297 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_1155 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007796  Mhun_1155  lactate/malate dehydrogenase  100 
 
 
290 aa  588  1e-167  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.327954  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1109  lactate/malate dehydrogenase  50.35 
 
 
288 aa  285  7e-76  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.310763  normal  0.553423 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0797  lactate/malate dehydrogenase  48.95 
 
 
288 aa  284  1.0000000000000001e-75  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.11982  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1741  Lactate/malate dehydrogenase  49.29 
 
 
282 aa  271  6e-72  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0615  hypothetical protein  43.9 
 
 
283 aa  245  6e-64  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3728  Lactate/malate dehydrogenase  34.78 
 
 
304 aa  166  2.9999999999999998e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1974  Lactate/malate dehydrogenase  35.27 
 
 
304 aa  160  2e-38  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2649  malate dehydrogenase  31.99 
 
 
304 aa  159  4e-38  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.387053  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0803  malate dehydrogenase  32.73 
 
 
304 aa  157  2e-37  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3505  L-lactate dehydrogenase  32.78 
 
 
315 aa  150  4e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0489  L-lactate dehydrogenase  30.97 
 
 
319 aa  147  3e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4713  L-lactate dehydrogenase  31.54 
 
 
314 aa  145  1e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0236  L-lactate dehydrogenase  31.54 
 
 
314 aa  144  2e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0479489  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4762  L-lactate dehydrogenase  31.54 
 
 
314 aa  144  2e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0105004  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4600  L-lactate dehydrogenase  31.54 
 
 
314 aa  144  2e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4624  L-lactate dehydrogenase  31.54 
 
 
314 aa  144  2e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000281298  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5125  L-lactate dehydrogenase  31.54 
 
 
314 aa  144  2e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.464176  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4981  L-lactate dehydrogenase  31.54 
 
 
314 aa  144  2e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5002  L-lactate dehydrogenase  31.54 
 
 
314 aa  144  2e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0693832  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5032  L-lactate dehydrogenase  31.54 
 
 
314 aa  143  3e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5012  L-lactate dehydrogenase  31.54 
 
 
314 aa  143  3e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0813817  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0612  malate dehydrogenase  30.94 
 
 
309 aa  142  5e-33  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  decreased coverage  0.00000000109591 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1484  L-lactate dehydrogenase  29.18 
 
 
314 aa  139  4.999999999999999e-32  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.874193  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0421  L-lactate dehydrogenase  29.03 
 
 
314 aa  139  6e-32  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000701213  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0347  malate dehydrogenase  33.77 
 
 
313 aa  138  1e-31  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.536254  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0231  L-lactate dehydrogenase  29.32 
 
 
317 aa  138  1e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0225  L-lactate dehydrogenase  29.32 
 
 
317 aa  138  1e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2007  L-lactate dehydrogenase  29.84 
 
 
314 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.227909  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1784  L-lactate dehydrogenase  29.84 
 
 
314 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.521865  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1763  L-lactate dehydrogenase  29.84 
 
 
314 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00307694  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1741  L-lactate dehydrogenase  29.84 
 
 
314 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1923  L-lactate dehydrogenase  29.84 
 
 
314 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0148797  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1959  L-lactate dehydrogenase  29.84 
 
 
314 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000164106 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2028  L-lactate dehydrogenase  29.84 
 
 
314 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0115403  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1927  L-lactate dehydrogenase  29.84 
 
 
314 aa  136  4e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1509  malate dehydrogenase  30.26 
 
 
308 aa  136  4e-31  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.195418  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1029  malate dehydrogenase  30.42 
 
 
310 aa  136  4e-31  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00758057  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1699  malate dehydrogenase  29.41 
 
 
309 aa  136  5e-31  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000446484 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1798  L-lactate dehydrogenase  31.07 
 
 
314 aa  135  7.000000000000001e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0938319  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1918  L-lactate dehydrogenase  29.43 
 
 
314 aa  135  7.000000000000001e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000101641  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3415  L-lactate dehydrogenase  30.71 
 
 
314 aa  133  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000130483 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1361  L-lactate dehydrogenase  30.65 
 
 
317 aa  132  6e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1571  malate dehydrogenase  30.49 
 
 
309 aa  132  6e-30  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  unclonable  0.0000000000000156495 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0862  malate dehydrogenase  30.07 
 
 
310 aa  131  1.0000000000000001e-29  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0390301  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0338  malate dehydrogenase  30.2 
 
 
304 aa  131  1.0000000000000001e-29  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1900  malate dehydrogenase  32.03 
 
 
310 aa  131  1.0000000000000001e-29  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1053  L-lactate dehydrogenase  32.99 
 
 
317 aa  130  2.0000000000000002e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.189313  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0216  L-lactate dehydrogenase  31.63 
 
 
311 aa  131  2.0000000000000002e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0832  malate dehydrogenase  31.49 
 
 
310 aa  130  2.0000000000000002e-29  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.328831  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08746  malate dehydrogenase  32.46 
 
 
308 aa  130  3e-29  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1826  malate dehydrogenase (NAD)  30.03 
 
