259 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_1506 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012039  Cla_1506  conserved hypothetical integral membrane protein (UPF0005 domain protein)  100 
 
 		 233 aa  458  9.999999999999999e-129  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.874501  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0287  hypothetical protein  84.55 
 
 		 231 aa  389  1e-107  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0261  hypothetical protein  84.55 
 
 		 231 aa  389  1e-107  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0234  hypothetical protein  83.26 
 
 		 231 aa  386  1e-106  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2115  ribonuclease 3 (ribonuclease III) (RNase III)  69.96 
 
 		 236 aa  314  7e-85  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0337  putative ferric receptor CfrA  67.97 
 
 		 232 aa  303  1.0000000000000001e-81  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.284951  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1784  hypothetical protein  57.69 
 
 		 226 aa  246  2e-64  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2270  protein of unknown function UPF0005  63.87 
 
 		 235 aa  232  3e-60  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2054  hypothetical protein  47.44 
 
 		 232 aa  201  7e-51  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.213667  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0363  hypothetical protein  48.13 
 
 		 234 aa  187  9e-47  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.000375584  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1424  hypothetical protein  36.06 
 
 		 232 aa  121  8e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.170635  normal  0.0981664 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2350  hypothetical protein  37.17 
 
 		 222 aa  119  6e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0554095  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0852  hypothetical protein  36.71 
 
 		 230 aa  119  6e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000920073  hitchhiker  0.0000816273 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1590  hypothetical protein  33.33 
 
 		 232 aa  118  9e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.70175 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2545  protein of unknown function UPF0005  33.33 
 
 		 232 aa  118  9e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0069764  hitchhiker  0.00953127 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1441  protein of unknown function UPF0005  36 
 
 		 230 aa  117  1.9999999999999998e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0811132  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1764  hypothetical protein  36 
 
 		 230 aa  117  1.9999999999999998e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.241262  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1054  protein of unknown function UPF0005  34.3 
 
 		 233 aa  116  1.9999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.698213  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1146  protein of unknown function UPF0005  33.82 
 
 		 233 aa  116  3.9999999999999997e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.39216  normal  0.517284 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2194  hypothetical protein  34.62 
 
 		 232 aa  115  5e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.259485  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2232  hypothetical protein  34.62 
 
 		 232 aa  115  5e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2359  hypothetical protein  34.62 
 
 		 232 aa  115  5e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.372177  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2230  hypothetical protein  34.62 
 
 		 232 aa  115  5e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1459  hypothetical protein  35.58 
 
 		 232 aa  115  6.9999999999999995e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.372489  normal  0.378234 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2825  hypothetical protein  36.89 
 
 		 231 aa  115  6.9999999999999995e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0971  hypothetical protein  41.36 
 
 		 223 aa  115  7.999999999999999e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000000502235  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1349  hypothetical protein  34.62 
 
 		 232 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5117  hypothetical protein  34.13 
 
 		 232 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0409876  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1754  hypothetical protein  35.1 
 
 		 232 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1111  hypothetical protein  34.62 
 
 		 232 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1727  hypothetical protein  35.1 
 
 		 232 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.593403  normal  0.215205 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1839  hypothetical protein  34.62 
 
 		 232 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.780096  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0058  hypothetical protein  34.62 
 
 		 232 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.143946  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6263  hypothetical protein  35.1 
 
 		 232 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1816  hypothetical protein  35.1 
 
 		 232 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.152452  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1840  hypothetical protein  35.1 
 
 		 232 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.339326 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1210  hypothetical protein  33.82 
 
 		 233 aa  110  1.0000000000000001e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2091  hypothetical protein  35.1 
 
 		 233 aa  110  3e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0896  protein of unknown function UPF0005  35.81 
 
 		 229 aa  107  2e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.723604 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1630  hypothetical protein  35.65 
 
 		 223 aa  107  2e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.068558  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1809  hypothetical protein  40.14 
 
 		 219 aa  106  3e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000000000169879  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3403  protein of unknown function UPF0005  43.87 
 
 		 221 aa  106  3e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1257  hypothetical protein  34.13 
 
 		 231 aa  106  4e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0923659 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2111  hypothetical protein  33.66 
 
 		 235 aa  105  5e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.312383  normal  0.217151 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1782  hypothetical protein  35.84 
 
 		 218 aa  105  6e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.104064  normal  0.0481152 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1804  hypothetical protein  34.29 
 
 		 219 aa  104  1e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.372462  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2375  hypothetical protein  39.46 
 
 		 219 aa  103  3e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4627  hypothetical protein  34.27 
 
 		 230 aa  102  5e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000408248 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2166  hypothetical protein  38.78 
 
 		 219 aa  101  1e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000000169017  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2201  protein of unknown function UPF0005  37.58 
 
 		 219 aa  100  2e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000000806989  normal  0.147893 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2215  hypothetical protein  33.79 
 
 		 231 aa  100  2e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  unclonable  0.000000153024  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1973  hypothetical protein  38.78 
 
