More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_0850 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009801  EcE24377A_0706  glutaminyl-tRNA synthetase  57.86 
 
 		 554 aa  648    Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000238299  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1595  glutaminyl-tRNA synthetase  58.45 
 
 		 562 aa  659    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000811863  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00637  glutaminyl-tRNA synthetase  57.86 
 
 		 554 aa  648    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3791  glutaminyl-tRNA synthetase  59 
 
 		 565 aa  678    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0907  glutaminyl-tRNA synthetase  66.91 
 
 		 573 aa  816    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.47238  normal  0.116742 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2957  glutaminyl-tRNA synthetase  57.86 
 
 		 554 aa  648    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.690706  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1384  glutaminyl-tRNA synthetase  57.99 
 
 		 563 aa  672    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.559394 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1722  glutaminyl-tRNA synthetase  57.72 
 
 		 590 aa  700    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3366  glutaminyl-tRNA synthetase  63.91 
 
 		 554 aa  736    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2904  glutaminyl-tRNA synthetase  59.32 
 
 		 567 aa  662    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.781654 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2106  glutaminyl-tRNA synthetase  58.83 
 
 		 620 aa  692    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0189  glutaminyl-tRNA synthetase  59.96 
 
 		 561 aa  686    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.360973  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0791  glutaminyl-tRNA synthetase  65.17 
 
 		 580 aa  781    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00535923  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1419  glutaminyl-tRNA synthetase  68.74 
 
 		 569 aa  822    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0242  glutaminyl-tRNA synthetase  60.14 
 
 		 555 aa  665    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2828  glutaminyl-tRNA synthetase  68.03 
 
 		 569 aa  815    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.531779  normal  0.0114243 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3743  glutaminyl-tRNA synthetase  59.21 
 
 		 569 aa  666    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0260392  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0892  glutaminyl-tRNA synthetase  68.74 
 
 		 569 aa  822    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.522948  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0421  glutaminyl-tRNA synthetase  55.99 
 
 		 559 aa  649    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0570  glutaminyl-tRNA synthetase  57.78 
 
 		 554 aa  648    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.011441  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1440  glutaminyl-tRNA synthetase  57.39 
 
 		 590 aa  697    Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2128  glutaminyl-tRNA synthetase  59.03 
 
 		 558 aa  687    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.116661  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1734  glutaminyl-tRNA synthetase  58.86 
 
 		 564 aa  665    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.112324  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1910  glutaminyl-tRNA synthetase  69.49 
 
 		 569 aa  833    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.125081  normal  0.474008 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3447  glutaminyl-tRNA synthetase  70.27 
 
 		 601 aa  869    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.183021  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0833  glutaminyl-tRNA synthetase  66.21 
 
 		 609 aa  800    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.227422  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2787  glutaminyl-tRNA synthetase  59.32 
 
 		 567 aa  661    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0850  glutaminyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 565 aa  1180    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.750586 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1843  glutaminyl-tRNA synthetase  56.71 
 
 		 559 aa  637    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.311784  normal  0.481089 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0737  glutaminyl-tRNA synthetase  65.62 
 
 		 576 aa  790    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.705767 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0682  glutaminyl-tRNA synthetase  56.74 
 
 		 582 aa  640    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.613732  normal  0.476969 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1812  glutaminyl-tRNA synthetase  68.74 
 
 		 596 aa  822    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0624978  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1655  glutaminyl-tRNA synthetase  68.74 
 
 		 569 aa  822    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.434975  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3639  glutaminyl-tRNA synthetase  58.6 
 
 		 566 aa  665    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.193855 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1314  glutaminyl-tRNA synthetase  61.89 
 
 		 609 aa  728    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0101  glutaminyl-tRNA synthetase  58.73 
 
 		 572 aa  689    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3615  glutaminyl-tRNA synthetase  60.93 
 
 		 604 aa  722    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4549  glutaminyl-tRNA synthetase  68.61 
 
 		 569 aa  823    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0058  glutaminyl-tRNA synthetase  61.91 
 
 		 553 aa  708    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1485  glutaminyl-tRNA synthetase  61.74 
 
 		 569 aa  702    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0626  glutaminyl-tRNA synthetase  59.82 
 
 		 568 aa  682    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.16998  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0733  glutaminyl-tRNA synthetase  57.5 
 
 		 555 aa  644    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2406  glutaminyl-tRNA synthetase  58.96 
 
 		 567 aa  662    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2083  glutaminyl-tRNA synthetase  67.39 
 
 		 565 aa  794    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2665  glutaminyl-tRNA synthetase  69.22 
 
 		 569 aa  827    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0180309  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1956  glutaminyl-tRNA synthetase  58.51 
 
 		 619 aa  721    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23520  glutaminyl-tRNA synthetase  58.08 
 
 		 555 aa  650    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0536  glutaminyl-tRNA synthetase  60 
 
 		 556 aa  690    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0725  glutaminyl-tRNA synthetase  57.86 
 
 		 554 aa  648    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.769137  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4167  glutaminyl-tRNA synthetase  62.3 
 
 		 568 aa  712    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1823  glutaminyl-tRNA synthetase  62.09 
 
