More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnuc_1722 on replicon NC_009379
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012856  Rpic12D_0807  glutaminyl-tRNA synthetase  67.79 
 
 		 576 aa  846    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3366  glutaminyl-tRNA synthetase  56.92 
 
 		 554 aa  661    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1440  glutaminyl-tRNA synthetase  92.71 
 
 		 590 aa  1163    Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2300  glutaminyl-tRNA synthetase  57.02 
 
 		 604 aa  700    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.775495  hitchhiker  0.00472002 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4167  glutaminyl-tRNA synthetase  54.92 
 
 		 568 aa  663    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0791  glutaminyl-tRNA synthetase  68.29 
 
 		 580 aa  840    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00535923  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0701  glutaminyl-tRNA synthetase  64.06 
 
 		 569 aa  793    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1722  glutaminyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 590 aa  1236    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0737  glutaminyl-tRNA synthetase  67.96 
 
 		 576 aa  851    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.705767 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3882  glutaminyl-tRNA synthetase  54 
 
 		 565 aa  651    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0892  glutaminyl-tRNA synthetase  64.06 
 
 		 569 aa  793    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.522948  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2828  glutaminyl-tRNA synthetase  64 
 
 		 569 aa  786    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.531779  normal  0.0114243 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1485  glutaminyl-tRNA synthetase  56.15 
 
 		 569 aa  644    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3447  glutaminyl-tRNA synthetase  54.74 
 
 		 601 aa  684    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.183021  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0833  glutaminyl-tRNA synthetase  67.95 
 
 		 609 aa  865    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.227422  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0850  glutaminyl-tRNA synthetase  57.72 
 
 		 565 aa  700    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.750586 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1633  glutaminyl-tRNA synthetase  64.06 
 
 		 569 aa  793    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0234579  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1316  glutaminyl-tRNA synthetase  65.22 
 
 		 569 aa  795    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.110897 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1812  glutaminyl-tRNA synthetase  64.06 
 
 		 596 aa  794    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0624978  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0101  glutaminyl-tRNA synthetase  54.51 
 
 		 572 aa  635    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4549  glutaminyl-tRNA synthetase  64.7 
 
 		 569 aa  793    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0058  glutaminyl-tRNA synthetase  56 
 
 		 553 aa  654    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1608  glutaminyl-tRNA synthetase  56.13 
 
 		 613 aa  682    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0558752  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0907  glutaminyl-tRNA synthetase  62.22 
 
 		 573 aa  782    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.47238  normal  0.116742 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2083  glutaminyl-tRNA synthetase  58.84 
 
 		 565 aa  713    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2665  glutaminyl-tRNA synthetase  64.24 
 
 		 569 aa  796    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0180309  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0459  glutaminyl-tRNA synthetase  64.06 
 
 		 569 aa  793    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.200352  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1419  glutaminyl-tRNA synthetase  64.06 
 
 		 569 aa  793    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4234  glutaminyl-tRNA synthetase  54.89 
 
 		 628 aa  676    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.512355  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1823  glutaminyl-tRNA synthetase  57.34 
 
 		 620 aa  707    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.236444  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1383  glutaminyl-tRNA synthetase  65.04 
 
 		 569 aa  794    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.21862 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1220  glutaminyl-tRNA synthetase  54.64 
 
 		 573 aa  681    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2082  glutaminyl-tRNA synthetase  58.61 
 
 		 596 aa  731    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3350  glutaminyl-tRNA synthetase  57.26 
 
 		 612 aa  710    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.446012  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1307  glutaminyl-tRNA synthetase  63.83 
 
 		 569 aa  789    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.518903 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3799  glutaminyl-tRNA synthetase  54.41 
 
 		 565 aa  653    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.105698  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0818  glutaminyl-tRNA synthetase  67.28 
 
 		 582 aa  858    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0602034 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1910  glutaminyl-tRNA synthetase  64.87 
 
 		 569 aa  798    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.125081  normal  0.474008 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1314  glutaminyl-tRNA synthetase  57.6 
 
 		 609 aa  707    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1351  glutaminyl-tRNA synthetase  56.95 
 
 		 625 aa  698    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.22682 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0923  glutaminyl-tRNA synthetase  64.87 
 
 		 569 aa  790    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2489  glutaminyl-tRNA synthetase  56.45 
 
 		 628 aa  689    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.348207  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3475  glutaminyl-tRNA synthetase  61.31 
 
 		 580 aa  739    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.675011  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1655  glutaminyl-tRNA synthetase  64.06 
 
 		 569 aa  793    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.434975  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0517  glutaminyl-tRNA synthetase  54.59 
 
 		 556 aa  637    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1282  glutaminyl-tRNA synthetase  65.39 
 
 		 569 aa  798    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2106  glutaminyl-tRNA synthetase  56.13 
 
 		 620 aa  680    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1405  glutaminyl-tRNA synthetase  65.04 
 
 		 569 aa  793    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.681017  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1956  glutaminyl-tRNA synthetase  53.98 
 
 		 619 aa  682    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3615  glutaminyl-tRNA synthetase  53.73 
 
 		 604 aa  642    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1725  glutaminyl-tRNA synthetase  54.43 
 
 		 565 aa  639    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.153622  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0706  glutaminyl-tRNA synthetase  53.9 
 
 		 554 aa  628  1e-179  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000238299  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00637  glutaminyl-tRNA synthetase  53.9 
 
 		 554 aa  628  1e-179  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2957  glutaminyl-tRNA synthetase  53.9 
 