 		 219 aa  100  2e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000288339  normal  0.569668 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2003  hypothetical protein  38.78 
 
 		 219 aa  100  2e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.026814  hitchhiker  0.000326951 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2313  hypothetical protein  38.78 
 
 		 219 aa  100  2e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000688522  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2001  hypothetical protein  38.1 
 
 		 219 aa  100  2e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.000000000304908  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2205  hypothetical protein  38.78 
 
 		 219 aa  100  2e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000000321186  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3316  hypothetical protein  33.02 
 
 		 230 aa  100  2e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.2042  normal  0.782956 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1437  protein of unknown function UPF0005  34.43 
 
 		 230 aa  100  3e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2060  hypothetical protein  38.78 
 
 		 219 aa  100  3e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00317153  hitchhiker  0.0000338815 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2411  hypothetical protein  34.43 
 
 		 230 aa  100  3e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.411936  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2487  hypothetical protein  33.48 
 
 		 223 aa  99.4  4e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0234713  normal  0.383043 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0489  hypothetical protein  36.63 
 
 		 221 aa  99.4  5e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28110  hypothetical protein  35.58 
 
 		 223 aa  99  5e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3056  hypothetical protein  33.33 
 
 		 229 aa  98.6  7e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2451  hypothetical protein  40.79 
 
 		 222 aa  98.6  7e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00000005036  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30410  hypothetical protein  36.28 
 
 		 222 aa  98.6  7e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2518  protein of unknown function UPF0005  36.05 
 
 		 236 aa  98.6  7e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0945287  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG04050  vacuole protein, putative  33.89 
 
 		 283 aa  98.6  8e-20  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.701829  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2604  hypothetical protein  36.73 
 
 		 222 aa  98.6  8e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.50496  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3990  hypothetical protein  32.6 
 
 		 223 aa  97.4  2e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0132572 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3596  hypothetical protein  32.6 
 
 		 223 aa  97.4  2e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.351056 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0661  protein of unknown function UPF0005  32.18 
 
 		 233 aa  97.4  2e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  decreased coverage  0.00649456  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3333  hypothetical protein  33.92 
 
 		 223 aa  97.1  2e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.722624  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3164  hypothetical protein  33.92 
 
 		 223 aa  97.1  2e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.30239 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1842  hypothetical protein  32.6 
 
 		 223 aa  97.4  2e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0016223 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2427  protein of unknown function UPF0005  34.66 
 
 		 236 aa  97.1  2e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2111  hypothetical protein  34.78 
 
 		 220 aa  97.4  2e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.0000565103  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1802  protein of unknown function UPF0005  33.66 
 
 		 233 aa  97.4  2e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.525736  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2136  hypothetical protein  38.1 
 
 		 219 aa  97.1  2e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0452556  normal  0.017863 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3472  hypothetical protein  33.91 
 
 		 234 aa  97.4  2e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.31473  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1518  hypothetical protein  39.43 
 
 		 233 aa  97.1  2e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.884646  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2473  hypothetical protein  36.73 
 
 		 219 aa  96.7  3e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.0000529364  hitchhiker  0.00138122 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1294  hypothetical protein  31.68 
 
 		 233 aa  96.3  3e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000365925  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2601  membrane protein, putaive  35.16 
 
 		 233 aa  96.3  3e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0232013  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2573  hypothetical protein  32.51 
 
 		 230 aa  96.7  3e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.0057629  decreased coverage  0.000137367 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2134  protein of unknown function UPF0005  31.2 
 
 		 235 aa  95.5  6e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.00000000183428  normal  0.170874 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2014  hypothetical protein  38.1 
 
 		 219 aa  95.5  6e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000147608  hitchhiker  0.00304334 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3395  hypothetical protein  32.16 
 
 		 223 aa  95.1  8e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.912483  normal  0.775889 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2376  hypothetical protein  33.92 
 
 		 222 aa  94.4  1e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.128059  normal  0.023918 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0296  integral membrane protein, interacts with FtsH  35.65 
 
 		 229 aa  94.7  1e-18  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2776  hypothetical protein  33.33 
 
 		 231 aa  94  2e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1390  hypothetical protein  33.46 
 
 		 256 aa  93.2  3e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.330784 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4182  hypothetical protein  35.06 
 
 		 256 aa  92.8  4e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.253743  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1173  protein of unknown function UPF0005  34.88 
 
 		 240 aa  92.4  5e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00047203  normal  0.359337 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2947  protein of unknown function UPF0005  33.19 
 
 		 235 aa  92  6e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1726  hypothetical protein  36.88 
 
 		 238 aa  92  7e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.327418 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_84906  predicted protein  33.18 
 
 		 252 aa  92  7e-18  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.521244  normal  0.814262 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1724  hypothetical protein  36.81 
 
 		 235 aa  91.7  8e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000390624  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1517  hypothetical protein  33.63 
 
 		 235 aa  91.7  1e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1912  protein of unknown function UPF0005  38.75 
 
 		 261 aa  91.7  1e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.224132 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>