More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_0737 on replicon NC_010682
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009801  EcE24377A_0706  glutaminyl-tRNA synthetase  58.04 
 
 		 554 aa  660    Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000238299  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3126  glutaminyl-tRNA synthetase  56.84 
 
 		 552 aa  650    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.0016183  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00637  glutaminyl-tRNA synthetase  58.04 
 
 		 554 aa  660    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2957  glutaminyl-tRNA synthetase  58.04 
 
 		 554 aa  660    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.690706  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01337  glutaminyl-tRNA synthetase  57.27 
 
 		 556 aa  653    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4234  glutaminyl-tRNA synthetase  60.56 
 
 		 628 aa  738    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.512355  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3366  glutaminyl-tRNA synthetase  59.86 
 
 		 554 aa  697    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2904  glutaminyl-tRNA synthetase  57.59 
 
 		 567 aa  647    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.781654 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00628  hypothetical protein  58.04 
 
 		 554 aa  660    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1116  glutaminyl-tRNA synthetase  57.47 
 
 		 552 aa  659    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0517  glutaminyl-tRNA synthetase  58.39 
 
 		 556 aa  658    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0791  glutaminyl-tRNA synthetase  91.72 
 
 		 580 aa  1113    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00535923  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0807  glutaminyl-tRNA synthetase  98.96 
 
 		 576 aa  1182    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0792  glutaminyl-tRNA synthetase  57.87 
 
 		 555 aa  657    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.674612  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0892  glutaminyl-tRNA synthetase  72.13 
 
 		 569 aa  880    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.522948  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1383  glutaminyl-tRNA synthetase  71.06 
 
 		 569 aa  864    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.21862 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2940  glutaminyl-tRNA synthetase  57.19 
 
 		 552 aa  654    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0919452  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2106  glutaminyl-tRNA synthetase  60.8 
 
 		 620 aa  734    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0805  glutaminyl-tRNA synthetase  57.87 
 
 		 555 aa  657    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.112626  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1734  glutaminyl-tRNA synthetase  56.33 
 
 		 564 aa  637    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.112324  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2879  glutaminyl-tRNA synthetase  57.24 
 
 		 567 aa  644    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3447  glutaminyl-tRNA synthetase  62.44 
 
 		 601 aa  766    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.183021  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0833  glutaminyl-tRNA synthetase  81.06 
 
 		 609 aa  998    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.227422  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0725  glutaminyl-tRNA synthetase  58.04 
 
 		 554 aa  660    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.769137  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1910  glutaminyl-tRNA synthetase  71.06 
 
 		 569 aa  867    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.125081  normal  0.474008 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0850  glutaminyl-tRNA synthetase  65.62 
 
 		 565 aa  790    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.750586 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0907  glutaminyl-tRNA synthetase  68.01 
 
 		 573 aa  841    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.47238  normal  0.116742 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0189  glutaminyl-tRNA synthetase  55.89 
 
 		 561 aa  638    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.360973  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1812  glutaminyl-tRNA synthetase  72.13 
 
 		 596 aa  880    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0624978  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3639  glutaminyl-tRNA synthetase  56.45 
 
 		 566 aa  642    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.193855 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0101  glutaminyl-tRNA synthetase  56.41 
 
 		 572 aa  653    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1351  glutaminyl-tRNA synthetase  63.16 
 
 		 625 aa  771    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.22682 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4549  glutaminyl-tRNA synthetase  70.54 
 
 		 569 aa  860    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0058  glutaminyl-tRNA synthetase  60.45 
 
 		 553 aa  687    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2363  glutaminyl-tRNA synthetase  55.34 
 
 		 570 aa  636    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.621285 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0702  glutaminyl-tRNA synthetase  57.87 
 
 		 554 aa  659    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.237561  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2828  glutaminyl-tRNA synthetase  70.71 
 
 		 569 aa  868    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.531779  normal  0.0114243 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2083  glutaminyl-tRNA synthetase  62.76 
 
 		 565 aa  752    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2665  glutaminyl-tRNA synthetase  72.2 
 
 		 569 aa  876    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0180309  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3799  glutaminyl-tRNA synthetase  57.54 
 
 		 565 aa  674    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.105698  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1229  glutaminyl-tRNA synthetase  57.17 
 
 		 554 aa  648    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0152842  normal  0.0951842 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1316  glutaminyl-tRNA synthetase  71.06 
 
 		 569 aa  865    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.110897 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1608  glutaminyl-tRNA synthetase  60.63 
 
 		 613 aa  733    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0558752  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4167  glutaminyl-tRNA synthetase  57.91 
 
 		 568 aa  684    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1419  glutaminyl-tRNA synthetase  72.13 
 
 		 569 aa  880    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1823  glutaminyl-tRNA synthetase  64.2 
 
 		 620 aa  781    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.236444  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2976  glutaminyl-tRNA synthetase  58.04 
 
 		 554 aa  660    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1205  glutaminyl-tRNA synthetase  57.37 
 
 		 552 aa  652    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00285651  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2082  glutaminyl-tRNA synthetase  64.25 
 
 		 596 aa  795    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3350  glutaminyl-tRNA synthetase  65.13 
 
