More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMA0892 on replicon NC_006348
Organism: Burkholderia mallei ATCC 23344



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009801  EcE24377A_0706  glutaminyl-tRNA synthetase  57.35 
 
 
554 aa  650    Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000238299  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1595  glutaminyl-tRNA synthetase  57.07 
 
 
562 aa  654    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000811863  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00637  glutaminyl-tRNA synthetase  57.35 
 
 
554 aa  650    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2957  glutaminyl-tRNA synthetase  57.35 
 
 
554 aa  650    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.690706  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2907  glutaminyl-tRNA synthetase  57.96 
 
 
555 aa  647    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.483628  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2489  glutaminyl-tRNA synthetase  59.46 
 
 
628 aa  721    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.348207  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3366  glutaminyl-tRNA synthetase  61.22 
 
 
554 aa  702    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2904  glutaminyl-tRNA synthetase  58.44 
 
 
567 aa  643    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.781654 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0733  glutaminyl-tRNA synthetase  57.71 
 
 
555 aa  651    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1116  glutaminyl-tRNA synthetase  57.48 
 
 
552 aa  642    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1314  glutaminyl-tRNA synthetase  60.85 
 
 
609 aa  755    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1220  glutaminyl-tRNA synthetase  61.78 
 
 
573 aa  726    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0791  glutaminyl-tRNA synthetase  70.62 
 
 
580 aa  867    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00535923  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1195  glutaminyl-tRNA synthetase  58.06 
 
 
555 aa  657    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.068426  decreased coverage  0.0000265755 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0773  glutaminyl-tRNA synthetase  57.17 
 
 
554 aa  650    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0411639  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3126  glutaminyl-tRNA synthetase  56.4 
 
 
552 aa  635    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.0016183  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0892  glutaminyl-tRNA synthetase  100 
 
 
569 aa  1189    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.522948  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1956  glutaminyl-tRNA synthetase  57.71 
 
 
619 aa  719    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1383  glutaminyl-tRNA synthetase  91.39 
 
 
569 aa  1085    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.21862 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2940  glutaminyl-tRNA synthetase  57.01 
 
 
552 aa  640    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0919452  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0267  glutaminyl-tRNA synthetase  57.29 
 
 
587 aa  667    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2879  glutaminyl-tRNA synthetase  58.61 
 
 
567 aa  644    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3447  glutaminyl-tRNA synthetase  62.6 
 
 
601 aa  773    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.183021  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0833  glutaminyl-tRNA synthetase  73.2 
 
 
609 aa  887    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.227422  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2994  glutaminyl-tRNA synthetase  57.78 
 
 
555 aa  645    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0850  glutaminyl-tRNA synthetase  68.74 
 
 
565 aa  822    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.750586 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01892  glutaminyl-tRNA synthetase  56.09 
 
 
555 aa  635    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00449379  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2828  glutaminyl-tRNA synthetase  87.7 
 
 
569 aa  1056    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.531779  normal  0.0114243 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1812  glutaminyl-tRNA synthetase  100 
 
 
596 aa  1189    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0624978  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1384  glutaminyl-tRNA synthetase  59.12 
 
 
563 aa  675    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.559394 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1485  glutaminyl-tRNA synthetase  61.04 
 
 
569 aa  692    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4234  glutaminyl-tRNA synthetase  57.59 
 
 
628 aa  699    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.512355  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0101  glutaminyl-tRNA synthetase  58.19 
 
 
572 aa  677    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4549  glutaminyl-tRNA synthetase  91.04 
 
 
569 aa  1084    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0058  glutaminyl-tRNA synthetase  58.8 
 
 
553 aa  677    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0459  glutaminyl-tRNA synthetase  100 
 
 
569 aa  1189    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.200352  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0626  glutaminyl-tRNA synthetase  58.44 
 
 
568 aa  674    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.16998  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2128  glutaminyl-tRNA synthetase  56.08 
 
 
558 aa  660    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.116661  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1440  glutaminyl-tRNA synthetase  64.41 
 
 
590 aa  790    Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0701  glutaminyl-tRNA synthetase  100 
 
 
569 aa  1189    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2083  glutaminyl-tRNA synthetase  67.38 
 
 
565 aa  804    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0189  glutaminyl-tRNA synthetase  58.21 
 
 
561 aa  667    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.360973  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2665  glutaminyl-tRNA synthetase  97.72 
 
 
569 aa  1162    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0180309  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1655  glutaminyl-tRNA synthetase  99.82 
 
 
569 aa  1186    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.434975  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1316  glutaminyl-tRNA synthetase  91.21 
 
 
569 aa  1082    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.110897 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0832  glutaminyl-tRNA synthetase  57.81 
 
 
552 aa  649    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.551071  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0917  glutaminyl-tRNA synthetase  59.72 
 
 
580 aa  684    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000234027  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2406  glutaminyl-tRNA synthetase  58.79 
 
 
567 aa  646    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1351  glutaminyl-tRNA synthetase  60.63 
 
 
625 aa  746    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.22682 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1419  glutaminyl-tRNA synthetase  100 
 
