202 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_1911 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_1911  hypothetical protein  100 
 
 
358 aa  727    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0489557  normal  0.211414 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0164  hypothetical protein  52.25 
 
 
372 aa  399  9.999999999999999e-111  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3578  hypothetical protein  47.65 
 
 
361 aa  354  1e-96  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0579989 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5286  hypothetical protein  25.99 
 
 
360 aa  114  3e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.153948  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0402  hypothetical protein  24.92 
 
 
357 aa  92.4  1e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0280  hypothetical protein  25.79 
 
 
364 aa  92  1e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0094  hypothetical protein  28.9 
 
 
333 aa  71.6  0.00000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6145  hypothetical protein  28.05 
 
 
332 aa  71.2  0.00000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.8095  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1898  hypothetical protein  25.45 
 
 
329 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.931279  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5949  hypothetical protein  27.1 
 
 
324 aa  61.6  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.011365  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0498  hypothetical protein  41.86 
 
 
318 aa  60.8  0.00000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2301  hypothetical protein  25.17 
 
 
337 aa  60.5  0.00000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.100288  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1121  hypothetical protein  26.03 
 
 
325 aa  60.5  0.00000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.237862  normal  0.618143 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1041  hypothetical protein  26.03 
 
 
327 aa  60.5  0.00000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3792  extra-cytoplasmic solute receptor  27.67 
 
 
326 aa  59.7  0.00000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0125  hypothetical protein  26.3 
 
 
332 aa  58.9  0.0000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.232724  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4356  hypothetical protein  25.64 
 
 
323 aa  58.2  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4598  hypothetical protein  27.59 
 
 
332 aa  58.2  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2124  tripartite tricarboxylate transporter(TTT) family, periplasmic ligand binding protein TctC  25.16 
 
 
316 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0230  hypothetical protein  25.08 
 
 
325 aa  57.4  0.0000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.297897  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5507  hypothetical protein  25.25 
 
 
319 aa  57.4  0.0000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4101  extra-cytoplasmic solute receptor  25.62 
 
 
328 aa  57.4  0.0000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0889008  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0522  hypothetical protein  23.96 
 
 
324 aa  57  0.0000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1312  hypothetical protein  27.12 
 
 
320 aa  57  0.0000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5119  hypothetical protein  26.4 
 
 
328 aa  56.6  0.0000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.111845 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3745  hypothetical protein  26.41 
 
 
330 aa  55.5  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0812255  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5273  extra-cytoplasmic solute receptor  25.08 
 
 
322 aa  55.5  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.320147  normal  0.0608959 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2061  hypothetical protein  26.96 
 
 
348 aa  55.8  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3703  hypothetical protein  25.62 
 
 
333 aa  55.1  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3194  hypothetical protein  26.96 
 
 
318 aa  55.1  0.000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0108  hypothetical protein  25.84 
 
 
332 aa  55.1  0.000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.251449 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5060  hypothetical protein  29.73 
 
 
331 aa  54.7  0.000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2997  hypothetical protein  25.42 
 
 
343 aa  53.9  0.000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0266851  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4752  twin-arginine translocation pathway signal  27.22 
 
 
333 aa  53.9  0.000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.417694  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4353  hypothetical protein  24.37 
 
 
341 aa  53.9  0.000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0875589  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5146  hypothetical protein  26.23 
 
 
327 aa  53.5  0.000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0987531  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3420  hypothetical protein  25.23 
 
 
320 aa  53.1  0.000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.21089  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1635  hypothetical protein  25.96 
 
 
333 aa  53.1  0.000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.345549  normal  0.902401 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4931  extra-cytoplasmic solute receptor  25.43 
 
 
330 aa  53.1  0.000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.875929 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2030  hypothetical protein  28.25 
 
 
332 aa  53.1  0.000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.608213  normal  0.556518 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5896  hypothetical protein  25.87 
 
 
332 aa  52.4  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.971815  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6277  hypothetical protein  26.5 
 
 
325 aa  52  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3931  hypothetical protein  24.77 
 
 
320 aa  52  0.00001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0228  hypothetical protein  23.81 
 
 
328 aa  52  0.00001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1017  hypothetical protein  24.29 
 
 
304 aa  52.4  0.00001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.221773 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1026  hypothetical protein  23.37 
 
 
333 aa  51.2  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.346833  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5968  hypothetical protein  24.34 
 
 
344 aa  52  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2596  hypothetical protein  25.34 
 
 
327 aa  51.6  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.523201  normal  0.428813 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3288  hypothetical protein  25.7 
 
 
323 aa  52  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0157396  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3329  hypothetical protein  26.67 
 
 
323 aa  52  0.00002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.422296  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3678  hypothetical protein  26.39 
 
