245 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_2350 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_2350  hypothetical protein  100 
 
 		 222 aa  432  1e-120  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0554095  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2451  hypothetical protein  64.86 
 
 		 222 aa  290  2e-77  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00000005036  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2200  hypothetical protein  62.79 
 
 		 219 aa  267  8.999999999999999e-71  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.581022  normal  0.150789 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2111  hypothetical protein  54.79 
 
 		 220 aa  241  5e-63  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.0000565103  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3403  protein of unknown function UPF0005  56.31 
 
 		 221 aa  240  2e-62  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2014  hypothetical protein  56.34 
 
 		 219 aa  239  2.9999999999999997e-62  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000147608  hitchhiker  0.00304334 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2201  protein of unknown function UPF0005  55.87 
 
 		 219 aa  237  1e-61  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000000806989  normal  0.147893 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2313  hypothetical protein  55.4 
 
 		 219 aa  236  2e-61  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000688522  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0489  hypothetical protein  56.13 
 
 		 221 aa  236  2e-61  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2205  hypothetical protein  55.4 
 
 		 219 aa  236  2e-61  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000000321186  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1973  hypothetical protein  55.45 
 
 		 219 aa  236  2e-61  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000288339  normal  0.569668 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2136  hypothetical protein  54.34 
 
 		 219 aa  236  2e-61  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0452556  normal  0.017863 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2473  hypothetical protein  53.42 
 
 		 219 aa  235  3e-61  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.0000529364  hitchhiker  0.00138122 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2060  hypothetical protein  55 
 
 		 219 aa  234  7e-61  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00317153  hitchhiker  0.0000338815 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2001  hypothetical protein  55.4 
 
 		 219 aa  234  8e-61  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.000000000304908  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2166  hypothetical protein  54.93 
 
 		 219 aa  234  8e-61  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000000169017  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2003  hypothetical protein  55 
 
 		 219 aa  234  1.0000000000000001e-60  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.026814  hitchhiker  0.000326951 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2375  hypothetical protein  55 
 
 		 219 aa  233  2.0000000000000002e-60  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1809  hypothetical protein  56.94 
 
 		 219 aa  233  2.0000000000000002e-60  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000000000169879  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1804  hypothetical protein  57.89 
 
 		 219 aa  231  5e-60  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.372462  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0466  protein of unknown function UPF0005  55.3 
 
 		 221 aa  228  5e-59  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1782  hypothetical protein  55.19 
 
 		 218 aa  224  9e-58  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.104064  normal  0.0481152 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1630  hypothetical protein  54.98 
 
 		 223 aa  223  1e-57  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.068558  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0971  hypothetical protein  54.26 
 
 		 223 aa  217  1e-55  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000000502235  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2537  hypothetical protein  54.88 
 
 		 219 aa  216  2.9999999999999998e-55  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0345189  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2846  hypothetical protein  53.95 
 
 		 219 aa  214  9.999999999999999e-55  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.0018864  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1654  hypothetical protein  54.5 
 
 		 222 aa  213  2.9999999999999995e-54  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.000000000318402  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1482  hypothetical protein  54.42 
 
 		 245 aa  211  5.999999999999999e-54  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00851236  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2673  protein of unknown function UPF0005  52.56 
 
 		 219 aa  209  2e-53  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000665712  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2626  hypothetical protein  52.56 
 
 		 219 aa  209  2e-53  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0636098  hitchhiker  0.0000185004 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1078  hypothetical protein  52.56 
 
 		 219 aa  209  2e-53  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000486786  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2148  hypothetical protein  52.56 
 
 		 219 aa  209  2e-53  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0598762  normal  0.366892 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1084  hypothetical protein  52.56 
 
 		 219 aa  209  2e-53  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000421704  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1135  hypothetical protein  52.56 
 
 		 219 aa  209  3e-53  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.53324  normal  0.675558 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2345  hypothetical protein  52.09 
 
 		 219 aa  209  3e-53  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0311475  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00974  inner membrane protein  52.56 
 
 		 219 aa  209  4e-53  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0511489  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00981  hypothetical protein  52.56 
 
 		 219 aa  209  4e-53  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0860489  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1148  hypothetical protein  55.88 
 
 		 219 aa  206  2e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.466231  normal  0.361481 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1194  hypothetical protein  55.88 
 
 		 219 aa  206  2e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1126  hypothetical protein  55.88 
 
 		 219 aa  206  2e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  3.21152e-22 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1160  hypothetical protein  55.88 
 
 		 219 aa  206  2e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.572482  normal  0.332109 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1043  hypothetical protein  55.88 
 
 		 219 aa  206  2e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.598631  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1011  hypothetical protein  49.1 
 
 		 224 aa  205  4e-52  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0978  hypothetical protein  49.1 
 
 		 224 aa  205  4e-52  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1221  protein of unknown function UPF0005  52.56 
 
 		 219 aa  205  4e-52  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1618  integral membrane protein  53.49 
 
 		 217 aa  204  7e-52  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.0000000000000193362  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1927  hypothetical protein  51.12 
 
 		 222 aa  204  8e-52  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.199344  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0896  protein of unknown function UPF0005  52.56 
 
