More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_0615 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008942  Mlab_0615  hypothetical protein  100 
 
 		 283 aa  577  1e-164  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0797  lactate/malate dehydrogenase  48.77 
 
 		 288 aa  273  3e-72  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.11982  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1109  lactate/malate dehydrogenase  49.65 
 
 		 288 aa  270  2.9999999999999997e-71  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.310763  normal  0.553423 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1741  Lactate/malate dehydrogenase  48.57 
 
 		 282 aa  268  5.9999999999999995e-71  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1155  lactate/malate dehydrogenase  43.9 
 
 		 290 aa  245  6e-64  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.327954  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0345  malate dehydrogenase (NAD)  31.72 
 
 		 318 aa  143  3e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.569498  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0489  L-lactate dehydrogenase  29.68 
 
 		 319 aa  133  3e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0338  malate dehydrogenase  30.69 
 
 		 304 aa  131  2.0000000000000002e-29  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2649  malate dehydrogenase  33.93 
 
 		 304 aa  129  5.0000000000000004e-29  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.387053  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1361  L-lactate dehydrogenase  29.87 
 
 		 317 aa  129  6e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0137  L-lactate dehydrogenase  28.16 
 
 		 310 aa  123  3e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000000668633  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3728  Lactate/malate dehydrogenase  32.98 
 
 		 304 aa  123  4e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0803  malate dehydrogenase  33.33 
 
 		 304 aa  123  4e-27  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1582  L-lactate dehydrogenase  30.23 
 
 		 309 aa  122  6e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1121  malate dehydrogenase  31.49 
 
 		 316 aa  120  1.9999999999999998e-26  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0421  L-lactate dehydrogenase  26.28 
 
 		 314 aa  121  1.9999999999999998e-26  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000701213  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0700  L-lactate dehydrogenase  29.84 
 
 		 318 aa  119  4.9999999999999996e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1974  Lactate/malate dehydrogenase  32.03 
 
 		 304 aa  118  9.999999999999999e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3395  malate dehydrogenase  30.29 
 
 		 321 aa  116  3e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2007  L-lactate dehydrogenase  29.05 
 
 		 314 aa  115  6e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.227909  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1784  L-lactate dehydrogenase  29.05 
 
 		 314 aa  115  6e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.521865  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1763  L-lactate dehydrogenase  29.05 
 
 		 314 aa  115  6e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00307694  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1741  L-lactate dehydrogenase  29.05 
 
 		 314 aa  115  6e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1923  L-lactate dehydrogenase  29.05 
 
 		 314 aa  115  6e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0148797  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2028  L-lactate dehydrogenase  29.05 
 
 		 314 aa  115  6e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0115403  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1959  L-lactate dehydrogenase  29.05 
 
 		 314 aa  115  6e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000164106 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1918  L-lactate dehydrogenase  27.72 
 
 		 314 aa  115  6e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000101641  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0561  malate dehydrogenase  31.37 
 
 		 320 aa  115  6.9999999999999995e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.394685  normal  0.500877 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0216  L-lactate dehydrogenase  29.35 
 
 		 311 aa  115  7.999999999999999e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1927  L-lactate dehydrogenase  29.05 
 
 		 314 aa  115  8.999999999999998e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5002  L-lactate dehydrogenase  28.01 
 
 		 314 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0693832  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4762  L-lactate dehydrogenase  28.01 
 
 		 314 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0105004  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4600  L-lactate dehydrogenase  28.01 
 
 		 314 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4624  L-lactate dehydrogenase  28.01 
 
 		 314 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000281298  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5125  L-lactate dehydrogenase  28.01 
 
 		 314 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.464176  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0236  L-lactate dehydrogenase  28.01 
 
 		 314 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0479489  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4981  L-lactate dehydrogenase  28.01 
 
 		 314 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0520  L-lactate dehydrogenase  30.43 
 
 		 312 aa  114  1.0000000000000001e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2797  L-lactate dehydrogenase  28.2 
 
 		 314 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5032  L-lactate dehydrogenase  28.01 
 
 		 314 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5012  L-lactate dehydrogenase  27.69 
 
 		 314 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0813817  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0862  malate dehydrogenase  28.05 
 
 		 310 aa  114  2.0000000000000002e-24  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0390301  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1483  malate dehydrogenase (NAD)  28.05 
 
 		 321 aa  114  2.0000000000000002e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2434  L-lactate dehydrogenase  29.03 
 
 		 325 aa  114  2.0000000000000002e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.167349  normal  0.351955 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3505  L-lactate dehydrogenase  26.95 
 
 		 315 aa  114  3e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1798  L-lactate dehydrogenase  28.93 
 
 		 314 aa  113  3e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0938319  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0956  malate dehydrogenase, NAD-dependent  29.11 
 
 		 315 aa  113  3e-24  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0952  L-lactate dehydrogenase  27.24 
 
 		 319 aa  113  3e-24  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.172568  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4713  L-lactate dehydrogenase  27.69 
 
 		 314 aa  112  5e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0231  L-lactate dehydrogenase  27.69 
 
