More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_3447 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009074  BURPS668_1633  glutaminyl-tRNA synthetase  62.6 
 
 		 569 aa  773    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0234579  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3366  glutaminyl-tRNA synthetase  56.1 
 
 		 554 aa  665    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1314  glutaminyl-tRNA synthetase  59.93 
 
 		 609 aa  737    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0791  glutaminyl-tRNA synthetase  62.1 
 
 		 580 aa  768    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00535923  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2106  glutaminyl-tRNA synthetase  59.16 
 
 		 620 aa  725    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1440  glutaminyl-tRNA synthetase  55.56 
 
 		 590 aa  690    Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1608  glutaminyl-tRNA synthetase  59.16 
 
 		 613 aa  725    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0558752  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0892  glutaminyl-tRNA synthetase  62.6 
 
 		 569 aa  773    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.522948  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1419  glutaminyl-tRNA synthetase  62.6 
 
 		 569 aa  773    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3447  glutaminyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 601 aa  1255    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.183021  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0833  glutaminyl-tRNA synthetase  63.31 
 
 		 609 aa  784    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.227422  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0850  glutaminyl-tRNA synthetase  70.27 
 
 		 565 aa  869    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.750586 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1812  glutaminyl-tRNA synthetase  62.6 
 
 		 596 aa  774    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0624978  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0459  glutaminyl-tRNA synthetase  62.6 
 
 		 569 aa  773    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.200352  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1655  glutaminyl-tRNA synthetase  62.77 
 
 		 569 aa  776    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.434975  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4549  glutaminyl-tRNA synthetase  62.48 
 
 		 569 aa  758    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0058  glutaminyl-tRNA synthetase  54.34 
 
 		 553 aa  638    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0417  glutaminyl-tRNA synthetase  58.6 
 
 		 570 aa  648    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2083  glutaminyl-tRNA synthetase  59.27 
 
 		 565 aa  719    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2665  glutaminyl-tRNA synthetase  62.6 
 
 		 569 aa  776    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0180309  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1351  glutaminyl-tRNA synthetase  61.31 
 
 		 625 aa  759    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.22682 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2828  glutaminyl-tRNA synthetase  63.03 
 
 		 569 aa  784    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.531779  normal  0.0114243 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1823  glutaminyl-tRNA synthetase  60.54 
 
 		 620 aa  754    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.236444  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4234  glutaminyl-tRNA synthetase  57.19 
 
 		 628 aa  718    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.512355  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2082  glutaminyl-tRNA synthetase  71.6 
 
 		 596 aa  898    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3350  glutaminyl-tRNA synthetase  61.21 
 
 		 612 aa  764    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.446012  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1307  glutaminyl-tRNA synthetase  63.19 
 
 		 569 aa  790    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.518903 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1383  glutaminyl-tRNA synthetase  62.82 
 
 		 569 aa  759    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.21862 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2489  glutaminyl-tRNA synthetase  60.1 
 
 		 628 aa  738    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.348207  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1956  glutaminyl-tRNA synthetase  59.05 
 
 		 619 aa  738    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0818  glutaminyl-tRNA synthetase  63.46 
 
 		 582 aa  786    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0602034 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4167  glutaminyl-tRNA synthetase  54.64 
 
 		 568 aa  645    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1910  glutaminyl-tRNA synthetase  63.5 
 
 		 569 aa  766    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.125081  normal  0.474008 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3799  glutaminyl-tRNA synthetase  53.79 
 
 		 565 aa  642    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.105698  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0923  glutaminyl-tRNA synthetase  62.82 
 
 		 569 aa  759    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2300  glutaminyl-tRNA synthetase  60.13 
 
 		 604 aa  736    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.775495  hitchhiker  0.00472002 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1485  glutaminyl-tRNA synthetase  53.95 
 
 		 569 aa  637    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3475  glutaminyl-tRNA synthetase  69.73 
 
 		 580 aa  860    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.675011  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1220  glutaminyl-tRNA synthetase  61.08 
 
 		 573 aa  744    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0907  glutaminyl-tRNA synthetase  62.07 
 
 		 573 aa  775    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.47238  normal  0.116742 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0807  glutaminyl-tRNA synthetase  62.61 
 
 		 576 aa  768    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0701  glutaminyl-tRNA synthetase  62.6 
 
 		 569 aa  773    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1282  glutaminyl-tRNA synthetase  62.48 
 
 		 569 aa  753    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3615  glutaminyl-tRNA synthetase  58.31 
 
 		 604 aa  716    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1405  glutaminyl-tRNA synthetase  62.99 
 
 		 569 aa  761    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.681017  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0737  glutaminyl-tRNA synthetase  62.44 
 
 		 576 aa  766    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.705767 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3882  glutaminyl-tRNA synthetase  54.09 
 
 		 565 aa  645    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1722  glutaminyl-tRNA synthetase  54.74 
 
 		 590 aa  684    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1316  glutaminyl-tRNA synthetase  62.31 
 
 		 569 aa  753    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.110897 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1734  glutaminyl-tRNA synthetase  54.08 
 
 		 564 aa  632  1e-180  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.112324  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2572  glutaminyl-tRNA synthetase  54.33 
 
 		 555 aa  629  1e-179  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0923139  hitchhiker  0.00019462 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0917  glutaminyl-tRNA synthetase  53.48 
 
 		 580 aa  630  1e-179  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000234027  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0189  glutaminyl-tRNA synthetase  53.74 
 
 		 561 aa  628  1e-178  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.360973  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2128  glutaminyl-tRNA synthetase  52.71 
 
