260 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_1390 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008686  Pden_1390  hypothetical protein  100 
 
 		 256 aa  506  9.999999999999999e-143  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.330784 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0671  hypothetical protein  66.92 
 
 		 246 aa  328  7e-89  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.435313  decreased coverage  0.00362929 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1889  hypothetical protein  65.77 
 
 		 246 aa  325  3e-88  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1913  hypothetical protein  66.15 
 
 		 259 aa  326  3e-88  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.841584  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0536  hypothetical protein  65.77 
 
 		 246 aa  325  3e-88  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2779  hypothetical protein  57.2 
 
 		 240 aa  285  4e-76  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.196634  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3353  hypothetical protein  56.81 
 
 		 248 aa  266  2e-70  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4057  protein of unknown function UPF0005  58.82 
 
 		 242 aa  260  1e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2043  hypothetical protein  53.23 
 
 		 261 aa  256  2e-67  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.28558  normal  0.977268 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0100  hypothetical protein  54.96 
 
 		 260 aa  255  4e-67  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.179512  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3734  protein of unknown function UPF0005  58.4 
 
 		 242 aa  254  7e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3076  hypothetical protein  53.91 
 
 		 245 aa  254  9e-67  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0001  hypothetical protein  52.9 
 
 		 257 aa  250  2e-65  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1395  hypothetical protein  55.17 
 
 		 252 aa  248  5e-65  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.681625  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0088  hypothetical protein  52.69 
 
 		 245 aa  247  1e-64  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.695225  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4182  hypothetical protein  50.78 
 
 		 256 aa  247  2e-64  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.253743  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5468  hypothetical protein  53.33 
 
 		 274 aa  245  4e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.328597 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0086  hypothetical protein  52.31 
 
 		 245 aa  245  6e-64  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1779  protein of unknown function UPF0005  53.15 
 
 		 274 aa  244  6.999999999999999e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1019  hypothetical protein  51.38 
 
 		 256 aa  237  1e-61  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.219255  normal  0.241296 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0386  putative transport protein  52.19 
 
 		 263 aa  231  7.000000000000001e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.631786 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0413  hypothetical protein  54.1 
 
 		 263 aa  229  2e-59  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.229598  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0200  hypothetical protein  52.12 
 
 		 271 aa  230  2e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2225  protein of unknown function UPF0005  51.41 
 
 		 255 aa  230  2e-59  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0352825 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1228  hypothetical protein  50.57 
 
 		 252 aa  229  3e-59  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.181817  normal  0.877697 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2543  protein of unknown function UPF0005  50.6 
 
 		 255 aa  229  5e-59  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.516916  normal  0.0807809 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0287  hypothetical protein  53.17 
 
 		 263 aa  228  7e-59  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0137467 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0529  hypothetical protein  52.78 
 
 		 263 aa  228  8e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0551  hypothetical protein  52.81 
 
 		 271 aa  226  2e-58  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6013  protein of unknown function UPF0005  50.78 
 
 		 236 aa  226  3e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0713321 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7161  protein of unknown function UPF0005  49.8 
 
 		 236 aa  219  5e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.147509  normal  0.897358 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4550  hypothetical protein  50 
 
 		 236 aa  217  2e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00145642 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6220  hypothetical protein  46.69 
 
 		 238 aa  216  2.9999999999999998e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.107819  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1912  protein of unknown function UPF0005  50.62 
 
 		 261 aa  214  9.999999999999999e-55  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.224132 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0813  hypothetical protein  52.23 
 
 		 242 aa  212  3.9999999999999995e-54  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0875239  hitchhiker  0.00101032 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0849  hypothetical protein  50.78 
 
 		 242 aa  210  2e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.890327  normal  0.272287 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0050  putative membrane proetin  42.97 
 
 		 251 aa  208  7e-53  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0443  hypothetical protein  47.31 
 
 		 256 aa  208  8e-53  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4482  protein of unknown function UPF0005  47.97 
 
 		 236 aa  207  2e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.295121  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1143  hypothetical protein  46.1 
 
 		 247 aa  206  4e-52  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2268  hypothetical protein  50.79 
 
 		 294 aa  199  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.476385 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0828  hypothetical protein  50 
 
 		 256 aa  198  6e-50  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.273109 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3093  integral membrane protein  45.78 
 
 		 237 aa  192  3e-48  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.718082  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3820  hypothetical protein  45.78 
 
 		 237 aa  192  3e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.562696  normal  0.246565 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3673  hypothetical protein  46.59 
 
 		 236 aa  190  2e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.915645 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1325  hypothetical protein  46.18 
 
 		 236 aa  189  4e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.891235  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2947  protein of unknown function UPF0005  45.38 
 
 		 235 aa  189  4e-47  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3558  hypothetical protein  44.71 
 
 		 250 aa  189  4e-47  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.487101  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2832  hypothetical protein  45.38 
 
 		 236 aa  188  7e-47  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.448865  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2918  hypothetical protein  45.38 
 
 		 236 aa  188  7e-47  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.117943  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6925  hypothetical protein  44.14 
 