 		 620 aa  739    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.236444  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0702  glutaminyl-tRNA synthetase  57.68 
 
 		 554 aa  647    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.237561  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2452  glutaminyl-tRNA synthetase  57.25 
 
 		 559 aa  642    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.930191  normal  0.727818 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1608  glutaminyl-tRNA synthetase  58.29 
 
 		 613 aa  694    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0558752  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2082  glutaminyl-tRNA synthetase  72.34 
 
 		 596 aa  887    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3350  glutaminyl-tRNA synthetase  63.42 
 
 		 612 aa  759    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.446012  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1307  glutaminyl-tRNA synthetase  68.21 
 
 		 569 aa  823    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.518903 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3251  glutaminyl-tRNA synthetase  57.07 
 
 		 560 aa  644    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0745  glutaminyl-tRNA synthetase  57.68 
 
 		 555 aa  645    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.794095  normal  0.613987 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2300  glutaminyl-tRNA synthetase  60.63 
 
 		 604 aa  715    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.775495  hitchhiker  0.00472002 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0792  glutaminyl-tRNA synthetase  57.5 
 
 		 555 aa  644    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.674612  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1633  glutaminyl-tRNA synthetase  68.74 
 
 		 569 aa  822    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0234579  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1710  glutaminyl-tRNA synthetase  56.99 
 
 		 558 aa  646    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1116  glutaminyl-tRNA synthetase  56.65 
 
 		 552 aa  640    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0818  glutaminyl-tRNA synthetase  66.67 
 
 		 582 aa  809    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0602034 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2976  glutaminyl-tRNA synthetase  57.86 
 
 		 554 aa  648    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1195  glutaminyl-tRNA synthetase  56.79 
 
 		 555 aa  645    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.068426  decreased coverage  0.0000265755 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2879  glutaminyl-tRNA synthetase  59.5 
 
 		 567 aa  664    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4234  glutaminyl-tRNA synthetase  56.51 
 
 		 628 aa  683    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.512355  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0923  glutaminyl-tRNA synthetase  68.61 
 
 		 569 aa  822    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2489  glutaminyl-tRNA synthetase  59.32 
 
 		 628 aa  704    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.348207  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0805  glutaminyl-tRNA synthetase  57.5 
 
 		 555 aa  644    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.112626  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0917  glutaminyl-tRNA synthetase  60.39 
 
 		 580 aa  702    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000234027  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0626  glutaminyl-tRNA synthetase  56.99 
 
 		 552 aa  637    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00799923  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0612  glutaminyl-tRNA synthetase  57.17 
 
 		 552 aa  639    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000113459  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0773  glutaminyl-tRNA synthetase  57.86 
 
 		 554 aa  648    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0411639  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1351  glutaminyl-tRNA synthetase  63.12 
 
 		 625 aa  759    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.22682 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0267  glutaminyl-tRNA synthetase  58.01 
 
 		 587 aa  672    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3475  glutaminyl-tRNA synthetase  74.6 
 
 		 580 aa  883    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.675011  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0841  glutaminyl-tRNA synthetase  57.5 
 
 		 555 aa  643    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3509  glutaminyl-tRNA synthetase  59.39 
 
 		 561 aa  665    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.271227  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2459  glutaminyl-tRNA synthetase  57.09 
 
 		 589 aa  666    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1282  glutaminyl-tRNA synthetase  69.66 
 
 		 569 aa  832    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41380  glutaminyl-tRNA synthetase  59.57 
 
 		 556 aa  667    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.423392 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1405  glutaminyl-tRNA synthetase  68.78 
 
 		 569 aa  824    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.681017  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00628  hypothetical protein  57.86 
 
 		 554 aa  648    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0517  glutaminyl-tRNA synthetase  58.24 
 
 		 556 aa  658    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3516  glutaminyl-tRNA synthetase  57.07 
 
 		 564 aa  666    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.953083  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3799  glutaminyl-tRNA synthetase  61.65 
 
 		 565 aa  711    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.105698  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1725  glutaminyl-tRNA synthetase  59.31 
 
 		 565 aa  681    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.153622  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04610  glutaminyl-tRNA synthetase  54.97 
 
 		 579 aa  642    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.959469  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0459  glutaminyl-tRNA synthetase  68.74 
 
 		 569 aa  822    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.200352  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3882  glutaminyl-tRNA synthetase  61.68 
 
 		 565 aa  711    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1316  glutaminyl-tRNA synthetase  69.49 
 
 		 569 aa  830    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.110897 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2572  glutaminyl-tRNA synthetase  59.21 
 
 		 555 aa  660    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0923139  hitchhiker  0.00019462 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2940  glutaminyl-tRNA synthetase  56.76 
 
 		 552 aa  635    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0919452  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1383  glutaminyl-tRNA synthetase  68.96 
 
 		 569 aa  826    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.21862 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0701  glutaminyl-tRNA synthetase  68.74 
 
 		 569 aa  822    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0807  glutaminyl-tRNA synthetase  65.8 
 
 		 576 aa  791    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0417  glutaminyl-tRNA synthetase  60.04 
 
 		 570 aa  700    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>