 		 317 aa  112  5e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0225  L-lactate dehydrogenase  27.69 
 
 		 317 aa  112  5e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5004  malate dehydrogenase  30.27 
 
 		 320 aa  112  5e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16140  L-lactate dehydrogenase  29.47 
 
 		 322 aa  112  6e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0169576  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0102  L-lactate dehydrogenase  28.05 
 
 		 317 aa  112  6e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.02476  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3415  L-lactate dehydrogenase  28.57 
 
 		 314 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000130483 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1484  L-lactate dehydrogenase  28.38 
 
 		 314 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.874193  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0463  L-lactate dehydrogenase  28.71 
 
 		 335 aa  111  1.0000000000000001e-23  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.23443  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0080  malate dehydrogenase  28.8 
 
 		 320 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2156  L-lactate dehydrogenase  27.91 
 
 		 316 aa  111  2.0000000000000002e-23  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1116  L-lactate dehydrogenase  29.22 
 
 		 317 aa  110  2.0000000000000002e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0119464  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0098  L-lactate dehydrogenase  27.39 
 
 		 317 aa  110  2.0000000000000002e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.409551  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2253  L-lactate dehydrogenase  27.54 
 
 		 318 aa  110  2.0000000000000002e-23  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0398  malate dehydrogenase  27.51 
 
 		 313 aa  110  3e-23  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1510  malate dehydrogenase  27.21 
 
 		 310 aa  109  4.0000000000000004e-23  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0354026  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1900  malate dehydrogenase  28.34 
 
 		 310 aa  109  6e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0968  malate dehydrogenase  28.8 
 
 		 338 aa  108  1e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2230  malate dehydrogenase  28.75 
 
 		 320 aa  108  1e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2628  malate dehydrogenase  28.8 
 
 		 320 aa  108  1e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0022  malate dehydrogenase  29.97 
 
 		 321 aa  108  1e-22  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1450  malate dehydrogenase, NAD-dependent  29.07 
 
 		 333 aa  107  2e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0382  malate dehydrogenase (NAD)  28.66 
 
 		 329 aa  107  2e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.277292  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4129  malate dehydrogenase  28.9 
 
 		 320 aa  107  2e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0370  malate dehydrogenase (NAD)  28.66 
 
 		 329 aa  107  2e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0237216  normal  0.979126 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0391  malate dehydrogenase (NAD)  28.66 
 
 		 329 aa  107  2e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.624215 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1065  L-lactate dehydrogenase  27.12 
 
 		 311 aa  107  3e-22  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000000229856  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0818  malate dehydrogenase  30.17 
 
 		 320 aa  106  4e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.68973 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0930  L-lactate dehydrogenase  27.8 
 
 		 319 aa  106  4e-22  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000455323  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1053  L-lactate dehydrogenase  26.23 
 
 		 317 aa  106  4e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.189313  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1029  malate dehydrogenase  27.21 
 
 		 310 aa  106  5e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00758057  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0435  L-2-hydroxyisocaproate/malate/lactate dehydrogenase-like protein  28.29 
 
 		 316 aa  105  7e-22  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0223779  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0351  L-lactate dehydrogenase  28.37 
 
 		 315 aa  105  9e-22  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0206  L-lactate dehydrogenase  28.43 
 
 		 319 aa  104  1e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0930  malate dehydrogenase  29.22 
 
 		 320 aa  105  1e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2193  malate dehydrogenase  30.18 
 
 		 318 aa  104  1e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000748395  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0716  malate dehydrogenase (NAD)  28.85 
 
 		 319 aa  104  2e-21  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.00000000000101749  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1273  malate dehydrogenase  28.71 
 
 		 324 aa  104  2e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.570878  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1522  L-lactate dehydrogenase  28.42 
 
 		 310 aa  104  2e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0323488  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0641  malate dehydrogenase  28.91 
 
 		 313 aa  104  2e-21  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1856  malate dehydrogenase  29.22 
 
 		 320 aa  104  2e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0187  malate dehydrogenase  28.85 
 
 		 322 aa  104  2e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.433088  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0132  L-lactate dehydrogenase  28.52 
 
 		 313 aa  103  3e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3685  malate dehydrogenase  27.36 
 
 		 320 aa  103  3e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0194  malate dehydrogenase (NAD)  31.15 
 
 		 310 aa  103  3e-21  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000257978  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1713  malate dehydrogenase  27.39 
 
 		 310 aa  103  3e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.905202  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1951  malate dehydrogenase (NAD)  30.9 
 
 		 308 aa  103  3e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.800681 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3974  malate dehydrogenase  27.36 
 
 		 320 aa  103  3e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.342256  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0832  malate dehydrogenase  26.95 
 
 		 310 aa  103  3e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.328831  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1625  malate dehydrogenase  27.74 
 
 		 321 aa  103  3e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000635356  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0985  L-lactate dehydrogenase  27.45 
 
 		 309 aa  103  3e-21  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3778  L-lactate dehydrogenase  26.56 
 
 		 331 aa  103  4e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.95012 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>