 		 558 aa  625  1e-178  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.116661  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3743  glutaminyl-tRNA synthetase  53.23 
 
 		 569 aa  624  1e-177  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0260392  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41380  glutaminyl-tRNA synthetase  53.27 
 
 		 556 aa  623  1e-177  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.423392 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3509  glutaminyl-tRNA synthetase  53.27 
 
 		 561 aa  622  1e-177  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.271227  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3639  glutaminyl-tRNA synthetase  52.2 
 
 		 566 aa  618  1e-176  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.193855 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0101  glutaminyl-tRNA synthetase  52.6 
 
 		 572 aa  620  1e-176  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0626  glutaminyl-tRNA synthetase  53.17 
 
 		 568 aa  615  1e-175  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.16998  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2406  glutaminyl-tRNA synthetase  51.75 
 
 		 567 aa  616  1e-175  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2452  glutaminyl-tRNA synthetase  53.16 
 
 		 559 aa  617  1e-175  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.930191  normal  0.727818 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1725  glutaminyl-tRNA synthetase  53.07 
 
 		 565 aa  615  1e-175  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.153622  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0682  glutaminyl-tRNA synthetase  51.4 
 
 		 582 aa  611  9.999999999999999e-175  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.613732  normal  0.476969 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2879  glutaminyl-tRNA synthetase  51.75 
 
 		 567 aa  613  9.999999999999999e-175  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23520  glutaminyl-tRNA synthetase  52.9 
 
 		 555 aa  614  9.999999999999999e-175  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3251  glutaminyl-tRNA synthetase  52.82 
 
 		 560 aa  612  9.999999999999999e-175  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2363  glutaminyl-tRNA synthetase  51.73 
 
 		 570 aa  615  9.999999999999999e-175  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.621285 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2904  glutaminyl-tRNA synthetase  51.59 
 
 		 567 aa  609  1e-173  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.781654 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0536  glutaminyl-tRNA synthetase  52.69 
 
 		 556 aa  608  1e-173  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2787  glutaminyl-tRNA synthetase  51.59 
 
 		 567 aa  610  1e-173  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2841  glutaminyl-tRNA synthetase  51.43 
 
 		 561 aa  610  1e-173  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.602815 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2459  glutaminyl-tRNA synthetase  52.76 
 
 		 589 aa  611  1e-173  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3516  glutaminyl-tRNA synthetase  52.02 
 
 		 564 aa  609  1e-173  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.953083  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1595  glutaminyl-tRNA synthetase  52.64 
 
 		 562 aa  606  9.999999999999999e-173  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000811863  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1384  glutaminyl-tRNA synthetase  51.7 
 
 		 563 aa  606  9.999999999999999e-173  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.559394 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0267  glutaminyl-tRNA synthetase  51.58 
 
 		 587 aa  606  9.999999999999999e-173  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3791  glutaminyl-tRNA synthetase  52.28 
 
 		 565 aa  603  1.0000000000000001e-171  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04610  glutaminyl-tRNA synthetase  50.74 
 
 		 579 aa  603  1.0000000000000001e-171  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.959469  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0242  glutaminyl-tRNA synthetase  52.22 
 
 		 555 aa  603  1.0000000000000001e-171  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2811  glutaminyl-tRNA synthetase  51.43 
 
 		 561 aa  603  1.0000000000000001e-171  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.129668  normal  0.859959 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0517  glutaminyl-tRNA synthetase  52.38 
 
 		 556 aa  603  1.0000000000000001e-171  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4500  glutaminyl-tRNA synthetase  52.14 
 
 		 563 aa  602  1.0000000000000001e-171  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.111687  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1263  glutaminyl-tRNA synthetase  51.51 
 
 		 781 aa  598  1e-169  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.578242  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0832  glutaminyl-tRNA synthetase  50.85 
 
 		 552 aa  592  1e-168  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.551071  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1350  glutaminyl-tRNA synthetase  51.52 
 
 		 777 aa  592  1e-168  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0295693  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1195  glutaminyl-tRNA synthetase  51.19 
 
 		 555 aa  594  1e-168  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.068426  decreased coverage  0.0000265755 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1710  glutaminyl-tRNA synthetase  52.22 
 
 		 558 aa  593  1e-168  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004127  glutaminyl-tRNA synthetase  51.19 
 
 		 556 aa  588  1e-167  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000085379  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1249  glutaminyl-tRNA synthetase  51.71 
 
 		 777 aa  591  1e-167  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2599  glutaminyl-tRNA synthetase  52.05 
 
 		 778 aa  590  1e-167  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0790772  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0612  glutaminyl-tRNA synthetase  51.37 
 
 		 552 aa  589  1e-167  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000113459  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3486  glutaminyl-tRNA synthetase  51.68 
 
 		 565 aa  588  1e-167  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.409047  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00637  glutaminyl-tRNA synthetase  51.36 
 
 		 554 aa  585  1e-166  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4882  glutaminyl-tRNA synthetase  50.68 
 
 		 540 aa  587  1e-166  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2976  glutaminyl-tRNA synthetase  51.36 
 
 		 554 aa  585  1e-166  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0733  glutaminyl-tRNA synthetase  51.19 
 
 		 555 aa  585  1e-166  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0421  glutaminyl-tRNA synthetase  50.84 
 
 		 559 aa  587  1e-166  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0725  glutaminyl-tRNA synthetase  51.36 
 
 		 554 aa  585  1e-166  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.769137  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0773  glutaminyl-tRNA synthetase  51.36 
 
 		 554 aa  586  1e-166  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0411639  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>