More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_1215 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008705  Mkms_1232  2-nitropropane dioxygenase, NPD  100 
 
 
295 aa  561  1.0000000000000001e-159  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.86313 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1215  2-nitropropane dioxygenase, NPD  100 
 
 
295 aa  561  1.0000000000000001e-159  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.58877  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1242  2-nitropropane dioxygenase, NPD  93.56 
 
 
295 aa  455  1e-127  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.488111 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5156  2-nitropropane dioxygenase, NPD  59.35 
 
 
317 aa  276  4e-73  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.707988  normal  0.110244 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4537  2-nitropropane dioxygenase, NPD  59.09 
 
 
318 aa  256  4e-67  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.262388  normal  0.792833 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4881  2-nitropropane dioxygenase NPD  44.9 
 
 
320 aa  167  2e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3068  2-nitropropane dioxygenase, NPD  42.04 
 
 
323 aa  163  3e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0899956  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2965  2-nitropropane dioxygenase NPD  37.24 
 
 
338 aa  158  9e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.752049  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3202  oxidoreductase, 2-nitropropane dioxygenase family  40.89 
 
 
323 aa  156  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.306208  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2787  2-nitropropane dioxygenase NPD  40.13 
 
 
331 aa  143  3e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4715  putative 2-nitropropane dioxygenase  37.42 
 
 
333 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10021  hypothetical protein  38.1 
 
 
322 aa  137  2e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8517  2-nitropropane dioxygenase NPD  36.72 
 
 
326 aa  136  4e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2074  2-nitropropane dioxygenase, NPD  33.33 
 
 
315 aa  135  7.000000000000001e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000655776  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3114  2-nitropropane dioxygenase NPD  34.93 
 
 
492 aa  133  3e-30  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3841  2-nitropropane dioxygenase, NPD  35.22 
 
 
506 aa  133  3e-30  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.278341  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1178  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase II  34.19 
 
 
316 aa  132  6e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000736816  hitchhiker  0.00901561 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0580  2-nitropropane dioxygenase NPD  34.56 
 
 
312 aa  128  1.0000000000000001e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1852  2-nitropropane dioxygenase-like protein  33.44 
 
 
317 aa  128  1.0000000000000001e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00272263  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7147  2-nitropropane dioxygenase, NPD  30.2 
 
 
360 aa  125  1e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0690438  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1358  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase II  29.84 
 
 
316 aa  125  1e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000252963  normal  0.0405419 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2452  2-nitropropane dioxygenase NPD  41.34 
 
 
345 aa  123  4e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3064  2-nitropropane dioxygenase NPD  34.24 
 
 
311 aa  121  9.999999999999999e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1779  2-nitropropane dioxygenase NPD  31.02 
 
 
377 aa  121  1.9999999999999998e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.883896  normal  0.0611887 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2942  2-nitropropane dioxygenase NPD  33.92 
 
 
350 aa  117  1.9999999999999998e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7097  2-nitropropane dioxygenase NPD  34.89 
 
 
366 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2091  2-nitropropane dioxygenase NPD  34.47 
 
 
362 aa  117  1.9999999999999998e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1908  2-nitropropane dioxygenase, NPD  34.43 
 
 
350 aa  117  1.9999999999999998e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.430969  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1549  2-nitropropane dioxygenase NPD  36.8 
 
 
366 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.486705  normal  0.142209 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1141  2-nitropropane dioxygenase, NPD  35.44 
 
 
338 aa  114  1.0000000000000001e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.487634  normal  0.166905 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0612  2-nitropropane dioxygenase NPD  28.39 
 
 
323 aa  114  2.0000000000000002e-24  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.000000694328  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0964  2-nitropropane dioxygenase NPD  31.58 
 
 
319 aa  114  3e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0729206  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1839  2-nitropropane dioxygenase NPD  33.44 
 
 
319 aa  113  3e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7089  2-nitropropane dioxygenase NPD  32.12 
 
 
329 aa  114  3e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0758  2-nitropropane dioxygenase NPD  30.96 
 
 
331 aa  113  4.0000000000000004e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3819  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase II  32.8 
 
 
315 aa  112  8.000000000000001e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000661973  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1318  2-nitropropane dioxygenase NPD  35.27 
 
 
354 aa  112  8.000000000000001e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6053  2-nitropropane dioxygenase NPD  37.25 
 
 
341 aa  112  9e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.146292 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1725  2-nitropropane dioxygenase, NPD  31.51 
 
 
313 aa  112  9e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000021316  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6745  2-nitropropane dioxygenase NPD  32.23 
 
 
367 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.566568 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2147  2-nitropropane dioxygenase NPD  30.75 
 
 
354 aa  111  1.0000000000000001e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3091  2-nitropropane dioxygenase NPD  33.55 
 
 
307 aa  110  3e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.171108 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0640  2-nitropropane dioxygenase, NPD  33.02 
 
 
316 aa  110  4.0000000000000004e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000697959  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5309  2-nitropropane dioxygenase NPD  29.74 
 
 
380 aa  109  5e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.1832 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3191  2-nitropropane dioxygenase NPD  36.39 
 
 
492 aa  109  7.000000000000001e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.269993 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0311  dioxygenase  28.43 
 
 
321 aa  108  7.000000000000001e-23  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2392  2-nitropropane dioxygenase NPD  36.07 
 
 
363 aa  108  1e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.895701 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3136  2-nitropropane dioxygenase, NPD  34.32 
 