 		 612 aa  793    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.446012  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1307  glutaminyl-tRNA synthetase  70.88 
 
 		 569 aa  875    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.518903 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2128  glutaminyl-tRNA synthetase  55.38 
 
 		 558 aa  657    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.116661  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1655  glutaminyl-tRNA synthetase  72.13 
 
 		 569 aa  879    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.434975  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0832  glutaminyl-tRNA synthetase  55.69 
 
 		 552 aa  640    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.551071  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0459  glutaminyl-tRNA synthetase  72.13 
 
 		 569 aa  880    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.200352  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0570  glutaminyl-tRNA synthetase  57.97 
 
 		 554 aa  660    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.011441  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1956  glutaminyl-tRNA synthetase  62.94 
 
 		 619 aa  770    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004127  glutaminyl-tRNA synthetase  58.32 
 
 		 556 aa  666    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000085379  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1633  glutaminyl-tRNA synthetase  72.13 
 
 		 569 aa  880    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0234579  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0326  glutaminyl-tRNA synthetase  57.19 
 
 		 555 aa  649    Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000088467  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0818  glutaminyl-tRNA synthetase  83.16 
 
 		 582 aa  1008    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0602034 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2406  glutaminyl-tRNA synthetase  57.24 
 
 		 567 aa  642    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2994  glutaminyl-tRNA synthetase  57.02 
 
 		 555 aa  647    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0701  glutaminyl-tRNA synthetase  72.13 
 
 		 569 aa  880    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1440  glutaminyl-tRNA synthetase  68.47 
 
 		 590 aa  857    Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0923  glutaminyl-tRNA synthetase  71.06 
 
 		 569 aa  862    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2907  glutaminyl-tRNA synthetase  57.19 
 
 		 555 aa  649    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.483628  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2489  glutaminyl-tRNA synthetase  64.91 
 
 		 628 aa  785    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.348207  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0267  glutaminyl-tRNA synthetase  55.29 
 
 		 587 aa  635    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0745  glutaminyl-tRNA synthetase  57.87 
 
 		 555 aa  657    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.794095  normal  0.613987 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3882  glutaminyl-tRNA synthetase  57.56 
 
 		 565 aa  675    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0841  glutaminyl-tRNA synthetase  57.87 
 
 		 555 aa  657    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0417  glutaminyl-tRNA synthetase  58.32 
 
 		 570 aa  661    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3475  glutaminyl-tRNA synthetase  63.48 
 
 		 580 aa  764    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.675011  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0242  glutaminyl-tRNA synthetase  56.69 
 
 		 555 aa  649    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1195  glutaminyl-tRNA synthetase  56.82 
 
 		 555 aa  653    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.068426  decreased coverage  0.0000265755 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1384  glutaminyl-tRNA synthetase  55.71 
 
 		 563 aa  635    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.559394 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0737  glutaminyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 576 aa  1195    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.705767 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1282  glutaminyl-tRNA synthetase  71.06 
 
 		 569 aa  865    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2300  glutaminyl-tRNA synthetase  63.85 
 
 		 604 aa  762    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.775495  hitchhiker  0.00472002 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1405  glutaminyl-tRNA synthetase  71.06 
 
 		 569 aa  862    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.681017  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0733  glutaminyl-tRNA synthetase  57.87 
 
 		 555 aa  657    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1220  glutaminyl-tRNA synthetase  59.9 
 
 		 573 aa  714    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1314  glutaminyl-tRNA synthetase  62.82 
 
 		 609 aa  762    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0773  glutaminyl-tRNA synthetase  58.04 
 
 		 554 aa  660    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0411639  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3615  glutaminyl-tRNA synthetase  62.6 
 
 		 604 aa  733    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1725  glutaminyl-tRNA synthetase  57.52 
 
 		 565 aa  667    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.153622  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1485  glutaminyl-tRNA synthetase  60.17 
 
 		 569 aa  677    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1722  glutaminyl-tRNA synthetase  67.96 
 
 		 590 aa  851    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2787  glutaminyl-tRNA synthetase  57.24 
 
 		 567 aa  644    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3743  glutaminyl-tRNA synthetase  54.56 
 
 		 569 aa  632  1e-180  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0260392  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0682  glutaminyl-tRNA synthetase  55.71 
 
 		 582 aa  632  1e-180  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.613732  normal  0.476969 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0895  glutaminyl-tRNA synthetase  55.87 
 
 		 548 aa  633  1e-180  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2572  glutaminyl-tRNA synthetase  56.32 
 
 		 555 aa  629  1e-179  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0923139  hitchhiker  0.00019462 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2184  glutaminyl-tRNA synthetase  54.74 
 
 		 558 aa  631  1e-179  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.213652  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0536  glutaminyl-tRNA synthetase  55.23 
 
 		 556 aa  630  1e-179  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1263  glutaminyl-tRNA synthetase  55.83 
 
 		 781 aa  626  1e-178  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.578242  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1216  glutaminyl-tRNA synthetase  55.34 
 
 		 555 aa  624  1e-177  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0626  glutaminyl-tRNA synthetase  55.28 
 
 		 568 aa  624  1e-177  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.16998  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0917  glutaminyl-tRNA synthetase  54.83 
 
 		 580 aa  621  1e-177  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000234027  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>