243 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_3472 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008576  Mmc1_3472  hypothetical protein  100 
 
 		 234 aa  461  1e-129  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.31473  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1784  hypothetical protein  35.87 
 
 		 226 aa  113  3e-24  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0363  hypothetical protein  35.24 
 
 		 234 aa  106  4e-22  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.000375584  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3403  protein of unknown function UPF0005  37.61 
 
 		 221 aa  97.4  1e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1506  conserved hypothetical integral membrane protein (UPF0005 domain protein)  33.91 
 
 		 233 aa  97.4  2e-19  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.874501  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1630  hypothetical protein  33.49 
 
 		 223 aa  94.7  1e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.068558  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0234  hypothetical protein  31.98 
 
 		 231 aa  93.2  3e-18  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1782  hypothetical protein  37.88 
 
 		 218 aa  93.2  3e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.104064  normal  0.0481152 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2115  ribonuclease 3 (ribonuclease III) (RNase III)  32.24 
 
 		 236 aa  92.4  6e-18  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0489  hypothetical protein  36.11 
 
 		 221 aa  91.3  1e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2350  hypothetical protein  35.86 
 
 		 222 aa  90.5  2e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0554095  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0287  hypothetical protein  32.43 
 
 		 231 aa  90.9  2e-17  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0261  hypothetical protein  32.43 
 
 		 231 aa  90.9  2e-17  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28110  hypothetical protein  36.55 
 
 		 223 aa  89.4  5e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1441  protein of unknown function UPF0005  32.09 
 
 		 230 aa  88.6  8e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0811132  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1764  hypothetical protein  32.09 
 
 		 230 aa  88.6  8e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.241262  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1726  hypothetical protein  30.93 
 
 		 238 aa  88.6  8e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.327418 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1973  hypothetical protein  34.53 
 
 		 219 aa  87.8  1e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000288339  normal  0.569668 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0337  putative ferric receptor CfrA  32.73 
 
 		 232 aa  88.2  1e-16  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.284951  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1194  hypothetical protein  34.12 
 
 		 219 aa  87  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1126  hypothetical protein  34.12 
 
 		 219 aa  87  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  3.21152e-22 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1160  hypothetical protein  34.12 
 
 		 219 aa  87  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.572482  normal  0.332109 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1148  hypothetical protein  34.12 
 
 		 219 aa  87  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.466231  normal  0.361481 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1043  hypothetical protein  34.12 
 
 		 219 aa  87  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.598631  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0971  hypothetical protein  35 
 
 		 223 aa  86.3  3e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000000502235  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2003  hypothetical protein  34.53 
 
 		 219 aa  86.3  3e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.026814  hitchhiker  0.000326951 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2060  hypothetical protein  34.53 
 
 		 219 aa  86.3  3e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00317153  hitchhiker  0.0000338815 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00974  inner membrane protein  33.53 
 
 		 219 aa  85.9  4e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0511489  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2345  hypothetical protein  33.53 
 
 		 219 aa  85.9  4e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0311475  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00981  hypothetical protein  33.53 
 
 		 219 aa  85.9  4e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0860489  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2673  protein of unknown function UPF0005  33.53 
 
 		 219 aa  85.9  5e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000665712  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1078  hypothetical protein  33.53 
 
 		 219 aa  85.9  5e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000486786  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2148  hypothetical protein  33.53 
 
 		 219 aa  85.9  5e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0598762  normal  0.366892 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1518  hypothetical protein  34.07 
 
 		 233 aa  85.9  5e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.884646  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2626  hypothetical protein  33.53 
 
 		 219 aa  85.9  5e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0636098  hitchhiker  0.0000185004 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1084  hypothetical protein  33.53 
 
 		 219 aa  85.9  5e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000421704  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1135  hypothetical protein  33.53 
 
 		 219 aa  85.1  8e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.53324  normal  0.675558 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2201  protein of unknown function UPF0005  34.08 
 
 		 219 aa  85.1  9e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000000806989  normal  0.147893 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2473  hypothetical protein  34.23 
 
 		 219 aa  84.3  0.000000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.0000529364  hitchhiker  0.00138122 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2375  hypothetical protein  34.85 
 
 		 219 aa  84  0.000000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3333  hypothetical protein  33.5 
 
 		 223 aa  84  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.722624  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3164  hypothetical protein  33.5 
 
 		 223 aa  84  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.30239 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0466  protein of unknown function UPF0005  38.24 
 
 		 221 aa  84  0.000000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1809  hypothetical protein  35.35 
 
 		 219 aa  84  0.000000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000000000169879  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1482  hypothetical protein  31.19 
 
 		 245 aa  84  0.000000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00851236  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2166  hypothetical protein  33.78 
 
 		 219 aa  84  0.000000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000000169017  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3990  hypothetical protein  35.03 
 
 		 223 aa  83.2  0.000000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0132572 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2001  hypothetical protein  34.34 
 
 		 219 aa  83.2  0.000000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.000000000304908  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1842  hypothetical protein  35.03 
 
 		 223 aa  83.2  0.000000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0016223 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2313  hypothetical protein  33.63 
 
 		 219 aa  83.6  0.000000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000688522  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3596  hypothetical protein  35.03 
 
