More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B5286 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007348  Reut_B5286  hypothetical protein  100 
 
 		 360 aa  738    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.153948  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1911  hypothetical protein  25.99 
 
 		 358 aa  114  3e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0489557  normal  0.211414 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3578  hypothetical protein  27.87 
 
 		 361 aa  107  4e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0579989 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0164  hypothetical protein  25.61 
 
 		 372 aa  81.6  0.00000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2301  hypothetical protein  25.15 
 
 		 337 aa  68.9  0.0000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.100288  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3442  hypothetical protein  25.87 
 
 		 324 aa  68.6  0.0000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0502272 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2061  hypothetical protein  22.22 
 
 		 348 aa  66.2  0.0000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1635  hypothetical protein  23.44 
 
 		 333 aa  64.7  0.000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.345549  normal  0.902401 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3703  hypothetical protein  27.52 
 
 		 333 aa  63.9  0.000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6283  hypothetical protein  26.4 
 
 		 321 aa  61.6  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.120039  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3266  hypothetical protein  23.93 
 
 		 343 aa  61.6  0.00000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000301763 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2833  hypothetical protein  26.01 
 
 		 342 aa  60.8  0.00000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.226544  normal  0.225758 
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4353  hypothetical protein  22.95 
 
 		 341 aa  60.1  0.00000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0875589  n/a   
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4197  hypothetical protein  24.32 
 
 		 316 aa  59.3  0.0000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.504073  normal  0.975042 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2912  hypothetical protein  24.92 
 
 		 337 aa  58.9  0.0000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1404  hypothetical protein  23.31 
 
 		 328 aa  59.3  0.0000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2972  hypothetical protein  24.4 
 
 		 323 aa  58.9  0.0000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3789  extra-cytoplasmic solute receptor  25.52 
 
 		 326 aa  59.3  0.0000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2249  hypothetical protein  30.8 
 
 		 331 aa  58.5  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0784  hypothetical protein  25.23 
 
 		 328 aa  58.5  0.0000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4137  hypothetical protein  24.42 
 
 		 326 aa  58.2  0.0000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.864349 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1697  hypothetical protein  30.8 
 
 		 331 aa  58.5  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.316918  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1624  hypothetical protein  30.8 
 
 		 331 aa  58.5  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0855  hypothetical protein  24.92 
 
 		 353 aa  57.4  0.0000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.898803 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5147  extra-cytoplasmic solute receptor  23.62 
 
 		 320 aa  56.6  0.0000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.698563  normal  0.563225 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0579  hypothetical protein  25.67 
 
 		 322 aa  56.6  0.0000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.444417  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2584  hypothetical protein  25.75 
 
 		 323 aa  56.2  0.0000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.238568  normal  0.0261677 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1161  hypothetical protein  26.09 
 
 		 323 aa  56.2  0.0000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.334484  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2476  hypothetical protein  23.48 
 
 		 321 aa  56.2  0.0000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0303847  normal  0.0316178 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4457  hypothetical protein  27.45 
 
 		 323 aa  56.2  0.0000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0502897  normal  0.32716 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1011  hypothetical protein  25.32 
 
 		 395 aa  55.5  0.000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.630289  normal  0.164657 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1562  hypothetical protein  24.93 
 
 		 322 aa  55.8  0.000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000177519 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1930  hypothetical protein  27.68 
 
 		 330 aa  55.8  0.000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.886467  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1733  hypothetical protein  27.68 
 
 		 330 aa  56.2  0.000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3537  hypothetical protein  26.36 
 
 		 322 aa  55.1  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1908  hypothetical protein  29.08 
 
 		 336 aa  54.7  0.000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.781517  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4853  extra-cytoplasmic solute receptor  25.64 
 
 		 314 aa  54.7  0.000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0565268  normal  0.206495 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0191  hypothetical protein  24.38 
 
 		 335 aa  54.3  0.000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4354  hypothetical protein  25.07 
 
 		 327 aa  54.7  0.000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.110423  normal  0.165755 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1717  hypothetical protein  23.29 
 
 		 330 aa  54.7  0.000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.169515  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3614  hypothetical protein  24.46 
 
 		 355 aa  53.9  0.000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.380289  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1162  hypothetical protein  30.12 
 
 		 330 aa  53.9  0.000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1696  hypothetical protein  38.16 
 
 		 327 aa  53.5  0.000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.910733  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5896  hypothetical protein  23.84 
 
 		 332 aa  53.1  0.000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.971815  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5949  hypothetical protein  24.15 
 
 		 324 aa  52.8  0.000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.011365  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3566  hypothetical protein  24.1 
 
 		 330 aa  52.8  0.000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00357296  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5438  hypothetical protein  26.95 
 
 		 326 aa  53.1  0.000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4673  hypothetical protein  25.98 
 
 		 344 aa  53.1  0.000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3152  hypothetical protein  28.69 
 
 		 333 aa  52.8  0.000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.35228  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5015  hypothetical protein  24.67 
 
