetical protein  49.01 
 
 
167 aa  128  3e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.542717 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1417  protein YciF  49.01 
 
 
167 aa  128  3e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.341518  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3832  hypothetical protein  47.17 
 
 
168 aa  128  4.0000000000000003e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.148177  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1033  hypothetical protein  46.84 
 
 
168 aa  127  5.0000000000000004e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.665565  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4862  hypothetical protein  48.43 
 
 
177 aa  128  5.0000000000000004e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0036  hypothetical protein  44.3 
 
 
175 aa  128  5.0000000000000004e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0130409 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5347  protein of unknown function DUF892  48.43 
 
 
167 aa  128  5.0000000000000004e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0196  hypothetical protein  46.1 
 
 
169 aa  127  6e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5401  protein of unknown function DUF892  48.43 
 
 
167 aa  127  9.000000000000001e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.949113 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1308  protein of unknown function DUF892  46.54 
 
 
191 aa  126  1.0000000000000001e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.758326  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2390  protein of unknown function DUF892  45.91 
 
 
196 aa  127  1.0000000000000001e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.421917  normal  0.147329 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3365  hypothetical protein  43.95 
 
 
198 aa  127  1.0000000000000001e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.430964  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2287  hypothetical protein  46.15 
 
 
168 aa  125  2.0000000000000002e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3127  hypothetical protein  49.02 
 
 
164 aa  125  3e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.136423 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3730  protein of unknown function DUF892  40.99 
 
 
169 aa  125  4.0000000000000003e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1657  hypothetical protein  47.17 
 
 
168 aa  124  6e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0448276  normal  0.877202 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1727  protein of unknown function DUF892  47.74 
 
 
184 aa  124  7e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.403983  hitchhiker  0.000459015 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1370  protein of unknown function DUF892  43.12 
 
 
168 aa  123  1e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1647  YciF protein  47.02 
 
 
166 aa  122  2e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1026  hypothetical protein  44.85 
 
 
187 aa  122  3e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.158329  hitchhiker  0.000105516 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4833  protein of unknown function DUF892  45.16 
 
 
180 aa  122  3e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2489  non-heme manganese-containing catalase  44.59 
 
 
421 aa  121  4e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6464  hypothetical protein  46.54 
 
 
167 aa  120  8e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.255827  normal  0.636279 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3623  hypothetical protein  39.75 
 
 
169 aa  120  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0183446 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3141  hypothetical protein  44.59 
 
 
189 aa  120  9.999999999999999e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.51971  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3218  hypothetical protein  46.2 
 
 
167 aa  120  9.999999999999999e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.708155  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2487  protein of unknown function DUF892  43.2 
 
 
247 aa  119  1.9999999999999998e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.48482  normal  0.272149 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2256  hypothetical protein  39.13 
 
 
169 aa  119  3e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.949168  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4071  hypothetical protein  42.31 
 
 
168 aa  119  3e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0479613  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2646  hypothetical protein  45.27 
 
 
189 aa  117  7.999999999999999e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3186  hypothetical protein  45.06 
 
 
174 aa  112  2.0000000000000002e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4158  protein of unknown function DUF892  44.67 
 
 
162 aa  110  1.0000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0088  ycfI, putative structural proteins  43.23 
 
 
166 aa  109  2.0000000000000002e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.136593  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1724  hypothetical protein  43.23 
 
 
166 aa  109  2.0000000000000002e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5574  protein of unknown function DUF892  40.4 
 
 
183 aa  107  6e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5097  hypothetical protein  45.03 
 
 
165 aa  107  8.000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1678  hypothetical protein  42.58 
 
 
166 aa  107  1e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.108531  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5840  protein of unknown function DUF892  50 
 
 
253 aa  102  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.197691  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1599  protein of unknown function DUF892  38.31 
 
 
164 aa  102  4e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0568744  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5857  protein of unknown function DUF892  40.51 
 
 
174 aa  102  4e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0615276  normal  0.702479 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2773  protein of unknown function DUF892  38.56 
 
 
165 aa  97.8  7e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3344  protein of unknown function DUF892  41.33 
 
 
212 aa  95.1  5e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0480671 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2282  protein of unknown function DUF892  35.29 
 
 
179 aa  90.9  8e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3586  protein of unknown function DUF892  35.67 
 
 
154 aa  87  1e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>