257 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr7_2003 on replicon NC_008322
Organism: Shewanella sp. MR-7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008322  Shewmr7_2003  hypothetical protein  100 
 
 		 219 aa  424  1e-118  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.026814  hitchhiker  0.000326951 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2060  hypothetical protein  99.54 
 
 		 219 aa  422  1e-117  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00317153  hitchhiker  0.0000338815 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1973  hypothetical protein  99.09 
 
 		 219 aa  419  1e-116  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000288339  normal  0.569668 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2375  hypothetical protein  97.26 
 
 		 219 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2205  hypothetical protein  91.78 
 
 		 219 aa  402  1e-111  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000000321186  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2201  protein of unknown function UPF0005  91.78 
 
 		 219 aa  401  1e-111  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000000806989  normal  0.147893 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2313  hypothetical protein  91.78 
 
 		 219 aa  402  1e-111  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000688522  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2001  hypothetical protein  91.78 
 
 		 219 aa  399  9.999999999999999e-111  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.000000000304908  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2166  hypothetical protein  91.32 
 
 		 219 aa  399  9.999999999999999e-111  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000000169017  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1809  hypothetical protein  82.65 
 
 		 219 aa  365  1e-100  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000000000169879  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2473  hypothetical protein  79.45 
 
 		 219 aa  363  2e-99  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.0000529364  hitchhiker  0.00138122 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2014  hypothetical protein  80.37 
 
 		 219 aa  362  2e-99  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000147608  hitchhiker  0.00304334 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2136  hypothetical protein  78.08 
 
 		 219 aa  358  4e-98  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0452556  normal  0.017863 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2111  hypothetical protein  79.91 
 
 		 220 aa  356  1.9999999999999998e-97  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.0000565103  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1804  hypothetical protein  79 
 
 		 219 aa  328  3e-89  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.372462  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1782  hypothetical protein  74.43 
 
 		 218 aa  325  5e-88  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.104064  normal  0.0481152 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2451  hypothetical protein  56.31 
 
 		 222 aa  244  6.999999999999999e-64  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00000005036  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2350  hypothetical protein  55 
 
 		 222 aa  234  1.0000000000000001e-60  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0554095  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0971  hypothetical protein  56.94 
 
 		 223 aa  225  5.0000000000000005e-58  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000000502235  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2200  hypothetical protein  58.82 
 
 		 219 aa  219  1.9999999999999999e-56  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.581022  normal  0.150789 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3403  protein of unknown function UPF0005  47.93 
 
 		 221 aa  190  2e-47  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0466  protein of unknown function UPF0005  46.12 
 
 		 221 aa  187  1e-46  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0489  hypothetical protein  47.69 
 
 		 221 aa  183  2.0000000000000003e-45  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28110  hypothetical protein  46.05 
 
 		 223 aa  170  2e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3246  hypothetical protein  49.75 
 
 		 217 aa  169  3e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  0.0000000289843  hitchhiker  0.0000576794 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2376  hypothetical protein  47.17 
 
 		 222 aa  166  2e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.128059  normal  0.023918 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1630  hypothetical protein  43.05 
 
 		 223 aa  166  2e-40  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.068558  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1927  hypothetical protein  45.63 
 
 		 222 aa  164  1.0000000000000001e-39  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.199344  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30410  hypothetical protein  44.95 
 
 		 222 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1654  hypothetical protein  49.08 
 
 		 222 aa  162  3e-39  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.000000000318402  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2604  hypothetical protein  44.95 
 
 		 222 aa  162  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.50496  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2686  protein of unknown function UPF0005  45.93 
 
 		 219 aa  157  1e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1482  hypothetical protein  46.92 
 
 		 245 aa  157  2e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00851236  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1011  hypothetical protein  44.5 
 
 		 224 aa  155  4e-37  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0978  hypothetical protein  44.5 
 
 		 224 aa  155  4e-37  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1391  hypothetical protein  45.71 
 
 		 226 aa  155  5.0000000000000005e-37  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2345  hypothetical protein  45.97 
 
 		 219 aa  154  7e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0311475  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2673  protein of unknown function UPF0005  45.5 
 
 		 219 aa  154  1e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000665712  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1135  hypothetical protein  45.5 
 
 		 219 aa  154  1e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.53324  normal  0.675558 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2626  hypothetical protein  45.5 
 
 		 219 aa  154  1e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0636098  hitchhiker  0.0000185004 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1084  hypothetical protein  45.5 
 
 		 219 aa  154  1e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000421704  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2148  hypothetical protein  45.5 
 
 		 219 aa  154  1e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0598762  normal  0.366892 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1078  hypothetical protein  45.5 
 
 		 219 aa  154  1e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000486786  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1221  protein of unknown function UPF0005  44.98 
 
 		 219 aa  154  1e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00974  inner membrane protein  46.12 
 
 		 219 aa  153  2e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0511489  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3990  hypothetical protein  45.15 
 
 		 223 aa  153  2e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0132572 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2487  hypothetical protein  43.87 
 