 		 229 aa  202  2e-51  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.723604 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2686  protein of unknown function UPF0005  52.09 
 
 		 219 aa  202  3e-51  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1767  hypothetical protein  54.04 
 
 		 219 aa  198  6e-50  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.000000691139  hitchhiker  0.00190191 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2053  inner membrane protein  47.06 
 
 		 220 aa  197  1.0000000000000001e-49  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0952289  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3246  hypothetical protein  51.43 
 
 		 217 aa  196  2.0000000000000003e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  0.0000000289843  hitchhiker  0.0000576794 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2487  hypothetical protein  45.7 
 
 		 223 aa  193  2e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0234713  normal  0.383043 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28110  hypothetical protein  47.42 
 
 		 223 aa  192  2e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2376  hypothetical protein  46.85 
 
 		 222 aa  192  4e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.128059  normal  0.023918 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3333  hypothetical protein  45.7 
 
 		 223 aa  191  7e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.722624  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3164  hypothetical protein  45.7 
 
 		 223 aa  191  7e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.30239 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3990  hypothetical protein  46.61 
 
 		 223 aa  191  9e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0132572 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1842  hypothetical protein  46.61 
 
 		 223 aa  191  9e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0016223 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3596  hypothetical protein  46.61 
 
 		 223 aa  191  9e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.351056 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3395  hypothetical protein  46.15 
 
 		 223 aa  190  2e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.912483  normal  0.775889 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30410  hypothetical protein  45.95 
 
 		 222 aa  190  2e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1726  hypothetical protein  47.42 
 
 		 238 aa  190  2e-47  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.327418 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1308  hypothetical protein  52.11 
 
 		 225 aa  188  4e-47  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003413  putative TEGT family carrier/transport protein  48.65 
 
 		 220 aa  189  4e-47  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000444328  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2604  hypothetical protein  45.5 
 
 		 222 aa  188  5.999999999999999e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.50496  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02365  hypothetical protein  48.2 
 
 		 220 aa  185  5e-46  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0330  integral membrane protein  47.3 
 
 		 220 aa  180  2e-44  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.00000000128049  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1424  hypothetical protein  43.24 
 
 		 232 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.170635  normal  0.0981664 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0852  hypothetical protein  44.1 
 
 		 230 aa  172  3.9999999999999995e-42  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000920073  hitchhiker  0.0000816273 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1590  hypothetical protein  43.3 
 
 		 232 aa  172  3.9999999999999995e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.70175 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2545  protein of unknown function UPF0005  43.3 
 
 		 232 aa  172  5e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0069764  hitchhiker  0.00953127 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1459  hypothetical protein  42.79 
 
 		 232 aa  171  6.999999999999999e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.372489  normal  0.378234 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1754  hypothetical protein  42.99 
 
 		 232 aa  171  7.999999999999999e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1727  hypothetical protein  42.99 
 
 		 232 aa  171  7.999999999999999e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.593403  normal  0.215205 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6263  hypothetical protein  42.99 
 
 		 232 aa  171  1e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1840  hypothetical protein  42.99 
 
 		 232 aa  171  1e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.339326 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1816  hypothetical protein  42.99 
 
 		 232 aa  171  1e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.152452  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1391  hypothetical protein  50.24 
 
 		 226 aa  169  2e-41  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5117  hypothetical protein  42.53 
 
 		 232 aa  168  6e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0409876  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2232  hypothetical protein  43.13 
 
 		 232 aa  167  2e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2359  hypothetical protein  43.13 
 
 		 232 aa  167  2e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.372177  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2230  hypothetical protein  43.13 
 
 		 232 aa  167  2e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1518  hypothetical protein  47.47 
 
 		 233 aa  166  2e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.884646  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2194  hypothetical protein  43.13 
 
 		 232 aa  167  2e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.259485  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1349  hypothetical protein  43.13 
 
 		 232 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1111  hypothetical protein  43.13 
 
 		 232 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1839  hypothetical protein  43.13 
 
 		 232 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.780096  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0058  hypothetical protein  43.13 
 
 		 232 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.143946  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2091  hypothetical protein  42.73 
 
 		 233 aa  164  6.9999999999999995e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2215  hypothetical protein  42.13 
 
 		 231 aa  163  2.0000000000000002e-39  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  unclonable  0.000000153024  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1257  hypothetical protein  43.72 
 
 		 231 aa  161  7e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0923659 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2111  hypothetical protein  42.79 
 
 		 235 aa  160  1e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.312383  normal  0.217151 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2825  hypothetical protein  42.61 
 
 		 231 aa  159  3e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1202  carrier/transport protein  48.29 
 
 		 222 aa  159  4e-38  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0661  protein of unknown function UPF0005  43.3 
 
 		 233 aa  159  5e-38  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  decreased coverage  0.00649456  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1210  hypothetical protein  39.91 
 
 		 233 aa  156  2e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3056  hypothetical protein  41.92 
 
 		 229 aa  156  2e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1054  protein of unknown function UPF0005  39.64 
 
 		 233 aa  153  2e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.698213  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1294  hypothetical protein  42.48 
 
 		 233 aa  153  2e-36  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000365925  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>