294 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_1109 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009712  Mboo_1109  lactate/malate dehydrogenase  100 
 
 		 288 aa  585  1e-166  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.310763  normal  0.553423 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0797  lactate/malate dehydrogenase  59.51 
 
 		 288 aa  350  1e-95  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.11982  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1741  Lactate/malate dehydrogenase  62.14 
 
 		 282 aa  348  4e-95  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1155  lactate/malate dehydrogenase  50.35 
 
 		 290 aa  285  7e-76  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.327954  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0615  hypothetical protein  49.65 
 
 		 283 aa  270  2.9999999999999997e-71  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3728  Lactate/malate dehydrogenase  37.59 
 
 		 304 aa  172  7.999999999999999e-42  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0803  malate dehydrogenase  39.05 
 
 		 304 aa  166  5e-40  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2649  malate dehydrogenase  37.23 
 
 		 304 aa  164  2.0000000000000002e-39  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.387053  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1974  Lactate/malate dehydrogenase  35.53 
 
 		 304 aa  162  7e-39  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4713  L-lactate dehydrogenase  32.91 
 
 		 314 aa  155  1e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5012  L-lactate dehydrogenase  32.7 
 
 		 314 aa  154  2e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0813817  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0236  L-lactate dehydrogenase  32.7 
 
 		 314 aa  154  2e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0479489  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4762  L-lactate dehydrogenase  32.7 
 
 		 314 aa  154  2e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0105004  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4981  L-lactate dehydrogenase  32.7 
 
 		 314 aa  154  2e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4600  L-lactate dehydrogenase  32.7 
 
 		 314 aa  154  2e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4624  L-lactate dehydrogenase  32.7 
 
 		 314 aa  154  2e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000281298  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5125  L-lactate dehydrogenase  32.7 
 
 		 314 aa  154  2e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.464176  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5002  L-lactate dehydrogenase  32.7 
 
 		 314 aa  154  2e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0693832  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5032  L-lactate dehydrogenase  32.7 
 
 		 314 aa  153  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0489  L-lactate dehydrogenase  32.03 
 
 		 319 aa  151  1e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0231  L-lactate dehydrogenase  31.8 
 
 		 317 aa  150  2e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0225  L-lactate dehydrogenase  31.8 
 
 		 317 aa  150  2e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2255  malate dehydrogenase  32.45 
 
 		 311 aa  148  9e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3505  L-lactate dehydrogenase  31.65 
 
 		 315 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2007  L-lactate dehydrogenase  31.11 
 
 		 314 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.227909  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1959  L-lactate dehydrogenase  31.11 
 
 		 314 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000164106 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1784  L-lactate dehydrogenase  31.11 
 
 		 314 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.521865  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1763  L-lactate dehydrogenase  31.11 
 
 		 314 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00307694  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1741  L-lactate dehydrogenase  31.11 
 
 		 314 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2028  L-lactate dehydrogenase  31.11 
 
 		 314 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0115403  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1923  L-lactate dehydrogenase  31.11 
 
 		 314 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0148797  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0338  malate dehydrogenase  32.17 
 
 		 304 aa  140  1.9999999999999998e-32  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1927  L-lactate dehydrogenase  31.11 
 
 		 314 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1361  L-lactate dehydrogenase  30.49 
 
 		 317 aa  139  6e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0862  malate dehydrogenase  30.03 
 
 		 310 aa  138  7.999999999999999e-32  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0390301  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1455  L-lactate dehydrogenase  29.61 
 
 		 325 aa  138  8.999999999999999e-32  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1065  L-lactate dehydrogenase  28.66 
 
 		 311 aa  138  1e-31  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000000229856  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0832  malate dehydrogenase  29.32 
 
 		 310 aa  138  1e-31  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.328831  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1484  L-lactate dehydrogenase  30.41 
 
 		 314 aa  137  2e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.874193  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0849  L-lactate dehydrogenase  32.87 
 
 		 308 aa  137  2e-31  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000165176  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1798  L-lactate dehydrogenase  31.69 
 
 		 314 aa  136  4e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0938319  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4708  L-lactate dehydrogenase  30.77 
 
 		 401 aa  136  5e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4869  L-lactate dehydrogenase  30.77 
 
 		 316 aa  135  6.0000000000000005e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4723  L-lactate dehydrogenase  30.77 
 
 		 316 aa  135  6.0000000000000005e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5106  L-lactate dehydrogenase  30.77 
 
 		 316 aa  135  6.0000000000000005e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5240  L-lactate dehydrogenase  30.77 
 
 		 316 aa  135  6.0000000000000005e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5142  L-lactate dehydrogenase  30.77 
 
 		 316 aa  135  6.0000000000000005e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000108181  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5140  L-lactate dehydrogenase  30.45 
 
 		 316 aa  135  7.000000000000001e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000543313  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0439  L-lactate/malate dehydrogenase  31.19 
 
 		 317 aa  134  9.999999999999999e-31  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  hitchhiker  0.00200825  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3395  malate dehydrogenase  30.65 
 
 		 321 aa  135  9.999999999999999e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0100  L-lactate dehydrogenase  30.45 
 
 		 316 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0267583  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1510  malate dehydrogenase  28.9 
 
