246 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_2054 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007575  Suden_2054  hypothetical protein  100 
 
 		 232 aa  456  1e-127  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.213667  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2115  ribonuclease 3 (ribonuclease III) (RNase III)  48.73 
 
 		 236 aa  241  7.999999999999999e-63  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0337  putative ferric receptor CfrA  47.23 
 
 		 232 aa  229  2e-59  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.284951  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1506  conserved hypothetical integral membrane protein (UPF0005 domain protein)  47.44 
 
 		 233 aa  220  1.9999999999999999e-56  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.874501  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0287  hypothetical protein  46.15 
 
 		 231 aa  207  9e-53  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0261  hypothetical protein  46.15 
 
 		 231 aa  207  9e-53  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0234  hypothetical protein  45.73 
 
 		 231 aa  205  4e-52  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2270  protein of unknown function UPF0005  51.06 
 
 		 235 aa  203  2e-51  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1784  hypothetical protein  45.26 
 
 		 226 aa  193  2e-48  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0363  hypothetical protein  40.57 
 
 		 234 aa  159  4e-38  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.000375584  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5117  hypothetical protein  35.32 
 
 		 232 aa  122  5e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0409876  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1459  hypothetical protein  35.89 
 
 		 232 aa  122  7e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.372489  normal  0.378234 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2194  hypothetical protein  35.41 
 
 		 232 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.259485  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1727  hypothetical protein  35.32 
 
 		 232 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.593403  normal  0.215205 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2232  hypothetical protein  35.41 
 
 		 232 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2359  hypothetical protein  35.41 
 
 		 232 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.372177  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2230  hypothetical protein  35.41 
 
 		 232 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6263  hypothetical protein  35.32 
 
 		 232 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1754  hypothetical protein  35.32 
 
 		 232 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1816  hypothetical protein  35.32 
 
 		 232 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.152452  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1840  hypothetical protein  35.32 
 
 		 232 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.339326 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1349  hypothetical protein  35.41 
 
 		 232 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1111  hypothetical protein  35.41 
 
 		 232 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1839  hypothetical protein  35.41 
 
 		 232 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.780096  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0058  hypothetical protein  35.41 
 
 		 232 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.143946  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1424  hypothetical protein  31.93 
 
 		 232 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.170635  normal  0.0981664 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1146  protein of unknown function UPF0005  33.65 
 
 		 233 aa  115  3.9999999999999997e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.39216  normal  0.517284 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1210  hypothetical protein  33.65 
 
 		 233 aa  115  6.9999999999999995e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1257  hypothetical protein  33.04 
 
 		 231 aa  115  7.999999999999999e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0923659 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1590  hypothetical protein  31.58 
 
 		 232 aa  114  8.999999999999998e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.70175 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2545  protein of unknown function UPF0005  31.58 
 
 		 232 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0069764  hitchhiker  0.00953127 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1054  protein of unknown function UPF0005  32.69 
 
 		 233 aa  113  2.0000000000000002e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.698213  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2350  hypothetical protein  34.51 
 
 		 222 aa  112  6e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0554095  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2091  hypothetical protein  32.17 
 
 		 233 aa  112  7.000000000000001e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1294  hypothetical protein  32.59 
 
 		 233 aa  109  4.0000000000000004e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000365925  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2166  hypothetical protein  35.56 
 
 		 219 aa  107  1e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000000169017  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0852  hypothetical protein  33.83 
 
 		 230 aa  107  2e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000920073  hitchhiker  0.0000816273 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3316  hypothetical protein  35.98 
 
 		 230 aa  107  2e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.2042  normal  0.782956 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2205  hypothetical protein  35.56 
 
 		 219 aa  107  2e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000000321186  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2313  hypothetical protein  35.56 
 
 		 219 aa  107  2e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000688522  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3056  hypothetical protein  33.92 
 
 		 229 aa  106  3e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2111  hypothetical protein  31.53 
 
 		 235 aa  106  3e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.312383  normal  0.217151 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2111  hypothetical protein  33.92 
 
 		 220 aa  105  4e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.0000565103  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2201  protein of unknown function UPF0005  35.11 
 
 		 219 aa  105  5e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000000806989  normal  0.147893 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1782  hypothetical protein  33.64 
 
 		 218 aa  105  5e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.104064  normal  0.0481152 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2473  hypothetical protein  34.38 
 
 		 219 aa  105  6e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.0000529364  hitchhiker  0.00138122 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2375  hypothetical protein  34.67 
 
 		 219 aa  104  1e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1973  hypothetical protein  34.67 
 
 		 219 aa  104  1e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000288339  normal  0.569668 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2825  hypothetical protein  31.6 
 
 		 231 aa  103  3e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1802  protein of unknown function UPF0005  33.8 
 
 		 233 aa  102  4e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.525736  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4627  hypothetical protein  34.11 
 
 		 230 aa  102  4e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000408248 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2136  hypothetical protein  35.27 
 