 
351 aa  108  1e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.278577  normal  0.604759 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3082  2-nitropropane dioxygenase, NPD  33.59 
 
 
354 aa  108  1e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.926981  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1940  2-nitropropane dioxygenase, NPD  29.48 
 
 
348 aa  107  2e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0127053 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10270  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase II  32.19 
 
 
320 aa  106  5e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0212117  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3196  2-nitropropane dioxygenase NPD  33.58 
 
 
358 aa  106  6e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09580  hypothetical protein  35.05 
 
 
351 aa  105  6e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0896  hypothetical protein  34.48 
 
 
351 aa  105  8e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.467811  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0562  2-nitropropane dioxygenase, NPD  31.04 
 
 
378 aa  105  9e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000315665 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0207  2-nitropropane dioxygenase NPD  32.84 
 
 
356 aa  105  1e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1099  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase II  36.11 
 
 
326 aa  105  1e-21  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000664093  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2755  2-nitropropane dioxygenase, NPD  32.08 
 
 
359 aa  104  2e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0669905  normal  0.0255247 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5128  2-nitropropane dioxygenase, NPD  34.59 
 
 
376 aa  104  2e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.241888  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_38755  predicted protein  31.19 
 
 
343 aa  104  2e-21  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.172  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1435  2-nitropropane dioxygenase, NPD  40.89 
 
 
362 aa  103  3e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.212936  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1082  2-nitropropane dioxygenase NPD  37.88 
 
 
328 aa  103  3e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.707108  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0922  2-nitropropane dioxygenase, NPD  30.36 
 
 
319 aa  103  3e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0431  trans-2-enoyl-ACP reductase II  28.53 
 
 
321 aa  103  3e-21  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0279  2-nitropropane dioxygenase NPD  31.38 
 
 
357 aa  103  4e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3542  2-nitropropane dioxygenase NPD  33.96 
 
 
361 aa  103  4e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0130805 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4936  2-nitropropane dioxygenase, NPD  32.83 
 
 
492 aa  102  6e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.121654 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0271  2-nitropropane dioxygenase, NPD  32.65 
 
 
365 aa  102  8e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0346  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase II  33.04 
 
 
319 aa  102  9e-21  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.182837  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2459  2-nitropropane dioxygenase, NPD  32.26 
 
 
353 aa  101  1e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.36207 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6840  2-nitropropane dioxygenase NPD  32.2 
 
 
361 aa  102  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.437449  normal  0.0843125 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2774  2-nitropropane dioxygenase, NPD  33.97 
 
 
344 aa  101  1e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0462503 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3371  2-nitropropane dioxygenase, NPD  30.36 
 
 
354 aa  100  2e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.940632  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1416  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase II  35.35 
 
 
313 aa  100  3e-20  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.578712 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2972  oxidoreductase, 2-nitropropane dioxygenase family  32 
 
 
359 aa  100  3e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.24605  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1151  2-nitropropane dioxygenase NPD  37.74 
 
 
358 aa  100  3e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4414  2-nitropropane dioxygenase NPD  35.19 
 
 
321 aa  99.8  4e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3888  2-nitropropane dioxygenase NPD  30.71 
 
 
349 aa  99.8  4e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0126  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase II  33.63 
 
 
314 aa  99.8  5e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0317277  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0128  2-nitropropane dioxygenase, NPD  33.63 
 
 
314 aa  99.8  5e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0565011  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0188  2-nitropropane dioxygenase, NPD  33.62 
 
 
354 aa  99.4  6e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2656  2-nitropropane dioxygenase NPD  29.63 
 
 
352 aa  99  7e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0351221 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2940  2-nitropropane dioxygenase, NPD  30.3 
 
 
353 aa  99  8e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.917216  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0937  2-nitropropane dioxygenase NPD  27.61 
 
 
355 aa  99  8e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3672  2-nitropropane dioxygenase  36.99 
 
 
311 aa  99  8e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0919  2-nitropropane dioxygenase, NPD  27.61 
 
 
355 aa  99  8e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5586  2-nitropropane dioxygenase, NPD  37.21 
 
 
305 aa  98.6  1e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.658342  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2356  2-nitropropane dioxygenase NPD  34.26 
 
 
386 aa  97.1  3e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0726815 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3814  2-nitropropane dioxygenase NPD  30.36 
 
 
349 aa  97.1  3e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3013  2-nitropropane dioxygenase NPD  30.95 
 
 
324 aa  97.1  3e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.95223  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3501  2-nitropropane dioxygenase, NPD  36.64 
 
 
356 aa  97.4  3e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3732  2-nitropropane dioxygenase, NPD  30.95 
 
 
324 aa  97.1  3e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3992  2-nitropropane dioxygenase, NPD  29.14 
 
 
361 aa  97.1  3e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1176  2-nitropropane dioxygenase, NPD  36.26 
 
 
348 aa  97.1  4e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.829209  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4328  putative 2-nitropropane dioxygenase  35.29 
 
 
368 aa  96.7  4e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1075  2-nitropropane dioxygenase, NPD  26.88 
 
 
328 aa  96.7  4e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.192705  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4010  2-nitropropane dioxygenase NPD  29.39 
 
 
349 aa  96.7  5e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2858  2-nitropropane dioxygenase NPD  29.14 
 
 
316 aa  96.7  5e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4565  2-nitropropane dioxygenase NPD  33.09 
 
 
381 aa  96.7  5e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.190968 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1606  2-nitropropane dioxygenase, NPD  34.69 
 
 
366 aa  96.3  5e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.433617  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>