More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_0267 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_1533  glutaminyl-tRNA synthetase  56.12 
 
 		 556 aa  639    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.208966  normal  0.486812 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1595  glutaminyl-tRNA synthetase  66.25 
 
 		 562 aa  748    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000811863  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00637  glutaminyl-tRNA synthetase  60.32 
 
 		 554 aa  700    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2957  glutaminyl-tRNA synthetase  60.32 
 
 		 554 aa  700    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.690706  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01337  glutaminyl-tRNA synthetase  58.75 
 
 		 556 aa  689    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1482  glutaminyl-tRNA synthetase  57.85 
 
 		 556 aa  651    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.348011  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3366  glutaminyl-tRNA synthetase  59.74 
 
 		 554 aa  676    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2904  glutaminyl-tRNA synthetase  59.93 
 
 		 567 aa  686    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.781654 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04610  glutaminyl-tRNA synthetase  55.19 
 
 		 579 aa  647    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.959469  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0517  glutaminyl-tRNA synthetase  59.64 
 
 		 556 aa  695    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0737  glutaminyl-tRNA synthetase  55.29 
 
 		 576 aa  635    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.705767 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2879  glutaminyl-tRNA synthetase  60.28 
 
 		 567 aa  691    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0745  glutaminyl-tRNA synthetase  60.07 
 
 		 555 aa  695    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.794095  normal  0.613987 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1845  glutaminyl-tRNA synthetase  55.46 
 
 		 559 aa  646    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0459  glutaminyl-tRNA synthetase  57.29 
 
 		 569 aa  667    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.200352  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1786  glutaminyl-tRNA synthetase  57.3 
 
 		 556 aa  644    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3743  glutaminyl-tRNA synthetase  59.37 
 
 		 569 aa  685    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0260392  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0892  glutaminyl-tRNA synthetase  57.29 
 
 		 569 aa  667    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.522948  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1270  glutaminyl-tRNA synthetase  57.14 
 
 		 551 aa  645    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1269  glutaminyl-tRNA synthetase  56.78 
 
 		 551 aa  644    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1619  glutaminyl-tRNA synthetase  56.93 
 
 		 556 aa  640    Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00308456  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0706  glutaminyl-tRNA synthetase  60.32 
 
 		 554 aa  700    Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000238299  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1734  glutaminyl-tRNA synthetase  60.64 
 
 		 564 aa  690    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.112324  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0907  glutaminyl-tRNA synthetase  55.83 
 
 		 573 aa  660    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.47238  normal  0.116742 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0421  glutaminyl-tRNA synthetase  57.14 
 
 		 559 aa  638    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0833  glutaminyl-tRNA synthetase  55.22 
 
 		 609 aa  655    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.227422  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1596  glutaminyl-tRNA synthetase  56.75 
 
 		 556 aa  640    Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00615688  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2787  glutaminyl-tRNA synthetase  60.11 
 
 		 567 aa  688    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0850  glutaminyl-tRNA synthetase  58.01 
 
 		 565 aa  672    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.750586 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1843  glutaminyl-tRNA synthetase  63.39 
 
 		 559 aa  724    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.311784  normal  0.481089 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01892  glutaminyl-tRNA synthetase  57.99 
 
 		 555 aa  664    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00449379  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0326  glutaminyl-tRNA synthetase  60.5 
 
 		 555 aa  686    Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000088467  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1812  glutaminyl-tRNA synthetase  56.31 
 
 		 596 aa  669    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0624978  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3639  glutaminyl-tRNA synthetase  58.69 
 
 		 566 aa  679    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.193855 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2994  glutaminyl-tRNA synthetase  60.5 
 
 		 555 aa  685    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0101  glutaminyl-tRNA synthetase  62.94 
 
 		 572 aa  745    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2109  glutaminyl-tRNA synthetase  59.17 
 
 		 557 aa  683    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.831991  hitchhiker  0.000255722 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4549  glutaminyl-tRNA synthetase  57.45 
 
 		 569 aa  660    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1655  glutaminyl-tRNA synthetase  57.12 
 
 		 569 aa  665    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.434975  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0058  glutaminyl-tRNA synthetase  60.66 
 
 		 553 aa  676    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1195  glutaminyl-tRNA synthetase  60.25 
 
 		 555 aa  698    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.068426  decreased coverage  0.0000265755 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0626  glutaminyl-tRNA synthetase  73.45 
 
 		 568 aa  890    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.16998  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1585  glutaminyl-tRNA synthetase  57.12 
 
 		 571 aa  643    Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000343871  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0922  glutaminyl-tRNA synthetase  56.64 
 
 		 559 aa  650    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0189  glutaminyl-tRNA synthetase  62.39 
 
 		 561 aa  740    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.360973  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2083  glutaminyl-tRNA synthetase  59.45 
 
 		 565 aa  681    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0917  glutaminyl-tRNA synthetase  65.78 
 
 		 580 aa  771    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000234027  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2665  glutaminyl-tRNA synthetase  57.64 
 
 		 569 aa  674    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0180309  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1249  glutaminyl-tRNA synthetase  57.12 
 
 		 777 aa  637    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2811  glutaminyl-tRNA synthetase  62.72 
 
 		 561 aa  734    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.129668  normal  0.859959 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1910  glutaminyl-tRNA synthetase  57.63 
 
