More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_5156 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_5156  2-nitropropane dioxygenase, NPD  100 
 
 
317 aa  608  1e-173  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.707988  normal  0.110244 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4537  2-nitropropane dioxygenase, NPD  65.08 
 
 
318 aa  328  6e-89  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.262388  normal  0.792833 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1242  2-nitropropane dioxygenase, NPD  58.06 
 
 
295 aa  266  2.9999999999999995e-70  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.488111 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1215  2-nitropropane dioxygenase, NPD  59.35 
 
 
295 aa  249  3e-65  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.58877  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1232  2-nitropropane dioxygenase, NPD  59.35 
 
 
295 aa  249  3e-65  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.86313 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3068  2-nitropropane dioxygenase, NPD  40.39 
 
 
323 aa  193  3e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0899956  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3202  oxidoreductase, 2-nitropropane dioxygenase family  39.09 
 
 
323 aa  188  9e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.306208  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4715  putative 2-nitropropane dioxygenase  40.32 
 
 
333 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2787  2-nitropropane dioxygenase NPD  44.95 
 
 
331 aa  172  1e-41  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10021  hypothetical protein  40.75 
 
 
322 aa  159  8e-38  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4881  2-nitropropane dioxygenase NPD  44.87 
 
 
320 aa  152  5.9999999999999996e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8517  2-nitropropane dioxygenase NPD  35.91 
 
 
326 aa  146  5e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2965  2-nitropropane dioxygenase NPD  34.49 
 
 
338 aa  138  1e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.752049  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0580  2-nitropropane dioxygenase NPD  35.25 
 
 
312 aa  126  5e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2074  2-nitropropane dioxygenase, NPD  30.53 
 
 
315 aa  126  6e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000655776  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3064  2-nitropropane dioxygenase NPD  34.59 
 
 
311 aa  125  8.000000000000001e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3841  2-nitropropane dioxygenase, NPD  35 
 
 
506 aa  125  1e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.278341  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1082  2-nitropropane dioxygenase NPD  40.19 
 
 
328 aa  125  1e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.707108  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3114  2-nitropropane dioxygenase NPD  34.81 
 
 
492 aa  123  4e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6053  2-nitropropane dioxygenase NPD  34.17 
 
 
341 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.146292 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1358  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase II  30.19 
 
 
316 aa  119  4.9999999999999996e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000252963  normal  0.0405419 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2452  2-nitropropane dioxygenase NPD  40.47 
 
 
345 aa  118  9.999999999999999e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2480  2-nitropropane dioxygenase, NPD  36.16 
 
 
288 aa  117  1.9999999999999998e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.459764  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1178  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase II  31.55 
 
 
316 aa  116  3.9999999999999997e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000736816  hitchhiker  0.00901561 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7147  2-nitropropane dioxygenase, NPD  30.25 
 
 
360 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0690438  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0922  2-nitropropane dioxygenase, NPD  33.49 
 
 
319 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4936  2-nitropropane dioxygenase, NPD  35.05 
 
 
492 aa  114  3e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.121654 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0758  2-nitropropane dioxygenase NPD  30.06 
 
 
331 aa  114  3e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3191  2-nitropropane dioxygenase NPD  37.12 
 
 
492 aa  113  5e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.269993 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7097  2-nitropropane dioxygenase NPD  32.65 
 
 
366 aa  112  6e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1483  2-nitropropane dioxygenase, NPD  30.25 
 
 
335 aa  111  1.0000000000000001e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3819  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase II  30.65 
 
 
315 aa  111  2.0000000000000002e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000661973  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3672  2-nitropropane dioxygenase  32.04 
 
 
311 aa  109  5e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1852  2-nitropropane dioxygenase-like protein  30.38 
 
 
317 aa  109  7.000000000000001e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00272263  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5586  2-nitropropane dioxygenase, NPD  31.96 
 
 
305 aa  108  9.000000000000001e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.658342  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1549  2-nitropropane dioxygenase NPD  34.22 
 
 
366 aa  108  1e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.486705  normal  0.142209 
 
 
-
 
NC_002950  PG1416  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase II  31.01 
 
 
313 aa  108  2e-22  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.578712 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0206  2-nitropropane dioxygenase, NPD  34.91 
 
 
348 aa  107  2e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4414  2-nitropropane dioxygenase NPD  34.35 
 
 
321 aa  107  3e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_38755  predicted protein  29.34 
 
 
343 aa  106  5e-22  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.172  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0612  2-nitropropane dioxygenase NPD  29.45 
 
 
323 aa  106  5e-22  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.000000694328  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1222  2-nitropropane dioxygenase, NPD  31.27 
 
 
305 aa  106  6e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.925622 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2147  2-nitropropane dioxygenase NPD  30.85 
 
 
354 aa  105  7e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1141  2-nitropropane dioxygenase, NPD  34.56 
 
 
338 aa  105  1e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.487634  normal  0.166905 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3136  2-nitropropane dioxygenase, NPD  32.44 
 
 
351 aa  102  1e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.278577  normal  0.604759 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3542  2-nitropropane dioxygenase NPD  32.45 
 
 
361 aa  101  1e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0130805 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0937  2-nitropropane dioxygenase NPD  27.21 
 
 
355 aa  101  2e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1435  2-nitropropane dioxygenase, NPD  36.97 
 
 
362 aa  101  2e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.212936  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0919  2-nitropropane dioxygenase, NPD  27.21 
 
 
355 aa  101  2e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0311  dioxygenase  33.33 
 