 		 223 aa  153  2e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0234713  normal  0.383043 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1842  hypothetical protein  45.15 
 
 		 223 aa  153  2e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0016223 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2053  inner membrane protein  42.38 
 
 		 220 aa  153  2e-36  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0952289  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00981  hypothetical protein  46.12 
 
 		 219 aa  153  2e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0860489  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3596  hypothetical protein  45.15 
 
 		 223 aa  153  2e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.351056 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1308  hypothetical protein  45 
 
 		 225 aa  152  2.9999999999999998e-36  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2846  hypothetical protein  41.51 
 
 		 219 aa  151  7e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.0018864  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3395  hypothetical protein  44.66 
 
 		 223 aa  151  8.999999999999999e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.912483  normal  0.775889 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1194  hypothetical protein  45.63 
 
 		 219 aa  150  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1043  hypothetical protein  45.63 
 
 		 219 aa  150  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.598631  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1148  hypothetical protein  45.63 
 
 		 219 aa  150  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.466231  normal  0.361481 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1126  hypothetical protein  45.63 
 
 		 219 aa  150  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  3.21152e-22 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1160  hypothetical protein  45.63 
 
 		 219 aa  150  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.572482  normal  0.332109 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1767  hypothetical protein  44.33 
 
 		 219 aa  149  3e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.000000691139  hitchhiker  0.00190191 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1726  hypothetical protein  41.15 
 
 		 238 aa  149  3e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.327418 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2537  hypothetical protein  40.57 
 
 		 219 aa  148  5e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0345189  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1618  integral membrane protein  42.92 
 
 		 217 aa  148  5e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.0000000000000193362  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3333  hypothetical protein  42.86 
 
 		 223 aa  148  7e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.722624  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3164  hypothetical protein  42.86 
 
 		 223 aa  148  7e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.30239 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0330  integral membrane protein  43.87 
 
 		 220 aa  147  9e-35  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.00000000128049  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02365  hypothetical protein  39.62 
 
 		 220 aa  145  5e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0896  protein of unknown function UPF0005  43.75 
 
 		 229 aa  144  7.0000000000000006e-34  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.723604 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003413  putative TEGT family carrier/transport protein  39.07 
 
 		 220 aa  144  1e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000444328  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1518  hypothetical protein  42.92 
 
 		 233 aa  143  2e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.884646  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1202  carrier/transport protein  45.88 
 
 		 222 aa  142  3e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2776  hypothetical protein  38.53 
 
 		 231 aa  140  9.999999999999999e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3056  hypothetical protein  38.84 
 
 		 229 aa  140  1.9999999999999998e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2573  hypothetical protein  36.89 
 
 		 230 aa  134  9.999999999999999e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.0057629  decreased coverage  0.000137367 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2215  hypothetical protein  41.79 
 
 		 231 aa  133  3e-30  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  unclonable  0.000000153024  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4627  hypothetical protein  38.6 
 
 		 230 aa  132  3e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000408248 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1727  hypothetical protein  38.57 
 
 		 232 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.593403  normal  0.215205 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1754  hypothetical protein  38.57 
 
 		 232 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1459  hypothetical protein  38.57 
 
 		 232 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.372489  normal  0.378234 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1802  protein of unknown function UPF0005  36.24 
 
 		 233 aa  131  1.0000000000000001e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.525736  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1840  hypothetical protein  38.57 
 
 		 232 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.339326 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1590  hypothetical protein  37.33 
 
 		 232 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.70175 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6263  hypothetical protein  38.57 
 
 		 232 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2545  protein of unknown function UPF0005  37.33 
 
 		 232 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0069764  hitchhiker  0.00953127 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1816  hypothetical protein  38.57 
 
 		 232 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.152452  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1424  hypothetical protein  37.21 
 
 		 232 aa  128  9.000000000000001e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.170635  normal  0.0981664 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5117  hypothetical protein  37.67 
 
 		 232 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0409876  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2359  hypothetical protein  37.67 
 
 		 232 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.372177  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2230  hypothetical protein  37.67 
 
 		 232 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2232  hypothetical protein  37.67 
 
 		 232 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2194  hypothetical protein  37.67 
 
 		 232 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.259485  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1349  hypothetical protein  37.67 
 
 		 232 aa  125  5e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1111  hypothetical protein  37.67 
 
 		 232 aa  125  5e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1839  hypothetical protein  37.67 
 
 		 232 aa  125  5e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.780096  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0058  hypothetical protein  37.67 
 
 		 232 aa  125  5e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.143946  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2825  hypothetical protein  38.67 
 
 		 231 aa  124  8.000000000000001e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1437  protein of unknown function UPF0005  36.28 
 
 		 230 aa  124  1e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2411  hypothetical protein  36.28 
 
 		 230 aa  124  1e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.411936  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3316  hypothetical protein  34.42 
 
 		 230 aa  122  3e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.2042  normal  0.782956 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3069  hypothetical protein  35.53 
 
 		 231 aa  122  6e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0838324  normal  0.177428 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>