 		 219 aa  102  4e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0452556  normal  0.017863 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2060  hypothetical protein  34.22 
 
 		 219 aa  102  5e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00317153  hitchhiker  0.0000338815 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0896  protein of unknown function UPF0005  33.33 
 
 		 229 aa  102  5e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.723604 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2003  hypothetical protein  34.22 
 
 		 219 aa  102  6e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.026814  hitchhiker  0.000326951 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2573  hypothetical protein  33.18 
 
 		 230 aa  102  6e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.0057629  decreased coverage  0.000137367 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1437  protein of unknown function UPF0005  34.11 
 
 		 230 aa  101  1e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2411  hypothetical protein  34.11 
 
 		 230 aa  101  1e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.411936  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2451  hypothetical protein  32.46 
 
 		 222 aa  100  2e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00000005036  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2001  hypothetical protein  33.78 
 
 		 219 aa  100  3e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.000000000304908  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0661  protein of unknown function UPF0005  30.95 
 
 		 233 aa  99.8  3e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  decreased coverage  0.00649456  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3069  hypothetical protein  31.98 
 
 		 231 aa  99.8  3e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0838324  normal  0.177428 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1804  hypothetical protein  33.48 
 
 		 219 aa  97.4  1e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.372462  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2014  hypothetical protein  34.53 
 
 		 219 aa  97.4  2e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000147608  hitchhiker  0.00304334 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1809  hypothetical protein  33.18 
 
 		 219 aa  95.5  6e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000000000169879  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1441  protein of unknown function UPF0005  31.28 
 
 		 230 aa  94  2e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0811132  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1764  hypothetical protein  31.28 
 
 		 230 aa  94  2e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.241262  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2487  hypothetical protein  29.61 
 
 		 223 aa  93.6  3e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0234713  normal  0.383043 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2776  hypothetical protein  29.44 
 
 		 231 aa  93.2  3e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3990  hypothetical protein  29.61 
 
 		 223 aa  92  7e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0132572 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1842  hypothetical protein  29.61 
 
 		 223 aa  92  7e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0016223 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3596  hypothetical protein  29.61 
 
 		 223 aa  92  7e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.351056 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2134  protein of unknown function UPF0005  32.47 
 
 		 235 aa  92  7e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.00000000183428  normal  0.170874 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3333  hypothetical protein  30.4 
 
 		 223 aa  91.7  1e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.722624  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3164  hypothetical protein  30.4 
 
 		 223 aa  91.7  1e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.30239 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3395  hypothetical protein  29.18 
 
 		 223 aa  90.9  1e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.912483  normal  0.775889 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3403  protein of unknown function UPF0005  33.78 
 
 		 221 aa  89.4  5e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28110  hypothetical protein  30.49 
 
 		 223 aa  88.6  7e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0971  hypothetical protein  32.93 
 
 		 223 aa  88.2  1e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000000502235  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0927  protein of unknown function UPF0005  31.76 
 
 		 235 aa  87  2e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.441127 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0466  protein of unknown function UPF0005  30.73 
 
 		 221 aa  85.5  7e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2376  hypothetical protein  29.69 
 
 		 222 aa  84  0.000000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.128059  normal  0.023918 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1438  hypothetical protein  28.99 
 
 		 236 aa  82.4  0.000000000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30410  hypothetical protein  30.04 
 
 		 222 aa  82  0.000000000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2918  hypothetical protein  28.99 
 
 		 236 aa  81.3  0.00000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.117943  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0489  hypothetical protein  31.8 
 
 		 221 aa  81.3  0.00000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2601  membrane protein, putaive  28.75 
 
 		 233 aa  81.6  0.00000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0232013  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2832  hypothetical protein  28.99 
 
 		 236 aa  81.3  0.00000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.448865  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0710  integral membrane protein, interacts with FtsH  31.15 
 
 		 239 aa  81.3  0.00000000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0741139  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2215  hypothetical protein  30.77 
 
 		 231 aa  80.5  0.00000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  unclonable  0.000000153024  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2604  hypothetical protein  29.6 
 
 		 222 aa  80.1  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.50496  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1148  hypothetical protein  30.73 
 
 		 219 aa  80.1  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.466231  normal  0.361481 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1126  hypothetical protein  30.73 
 
 		 219 aa  80.1  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  3.21152e-22 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1249  hypothetical protein  29.78 
 
 		 237 aa  80.1  0.00000000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000770984  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1160  hypothetical protein  30.73 
 
 		 219 aa  80.1  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.572482  normal  0.332109 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1482  hypothetical protein  28.76 
 
 		 245 aa  79.7  0.00000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00851236  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1194  hypothetical protein  30.73 
 
 		 219 aa  80.1  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1043  hypothetical protein  30.73 
 
 		 219 aa  80.1  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.598631  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2043  hypothetical protein  41.88 
 
 		 261 aa  80.1  0.00000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.28558  normal  0.977268 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2135  protein of unknown function UPF0005  38.6 
 
 		 224 aa  80.1  0.00000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.000000126881  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>