More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_1741 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_1741  Lactate/malate dehydrogenase  100 
 
 		 282 aa  573  1.0000000000000001e-162  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1109  lactate/malate dehydrogenase  62.14 
 
 		 288 aa  348  4e-95  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.310763  normal  0.553423 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0797  lactate/malate dehydrogenase  60.14 
 
 		 288 aa  341  1e-92  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.11982  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1155  lactate/malate dehydrogenase  49.29 
 
 		 290 aa  271  6e-72  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.327954  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0615  hypothetical protein  48.57 
 
 		 283 aa  268  5.9999999999999995e-71  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0803  malate dehydrogenase  39.81 
 
 		 304 aa  157  2e-37  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0338  malate dehydrogenase  32.89 
 
 		 304 aa  153  2.9999999999999998e-36  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2649  malate dehydrogenase  37.67 
 
 		 304 aa  152  5e-36  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.387053  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3728  Lactate/malate dehydrogenase  35.9 
 
 		 304 aa  149  6e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1974  Lactate/malate dehydrogenase  35.68 
 
 		 304 aa  148  1.0000000000000001e-34  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0489  L-lactate dehydrogenase  30.33 
 
 		 319 aa  140  1.9999999999999998e-32  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0225  L-lactate dehydrogenase  32.18 
 
 		 317 aa  137  2e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0231  L-lactate dehydrogenase  32.18 
 
 		 317 aa  137  2e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1088  malate dehydrogenase, NAD-dependent  30.67 
 
 		 316 aa  135  6.0000000000000005e-31  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00100592  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0832  malate dehydrogenase  29.57 
 
 		 310 aa  135  9e-31  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.328831  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1918  L-lactate dehydrogenase  27.04 
 
 		 314 aa  135  9.999999999999999e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000101641  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1048  malate dehydrogenase  30.79 
 
 		 319 aa  134  1.9999999999999998e-30  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.466907  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3604  malate dehydrogenase, NAD-dependent  34.1 
 
 		 320 aa  133  3e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.321555  normal  0.254256 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1484  L-lactate dehydrogenase  28.87 
 
 		 314 aa  133  3.9999999999999996e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.874193  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0421  L-lactate dehydrogenase  28.91 
 
 		 314 aa  131  1.0000000000000001e-29  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000701213  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0187  malate dehydrogenase  31.58 
 
 		 322 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.433088  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4129  malate dehydrogenase  30.59 
 
 		 320 aa  130  3e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4713  L-lactate dehydrogenase  30 
 
 		 314 aa  130  3e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3395  malate dehydrogenase  30.92 
 
 		 321 aa  130  3e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1029  malate dehydrogenase  29.37 
 
 		 310 aa  130  3e-29  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00758057  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0930  malate dehydrogenase  31.58 
 
 		 320 aa  130  3e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1510  malate dehydrogenase  28.48 
 
 		 310 aa  129  4.0000000000000003e-29  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0354026  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2675  L-lactate dehydrogenase  33.22 
 
 		 318 aa  129  4.0000000000000003e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2007  L-lactate dehydrogenase  29.55 
 
 		 314 aa  129  5.0000000000000004e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.227909  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1784  L-lactate dehydrogenase  29.55 
 
 		 314 aa  129  5.0000000000000004e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.521865  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2028  L-lactate dehydrogenase  29.55 
 
 		 314 aa  129  5.0000000000000004e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0115403  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1763  L-lactate dehydrogenase  29.55 
 
 		 314 aa  129  5.0000000000000004e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00307694  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1741  L-lactate dehydrogenase  29.55 
 
 		 314 aa  129  5.0000000000000004e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1923  L-lactate dehydrogenase  29.55 
 
 		 314 aa  129  5.0000000000000004e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0148797  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1927  L-lactate dehydrogenase  29.55 
 
 		 314 aa  129  5.0000000000000004e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1856  malate dehydrogenase  31.58 
 
 		 320 aa  129  5.0000000000000004e-29  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1959  L-lactate dehydrogenase  29.55 
 
 		 314 aa  129  5.0000000000000004e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000164106 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1713  malate dehydrogenase  29.9 
 
 		 310 aa  129  6e-29  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.905202  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0236  L-lactate dehydrogenase  30 
 
 		 314 aa  129  7.000000000000001e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0479489  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1927  malate dehydrogenase  31.58 
 
 		 320 aa  129  7.000000000000001e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4762  L-lactate dehydrogenase  30 
 
 		 314 aa  129  7.000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0105004  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4600  L-lactate dehydrogenase  30 
 
 		 314 aa  129  7.000000000000001e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4624  L-lactate dehydrogenase  30 
 
 		 314 aa  129  7.000000000000001e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000281298  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0862  malate dehydrogenase  27.96 
 
 		 310 aa  129  7.000000000000001e-29  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0390301  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5125  L-lactate dehydrogenase  30 
 
 		 314 aa  129  7.000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.464176  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1121  malate dehydrogenase  30.69 
 
 		 309 aa  129  7.000000000000001e-29  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5002  L-lactate dehydrogenase  30 
 
 		 314 aa  129  7.000000000000001e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0693832  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1900  malate dehydrogenase  29.14 
 
 		 310 aa  129  7.000000000000001e-29  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4981  L-lactate dehydrogenase  30 
 
