More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_0803 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013202  Hmuk_0803  malate dehydrogenase  100 
 
 		 304 aa  608  1e-173  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3728  Lactate/malate dehydrogenase  84.16 
 
 		 304 aa  498  1e-140  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2649  malate dehydrogenase  83.17 
 
 		 304 aa  495  1e-139  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.387053  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1974  Lactate/malate dehydrogenase  82.51 
 
 		 304 aa  489  1e-137  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0137  L-lactate dehydrogenase  35.88 
 
 		 310 aa  206  5e-52  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000000668633  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0345  malate dehydrogenase (NAD)  34.08 
 
 		 318 aa  201  9.999999999999999e-51  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.569498  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1053  L-lactate dehydrogenase  35.18 
 
 		 317 aa  199  3.9999999999999996e-50  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.189313  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3505  L-lactate dehydrogenase  36.25 
 
 		 315 aa  193  3e-48  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1484  L-lactate dehydrogenase  36.61 
 
 		 314 aa  192  5e-48  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.874193  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1918  L-lactate dehydrogenase  33.89 
 
 		 314 aa  191  1e-47  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000101641  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1927  L-lactate dehydrogenase  36.27 
 
 		 314 aa  188  8e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0216  L-lactate dehydrogenase  34.98 
 
 		 311 aa  188  1e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1257  L-lactate dehydrogenase  37.42 
 
 		 328 aa  188  1e-46  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000840632  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2007  L-lactate dehydrogenase  35.93 
 
 		 314 aa  187  2e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.227909  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1784  L-lactate dehydrogenase  35.93 
 
 		 314 aa  187  2e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.521865  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1763  L-lactate dehydrogenase  35.93 
 
 		 314 aa  187  2e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00307694  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1741  L-lactate dehydrogenase  35.93 
 
 		 314 aa  187  2e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2028  L-lactate dehydrogenase  35.93 
 
 		 314 aa  187  2e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0115403  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1923  L-lactate dehydrogenase  35.93 
 
 		 314 aa  187  2e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0148797  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1959  L-lactate dehydrogenase  35.93 
 
 		 314 aa  187  2e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000164106 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08746  malate dehydrogenase  34.54 
 
 		 308 aa  186  4e-46  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2485  L-lactate dehydrogenase  32.25 
 
 		 316 aa  185  7e-46  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0241914  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0231  L-lactate dehydrogenase  35.97 
 
 		 317 aa  184  2.0000000000000003e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5032  L-lactate dehydrogenase  34.2 
 
 		 314 aa  183  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4762  L-lactate dehydrogenase  34.2 
 
 		 314 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0105004  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4600  L-lactate dehydrogenase  34.2 
 
 		 314 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4624  L-lactate dehydrogenase  34.2 
 
 		 314 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000281298  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5125  L-lactate dehydrogenase  34.2 
 
 		 314 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.464176  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5012  L-lactate dehydrogenase  34.2 
 
 		 314 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0813817  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0236  L-lactate dehydrogenase  34.2 
 
 		 314 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0479489  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1951  malate dehydrogenase (NAD)  36.36 
 
 		 308 aa  184  2.0000000000000003e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.800681 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5002  L-lactate dehydrogenase  34.2 
 
 		 314 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0693832  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4981  L-lactate dehydrogenase  34.2 
 
 		 314 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0225  L-lactate dehydrogenase  35.97 
 
 		 317 aa  184  2.0000000000000003e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0520  L-lactate dehydrogenase  35.47 
 
 		 312 aa  182  4.0000000000000006e-45  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4713  L-lactate dehydrogenase  33.88 
 
 		 314 aa  182  5.0000000000000004e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2156  L-lactate dehydrogenase  34.29 
 
 		 316 aa  181  1e-44  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3415  L-lactate dehydrogenase  36.4 
 
 		 314 aa  181  1e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000130483 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0421  L-lactate dehydrogenase  34.08 
 
 		 314 aa  181  1e-44  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000701213  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0489  L-lactate dehydrogenase  34.09 
 
 		 319 aa  181  1e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0862  malate dehydrogenase  32.89 
 
 		 310 aa  181  2e-44  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0390301  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1798  L-lactate dehydrogenase  36.4 
 
 		 314 aa  180  2.9999999999999997e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0938319  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0463  L-lactate dehydrogenase  34.08 
 
 		 335 aa  180  2.9999999999999997e-44  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.23443  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3276  malate dehydrogenase  36.43 
 
 		 312 aa  179  4e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl596  L-lactate dehydrogenase  35.71 
 
 		 317 aa  178  9e-44  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3591  L-lactate dehydrogenase  31.73 
 
 		 316 aa  178  9e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.729354  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1713  malate dehydrogenase  33.22 
 
 		 310 aa  177  1e-43  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.905202  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1029  malate dehydrogenase  31.49 
 
 		 310 aa  178  1e-43  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00758057  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0351  L-lactate dehydrogenase  35.35 
 
 		 315 aa  177  2e-43  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0959  L-lactate dehydrogenase  34.95 
 