 		 239 aa  188  9e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1517  hypothetical protein  44.58 
 
 		 235 aa  187  1e-46  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1438  hypothetical protein  44.98 
 
 		 236 aa  186  3e-46  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2518  protein of unknown function UPF0005  44.58 
 
 		 236 aa  185  5e-46  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0945287  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0260  protein of unknown function UPF0005  42.41 
 
 		 259 aa  181  8.000000000000001e-45  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0529527  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0937  hypothetical protein  40.62 
 
 		 234 aa  179  2.9999999999999997e-44  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  hitchhiker  0.0000000419647  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0956  inner membrane protein YbhL  44.92 
 
 		 234 aa  179  4e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0870  membrane protein  44.92 
 
 		 234 aa  179  4e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.484875  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0901  inner membrane protein YbhL  44.92 
 
 		 234 aa  179  4e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0842  inner membrane protein YbhL  44.92 
 
 		 234 aa  179  4e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1278  hypothetical protein  44.49 
 
 		 235 aa  176  3e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.278652  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00753  predicted inner membrane protein  44.3 
 
 		 234 aa  173  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0840  hypothetical protein  44.3 
 
 		 234 aa  173  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2856  protein of unknown function UPF0005  44.3 
 
 		 234 aa  173  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2566  hypothetical protein  44.3 
 
 		 234 aa  173  1.9999999999999998e-42  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.155048  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0933  hypothetical protein  44.44 
 
 		 237 aa  174  1.9999999999999998e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2857  hypothetical protein  44.3 
 
 		 234 aa  173  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00496163 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00770  hypothetical protein  44.3 
 
 		 234 aa  173  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0849  hypothetical protein  44.3 
 
 		 234 aa  173  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.709016  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2427  protein of unknown function UPF0005  42.86 
 
 		 236 aa  173  1.9999999999999998e-42  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0809  hypothetical protein  44.3 
 
 		 234 aa  174  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.00257878  normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3668  hypothetical protein  43.57 
 
 		 244 aa  172  2.9999999999999996e-42  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.16725  hitchhiker  0.0000130091 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0934  hypothetical protein  43.88 
 
 		 234 aa  171  1e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0009  hypothetical protein  36.72 
 
 		 233 aa  169  3e-41  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  unclonable  0.0000179437  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0129  hypothetical protein  44.4 
 
 		 241 aa  169  5e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.576127 
 
 
-
 
NC_002978  WD0950  hypothetical protein  40.32 
 
 		 240 aa  167  2e-40  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.816971  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1173  protein of unknown function UPF0005  39.13 
 
 		 240 aa  166  4e-40  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00047203  normal  0.359337 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2081  protein of unknown function UPF0005  41.3 
 
 		 224 aa  165  5e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.0430200000000002e-29 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0772  hypothetical protein  41.5 
 
 		 233 aa  165  6.9999999999999995e-40  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.768217  normal  0.283665 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2135  protein of unknown function UPF0005  40.89 
 
 		 224 aa  163  2.0000000000000002e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.000000126881  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0927  protein of unknown function UPF0005  42.17 
 
 		 235 aa  162  3e-39  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.441127 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0549  hypothetical protein  40.6 
 
 		 232 aa  162  7e-39  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.235256  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0738  protein of unknown function UPF0005  41.77 
 
 		 234 aa  158  6e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.0000107382  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2601  membrane protein, putaive  40.08 
 
 		 233 aa  158  7e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0232013  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2134  protein of unknown function UPF0005  39.92 
 
 		 235 aa  158  7e-38  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.00000000183428  normal  0.170874 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4993  hypothetical protein  43.02 
 
 		 248 aa  157  1e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.743316 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1724  hypothetical protein  40.83 
 
 		 235 aa  156  2e-37  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000390624  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5385  hypothetical protein  39.13 
 
 		 241 aa  153  2.9999999999999998e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0912  hypothetical protein  40.6 
 
 		 232 aa  153  2.9999999999999998e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.409421  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1437  protein of unknown function UPF0005  40.53 
 
 		 219 aa  146  4.0000000000000006e-34  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2972  hypothetical protein  42.25 
 
 		 237 aa  145  5e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.416031  normal  0.346292 
 
 
-
 
NC_002950  PG0795  hypothetical protein  44.86 
 
 		 236 aa  144  1e-33  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0538  hypothetical protein  38.93 
 
 		 228 aa  144  1e-33  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0302  hypothetical protein  38.52 
 
 		 234 aa  140  3e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000171893  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2141  hypothetical protein  41.15 
 
 		 232 aa  139  3.9999999999999997e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000000126118  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3782  protein of unknown function UPF0005  39.63 
 
 		 249 aa  136  3.0000000000000003e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3162  protein of unknown function UPF0005  39.25 
 
 		 234 aa  132  6e-30  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0296  integral membrane protein, interacts with FtsH  39.83 
 
 		 229 aa  130  3e-29  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4095  protein of unknown function UPF0005  37.77 
 
 		 236 aa  126  3e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4126  protein of unknown function UPF0005  37.34 
 
 		 236 aa  125  7e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>