107 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_2762 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008146  Mmcs_2762  membrane protein-like protein  100 
 
 		 648 aa  1250    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2806  membrane protein-like protein  100 
 
 		 649 aa  1250    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.580029 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2792  protein of unknown function DUF893, YccS/YhfK  100 
 
 		 649 aa  1250    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.86997  normal  0.522376 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3327  protein of unknown function DUF893, YccS/YhfK  45.11 
 
 		 671 aa  427  1e-118  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.60724  normal  0.042406 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3048  protein of unknown function DUF893, YccS/YhfK  49.43 
 
 		 672 aa  414  1e-114  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.300756  normal  0.21129 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1602  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  26.68 
 
 		 737 aa  94.7  5e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.517222  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1095  hypothetical protein  29.49 
 
 		 696 aa  80.9  0.00000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.534792  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2531  protein of unknown function DUF893, YccS/YhfK  26.67 
 
 		 740 aa  69.3  0.0000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3048  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  27.72 
 
 		 740 aa  62  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.532486 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2001  YccS/YhfK family integral membrane protein  31.71 
 
 		 756 aa  61.6  0.00000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0304152  hitchhiker  0.00152336 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1670  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  25.48 
 
 		 730 aa  61.6  0.00000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3202  hypothetical protein  34.91 
 
 		 712 aa  60.8  0.00000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000417121  normal  0.0366922 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2627  hypothetical protein  33.6 
 
 		 712 aa  60.8  0.00000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0163181  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2538  inner membrane protein YccS  34.91 
 
 		 712 aa  60.5  0.00000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000319105  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2375  integral membrane protein, YccS/YhfK family  31.1 
 
 		 727 aa  60.1  0.0000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0284  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  29.74 
 
 		 744 aa  60.1  0.0000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2888  YccS/YhfK family integral membrane protein  31.1 
 
 		 727 aa  59.3  0.0000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3032  hypothetical protein  28.42 
 
 		 770 aa  58.9  0.0000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0228594  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1757  hypothetical protein  31.06 
 
 		 711 aa  57.8  0.0000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00297692  hitchhiker  0.0000536927 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2166  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  23.98 
 
 		 719 aa  57.8  0.0000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0513514  normal  0.798484 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1212  hypothetical protein  31.63 
 
 		 731 aa  57.4  0.0000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.000149337  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4696  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  28.35 
 
 		 745 aa  56.6  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.427482 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1207  protein of unknown function DUF893, YccS/YhfK  36.62 
 
 		 688 aa  56.2  0.000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  decreased coverage  0.00411304  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0733  protein of unknown function DUF893, YccS/YhfK  25.69 
 
 		 764 aa  55.8  0.000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.525617  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1213  protein of unknown function DUF893, YccS/YhfK  25.69 
 
 		 764 aa  55.8  0.000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0139359  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1186  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  25.69 
 
 		 764 aa  55.5  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.310514  normal  0.518709 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2060  fusaric acid resistance protein region  31.69 
 
 		 635 aa  54.7  0.000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.065197  normal  0.166692 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3199  hypothetical protein  38 
 
 		 700 aa  54.3  0.000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.000232699  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2709  membrane protein-like protein  29.71 
 
 		 631 aa  54.3  0.000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.399622  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2694  hypothetical protein  30.25 
 
 		 721 aa  53.9  0.000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0657  hypothetical protein  26.37 
 
 		 725 aa  53.1  0.00001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1612  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  23.61 
 
 		 851 aa  53.1  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.719802  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4720  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  25.68 
 
 		 746 aa  53.1  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0171257  hitchhiker  0.00604484 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1772  hypothetical protein  27.59 
 
 		 758 aa  53.1  0.00002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0697846  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2840  AraE family aromatic acid exporter  24.31 
 
 		 883 aa  53.1  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.33409  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3187  hypothetical protein  26.35 
 
 		 790 aa  52.4  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1351  hypothetical protein  26.53 
 
 		 721 aa  52.8  0.00002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1187  hypothetical protein  27.59 
 
 		 758 aa  53.1  0.00002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.775183  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0683  hypothetical protein  27.59 
 
 		 758 aa  53.1  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0469  hypothetical protein  27.59 
 
 		 758 aa  53.1  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.646757  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5820  membrane protein-like protein  26.69 
 
 		 659 aa  52.4  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.202056  normal  0.271534 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0164  hypothetical protein  26.71 
 
 		 359 aa  52.8  0.00002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1518  hypothetical protein  26.9 
 
 		 758 aa  52  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1383  hypothetical protein  26.9 
 
 		 758 aa  52  0.00003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1387  hypothetical protein  26.9 
 
 		 758 aa  52  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2135  inner membrane protein  28.11 
 
 		 734 aa  52  0.00003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0318465  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2853  hypothetical protein  26.21 
 
 		 758 aa  51.6  0.00004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.229586  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1096  protein of unknown function DUF893, YccS/YhfK  25 
 
 		 763 aa  52  0.00004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1472  integral membrane protein, YccS/YhfK family protein  23.91 
 
 		 733 aa  51.6  0.00004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.872698 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1096  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  25 
 