 		 329 aa  177  2e-43  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.000716339  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2677  malate dehydrogenase  34.55 
 
 		 312 aa  176  3e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1483  malate dehydrogenase (NAD)  33.99 
 
 		 321 aa  176  3e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0783  malate dehydrogenase  34.88 
 
 		 312 aa  177  3e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1689  Lactate/malate dehydrogenase  34.23 
 
 		 310 aa  176  4e-43  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.444612  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4826  L-lactate dehydrogenase  31.73 
 
 		 316 aa  176  6e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4723  malate dehydrogenase  35.22 
 
 		 312 aa  174  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5135  L-lactate dehydrogenase  31.41 
 
 		 316 aa  174  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.28654  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4486  malate dehydrogenase  35.22 
 
 		 312 aa  174  9.999999999999999e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4321  malate dehydrogenase  35.22 
 
 		 312 aa  174  9.999999999999999e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0536  malate dehydrogenase  35.22 
 
 		 312 aa  174  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00988703 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4837  malate dehydrogenase  35.22 
 
 		 312 aa  174  9.999999999999999e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4718  malate dehydrogenase  35.22 
 
 		 312 aa  174  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4702  malate dehydrogenase  35.22 
 
 		 312 aa  174  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.842149  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4496  malate dehydrogenase, NAD-dependent  35.4 
 
 		 313 aa  174  9.999999999999999e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.794515 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4707  malate dehydrogenase  35.22 
 
 		 312 aa  174  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000597561 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1919  L-lactate dehydrogenase  37.25 
 
 		 313 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0100  L-lactate dehydrogenase  31.41 
 
 		 316 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0267583  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5142  L-lactate dehydrogenase  31.09 
 
 		 316 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000108181  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4869  L-lactate dehydrogenase  31.09 
 
 		 316 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4708  L-lactate dehydrogenase  31.09 
 
 		 401 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4333  malate dehydrogenase  35.22 
 
 		 312 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4723  L-lactate dehydrogenase  31.09 
 
 		 316 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5240  L-lactate dehydrogenase  31.09 
 
 		 316 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0952  L-lactate dehydrogenase  32.69 
 
 		 319 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.172568  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5106  L-lactate dehydrogenase  31.09 
 
 		 316 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1900  malate dehydrogenase  32.57 
 
 		 310 aa  174  1.9999999999999998e-42  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0700  L-lactate dehydrogenase  33.12 
 
 		 318 aa  174  1.9999999999999998e-42  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1361  L-lactate dehydrogenase  34.87 
 
 		 317 aa  173  2.9999999999999996e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0269  L-lactate dehydrogenase  34.42 
 
 		 323 aa  173  2.9999999999999996e-42  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4422  malate dehydrogenase  34.88 
 
 		 312 aa  173  2.9999999999999996e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1109  lactate/malate dehydrogenase  38.18 
 
 		 288 aa  173  3.9999999999999995e-42  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.310763  normal  0.553423 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1510  malate dehydrogenase  33 
 
 		 310 aa  172  5.999999999999999e-42  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0354026  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0132  L-lactate dehydrogenase  34.74 
 
 		 313 aa  172  5.999999999999999e-42  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0832  malate dehydrogenase  32.14 
 
 		 310 aa  172  6.999999999999999e-42  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.328831  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5140  L-lactate dehydrogenase  31.09 
 
 		 316 aa  172  6.999999999999999e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000543313  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1656  malate dehydrogenase, NAD-dependent  35.08 
 
 		 312 aa  172  9e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0098  L-lactate dehydrogenase  30.69 
 
 		 317 aa  171  1e-41  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.409551  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0102  L-lactate dehydrogenase  30.69 
 
 		 317 aa  171  1e-41  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.02476  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0797  lactate/malate dehydrogenase  37.79 
 
 		 288 aa  170  2e-41  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.11982  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2352  L-lactate dehydrogenase  34.42 
 
 		 309 aa  171  2e-41  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0365594  normal  0.0145977 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1272  malate dehydrogenase (NAD)  34.64 
 
 		 312 aa  170  3e-41  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000869025  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3020  malate dehydrogenase (NAD)  34.77 
 
 		 312 aa  169  4e-41  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1088  malate dehydrogenase, NAD-dependent  34.1 
 
 		 316 aa  169  6e-41  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00100592  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0338  malate dehydrogenase  33.33 
 
 		 304 aa  169  7e-41  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2374  malate dehydrogenase, NAD-dependent  33.76 
 
 		 311 aa  169  7e-41  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1121  malate dehydrogenase  30.82 
 
 		 316 aa  169  8e-41  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2397  L-lactate dehydrogenase  34.58 
 
 		 316 aa  169  8e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.851403  normal  0.362138 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16140  L-lactate dehydrogenase  30.95 
 
 		 322 aa  168  9e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0169576  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0985  L-lactate dehydrogenase  34.44 
 
 		 309 aa  168  9e-41  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1065  L-lactate dehydrogenase  33.55 
 
 		 311 aa  167  1e-40  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000000229856  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>