 		 310 aa  134  1.9999999999999998e-30  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0354026  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3415  L-lactate dehydrogenase  31.34 
 
 		 314 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000130483 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0716  malate dehydrogenase (NAD)  27.21 
 
 		 319 aa  134  1.9999999999999998e-30  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.00000000000101749  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1689  Lactate/malate dehydrogenase  29.41 
 
 		 310 aa  134  1.9999999999999998e-30  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.444612  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0345  malate dehydrogenase (NAD)  28.39 
 
 		 318 aa  134  3e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.569498  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0137  L-lactate dehydrogenase  29.84 
 
 		 310 aa  133  3.9999999999999996e-30  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000000668633  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4826  L-lactate dehydrogenase  29.81 
 
 		 316 aa  133  3.9999999999999996e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08746  malate dehydrogenase  30.79 
 
 		 308 aa  133  3.9999999999999996e-30  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3591  L-lactate dehydrogenase  30.35 
 
 		 316 aa  132  5e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.729354  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0700  L-lactate dehydrogenase  27.83 
 
 		 318 aa  132  5e-30  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5135  L-lactate dehydrogenase  30.13 
 
 		 316 aa  132  6e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.28654  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2485  L-lactate dehydrogenase  27.99 
 
 		 316 aa  132  7.999999999999999e-30  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0241914  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2675  L-lactate dehydrogenase  31.92 
 
 		 318 aa  132  9e-30  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_393  malate dehydrogenase, NAD-dependent  30.56 
 
 		 308 aa  131  1.0000000000000001e-29  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.871516  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0612  malate dehydrogenase  28.71 
 
 		 309 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00000000109591 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1053  L-lactate dehydrogenase  29.13 
 
 		 332 aa  130  3e-29  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.689779 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2193  malate dehydrogenase  29.97 
 
 		 318 aa  129  4.0000000000000003e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000748395  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1029  malate dehydrogenase  28.85 
 
 		 310 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00758057  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1603  malate dehydrogenase  29.93 
 
 		 310 aa  129  5.0000000000000004e-29  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4129  malate dehydrogenase  29.49 
 
 		 320 aa  129  5.0000000000000004e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2876  malate dehydrogenase  31.29 
 
 		 320 aa  129  5.0000000000000004e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1900  malate dehydrogenase  30.39 
 
 		 310 aa  129  5.0000000000000004e-29  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0561  malate dehydrogenase  29.94 
 
 		 320 aa  129  5.0000000000000004e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.394685  normal  0.500877 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2156  L-lactate dehydrogenase  30.8 
 
 		 316 aa  129  8.000000000000001e-29  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1053  L-lactate dehydrogenase  27.33 
 
 		 317 aa  128  1.0000000000000001e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.189313  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0907  malate dehydrogenase (NAD)  29.67 
 
 		 324 aa  128  1.0000000000000001e-28  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.657603  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0520  L-lactate dehydrogenase  30.79 
 
 		 312 aa  128  1.0000000000000001e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0194  malate dehydrogenase (NAD)  33.33 
 
 		 310 aa  128  1.0000000000000001e-28  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000257978  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0347  malate dehydrogenase  29.74 
 
 		 313 aa  127  2.0000000000000002e-28  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.536254  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1257  L-lactate dehydrogenase  29.15 
 
 		 328 aa  127  2.0000000000000002e-28  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000840632  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0463  L-lactate dehydrogenase  28.43 
 
 		 335 aa  127  3e-28  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.23443  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0165  L-lactate dehydrogenase  30.07 
 
 		 320 aa  127  3e-28  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1713  malate dehydrogenase  28.9 
 
 		 310 aa  127  3e-28  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.905202  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1450  malate dehydrogenase, NAD-dependent  30.06 
 
 		 333 aa  126  3e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0428  malate dehydrogenase  30.79 
 
 		 307 aa  127  3e-28  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0421  L-lactate dehydrogenase  28.71 
 
 		 314 aa  126  4.0000000000000003e-28  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000701213  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0269  L-lactate dehydrogenase  29.15 
 
 		 323 aa  126  4.0000000000000003e-28  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2944  malate dehydrogenase  30.13 
 
 		 320 aa  126  4.0000000000000003e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.533999  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0451  malate dehydrogenase  30.23 
 
 		 307 aa  126  5e-28  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1273  malate dehydrogenase  32.35 
 
 		 324 aa  126  5e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.570878  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4459  malate dehydrogenase, NAD-dependent  29.14 
 
 		 309 aa  126  5e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.688925 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3974  malate dehydrogenase  30.77 
 
 		 320 aa  125  7e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.342256  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3685  malate dehydrogenase  30.77 
 
 		 320 aa  125  7e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0930  malate dehydrogenase  29.39 
 
 		 320 aa  125  8.000000000000001e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5004  malate dehydrogenase  30.25 
 
 		 320 aa  124  1e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1856  malate dehydrogenase  29.71 
 
 		 320 aa  124  1e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1927  malate dehydrogenase  29.71 
 
 		 320 aa  124  2e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1699  malate dehydrogenase  27.72 
 
 		 309 aa  124  2e-27  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000446484 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1918  L-lactate dehydrogenase  25.24 
 
 		 314 aa  122  5e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000101641  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>