263 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCC13826_0337 on replicon NC_009802
Organism: Campylobacter concisus 13826



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009802  CCC13826_0337  putative ferric receptor CfrA  100 
 
 
232 aa  453  1.0000000000000001e-126  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.284951  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2115  ribonuclease 3 (ribonuclease III) (RNase III)  84.32 
 
 
236 aa  397  9.999999999999999e-111  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1506  conserved hypothetical integral membrane protein (UPF0005 domain protein)  67.97 
 
 
233 aa  303  1.0000000000000001e-81  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.874501  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0287  hypothetical protein  64.78 
 
 
231 aa  281  5.000000000000001e-75  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0261  hypothetical protein  64.78 
 
 
231 aa  281  5.000000000000001e-75  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0234  hypothetical protein  64.35 
 
 
231 aa  281  6.000000000000001e-75  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2270  protein of unknown function UPF0005  70.46 
 
 
235 aa  280  2e-74  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1784  hypothetical protein  59.83 
 
 
226 aa  262  4e-69  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2054  hypothetical protein  47.23 
 
 
232 aa  212  2.9999999999999995e-54  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.213667  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0363  hypothetical protein  47.54 
 
 
234 aa  186  4e-46  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.000375584  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0971  hypothetical protein  44.72 
 
 
223 aa  134  9e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000000502235  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1146  protein of unknown function UPF0005  39.05 
 
 
233 aa  128  7.000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.39216  normal  0.517284 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1424  hypothetical protein  35.86 
 
 
232 aa  128  9.000000000000001e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.170635  normal  0.0981664 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1459  hypothetical protein  35.02 
 
 
232 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.372489  normal  0.378234 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2194  hypothetical protein  34.6 
 
 
232 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.259485  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2232  hypothetical protein  34.6 
 
 
232 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2359  hypothetical protein  34.6 
 
 
232 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.372177  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2230  hypothetical protein  34.6 
 
 
232 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1054  protein of unknown function UPF0005  38.76 
 
 
233 aa  126  3e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.698213  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5117  hypothetical protein  34.6 
 
 
232 aa  126  3e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0409876  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1727  hypothetical protein  34.6 
 
 
232 aa  126  3e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.593403  normal  0.215205 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1754  hypothetical protein  34.6 
 
 
232 aa  126  3e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1349  hypothetical protein  34.6 
 
 
232 aa  125  5e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1111  hypothetical protein  34.6 
 
 
232 aa  125  5e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1840  hypothetical protein  34.6 
 
 
232 aa  125  5e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.339326 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6263  hypothetical protein  34.6 
 
 
232 aa  125  5e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0058  hypothetical protein  34.6 
 
 
232 aa  125  5e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.143946  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1816  hypothetical protein  34.6 
 
 
232 aa  125  5e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.152452  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1839  hypothetical protein  34.6 
 
 
232 aa  125  5e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.780096  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2091  hypothetical protein  35.1 
 
 
233 aa  124  1e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1782  hypothetical protein  36.77 
 
 
218 aa  124  2e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.104064  normal  0.0481152 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1210  hypothetical protein  36.67 
 
 
233 aa  123  3e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2825  hypothetical protein  39.61 
 
 
231 aa  122  6e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0852  hypothetical protein  38.07 
 
 
230 aa  120  1.9999999999999998e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000920073  hitchhiker  0.0000816273 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1441  protein of unknown function UPF0005  36.74 
 
 
230 aa  120  1.9999999999999998e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0811132  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1764  hypothetical protein  36.74 
 
 
230 aa  120  1.9999999999999998e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.241262  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2545  protein of unknown function UPF0005  36.02 
 
 
232 aa  119  3e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0069764  hitchhiker  0.00953127 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1590  hypothetical protein  36.02 
 
 
232 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.70175 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2375  hypothetical protein  37.05 
 
 
219 aa  116  3.9999999999999997e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2166  hypothetical protein  35.14 
 
 
219 aa  113  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000000169017  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1809  hypothetical protein  40.85 
 
 
219 aa  113  2.0000000000000002e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000000000169879  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2001  hypothetical protein  34.68 
 
 
219 aa  113  3e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.000000000304908  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2350  hypothetical protein  33.62 
 
 
222 aa  112  4.0000000000000004e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0554095  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2313  hypothetical protein  35.14 
 
 
219 aa  112  4.0000000000000004e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000688522  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2205  hypothetical protein  35.14 
 
 
219 aa  112  4.0000000000000004e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000000321186  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1973  hypothetical protein  34.82 
 
 
219 aa  112  6e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000288339  normal  0.569668 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2003  hypothetical protein  36 
 
 
219 aa  112  7.000000000000001e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.026814  hitchhiker  0.000326951 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2201  protein of unknown function UPF0005  34.38 
 
 
219 aa  112  7.000000000000001e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000000806989  normal  0.147893 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2060  hypothetical protein  35.14 
 
 
219 aa  111  9e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00317153  hitchhiker  0.0000338815 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1437  protein of unknown function UPF0005  35.05 
 
