More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mfla_2082 on replicon NC_007947
Organism: Methylobacillus flagellatus KT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009943  Dole_1595  glutaminyl-tRNA synthetase  55.63 
 
 
562 aa  644    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000811863  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1722  glutaminyl-tRNA synthetase  58.61 
 
 
590 aa  731    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3366  glutaminyl-tRNA synthetase  58.25 
 
 
554 aa  682    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0791  glutaminyl-tRNA synthetase  63.4 
 
 
580 aa  778    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00535923  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2106  glutaminyl-tRNA synthetase  62.11 
 
 
620 aa  764    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1655  glutaminyl-tRNA synthetase  62.5 
 
 
569 aa  786    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.434975  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3799  glutaminyl-tRNA synthetase  58.46 
 
 
565 aa  683    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.105698  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0892  glutaminyl-tRNA synthetase  62.5 
 
 
569 aa  786    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.522948  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1956  glutaminyl-tRNA synthetase  62.95 
 
 
619 aa  803    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2128  glutaminyl-tRNA synthetase  55.63 
 
 
558 aa  667    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.116661  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3447  glutaminyl-tRNA synthetase  71.6 
 
 
601 aa  898    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.183021  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0833  glutaminyl-tRNA synthetase  64.77 
 
 
609 aa  810    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.227422  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4167  glutaminyl-tRNA synthetase  58.23 
 
 
568 aa  684    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0850  glutaminyl-tRNA synthetase  72.34 
 
 
565 aa  887    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.750586 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1351  glutaminyl-tRNA synthetase  64.47 
 
 
625 aa  819    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.22682 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1812  glutaminyl-tRNA synthetase  62.5 
 
 
596 aa  786    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0624978  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3639  glutaminyl-tRNA synthetase  54.21 
 
 
566 aa  636    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.193855 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0701  glutaminyl-tRNA synthetase  62.5 
 
 
569 aa  786    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2300  glutaminyl-tRNA synthetase  66 
 
 
604 aa  803    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.775495  hitchhiker  0.00472002 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0101  glutaminyl-tRNA synthetase  55.24 
 
 
572 aa  659    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1440  glutaminyl-tRNA synthetase  57.96 
 
 
590 aa  720    Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4549  glutaminyl-tRNA synthetase  61.82 
 
 
569 aa  771    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0058  glutaminyl-tRNA synthetase  57.78 
 
 
553 aa  676    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1419  glutaminyl-tRNA synthetase  62.5 
 
 
569 aa  786    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2083  glutaminyl-tRNA synthetase  63.01 
 
 
565 aa  761    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0417  glutaminyl-tRNA synthetase  56.99 
 
 
570 aa  640    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2665  glutaminyl-tRNA synthetase  62.67 
 
 
569 aa  789    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0180309  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1633  glutaminyl-tRNA synthetase  62.5 
 
 
569 aa  786    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0234579  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0459  glutaminyl-tRNA synthetase  62.5 
 
 
569 aa  786    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.200352  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1823  glutaminyl-tRNA synthetase  66.55 
 
 
620 aa  833    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.236444  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4234  glutaminyl-tRNA synthetase  60.93 
 
 
628 aa  777    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.512355  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2082  glutaminyl-tRNA synthetase  100 
 
 
596 aa  1248    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3350  glutaminyl-tRNA synthetase  67.01 
 
 
612 aa  842    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.446012  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1307  glutaminyl-tRNA synthetase  60.3 
 
 
569 aa  764    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.518903 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1383  glutaminyl-tRNA synthetase  62.16 
 
 
569 aa  773    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.21862 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0917  glutaminyl-tRNA synthetase  55.21 
 
 
580 aa  647    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000234027  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3615  glutaminyl-tRNA synthetase  62.48 
 
 
604 aa  765    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0818  glutaminyl-tRNA synthetase  65.44 
 
 
582 aa  815    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0602034 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1910  glutaminyl-tRNA synthetase  62.33 
 
 
569 aa  778    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.125081  normal  0.474008 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0907  glutaminyl-tRNA synthetase  59.9 
 
 
573 aa  760    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.47238  normal  0.116742 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0923  glutaminyl-tRNA synthetase  61.99 
 
 
569 aa  770    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0807  glutaminyl-tRNA synthetase  63.91 
 
 
576 aa  791    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3475  glutaminyl-tRNA synthetase  68.77 
 
 
580 aa  841    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.675011  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0737  glutaminyl-tRNA synthetase  64.25 
 
 
576 aa  795    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.705767 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2489  glutaminyl-tRNA synthetase  63.44 
 
 
628 aa  780    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.348207  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1282  glutaminyl-tRNA synthetase  61.66 
 
 
569 aa  767    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1316  glutaminyl-tRNA synthetase  61.66 
 
 
569 aa  767    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.110897 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1608  glutaminyl-tRNA synthetase  62.11 
 
 
613 aa  765    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0558752  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1405  glutaminyl-tRNA synthetase  62.16 
 
 
569 aa  772    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.681017  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2828  glutaminyl-tRNA synthetase  60.64 
 
 
569 aa  763    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.531779  normal  0.0114243 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1220  glutaminyl-tRNA synthetase  62.1 
 
 
573 aa  753    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1384  glutaminyl-tRNA synthetase  54.5 
 
 
563 aa  637    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.559394 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1725  glutaminyl-tRNA synthetase  58.16 
 