 
569 aa  1189    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1608  glutaminyl-tRNA synthetase  57.71 
 
 
613 aa  701    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0558752  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1823  glutaminyl-tRNA synthetase  59.28 
 
 
620 aa  737    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.236444  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2976  glutaminyl-tRNA synthetase  57.35 
 
 
554 aa  650    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0745  glutaminyl-tRNA synthetase  57.53 
 
 
555 aa  649    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.794095  normal  0.613987 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2082  glutaminyl-tRNA synthetase  62.5 
 
 
596 aa  786    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3350  glutaminyl-tRNA synthetase  61.95 
 
 
612 aa  751    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.446012  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1307  glutaminyl-tRNA synthetase  87.7 
 
 
569 aa  1060    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.518903 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0807  glutaminyl-tRNA synthetase  72.47 
 
 
576 aa  882    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0907  glutaminyl-tRNA synthetase  83.42 
 
 
573 aa  1018    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.47238  normal  0.116742 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0841  glutaminyl-tRNA synthetase  57.71 
 
 
555 aa  650    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3791  glutaminyl-tRNA synthetase  57.75 
 
 
565 aa  664    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0725  glutaminyl-tRNA synthetase  57.35 
 
 
554 aa  650    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.769137  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0570  glutaminyl-tRNA synthetase  57.27 
 
 
554 aa  651    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.011441  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1910  glutaminyl-tRNA synthetase  91.04 
 
 
569 aa  1092    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.125081  normal  0.474008 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0818  glutaminyl-tRNA synthetase  73.7 
 
 
582 aa  910    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0602034 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0702  glutaminyl-tRNA synthetase  57.17 
 
 
554 aa  649    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.237561  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0242  glutaminyl-tRNA synthetase  55.44 
 
 
555 aa  641    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0326  glutaminyl-tRNA synthetase  57.96 
 
 
555 aa  647    Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000088467  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2787  glutaminyl-tRNA synthetase  58.79 
 
 
567 aa  643    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0517  glutaminyl-tRNA synthetase  60.14 
 
 
556 aa  671    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0923  glutaminyl-tRNA synthetase  91.21 
 
 
569 aa  1082    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2106  glutaminyl-tRNA synthetase  57.55 
 
 
620 aa  699    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2184  glutaminyl-tRNA synthetase  56.15 
 
 
558 aa  640    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.213652  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1633  glutaminyl-tRNA synthetase  100 
 
 
569 aa  1189    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0234579  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004127  glutaminyl-tRNA synthetase  58.35 
 
 
556 aa  662    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000085379  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1205  glutaminyl-tRNA synthetase  57.48 
 
 
552 aa  639    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00285651  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3615  glutaminyl-tRNA synthetase  58.25 
 
 
604 aa  692    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0737  glutaminyl-tRNA synthetase  72.13 
 
 
576 aa  880    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.705767 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2363  glutaminyl-tRNA synthetase  55.02 
 
 
570 aa  647    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.621285 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3882  glutaminyl-tRNA synthetase  61.04 
 
 
565 aa  706    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0417  glutaminyl-tRNA synthetase  59.23 
 
 
570 aa  687    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0792  glutaminyl-tRNA synthetase  57.71 
 
 
555 aa  651    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.674612  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1722  glutaminyl-tRNA synthetase  64.06 
 
 
590 aa  793    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2459  glutaminyl-tRNA synthetase  56.97 
 
 
589 aa  655    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3475  glutaminyl-tRNA synthetase  68.62 
 
 
580 aa  815    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.675011  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1282  glutaminyl-tRNA synthetase  91.21 
 
 
569 aa  1083    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0805  glutaminyl-tRNA synthetase  57.71 
 
 
555 aa  651    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.112626  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0682  glutaminyl-tRNA synthetase  55.23 
 
 
582 aa  639    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.613732  normal  0.476969 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1405  glutaminyl-tRNA synthetase  91.39 
 
 
569 aa  1084    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.681017  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0536  glutaminyl-tRNA synthetase  57.14 
 
 
556 aa  642    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01337  glutaminyl-tRNA synthetase  58.17 
 
 
556 aa  653    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3516  glutaminyl-tRNA synthetase  55.96 
 
 
564 aa  648    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.953083  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1725  glutaminyl-tRNA synthetase  60.04 
 
 
565 aa  690    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.153622  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1229  glutaminyl-tRNA synthetase  56.73 
 
 
554 aa  635    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0152842  normal  0.0951842 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2300  glutaminyl-tRNA synthetase  59.36 
 
 
604 aa  723    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.775495  hitchhiker  0.00472002 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4167  glutaminyl-tRNA synthetase  60.18 
 
 
568 aa  702    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3799  glutaminyl-tRNA synthetase  60.49 
 
 
565 aa  704    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.105698  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00628  hypothetical protein  57.35 
 
 
554 aa  650    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3240  glutaminyl-tRNA synthetase  56.79 
 
 
556 aa  633  1e-180  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.00746606  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2669  glutaminyl-tRNA synthetase  57.12 
 
 
556 aa  633  1e-180  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0864702  normal  0.0642035 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>