 
327 aa  51.6  0.00002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0060  hypothetical protein  26.69 
 
 
322 aa  52  0.00002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1327  hypothetical protein  23.2 
 
 
328 aa  51.2  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5118  hypothetical protein  26.46 
 
 
320 aa  51.2  0.00003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.534032 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5277  hypothetical protein  25.14 
 
 
327 aa  50.8  0.00003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.450812  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0284  hypothetical protein  25.09 
 
 
323 aa  51.2  0.00003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5221  Bug family extra-cytoplasmic solute receptor  25.84 
 
 
347 aa  51.2  0.00003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.334182 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1047  hypothetical protein  39.13 
 
 
316 aa  51.2  0.00003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0384871  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1072  hypothetical protein  25.33 
 
 
316 aa  50.8  0.00003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0296212  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3496  hypothetical protein  24.16 
 
 
327 aa  50.4  0.00004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.192421 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1164  hypothetical protein  28.99 
 
 
332 aa  50.8  0.00004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3311  hypothetical protein  26.21 
 
 
324 aa  50.4  0.00004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.187965 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2198  hypothetical protein  26.47 
 
 
331 aa  50.4  0.00004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.000306315  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0267  hypothetical protein  26.35 
 
 
337 aa  50.4  0.00005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.717963  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5616  extra-cytoplasmic solute receptor  24.47 
 
 
329 aa  50.4  0.00005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3221  hypothetical protein  22.02 
 
 
317 aa  50.1  0.00005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.429997  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2663  hypothetical protein  26.03 
 
 
324 aa  50.4  0.00005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0983  hypothetical protein  35.51 
 
 
339 aa  50.1  0.00006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2114  hypothetical protein  25 
 
 
325 aa  50.1  0.00006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00328294 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1522  hypothetical protein  24.76 
 
 
326 aa  49.7  0.00007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.5354  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1812  hypothetical protein  25.95 
 
 
326 aa  49.7  0.00008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3415  hypothetical protein  24.14 
 
 
324 aa  49.7  0.00008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5370  extra-cytoplasmic solute receptor  25.66 
 
 
322 aa  49.3  0.00009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.114035  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6257  hypothetical protein  26.1 
 
 
332 aa  48.9  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.460323  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3798  hypothetical protein  23.25 
 
 
338 aa  49.3  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.366926  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0125  hypothetical protein  27.27 
 
 
331 aa  49.3  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.654987  n/a   
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4218  hypothetical protein  32.23 
 
 
317 aa  48.9  0.0001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1815  hypothetical protein  25.39 
 
 
325 aa  49.3  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00540737  normal  0.0160042 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3917  extra-cytoplasmic solute receptor  23.53 
 
 
328 aa  48.9  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.897664 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4073  extra-cytoplasmic solute receptor  24.8 
 
 
332 aa  49.3  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000509768  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3991  hypothetical protein  23.45 
 
 
319 aa  48.9  0.0001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0756989 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2909  hypothetical protein  24.68 
 
 
323 aa  48.1  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3086  hypothetical protein  23.56 
 
 
325 aa  48.5  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4197  hypothetical protein  24.05 
 
 
316 aa  48.1  0.0002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.504073  normal  0.975042 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5824  extra-cytoplasmic solute receptor  24.59 
 
 
330 aa  48.1  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1846  hypothetical protein  25.16 
 
 
321 aa  48.9  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0246944  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0265  hypothetical protein  27.5 
 
 
323 aa  48.5  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0112  hypothetical protein  34.88 
 
 
338 aa  47.8  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.25815  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1598  hypothetical protein  31.72 
 
 
330 aa  47.8  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.667416  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3966  hypothetical protein  25.76 
 
 
356 aa  47.8  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0682449  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0638  twin-arginine translocation pathway signal  26.58 
 
 
330 aa  47.8  0.0003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1904  hypothetical protein  23.08 
 
 
326 aa  47.8  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0291  hypothetical protein  28.36 
 
 
333 aa  48.1  0.0003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2501  hypothetical protein  24.15 
 
 
322 aa  47.8  0.0003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.111791  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0779  hypothetical protein  23.71 
 
 
360 aa  47.8  0.0003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3178  hypothetical protein  24.25 
 
 
328 aa  47.8  0.0003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000137109 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4280  hypothetical protein  26.85 
 
 
333 aa  47.8  0.0003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.711918  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1757  hypothetical protein  23.41 
 
 
325 aa  47.4  0.0004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.207491  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0693  hypothetical protein  24.39 
 
 
320 aa  47.4  0.0004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2136  tripartite tricarboxylate transporter(TTT) family, periplasmic ligand binding protein TctC  25.65 
 
 
323 aa  47.4  0.0004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.961673 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>