 		 324 aa  52.4  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.525082  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1913  hypothetical protein  25.62 
 
 		 333 aa  52  0.00001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0165718  hitchhiker  0.00808178 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0228  hypothetical protein  25.59 
 
 		 328 aa  52.8  0.00001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1213  hypothetical protein  25.52 
 
 		 325 aa  52.4  0.00001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.421726  normal  0.0620299 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1164  hypothetical protein  28.33 
 
 		 332 aa  52.8  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3496  hypothetical protein  24.9 
 
 		 327 aa  52  0.00001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.192421 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1691  hypothetical protein  26.07 
 
 		 330 aa  52  0.00001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0434  hypothetical protein  41.18 
 
 		 327 aa  52.4  0.00001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00000234827  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2931  hypothetical protein  25 
 
 		 317 aa  52.4  0.00001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.174254  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0478  hypothetical protein  24.31 
 
 		 325 aa  52.8  0.00001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.606939  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0038  hypothetical protein  26.59 
 
 		 332 aa  52.4  0.00001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.914226 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1842  twin-arginine translocation pathway signal  25.56 
 
 		 327 aa  52.4  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00400007  normal  0.117909 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1674  hypothetical protein  24.55 
 
 		 326 aa  52  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0696411  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5894  extra-cytoplasmic solute receptor  27.71 
 
 		 358 aa  51.6  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4970  hypothetical protein  25.8 
 
 		 321 aa  52  0.00002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3194  hypothetical protein  24.16 
 
 		 318 aa  52  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3163  hypothetical protein  26.34 
 
 		 334 aa  51.6  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000218374 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2776  hypothetical protein  28 
 
 		 332 aa  51.6  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.918758  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2138  hypothetical protein  27.31 
 
 		 331 aa  51.2  0.00002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.104945  decreased coverage  0.00594387 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0005  hypothetical protein  24.71 
 
 		 323 aa  50.8  0.00003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.736537 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3745  hypothetical protein  25.07 
 
 		 330 aa  51.2  0.00003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0812255  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3884  hypothetical protein  23.26 
 
 		 328 aa  50.8  0.00003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4068  hypothetical protein  26.8 
 
 		 315 aa  50.8  0.00003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4356  hypothetical protein  25.52 
 
 		 323 aa  51.2  0.00003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0579  hypothetical protein  25.84 
 
 		 330 aa  51.2  0.00003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2413  hypothetical protein  24.35 
 
 		 325 aa  51.2  0.00003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.325014  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2444  hypothetical protein  27 
 
 		 334 aa  50.8  0.00003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2399  hypothetical protein  21.89 
 
 		 323 aa  51.2  0.00003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0521  hypothetical protein  23.95 
 
 		 326 aa  51.2  0.00003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0895579  normal  0.13289 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4969  extra-cytoplasmic solute receptor  25.3 
 
 		 364 aa  51.2  0.00003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.332662  normal  0.322206 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0023  hypothetical protein  24.71 
 
 		 323 aa  50.8  0.00004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.908143  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1912  hypothetical protein  24.77 
 
 		 335 aa  50.4  0.00004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2429  hypothetical protein  28.29 
 
 		 326 aa  50.8  0.00004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1072  hypothetical protein  23.12 
 
 		 316 aa  50.4  0.00004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0296212  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3937  hypothetical protein  24.93 
 
 		 328 aa  50.4  0.00004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.178831  normal  0.0313351 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4416  hypothetical protein  21.86 
 
 		 327 aa  50.4  0.00004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7860  hypothetical protein  23.08 
 
 		 324 aa  50.8  0.00004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.266797 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3894  hypothetical protein  24.41 
 
 		 327 aa  50.4  0.00005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0367386  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4195  hypothetical protein  27.39 
 
 		 331 aa  50.1  0.00005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.776041 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0120  hypothetical protein  26.27 
 
 		 361 aa  50.4  0.00005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5370  extra-cytoplasmic solute receptor  27.59 
 
 		 322 aa  50.4  0.00005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.114035  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2597  hypothetical protein  22.63 
 
 		 331 aa  50.4  0.00005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0909173  normal  0.221055 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1427  twin-arginine translocation pathway signal  25 
 
 		 334 aa  50.4  0.00005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.195614 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5359  extra-cytoplasmic solute receptor  24.92 
 
 		 323 aa  50.1  0.00005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00868603  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3024  hypothetical protein  25.86 
 
 		 332 aa  50.1  0.00005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1719  hypothetical protein  23.99 
 
 		 327 aa  50.1  0.00006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0287751  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0552  hypothetical protein  23.55 
 
 		 332 aa  50.1  0.00006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3035  hypothetical protein  25.3 
 
 		 338 aa  50.1  0.00006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.208714  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0709  hypothetical protein  27.56 
 
 		 328 aa  49.7  0.00007  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.802476 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3854  hypothetical protein  25.42 
 
 		 325 aa  50.1  0.00007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1244  hypothetical protein  25 
 
 		 330 aa  49.7  0.00007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.275742  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>