 
317 aa  130  3e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.490371  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16140  L-lactate dehydrogenase  31.38 
 
 
322 aa  130  3e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0169576  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1582  L-lactate dehydrogenase  33.45 
 
 
309 aa  129  5.0000000000000004e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1065  L-lactate dehydrogenase  28.71 
 
 
311 aa  129  7.000000000000001e-29  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000000229856  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1483  malate dehydrogenase (NAD)  29.28 
 
 
321 aa  128  9.000000000000001e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1510  malate dehydrogenase  29.87 
 
 
310 aa  128  1.0000000000000001e-28  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0354026  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0463  L-lactate dehydrogenase  29.39 
 
 
335 aa  127  3e-28  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.23443  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2255  malate dehydrogenase  30.67 
 
 
311 aa  126  4.0000000000000003e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0952  L-lactate dehydrogenase  29.62 
 
 
319 aa  124  2e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.172568  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0206  L-lactate dehydrogenase  30.46 
 
 
319 aa  124  2e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1713  malate dehydrogenase  31.92 
 
 
310 aa  124  3e-27  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.905202  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1121  malate dehydrogenase  30.55 
 
 
316 aa  123  4e-27  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0398  malate dehydrogenase  30.23 
 
 
313 aa  122  6e-27  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1522  L-lactate dehydrogenase  32.48 
 
 
310 aa  122  7e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0323488  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0137  L-lactate dehydrogenase  31.86 
 
 
310 aa  122  7e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000000668633  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2485  L-lactate dehydrogenase  30.88 
 
 
316 aa  122  8e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0241914  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0956  malate dehydrogenase, NAD-dependent  28.34 
 
 
315 aa  121  9.999999999999999e-27  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0022  malate dehydrogenase  30.32 
 
 
321 aa  121  9.999999999999999e-27  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0187  malate dehydrogenase  29.97 
 
 
322 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.433088  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0676  lactate/malate dehydrogenase  29.25 
 
 
303 aa  120  1.9999999999999998e-26  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1121  malate dehydrogenase  30.1 
 
 
309 aa  121  1.9999999999999998e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1626  malate dehydrogenase  32.2 
 
 
312 aa  120  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3395  malate dehydrogenase  30.32 
 
 
321 aa  120  1.9999999999999998e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0930  malate dehydrogenase  30.99 
 
 
320 aa  120  1.9999999999999998e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1273  malate dehydrogenase  31.07 
 
 
324 aa  120  3e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.570878  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1856  malate dehydrogenase  30.45 
 
 
320 aa  120  3e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1951  malate dehydrogenase (NAD)  31.17 
 
 
308 aa  120  3e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.800681 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2797  L-lactate dehydrogenase  30.48 
 
 
314 aa  120  3e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1927  malate dehydrogenase  30.45 
 
 
320 aa  119  6e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1675  malate dehydrogenase  29.69 
 
 
309 aa  119  7e-26  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0291374  normal  0.817536 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0700  L-lactate dehydrogenase  28.85 
 
 
318 aa  119  7.999999999999999e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0520  L-lactate dehydrogenase  31.44 
 
 
312 aa  119  7.999999999999999e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1455  L-lactate dehydrogenase  28.99 
 
 
325 aa  119  7.999999999999999e-26  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4129  malate dehydrogenase  30.25 
 
 
320 aa  118  9.999999999999999e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0345  malate dehydrogenase (NAD)  29.35 
 
 
318 aa  117  1.9999999999999998e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.569498  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2156  L-lactate dehydrogenase  27.48 
 
 
316 aa  117  1.9999999999999998e-25  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1603  malate dehydrogenase  30.84 
 
 
310 aa  117  1.9999999999999998e-25  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2802  malate dehydrogenase, NAD-dependent  27.18 
 
 
311 aa  117  1.9999999999999998e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0641  malate dehydrogenase  30.87 
 
 
313 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4459  malate dehydrogenase, NAD-dependent  29.47 
 
 
309 aa  117  1.9999999999999998e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.688925 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1689  Lactate/malate dehydrogenase  28.94 
 
 
310 aa  117  1.9999999999999998e-25  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.444612  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2397  L-lactate dehydrogenase  31.03 
 
 
316 aa  117  3e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.851403  normal  0.362138 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0930  L-lactate dehydrogenase  29.94 
 
 
319 aa  116  3e-25  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000455323  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1799  malate dehydrogenase, NAD-dependent  31.63 
 
 
320 aa  117  3e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23050  malate dehydrogenase (NAD)  28.57 
 
 
331 aa  116  3.9999999999999997e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.697126  normal  0.046368 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5140  L-lactate dehydrogenase  29.71 
 
 
316 aa  116  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000543313  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4869  L-lactate dehydrogenase  30.03 
 
 
316 aa  116  5e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4723  L-lactate dehydrogenase  30.03 
 
 
316 aa  116  5e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5240  L-lactate dehydrogenase  30.03 
 
 
316 aa  116  5e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5106  L-lactate dehydrogenase  30.03 
 
 
316 aa  116  5e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>