 		 223 aa  83.2  0.000000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.351056 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2205  hypothetical protein  33.63 
 
 		 219 aa  83.6  0.000000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000000321186  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003413  putative TEGT family carrier/transport protein  38.73 
 
 		 220 aa  83.2  0.000000000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000444328  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2014  hypothetical protein  35.68 
 
 		 219 aa  82.4  0.000000000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000147608  hitchhiker  0.00304334 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2537  hypothetical protein  37.59 
 
 		 219 aa  81.6  0.000000000000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0345189  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0330  integral membrane protein  36.36 
 
 		 220 aa  82  0.000000000000008  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.00000000128049  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3395  hypothetical protein  32.99 
 
 		 223 aa  81.3  0.00000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.912483  normal  0.775889 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2487  hypothetical protein  34.52 
 
 		 223 aa  81.3  0.00000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0234713  normal  0.383043 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2846  hypothetical protein  37.59 
 
 		 219 aa  81.3  0.00000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.0018864  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2270  protein of unknown function UPF0005  37.7 
 
 		 235 aa  81.6  0.00000000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2111  hypothetical protein  34.8 
 
 		 220 aa  81.3  0.00000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.0000565103  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1221  protein of unknown function UPF0005  39.01 
 
 		 219 aa  80.9  0.00000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2686  protein of unknown function UPF0005  35.38 
 
 		 219 aa  80.5  0.00000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2053  inner membrane protein  37.32 
 
 		 220 aa  80.5  0.00000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0952289  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2601  membrane protein, putaive  31.86 
 
 		 233 aa  79.3  0.00000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0232013  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2136  hypothetical protein  34.52 
 
 		 219 aa  79  0.00000000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0452556  normal  0.017863 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1767  hypothetical protein  36.23 
 
 		 219 aa  79  0.00000000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.000000691139  hitchhiker  0.00190191 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02365  hypothetical protein  37.32 
 
 		 220 aa  78.6  0.00000000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1927  hypothetical protein  34.11 
 
 		 222 aa  78.2  0.00000000000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.199344  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30410  hypothetical protein  34.08 
 
 		 222 aa  77.8  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2604  hypothetical protein  34.08 
 
 		 222 aa  77  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.50496  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2376  hypothetical protein  36.11 
 
 		 222 aa  77  0.0000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.128059  normal  0.023918 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2451  hypothetical protein  31.22 
 
 		 222 aa  77  0.0000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00000005036  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0772  hypothetical protein  32.46 
 
 		 233 aa  76.6  0.0000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.768217  normal  0.283665 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2918  hypothetical protein  30.88 
 
 		 236 aa  76.3  0.0000000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.117943  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2832  hypothetical protein  30.88 
 
 		 236 aa  76.3  0.0000000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.448865  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1438  hypothetical protein  30.41 
 
 		 236 aa  74.7  0.000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1804  hypothetical protein  37.25 
 
 		 219 aa  73.6  0.000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.372462  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1654  hypothetical protein  39.22 
 
 		 222 aa  72.8  0.000000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.000000000318402  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0896  protein of unknown function UPF0005  34.27 
 
 		 229 aa  71.6  0.000000000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.723604 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1390  hypothetical protein  37.5 
 
 		 256 aa  71.2  0.00000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.330784 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1308  hypothetical protein  35.75 
 
 		 225 aa  70.5  0.00000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2215  hypothetical protein  27.6 
 
 		 231 aa  70.9  0.00000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  unclonable  0.000000153024  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG04050  vacuole protein, putative  26.61 
 
 		 283 aa  68.2  0.0000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.701829  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1011  hypothetical protein  34.69 
 
 		 224 aa  67.4  0.0000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0978  hypothetical protein  34.69 
 
 		 224 aa  67.4  0.0000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3246  hypothetical protein  30.59 
 
 		 217 aa  67.8  0.0000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  0.0000000289843  hitchhiker  0.0000576794 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2427  protein of unknown function UPF0005  32.02 
 
 		 236 aa  66.2  0.0000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1913  hypothetical protein  36.07 
 
 		 259 aa  65.9  0.0000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.841584  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2134  protein of unknown function UPF0005  31.36 
 
 		 235 aa  65.5  0.0000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.00000000183428  normal  0.170874 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0738  protein of unknown function UPF0005  30.09 
 
 		 234 aa  65.5  0.0000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.0000107382  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3734  protein of unknown function UPF0005  27.57 
 
 		 242 aa  65.1  0.0000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2947  protein of unknown function UPF0005  27.88 
 
 		 235 aa  65.1  0.0000000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0842  inner membrane protein YbhL  32.03 
 
 		 234 aa  64.7  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2543  protein of unknown function UPF0005  36.72 
 
 		 255 aa  64.3  0.000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.516916  normal  0.0807809 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3076  hypothetical protein  34.71 
 
 		 245 aa  64.7  0.000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0901  inner membrane protein YbhL  32.03 
 
 		 234 aa  64.7  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0956  inner membrane protein YbhL  32.03 
 
 		 234 aa  64.7  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4482  protein of unknown function UPF0005  30.51 
 
 		 236 aa  64.3  0.000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.295121  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1391  hypothetical protein  34.69 
 
 		 226 aa  64.7  0.000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>