 
230 aa  109  4.0000000000000004e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2411  hypothetical protein  35.05 
 
 
230 aa  109  4.0000000000000004e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.411936  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1804  hypothetical protein  34.39 
 
 
219 aa  108  6e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.372462  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4627  hypothetical protein  34.88 
 
 
230 aa  108  6e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000408248 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2573  hypothetical protein  33.04 
 
 
230 aa  108  7.000000000000001e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.0057629  decreased coverage  0.000137367 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3056  hypothetical protein  33.04 
 
 
229 aa  108  8.000000000000001e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2111  hypothetical protein  33.81 
 
 
235 aa  108  8.000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.312383  normal  0.217151 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1802  protein of unknown function UPF0005  34.88 
 
 
233 aa  107  1e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.525736  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2111  hypothetical protein  33.18 
 
 
220 aa  107  1e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.0000565103  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1257  hypothetical protein  34.43 
 
 
231 aa  107  2e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0923659 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1630  hypothetical protein  36.09 
 
 
223 aa  106  3e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.068558  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2014  hypothetical protein  35.78 
 
 
219 aa  105  6e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000147608  hitchhiker  0.00304334 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2776  hypothetical protein  33.49 
 
 
231 aa  104  9e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0489  hypothetical protein  35.87 
 
 
221 aa  104  1e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2215  hypothetical protein  34.4 
 
 
231 aa  104  1e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  unclonable  0.000000153024  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1912  protein of unknown function UPF0005  39.55 
 
 
261 aa  103  3e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.224132 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3316  hypothetical protein  33.49 
 
 
230 aa  102  5e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.2042  normal  0.782956 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0896  protein of unknown function UPF0005  36.44 
 
 
229 aa  102  6e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.723604 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1438  hypothetical protein  34.16 
 
 
236 aa  101  1e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3403  protein of unknown function UPF0005  38.89 
 
 
221 aa  100  2e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0772  hypothetical protein  30.58 
 
 
233 aa  100  2e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.768217  normal  0.283665 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2473  hypothetical protein  31.19 
 
 
219 aa  100  2e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.0000529364  hitchhiker  0.00138122 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3069  hypothetical protein  30.84 
 
 
231 aa  100  2e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0838324  normal  0.177428 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28110  hypothetical protein  31.6 
 
 
223 aa  99.8  3e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2832  hypothetical protein  33.74 
 
 
236 aa  99.4  5e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.448865  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2918  hypothetical protein  33.74 
 
 
236 aa  99.4  5e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.117943  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0661  protein of unknown function UPF0005  31.9 
 
 
233 aa  99  5e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  decreased coverage  0.00649456  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2518  protein of unknown function UPF0005  32.77 
 
 
236 aa  99  6e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0945287  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0738  protein of unknown function UPF0005  32.92 
 
 
234 aa  98.6  8e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.0000107382  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003413  putative TEGT family carrier/transport protein  35.02 
 
 
220 aa  98.2  1e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000444328  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2487  hypothetical protein  31.58 
 
 
223 aa  97.1  2e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0234713  normal  0.383043 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2136  hypothetical protein  30.73 
 
 
219 aa  97.4  2e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0452556  normal  0.017863 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1294  hypothetical protein  30.48 
 
 
233 aa  97.1  2e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000365925  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2601  membrane protein, putaive  32.47 
 
 
233 aa  97.1  2e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0232013  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2451  hypothetical protein  34.91 
 
 
222 aa  97.1  2e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00000005036  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3990  hypothetical protein  30.26 
 
 
223 aa  96.3  4e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0132572 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1842  hypothetical protein  30.26 
 
 
223 aa  96.3  4e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0016223 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3596  hypothetical protein  30.26 
 
 
223 aa  96.3  4e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.351056 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0927  protein of unknown function UPF0005  35.52 
 
 
235 aa  95.5  6e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.441127 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02365  hypothetical protein  31.72 
 
 
220 aa  94.4  1e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2427  protein of unknown function UPF0005  31.69 
 
 
236 aa  93.6  2e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1173  protein of unknown function UPF0005  32.51 
 
 
240 aa  94  2e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00047203  normal  0.359337 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3333  hypothetical protein  32.71 
 
 
223 aa  92.8  4e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.722624  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3164  hypothetical protein  32.71 
 
 
223 aa  92.8  4e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.30239 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1726  hypothetical protein  35.19 
 
 
238 aa  92.8  4e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.327418 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3395  hypothetical protein  29.82 
 
 
223 aa  92.4  5e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.912483  normal  0.775889 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0809  hypothetical protein  31.78 
 
 
234 aa  92.4  5e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.00257878  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1724  hypothetical protein  32.34 
 
 
235 aa  92.4  5e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000390624  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1395  hypothetical protein  39.86 
 
 
252 aa  92  6e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.681625  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1437  protein of unknown function UPF0005  35.81 
 
 
219 aa  91.3  1e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2947  protein of unknown function UPF0005  31.88 
 
 
235 aa  91.3  1e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>