250 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CJJ81176_0261 on replicon NC_008787
Organism: Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003912  CJE0287  hypothetical protein  100 
 
 
231 aa  451  1.0000000000000001e-126  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0261  hypothetical protein  100 
 
 
231 aa  451  1.0000000000000001e-126  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0234  hypothetical protein  98.7 
 
 
231 aa  447  1e-125  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1506  conserved hypothetical integral membrane protein (UPF0005 domain protein)  84.55 
 
 
233 aa  389  1e-107  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.874501  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2115  ribonuclease 3 (ribonuclease III) (RNase III)  65.38 
 
 
236 aa  291  5e-78  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0337  putative ferric receptor CfrA  64.78 
 
 
232 aa  281  5.000000000000001e-75  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.284951  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1784  hypothetical protein  55.36 
 
 
226 aa  234  9e-61  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2270  protein of unknown function UPF0005  61.67 
 
 
235 aa  225  4e-58  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2054  hypothetical protein  46.15 
 
 
232 aa  191  7e-48  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.213667  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0363  hypothetical protein  48.35 
 
 
234 aa  188  8e-47  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.000375584  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0852  hypothetical protein  36.16 
 
 
230 aa  123  2e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000920073  hitchhiker  0.0000816273 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0971  hypothetical protein  35.96 
 
 
223 aa  122  6e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000000502235  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1424  hypothetical protein  34.33 
 
 
232 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.170635  normal  0.0981664 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2545  protein of unknown function UPF0005  33.62 
 
 
232 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0069764  hitchhiker  0.00953127 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1590  hypothetical protein  33.62 
 
 
232 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.70175 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1459  hypothetical protein  34.5 
 
 
232 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.372489  normal  0.378234 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1754  hypothetical protein  33.91 
 
 
232 aa  113  3e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1727  hypothetical protein  33.91 
 
 
232 aa  113  3e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.593403  normal  0.215205 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2359  hypothetical protein  32.77 
 
 
232 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.372177  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2230  hypothetical protein  32.77 
 
 
232 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2232  hypothetical protein  32.77 
 
 
232 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2194  hypothetical protein  32.77 
 
 
232 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.259485  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5117  hypothetical protein  32.19 
 
 
232 aa  112  5e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0409876  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6263  hypothetical protein  33.91 
 
 
232 aa  112  5e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1816  hypothetical protein  33.91 
 
 
232 aa  112  5e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.152452  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1840  hypothetical protein  33.91 
 
 
232 aa  112  5e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.339326 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1349  hypothetical protein  32.77 
 
 
232 aa  111  9e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1111  hypothetical protein  32.77 
 
 
232 aa  111  9e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1839  hypothetical protein  32.77 
 
 
232 aa  111  9e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.780096  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0058  hypothetical protein  32.77 
 
 
232 aa  111  9e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.143946  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2350  hypothetical protein  35.94 
 
 
222 aa  109  3e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0554095  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1257  hypothetical protein  33.02 
 
 
231 aa  109  4.0000000000000004e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0923659 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1764  hypothetical protein  35.1 
 
 
230 aa  108  5e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.241262  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1441  protein of unknown function UPF0005  35.1 
 
 
230 aa  108  5e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0811132  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1782  hypothetical protein  35.84 
 
 
218 aa  107  1e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.104064  normal  0.0481152 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1210  hypothetical protein  33.49 
 
 
233 aa  106  2e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2825  hypothetical protein  33.01 
 
 
231 aa  107  2e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3403  protein of unknown function UPF0005  39.11 
 
 
221 aa  107  2e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1054  protein of unknown function UPF0005  32.37 
 
 
233 aa  107  2e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.698213  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1146  protein of unknown function UPF0005  31.88 
 
 
233 aa  106  3e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.39216  normal  0.517284 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0896  protein of unknown function UPF0005  35.56 
 
 
229 aa  105  7e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.723604 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1809  hypothetical protein  33.65 
 
 
219 aa  103  2e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000000000169879  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2091  hypothetical protein  33.65 
 
 
233 aa  102  4e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3316  hypothetical protein  34.5 
 
 
230 aa  102  6e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.2042  normal  0.782956 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1804  hypothetical protein  38.78 
 
 
219 aa  102  7e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.372462  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2604  hypothetical protein  36.49 
 
 
222 aa  101  8e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.50496  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2215  hypothetical protein  34.12 
 
 
231 aa  101  9e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  unclonable  0.000000153024  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2375  hypothetical protein  38.78 
 
 
219 aa  101  1e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1437  protein of unknown function UPF0005  35 
 
 
230 aa  100  1e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2166  hypothetical protein  38.78 
 
 
219 aa  100  1e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000000169017  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2411  hypothetical protein  35 
 
 
230 aa  100  1e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.411936  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4627  hypothetical protein  33.17 
 
 
230 aa  101  1e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000408248 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28110  hypothetical protein  35.75 
 