 		 569 aa  672    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.125081  normal  0.474008 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0570  glutaminyl-tRNA synthetase  60.32 
 
 		 554 aa  701    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.011441  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2907  glutaminyl-tRNA synthetase  60.5 
 
 		 555 aa  686    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.483628  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2406  glutaminyl-tRNA synthetase  59.93 
 
 		 567 aa  687    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1316  glutaminyl-tRNA synthetase  57.45 
 
 		 569 aa  660    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.110897 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2452  glutaminyl-tRNA synthetase  61.19 
 
 		 559 aa  704    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.930191  normal  0.727818 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2516  glutaminyl-tRNA synthetase  58.87 
 
 		 556 aa  662    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0318208  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0805  glutaminyl-tRNA synthetase  60.07 
 
 		 555 aa  696    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.112626  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2976  glutaminyl-tRNA synthetase  60.32 
 
 		 554 aa  700    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1307  glutaminyl-tRNA synthetase  57.45 
 
 		 569 aa  660    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.518903 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2828  glutaminyl-tRNA synthetase  57.27 
 
 		 569 aa  652    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.531779  normal  0.0114243 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1012  glutaminyl-tRNA synthetase  55.26 
 
 		 705 aa  635    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2841  glutaminyl-tRNA synthetase  62.37 
 
 		 561 aa  723    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.602815 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2052  glutaminyl-tRNA synthetase  58.05 
 
 		 576 aa  657    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.26884  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1419  glutaminyl-tRNA synthetase  57.29 
 
 		 569 aa  667    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1710  glutaminyl-tRNA synthetase  62.97 
 
 		 558 aa  728    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0682  glutaminyl-tRNA synthetase  57.49 
 
 		 582 aa  676    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.613732  normal  0.476969 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0818  glutaminyl-tRNA synthetase  57.02 
 
 		 582 aa  657    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0602034 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2128  glutaminyl-tRNA synthetase  57.89 
 
 		 558 aa  665    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.116661  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1383  glutaminyl-tRNA synthetase  57.99 
 
 		 569 aa  665    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.21862 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0841  glutaminyl-tRNA synthetase  59.89 
 
 		 555 aa  694    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0923  glutaminyl-tRNA synthetase  57.63 
 
 		 569 aa  662    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1633  glutaminyl-tRNA synthetase  57.29 
 
 		 569 aa  667    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0234579  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2184  glutaminyl-tRNA synthetase  58.21 
 
 		 558 aa  672    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.213652  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0725  glutaminyl-tRNA synthetase  60.32 
 
 		 554 aa  700    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.769137  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0626  glutaminyl-tRNA synthetase  59.27 
 
 		 552 aa  661    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00799923  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0612  glutaminyl-tRNA synthetase  59.45 
 
 		 552 aa  664    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000113459  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0895  glutaminyl-tRNA synthetase  57.17 
 
 		 548 aa  648    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2503  glutaminyl-tRNA synthetase  57.48 
 
 		 556 aa  648    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0137132  hitchhiker  0.0018216 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2571  glutaminyl-tRNA synthetase  57.66 
 
 		 556 aa  650    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.838936  normal  0.0268819 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3294  glutaminyl-tRNA synthetase  56.88 
 
 		 565 aa  641    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000133432  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2615  glutaminyl-tRNA synthetase  57.19 
 
 		 556 aa  647    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.620395  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0492  glutaminyl-tRNA synthetase  57.04 
 
 		 553 aa  656    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0995744  normal  0.607402 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2459  glutaminyl-tRNA synthetase  61.93 
 
 		 589 aa  712    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1282  glutaminyl-tRNA synthetase  57.63 
 
 		 569 aa  661    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4500  glutaminyl-tRNA synthetase  63 
 
 		 563 aa  719    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.111687  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41380  glutaminyl-tRNA synthetase  60.22 
 
 		 556 aa  671    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.423392 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1405  glutaminyl-tRNA synthetase  57.81 
 
 		 569 aa  664    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.681017  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0701  glutaminyl-tRNA synthetase  57.29 
 
 		 569 aa  667    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4167  glutaminyl-tRNA synthetase  62.06 
 
 		 568 aa  734    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1229  glutaminyl-tRNA synthetase  59.61 
 
 		 554 aa  681    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0152842  normal  0.0951842 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3516  glutaminyl-tRNA synthetase  65.83 
 
 		 564 aa  767    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.953083  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2669  glutaminyl-tRNA synthetase  57.66 
 
 		 556 aa  650    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0864702  normal  0.0642035 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0417  glutaminyl-tRNA synthetase  76.33 
 
 		 570 aa  931    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1725  glutaminyl-tRNA synthetase  60.4 
 
 		 565 aa  676    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.153622  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2572  glutaminyl-tRNA synthetase  60.5 
 
 		 555 aa  687    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0923139  hitchhiker  0.00019462 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3121  glutaminyl-tRNA synthetase  57.04 
 
 		 556 aa  641    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000496067 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3251  glutaminyl-tRNA synthetase  62.52 
 
 		 560 aa  731    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3509  glutaminyl-tRNA synthetase  60.22 
 
 		 561 aa  670    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.271227  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0702  glutaminyl-tRNA synthetase  60.14 
 
 		 554 aa  698    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.237561  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>