262 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHAB381_0363 on replicon NC_009714
Organism: Campylobacter hominis ATCC BAA-381



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009714  CHAB381_0363  hypothetical protein  100 
 
 		 234 aa  456  1e-127  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.000375584  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1784  hypothetical protein  58.8 
 
 		 226 aa  253  2.0000000000000002e-66  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2115  ribonuclease 3 (ribonuclease III) (RNase III)  48.13 
 
 		 236 aa  206  2e-52  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0234  hypothetical protein  49.17 
 
 		 231 aa  201  6e-51  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0287  hypothetical protein  48.35 
 
 		 231 aa  199  3e-50  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0261  hypothetical protein  48.35 
 
 		 231 aa  199  3e-50  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0337  putative ferric receptor CfrA  47.92 
 
 		 232 aa  198  7e-50  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.284951  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1506  conserved hypothetical integral membrane protein (UPF0005 domain protein)  48.55 
 
 		 233 aa  196  3e-49  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.874501  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2270  protein of unknown function UPF0005  43.57 
 
 		 235 aa  160  2e-38  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2054  hypothetical protein  38.68 
 
 		 232 aa  155  5.0000000000000005e-37  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.213667  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1764  hypothetical protein  37 
 
 		 230 aa  128  9.000000000000001e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.241262  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1441  protein of unknown function UPF0005  37 
 
 		 230 aa  128  9.000000000000001e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0811132  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0971  hypothetical protein  41.43 
 
 		 223 aa  123  3e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000000502235  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003413  putative TEGT family carrier/transport protein  39.25 
 
 		 220 aa  120  1.9999999999999998e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000444328  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3403  protein of unknown function UPF0005  40.76 
 
 		 221 aa  119  3.9999999999999996e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1782  hypothetical protein  40.72 
 
 		 218 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.104064  normal  0.0481152 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02365  hypothetical protein  37.85 
 
 		 220 aa  115  6e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2545  protein of unknown function UPF0005  33.77 
 
 		 232 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0069764  hitchhiker  0.00953127 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5117  hypothetical protein  32.77 
 
 		 232 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0409876  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1590  hypothetical protein  33.77 
 
 		 232 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.70175 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2451  hypothetical protein  39.51 
 
 		 222 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00000005036  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1727  hypothetical protein  33.19 
 
 		 232 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.593403  normal  0.215205 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1754  hypothetical protein  33.19 
 
 		 232 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1459  hypothetical protein  33.62 
 
 		 232 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.372489  normal  0.378234 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2053  inner membrane protein  34.22 
 
 		 220 aa  114  1.0000000000000001e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0952289  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1840  hypothetical protein  33.62 
 
 		 232 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.339326 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6263  hypothetical protein  33.62 
 
 		 232 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1816  hypothetical protein  33.62 
 
 		 232 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.152452  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2626  hypothetical protein  35.41 
 
 		 219 aa  110  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0636098  hitchhiker  0.0000185004 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00974  inner membrane protein  35.41 
 
 		 219 aa  110  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0511489  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2673  protein of unknown function UPF0005  35.41 
 
 		 219 aa  110  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000665712  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2350  hypothetical protein  37.44 
 
 		 222 aa  110  2.0000000000000002e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0554095  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1084  hypothetical protein  35.41 
 
 		 219 aa  110  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000421704  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2359  hypothetical protein  33.18 
 
 		 232 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.372177  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1078  hypothetical protein  35.41 
 
 		 219 aa  110  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000486786  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2230  hypothetical protein  33.18 
 
 		 232 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2148  hypothetical protein  35.41 
 
 		 219 aa  110  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0598762  normal  0.366892 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2232  hypothetical protein  33.18 
 
 		 232 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2194  hypothetical protein  33.18 
 
 		 232 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.259485  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00981  hypothetical protein  35.41 
 
 		 219 aa  110  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0860489  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2345  hypothetical protein  34.93 
 
 		 219 aa  109  3e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0311475  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1630  hypothetical protein  38.65 
 
 		 223 aa  109  3e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.068558  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1424  hypothetical protein  32.61 
 
 		 232 aa  110  3e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.170635  normal  0.0981664 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1111  hypothetical protein  33.18 
 
 		 232 aa  109  5e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1349  hypothetical protein  33.18 
 
 		 232 aa  109  5e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0058  hypothetical protein  33.18 
 
 		 232 aa  109  5e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.143946  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1839  hypothetical protein  33.18 
 
 		 232 aa  109  5e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.780096  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1135  hypothetical protein  35.41 
 
 		 219 aa  108  6e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.53324  normal  0.675558 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1146  protein of unknown function UPF0005  36.09 
 
 		 233 aa  108  6e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.39216  normal  0.517284 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0489  hypothetical protein  37.73 
 
 		 221 aa  108  7.000000000000001e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1148  hypothetical protein  34.93 
 