 		 314 aa  129  7.000000000000001e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1455  L-lactate dehydrogenase  30 
 
 		 325 aa  128  8.000000000000001e-29  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5032  L-lactate dehydrogenase  30 
 
 		 314 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5012  L-lactate dehydrogenase  30 
 
 		 314 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0813817  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1450  malate dehydrogenase, NAD-dependent  30 
 
 		 333 aa  127  2.0000000000000002e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2944  malate dehydrogenase  30.92 
 
 		 320 aa  126  3e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.533999  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1505  L-lactate dehydrogenase  29.69 
 
 		 322 aa  126  4.0000000000000003e-28  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0952  L-lactate dehydrogenase  28.52 
 
 		 319 aa  126  4.0000000000000003e-28  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.172568  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1689  Lactate/malate dehydrogenase  29.21 
 
 		 310 aa  125  6e-28  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.444612  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3505  L-lactate dehydrogenase  28.87 
 
 		 315 aa  125  6e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1299  lactate/malate dehydrogenase  29.83 
 
 		 309 aa  125  6e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2829  malate dehydrogenase (NAD)  31.94 
 
 		 320 aa  125  7e-28  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1603  malate dehydrogenase  28.57 
 
 		 310 aa  124  2e-27  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5004  malate dehydrogenase  30.97 
 
 		 320 aa  124  2e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3974  malate dehydrogenase  30.59 
 
 		 320 aa  124  3e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.342256  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3685  malate dehydrogenase  30.59 
 
 		 320 aa  124  3e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0561  malate dehydrogenase  30.65 
 
 		 320 aa  123  4e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.394685  normal  0.500877 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2876  malate dehydrogenase  29.68 
 
 		 320 aa  122  5e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0194  malate dehydrogenase  31.25 
 
 		 322 aa  122  7e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0912  malate dehydrogenase, NAD-dependent  28.24 
 
 		 312 aa  122  7e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0881394  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0930  L-lactate dehydrogenase  29.6 
 
 		 319 aa  122  7e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000455323  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3415  L-lactate dehydrogenase  29.55 
 
 		 314 aa  122  7e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000130483 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0463  L-lactate dehydrogenase  27.04 
 
 		 335 aa  122  9e-27  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.23443  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1361  L-lactate dehydrogenase  29.9 
 
 		 317 aa  121  9.999999999999999e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0545  malate dehydrogenase  30.79 
 
 		 322 aa  121  9.999999999999999e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.557349  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0716  malate dehydrogenase (NAD)  26.25 
 
 		 319 aa  121  9.999999999999999e-27  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.00000000000101749  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3276  malate dehydrogenase  30.62 
 
 		 312 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0392  malate dehydrogenase  31.68 
 
 		 322 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.293299  normal  0.208989 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1798  L-lactate dehydrogenase  29.55 
 
 		 314 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0938319  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0419  malate dehydrogenase  32.57 
 
 		 322 aa  120  1.9999999999999998e-26  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.425489  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1587  malate dehydrogenase, NAD-dependent  30.32 
 
 		 320 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.295644  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0435  L-2-hydroxyisocaproate/malate/lactate dehydrogenase-like protein  30.49 
 
 		 316 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0223779  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1257  L-lactate dehydrogenase  29.97 
 
 		 328 aa  120  1.9999999999999998e-26  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000840632  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2501  malate dehydrogenase, NAD-dependent  32.57 
 
 		 321 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.448823 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2156  L-lactate dehydrogenase  28.57 
 
 		 316 aa  120  3e-26  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4422  malate dehydrogenase  31.15 
 
 		 312 aa  120  3e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0206  L-lactate dehydrogenase  27.27 
 
 		 319 aa  120  3e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0968  malate dehydrogenase  30.32 
 
 		 338 aa  119  3.9999999999999996e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2628  malate dehydrogenase  30.32 
 
 		 320 aa  120  3.9999999999999996e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3778  L-lactate dehydrogenase  26.3 
 
 		 331 aa  119  4.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.95012 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4723  malate dehydrogenase  30.94 
 
 		 312 aa  119  4.9999999999999996e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0907  malate dehydrogenase (NAD)  29.9 
 
 		 324 aa  119  4.9999999999999996e-26  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.657603  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4486  malate dehydrogenase  30.94 
 
 		 312 aa  119  4.9999999999999996e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4321  malate dehydrogenase  30.94 
 
 		 312 aa  119  4.9999999999999996e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2485  L-lactate dehydrogenase  26.14 
 
 		 316 aa  119  4.9999999999999996e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0241914  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4837  malate dehydrogenase  30.94 
 
 		 312 aa  119  4.9999999999999996e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4718  malate dehydrogenase  30.94 
 
 		 312 aa  119  4.9999999999999996e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4707  malate dehydrogenase  30.94 
 
 		 312 aa  119  4.9999999999999996e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000597561 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2255  malate dehydrogenase  28.52 
 
 		 311 aa  119  4.9999999999999996e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4702  malate dehydrogenase  30.94 
 
 		 312 aa  119  4.9999999999999996e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.842149  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0536  malate dehydrogenase  30.94 
 
 		 312 aa  119  4.9999999999999996e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00988703 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0137  L-lactate dehydrogenase  28.42 
 
 		 310 aa  119  7.999999999999999e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000000668633  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>