 
321 aa  101  2e-20  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7089  2-nitropropane dioxygenase NPD  32.52 
 
 
329 aa  100  3e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1725  2-nitropropane dioxygenase, NPD  29.38 
 
 
313 aa  99.8  6e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000021316  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1779  2-nitropropane dioxygenase NPD  34.36 
 
 
377 aa  98.6  1e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.883896  normal  0.0611887 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00985  putative dioxygenase  28.57 
 
 
314 aa  98.6  1e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5309  2-nitropropane dioxygenase NPD  30.13 
 
 
380 aa  97.8  2e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.1832 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0133  2-nitropropane dioxygenase NPD  31.82 
 
 
352 aa  97.8  2e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.899957  normal  0.134277 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8522  2-nitropropane dioxygenase NPD  34.48 
 
 
351 aa  97.1  3e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3976  2-nitropropane dioxygenase, NPD  31.25 
 
 
341 aa  96.7  5e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.753497  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1839  2-nitropropane dioxygenase NPD  32.05 
 
 
319 aa  96.7  5e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5269  2-nitropropane dioxygenase, NPD  31.87 
 
 
356 aa  96.3  6e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.353912 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2392  2-nitropropane dioxygenase NPD  33.33 
 
 
363 aa  96.3  7e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.895701 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1487  2-nitropropane dioxygenase, NPD  31.87 
 
 
356 aa  96.3  7e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1318  2-nitropropane dioxygenase NPD  33.45 
 
 
354 aa  95.9  8e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1908  2-nitropropane dioxygenase, NPD  31.5 
 
 
350 aa  95.1  1e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.430969  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1290  2-nitropropane dioxygenase NPD  28.23 
 
 
378 aa  95.1  1e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.62886  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1989  2-nitropropane dioxygenase NPD  32.81 
 
 
325 aa  95.1  1e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.563999 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1477  hypothetical protein  36.13 
 
 
370 aa  95.5  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.801801 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0562  2-nitropropane dioxygenase, NPD  31.5 
 
 
378 aa  95.1  1e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000315665 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0964  2-nitropropane dioxygenase NPD  28.85 
 
 
319 aa  94.7  2e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0729206  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7295  2-nitropropane dioxygenase NPD  30.39 
 
 
311 aa  94.7  2e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0640  2-nitropropane dioxygenase, NPD  31.03 
 
 
316 aa  94.7  2e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000697959  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3196  2-nitropropane dioxygenase NPD  30.94 
 
 
358 aa  94.4  2e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0279  2-nitropropane dioxygenase NPD  34.26 
 
 
357 aa  94.4  2e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2091  2-nitropropane dioxygenase NPD  30.3 
 
 
362 aa  94.7  2e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0271  2-nitropropane dioxygenase, NPD  33.33 
 
 
365 aa  94.4  2e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2459  2-nitropropane dioxygenase, NPD  30.66 
 
 
353 aa  94.7  2e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.36207 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1419  nitropropane dioxygenase  28.87 
 
 
363 aa  94.7  2e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3574  2-nitropropane dioxygenase, NPD  28.96 
 
 
331 aa  95.1  2e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000129826  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0896  hypothetical protein  34.44 
 
 
351 aa  94  3e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.467811  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2942  2-nitropropane dioxygenase NPD  31.03 
 
 
350 aa  94  3e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0946  2-nitropropane dioxygenase, NPD  34.98 
 
 
313 aa  94.4  3e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00349563  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6745  2-nitropropane dioxygenase NPD  29.74 
 
 
367 aa  94  3e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.566568 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09580  hypothetical protein  33.47 
 
 
351 aa  94.4  3e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1257  2-nitropropane dioxygenase (nitroalkane oxidase)  26.12 
 
 
364 aa  93.6  4e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3082  2-nitropropane dioxygenase, NPD  30.3 
 
 
354 aa  93.2  5e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.926981  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0128  2-nitropropane dioxygenase, NPD  28.04 
 
 
314 aa  92.8  6e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0565011  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0126  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase II  28.04 
 
 
314 aa  92.8  6e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0317277  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1457  2-nitropropane dioxygenase  25.84 
 
 
365 aa  92.4  8e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.907571 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1255  2-nitropropane dioxygenase (nitroalkane oxidase)  25.84 
 
 
364 aa  91.7  1e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3924  nitropropane dioxygenase  28.18 
 
 
363 aa  92  1e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5071  2-nitropropane dioxygenase, NPD  30.4 
 
 
356 aa  91.3  2e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.615847  normal  0.587247 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1283  2-nitropropane dioxygenase  25.56 
 
 
364 aa  91.3  2e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1099  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase II  29.9 
 
 
326 aa  91.3  2e-17  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000664093  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1554  2-nitropropane dioxygenase, NPD  28.97 
 
 
324 aa  91.3  2e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.510846  normal  0.493902 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1385  2-nitropropane dioxygenase  25.56 
 
 
364 aa  91.3  2e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0744  2-nitropropane dioxygenase, NPD  29.94 
 
 
354 aa  90.9  2e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.620911  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2356  2-nitropropane dioxygenase NPD  34.45 
 
 
386 aa  91.7  2e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0726815 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6840  2-nitropropane dioxygenase NPD  30.3 
 
 
361 aa  91.7  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.437449  normal  0.0843125 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4686  2-nitropropane dioxygenase, NPD  30.4 
 
 
356 aa  91.3  2e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.989955  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2988  2-nitropropane dioxygenase family oxidoreductase  32.67 
 
 
383 aa  90.9  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.132342  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>