 		 219 aa  108  9.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.466231  normal  0.361481 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1126  hypothetical protein  34.93 
 
 		 219 aa  108  9.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  3.21152e-22 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1043  hypothetical protein  34.93 
 
 		 219 aa  108  9.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.598631  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1160  hypothetical protein  34.93 
 
 		 219 aa  108  9.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.572482  normal  0.332109 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1194  hypothetical protein  34.93 
 
 		 219 aa  108  9.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1054  protein of unknown function UPF0005  35.65 
 
 		 233 aa  107  1e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.698213  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3333  hypothetical protein  39.35 
 
 		 223 aa  107  2e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.722624  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3164  hypothetical protein  39.35 
 
 		 223 aa  107  2e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.30239 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1482  hypothetical protein  36.69 
 
 		 245 aa  106  3e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00851236  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3990  hypothetical protein  36.52 
 
 		 223 aa  106  3e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0132572 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3596  hypothetical protein  36.52 
 
 		 223 aa  106  3e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.351056 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1842  hypothetical protein  36.52 
 
 		 223 aa  106  3e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0016223 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2166  hypothetical protein  35.24 
 
 		 219 aa  106  3e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000000169017  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3472  hypothetical protein  35.24 
 
 		 234 aa  106  3e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.31473  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1804  hypothetical protein  38.54 
 
 		 219 aa  106  4e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.372462  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0330  integral membrane protein  35.05 
 
 		 220 aa  105  5e-22  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.00000000128049  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2091  hypothetical protein  34.04 
 
 		 233 aa  105  6e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3395  hypothetical protein  35.22 
 
 		 223 aa  105  6e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.912483  normal  0.775889 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2313  hypothetical protein  35.24 
 
 		 219 aa  105  8e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000688522  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2205  hypothetical protein  35.24 
 
 		 219 aa  105  8e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000000321186  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2111  hypothetical protein  34.22 
 
 		 220 aa  105  8e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.0000565103  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2375  hypothetical protein  35.71 
 
 		 219 aa  104  1e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0896  protein of unknown function UPF0005  33.78 
 
 		 229 aa  104  1e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.723604 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2111  hypothetical protein  35.44 
 
 		 235 aa  104  1e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.312383  normal  0.217151 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2487  hypothetical protein  34.6 
 
 		 223 aa  103  2e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0234713  normal  0.383043 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1973  hypothetical protein  35.71 
 
 		 219 aa  104  2e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000288339  normal  0.569668 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2201  protein of unknown function UPF0005  34.76 
 
 		 219 aa  103  2e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000000806989  normal  0.147893 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1257  hypothetical protein  31.49 
 
 		 231 aa  103  2e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0923659 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2001  hypothetical protein  34.29 
 
 		 219 aa  103  3e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.000000000304908  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2003  hypothetical protein  35.71 
 
 		 219 aa  103  3e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.026814  hitchhiker  0.000326951 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2060  hypothetical protein  35.71 
 
 		 219 aa  103  3e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00317153  hitchhiker  0.0000338815 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2215  hypothetical protein  35.18 
 
 		 231 aa  102  6e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  unclonable  0.000000153024  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0466  protein of unknown function UPF0005  36.23 
 
 		 221 aa  100  2e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1518  hypothetical protein  36.55 
 
 		 233 aa  100  2e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.884646  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1809  hypothetical protein  34.48 
 
 		 219 aa  99.8  3e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000000000169879  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30410  hypothetical protein  36 
 
 		 222 aa  99.8  3e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2846  hypothetical protein  36.23 
 
 		 219 aa  100  3e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.0018864  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1210  hypothetical protein  33.48 
 
 		 233 aa  99  5e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0661  protein of unknown function UPF0005  32.24 
 
 		 233 aa  97.8  1e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  decreased coverage  0.00649456  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2537  hypothetical protein  35.75 
 
 		 219 aa  97.8  1e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0345189  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2604  hypothetical protein  35.56 
 
 		 222 aa  98.2  1e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.50496  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2136  hypothetical protein  35.61 
 
 		 219 aa  97.4  2e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0452556  normal  0.017863 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28110  hypothetical protein  35.22 
 
 		 223 aa  97.4  2e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1011  hypothetical protein  33.48 
 
 		 224 aa  96.7  3e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0978  hypothetical protein  33.48 
 
 		 224 aa  96.7  3e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1294  hypothetical protein  31.78 
 
 		 233 aa  96.7  3e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000365925  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2376  hypothetical protein  33.76 
 
 		 222 aa  96.3  4e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.128059  normal  0.023918 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2014  hypothetical protein  35.96 
 
 		 219 aa  95.5  6e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000147608  hitchhiker  0.00304334 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2473  hypothetical protein  34.15 
 
 		 219 aa  95.5  7e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.0000529364  hitchhiker  0.00138122 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0852  hypothetical protein  30.09 
 
 		 230 aa  95.1  8e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000920073  hitchhiker  0.0000816273 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>