 		 554 aa  628  1e-179  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.690706  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1195  glutaminyl-tRNA synthetase  53.55 
 
 		 555 aa  628  1e-179  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.068426  decreased coverage  0.0000265755 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2904  glutaminyl-tRNA synthetase  53.54 
 
 		 567 aa  628  1e-179  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.781654 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00628  hypothetical protein  53.9 
 
 		 554 aa  628  1e-179  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0702  glutaminyl-tRNA synthetase  53.9 
 
 		 554 aa  629  1e-179  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.237561  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2976  glutaminyl-tRNA synthetase  53.9 
 
 		 554 aa  628  1e-179  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0725  glutaminyl-tRNA synthetase  53.9 
 
 		 554 aa  628  1e-179  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.769137  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004127  glutaminyl-tRNA synthetase  53.82 
 
 		 556 aa  629  1e-179  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000085379  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0832  glutaminyl-tRNA synthetase  53.58 
 
 		 552 aa  630  1e-179  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.551071  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0773  glutaminyl-tRNA synthetase  54.07 
 
 		 554 aa  630  1e-179  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0411639  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0570  glutaminyl-tRNA synthetase  53.82 
 
 		 554 aa  628  1e-178  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.011441  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2879  glutaminyl-tRNA synthetase  53.37 
 
 		 567 aa  626  1e-178  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2787  glutaminyl-tRNA synthetase  53.37 
 
 		 567 aa  626  1e-178  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0792  glutaminyl-tRNA synthetase  53.55 
 
 		 555 aa  624  1e-177  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.674612  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0733  glutaminyl-tRNA synthetase  53.55 
 
 		 555 aa  624  1e-177  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0841  glutaminyl-tRNA synthetase  53.55 
 
 		 555 aa  624  1e-177  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0805  glutaminyl-tRNA synthetase  53.55 
 
 		 555 aa  624  1e-177  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.112626  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2406  glutaminyl-tRNA synthetase  53.03 
 
 		 567 aa  623  1e-177  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0745  glutaminyl-tRNA synthetase  53.55 
 
 		 555 aa  624  1e-177  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.794095  normal  0.613987 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2994  glutaminyl-tRNA synthetase  53.65 
 
 		 555 aa  618  1e-176  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0626  glutaminyl-tRNA synthetase  53.58 
 
 		 568 aa  620  1e-176  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.16998  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2907  glutaminyl-tRNA synthetase  53.65 
 
 		 555 aa  619  1e-176  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.483628  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0326  glutaminyl-tRNA synthetase  53.65 
 
 		 555 aa  619  1e-176  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000088467  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0189  glutaminyl-tRNA synthetase  53.14 
 
 		 561 aa  621  1e-176  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.360973  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01337  glutaminyl-tRNA synthetase  53.12 
 
 		 556 aa  620  1e-176  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1595  glutaminyl-tRNA synthetase  52.88 
 
 		 562 aa  615  1e-175  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000811863  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1734  glutaminyl-tRNA synthetase  52.27 
 
 		 564 aa  617  1e-175  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.112324  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2128  glutaminyl-tRNA synthetase  51.38 
 
 		 558 aa  617  1e-175  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.116661  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0417  glutaminyl-tRNA synthetase  52.37 
 
 		 570 aa  617  1e-175  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3743  glutaminyl-tRNA synthetase  51.91 
 
 		 569 aa  612  9.999999999999999e-175  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0260392  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1116  glutaminyl-tRNA synthetase  52.78 
 
 		 552 aa  614  9.999999999999999e-175  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0917  glutaminyl-tRNA synthetase  54.01 
 
 		 580 aa  614  9.999999999999999e-175  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000234027  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1384  glutaminyl-tRNA synthetase  53.29 
 
 		 563 aa  612  9.999999999999999e-175  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.559394 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3126  glutaminyl-tRNA synthetase  52.86 
 
 		 552 aa  612  9.999999999999999e-175  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.0016183  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3639  glutaminyl-tRNA synthetase  52.46 
 
 		 566 aa  611  1e-173  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.193855 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1205  glutaminyl-tRNA synthetase  52.86 
 
 		 552 aa  609  1e-173  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00285651  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2940  glutaminyl-tRNA synthetase  52.34 
 
 		 552 aa  608  1e-173  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0919452  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1216  glutaminyl-tRNA synthetase  52.36 
 
 		 555 aa  605  9.999999999999999e-173  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0536  glutaminyl-tRNA synthetase  52.7 
 
 		 556 aa  606  9.999999999999999e-173  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0242  glutaminyl-tRNA synthetase  53.77 
 
 		 555 aa  606  9.999999999999999e-173  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1229  glutaminyl-tRNA synthetase  51.99 
 
 		 554 aa  603  1.0000000000000001e-171  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0152842  normal  0.0951842 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0895  glutaminyl-tRNA synthetase  52.36 
 
 		 548 aa  604  1.0000000000000001e-171  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0267  glutaminyl-tRNA synthetase  50 
 
 		 587 aa  602  1.0000000000000001e-171  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3516  glutaminyl-tRNA synthetase  51.65 
 
 		 564 aa  604  1.0000000000000001e-171  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.953083  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0421  glutaminyl-tRNA synthetase  51.2 
 
 		 559 aa  598  1e-170  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2459  glutaminyl-tRNA synthetase  49.83 
 
 		 589 aa  601  1e-170  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1263  glutaminyl-tRNA synthetase  52.09 
 
 		 781 aa  595  1e-169  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.578242  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>