 		 763 aa  52  0.00004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0524683  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4321  protein of unknown function DUF893, YccS/YhfK  25 
 
 		 763 aa  51.6  0.00005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2090  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  24.31 
 
 		 763 aa  51.2  0.00005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0338513  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2160  hypothetical protein  30.51 
 
 		 720 aa  51.2  0.00005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00328985  normal  0.533884 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1750  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  26.39 
 
 		 806 aa  51.6  0.00005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0916755  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2855  hypothetical protein  31.13 
 
 		 711 aa  51.6  0.00005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.0061473  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3131  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  29.05 
 
 		 738 aa  51.2  0.00006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.861685  normal  0.88928 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05920  hypothetical protein  26.56 
 
 		 733 aa  50.8  0.00007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.435767 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1182  hypothetical protein  28.68 
 
 		 717 aa  50.8  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.649657 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1136  hypothetical membrane protein  28.68 
 
 		 717 aa  50.8  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.61616  normal  0.960871 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2765  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  29.05 
 
 		 738 aa  51.2  0.00007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.617524 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2546  hypothetical protein  31.13 
 
 		 711 aa  50.8  0.00007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00487152  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000321  membrane protein  26.62 
 
 		 717 aa  50.8  0.00007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1114  hypothetical protein  28.68 
 
 		 717 aa  50.8  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.109888  hitchhiker  0.00000043653 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1148  hypothetical protein  28.68 
 
 		 717 aa  50.8  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00964  predicted inner membrane protein  29.66 
 
 		 717 aa  50.8  0.00009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000463684  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2683  hypothetical protein  29.66 
 
 		 720 aa  50.4  0.00009  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00493648  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5250  intergral membrane protein  29.51 
 
 		 727 aa  50.4  0.00009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3247  integral membrane protein, YccS/YhfK  33.33 
 
 		 733 aa  50.4  0.00009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1069  hypothetical protein  29.66 
 
 		 720 aa  50.4  0.00009  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000419542  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1074  hypothetical protein  29.66 
 
 		 720 aa  50.4  0.00009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000166924  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2636  hypothetical protein  29.66 
 
 		 720 aa  50.4  0.00009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0533993  hitchhiker  0.000000852874 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1031  hypothetical membrane protein  28.68 
 
 		 717 aa  50.8  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000967259  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1123  hypothetical protein  29.66 
 
 		 720 aa  50.4  0.00009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00725319  normal  0.391034 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00971  hypothetical protein  29.66 
 
 		 717 aa  50.8  0.00009  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000599042  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06123  hypothetical protein  23.33 
 
 		 717 aa  50.1  0.0001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0511  YccS/YhfK family integral membrane protein  35.8 
 
 		 727 aa  49.3  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.917341 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2356  hypothetical protein  28.81 
 
 		 720 aa  49.3  0.0002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0100238  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3344  hypothetical protein  33.11 
 
 		 632 aa  48.9  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000196875  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0555  hypothetical protein  26.04 
 
 		 733 aa  48.5  0.0003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5003  YccS/YhfK family integral membrane protein  33.71 
 
 		 727 aa  48.1  0.0004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.481214  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4954  integral membrane protein, YccS/YhfK family  33.71 
 
 		 727 aa  48.1  0.0005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4827  YccS/YhfK family integral membrane protein  33.71 
 
 		 727 aa  48.1  0.0005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.174  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0995  hypothetical protein  28.16 
 
 		 700 aa  47.8  0.0006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0470  YccS/YhfK family integral membrane protein  25.22 
 
 		 722 aa  47.4  0.0008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.393999  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0874  YccS/YhfK family integral membrane protein  28.16 
 
 		 700 aa  47.4  0.0008  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.866014  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5794  integral membrane protein, YccS/YhfK family  29.95 
 
 		 720 aa  47.4  0.0008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4581  YccS/YhfK family integral membrane protein  26.48 
 
 		 696 aa  47.4  0.0009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.271308  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1472  hypothetical protein  30.51 
 
 		 720 aa  46.6  0.001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000385386  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0473  membrane protein-like protein  29.07 
 
 		 764 aa  47  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.695599  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01106  hypothetical protein  30.49 
 
 		 680 aa  46.6  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05690  Integral membrane protein, YccS/YhfK family  30.16 
 
 		 724 aa  47  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2509  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  23.66 
 
 		 746 aa  47  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.000000000184796  normal  0.83989 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3465  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  32.37 
 
 		 660 aa  45.8  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.487354  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2703  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  25.32 
 
 		 708 aa  46.6  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.0000000297127  normal  0.375768 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3693  integral membrane protein, YccS/YhfK family  30.86 
 
 		 725 aa  45.8  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.427108 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1143  hypothetical protein  36.94 
 
 		 352 aa  46.2  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.602769  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3675  protein of unknown function DUF939  22.03 
 
 		 708 aa  45.8  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0097  hypothetical protein  26.51 
 
 		 347 aa  45.1  0.004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0146368  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1365  protein of unknown function DUF893, YccS/YhfK  27.98 
 
 		 744 aa  45.1  0.004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00298227 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3399  hypothetical protein  34.78 
 
 		 700 aa  44.3  0.006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.709327  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>