 
565 aa  684    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.153622  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1485  glutaminyl-tRNA synthetase  57.26 
 
 
569 aa  655    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0189  glutaminyl-tRNA synthetase  55.8 
 
 
561 aa  655    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.360973  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1314  glutaminyl-tRNA synthetase  64.37 
 
 
609 aa  786    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3882  glutaminyl-tRNA synthetase  58.01 
 
 
565 aa  688    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3791  glutaminyl-tRNA synthetase  54.96 
 
 
565 aa  634  1e-180  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0626  glutaminyl-tRNA synthetase  55.4 
 
 
568 aa  632  1e-180  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.16998  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2572  glutaminyl-tRNA synthetase  55.18 
 
 
555 aa  634  1e-180  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0923139  hitchhiker  0.00019462 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3251  glutaminyl-tRNA synthetase  53.86 
 
 
560 aa  632  1e-180  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0682  glutaminyl-tRNA synthetase  53.76 
 
 
582 aa  632  1e-180  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.613732  normal  0.476969 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0536  glutaminyl-tRNA synthetase  53.99 
 
 
556 aa  631  1e-179  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3743  glutaminyl-tRNA synthetase  54.15 
 
 
569 aa  631  1e-179  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0260392  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0832  glutaminyl-tRNA synthetase  54.12 
 
 
552 aa  628  1e-179  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.551071  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1734  glutaminyl-tRNA synthetase  54.15 
 
 
564 aa  629  1e-179  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.112324  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0517  glutaminyl-tRNA synthetase  53.92 
 
 
556 aa  629  1e-179  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0242  glutaminyl-tRNA synthetase  54.55 
 
 
555 aa  630  1e-179  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004127  glutaminyl-tRNA synthetase  54.1 
 
 
556 aa  629  1e-179  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000085379  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3294  glutaminyl-tRNA synthetase  54.62 
 
 
565 aa  628  1e-179  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000133432  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2879  glutaminyl-tRNA synthetase  54.68 
 
 
567 aa  629  1e-179  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2406  glutaminyl-tRNA synthetase  54.34 
 
 
567 aa  629  1e-179  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2459  glutaminyl-tRNA synthetase  54.84 
 
 
589 aa  630  1e-179  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0267  glutaminyl-tRNA synthetase  55.38 
 
 
587 aa  631  1e-179  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2811  glutaminyl-tRNA synthetase  52.85 
 
 
561 aa  627  1e-178  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.129668  normal  0.859959 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2452  glutaminyl-tRNA synthetase  54.55 
 
 
559 aa  627  1e-178  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.930191  normal  0.727818 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0421  glutaminyl-tRNA synthetase  52.68 
 
 
559 aa  627  1e-178  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2787  glutaminyl-tRNA synthetase  54.51 
 
 
567 aa  625  1e-178  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41380  glutaminyl-tRNA synthetase  54.5 
 
 
556 aa  625  1e-178  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.423392 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2904  glutaminyl-tRNA synthetase  54.34 
 
 
567 aa  623  1e-177  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.781654 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2841  glutaminyl-tRNA synthetase  53 
 
 
561 aa  621  1e-177  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.602815 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3509  glutaminyl-tRNA synthetase  54.33 
 
 
561 aa  624  1e-177  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.271227  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1195  glutaminyl-tRNA synthetase  53.75 
 
 
555 aa  621  1e-176  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.068426  decreased coverage  0.0000265755 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0612  glutaminyl-tRNA synthetase  53.94 
 
 
552 aa  620  1e-176  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000113459  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0773  glutaminyl-tRNA synthetase  54.27 
 
 
554 aa  618  1e-176  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0411639  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0706  glutaminyl-tRNA synthetase  54.1 
 
 
554 aa  616  1e-175  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000238299  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00637  glutaminyl-tRNA synthetase  54.1 
 
 
554 aa  616  1e-175  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2957  glutaminyl-tRNA synthetase  54.1 
 
 
554 aa  616  1e-175  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.690706  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4241  glutaminyl-tRNA synthetase  51.83 
 
 
564 aa  618  1e-175  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0792  glutaminyl-tRNA synthetase  54.1 
 
 
555 aa  617  1e-175  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.674612  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0570  glutaminyl-tRNA synthetase  54.1 
 
 
554 aa  616  1e-175  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.011441  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2976  glutaminyl-tRNA synthetase  54.1 
 
 
554 aa  616  1e-175  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01337  glutaminyl-tRNA synthetase  53.24 
 
 
556 aa  617  1e-175  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0841  glutaminyl-tRNA synthetase  54.1 
 
 
555 aa  617  1e-175  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04610  glutaminyl-tRNA synthetase  52.42 
 
 
579 aa  616  1e-175  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.959469  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0702  glutaminyl-tRNA synthetase  54.1 
 
 
554 aa  616  1e-175  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.237561  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0725  glutaminyl-tRNA synthetase  54.1 
 
 
554 aa  616  1e-175  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.769137  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0626  glutaminyl-tRNA synthetase  53.77 
 
 
552 aa  618  1e-175  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00799923  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4500  glutaminyl-tRNA synthetase  53.52 
 
 
563 aa  615  1e-175  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.111687  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0805  glutaminyl-tRNA synthetase  54.1 
 
 
555 aa  617  1e-175  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.112626  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>