 
223 aa  100  2e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1630  hypothetical protein  41.25 
 
 
223 aa  100  2e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.068558  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1518  hypothetical protein  36.89 
 
 
233 aa  100  2e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.884646  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2001  hypothetical protein  33.18 
 
 
219 aa  100  3e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.000000000304908  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2205  hypothetical protein  38.78 
 
 
219 aa  99.8  3e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000000321186  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1802  protein of unknown function UPF0005  32.52 
 
 
233 aa  99.8  3e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.525736  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2313  hypothetical protein  38.78 
 
 
219 aa  99.8  3e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000688522  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30410  hypothetical protein  36.04 
 
 
222 aa  99.8  3e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2201  protein of unknown function UPF0005  38.78 
 
 
219 aa  100  3e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000000806989  normal  0.147893 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1973  hypothetical protein  38.1 
 
 
219 aa  99.4  4e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000288339  normal  0.569668 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2003  hypothetical protein  38.1 
 
 
219 aa  98.6  8e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.026814  hitchhiker  0.000326951 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2060  hypothetical protein  38.1 
 
 
219 aa  98.2  8e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00317153  hitchhiker  0.0000338815 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2111  hypothetical protein  32.88 
 
 
220 aa  98.2  9e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.0000565103  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2111  hypothetical protein  32.67 
 
 
235 aa  98.2  9e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.312383  normal  0.217151 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0489  hypothetical protein  40 
 
 
221 aa  97.4  1e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2487  hypothetical protein  33.48 
 
 
223 aa  97.8  1e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0234713  normal  0.383043 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3056  hypothetical protein  29.52 
 
 
229 aa  97.4  2e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006692  CNG04050  vacuole protein, putative  35.21 
 
 
283 aa  95.9  5e-19  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.701829  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2451  hypothetical protein  39.47 
 
 
222 aa  95.9  5e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00000005036  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2573  hypothetical protein  31 
 
 
230 aa  95.5  6e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.0057629  decreased coverage  0.000137367 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2473  hypothetical protein  31.88 
 
 
219 aa  95.5  7e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.0000529364  hitchhiker  0.00138122 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3333  hypothetical protein  33.48 
 
 
223 aa  95.1  9e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.722624  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3164  hypothetical protein  33.48 
 
 
223 aa  95.1  9e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.30239 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2376  hypothetical protein  34.68 
 
 
222 aa  95.1  9e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.128059  normal  0.023918 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2014  hypothetical protein  32.71 
 
 
219 aa  94.4  1e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000147608  hitchhiker  0.00304334 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2136  hypothetical protein  38.1 
 
 
219 aa  93.6  2e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0452556  normal  0.017863 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2776  hypothetical protein  28.51 
 
 
231 aa  93.6  2e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3990  hypothetical protein  32.14 
 
 
223 aa  92.8  4e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0132572 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3596  hypothetical protein  32.14 
 
 
223 aa  92.8  4e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.351056 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1842  hypothetical protein  32.14 
 
 
223 aa  92.8  4e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0016223 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0661  protein of unknown function UPF0005  31.19 
 
 
233 aa  92.4  5e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  decreased coverage  0.00649456  normal 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_84906  predicted protein  34.8 
 
 
252 aa  92  8e-18  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.521244  normal  0.814262 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1843  hypothetical protein  34.31 
 
 
201 aa  91.3  1e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.00000000008049  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3395  hypothetical protein  31.7 
 
 
223 aa  90.1  2e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.912483  normal  0.775889 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3472  hypothetical protein  32.43 
 
 
234 aa  90.9  2e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.31473  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3069  hypothetical protein  29.03 
 
 
231 aa  90.5  2e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0838324  normal  0.177428 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1294  hypothetical protein  30.69 
 
 
233 aa  89.4  4e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000365925  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2601  membrane protein, putaive  30.77 
 
 
233 aa  88.2  9e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0232013  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0296  integral membrane protein, interacts with FtsH  32.77 
 
 
229 aa  88.2  9e-17  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01133  Putative uncharacterized protein [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:O74710]  33.8 
 
 
270 aa  87.8  1e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.234786  normal  0.0831451 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2673  protein of unknown function UPF0005  35.06 
 
 
219 aa  87  2e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000665712  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1084  hypothetical protein  35.06 
 
 
219 aa  87  2e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000421704  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2148  hypothetical protein  35.06 
 
 
219 aa  87  2e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0598762  normal  0.366892 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1078  hypothetical protein  35.06 
 
 
219 aa  87  2e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000486786  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1135  hypothetical protein  35.06 
 
 
219 aa  87  2e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.53324  normal  0.675558 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2626  hypothetical protein  35.06 
 
 
219 aa  87  2e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0636098  hitchhiker  0.0000185004 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1482  hypothetical protein  34.33 
 
 
245 aa  87.4  2e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00851236  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1390  hypothetical protein  32.42 
 
 
256 aa  87.4  2e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.330784 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>