More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_0417 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009801  EcE24377A_0706  glutaminyl-tRNA synthetase  58.92 
 
 
554 aa  663    Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000238299  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1595  glutaminyl-tRNA synthetase  66 
 
 
562 aa  748    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000811863  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00637  glutaminyl-tRNA synthetase  58.92 
 
 
554 aa  663    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2957  glutaminyl-tRNA synthetase  58.92 
 
 
554 aa  663    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.690706  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01337  glutaminyl-tRNA synthetase  58.62 
 
 
556 aa  670    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2572  glutaminyl-tRNA synthetase  62.04 
 
 
555 aa  697    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0923139  hitchhiker  0.00019462 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3366  glutaminyl-tRNA synthetase  61.69 
 
 
554 aa  700    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2904  glutaminyl-tRNA synthetase  59.47 
 
 
567 aa  688    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.781654 
 
 
-
 
NC_002950  PG1951  glutaminyl-tRNA synthetase  56.55 
 
 
566 aa  654    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0492  glutaminyl-tRNA synthetase  56.23 
 
 
553 aa  643    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0995744  normal  0.607402 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0791  glutaminyl-tRNA synthetase  58.02 
 
 
580 aa  662    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00535923  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0805  glutaminyl-tRNA synthetase  58.48 
 
 
555 aa  661    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.112626  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3743  glutaminyl-tRNA synthetase  60.25 
 
 
569 aa  696    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0260392  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0892  glutaminyl-tRNA synthetase  59.23 
 
 
569 aa  687    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.522948  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1270  glutaminyl-tRNA synthetase  56.04 
 
 
551 aa  640    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0517  glutaminyl-tRNA synthetase  59.68 
 
 
556 aa  685    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1269  glutaminyl-tRNA synthetase  55.86 
 
 
551 aa  636    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1845  glutaminyl-tRNA synthetase  56.19 
 
 
559 aa  644    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04610  glutaminyl-tRNA synthetase  55.22 
 
 
579 aa  634    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.959469  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01892  glutaminyl-tRNA synthetase  56.94 
 
 
555 aa  650    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00449379  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1734  glutaminyl-tRNA synthetase  60.78 
 
 
564 aa  697    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.112324  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0907  glutaminyl-tRNA synthetase  59.36 
 
 
573 aa  686    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.47238  normal  0.116742 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2516  glutaminyl-tRNA synthetase  57.07 
 
 
556 aa  645    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0318208  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3447  glutaminyl-tRNA synthetase  58.6 
 
 
601 aa  648    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.183021  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0833  glutaminyl-tRNA synthetase  58.22 
 
 
609 aa  679    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.227422  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4500  glutaminyl-tRNA synthetase  64.32 
 
 
563 aa  736    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.111687  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4167  glutaminyl-tRNA synthetase  62.21 
 
 
568 aa  743    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0850  glutaminyl-tRNA synthetase  60.04 
 
 
565 aa  700    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.750586 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0702  glutaminyl-tRNA synthetase  58.74 
 
 
554 aa  662    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.237561  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1843  glutaminyl-tRNA synthetase  62.72 
 
 
559 aa  714    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.311784  normal  0.481089 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1633  glutaminyl-tRNA synthetase  59.23 
 
 
569 aa  687    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0234579  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1229  glutaminyl-tRNA synthetase  58.2 
 
 
554 aa  658    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0152842  normal  0.0951842 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1812  glutaminyl-tRNA synthetase  59.23 
 
 
596 aa  687    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0624978  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3251  glutaminyl-tRNA synthetase  63.78 
 
 
560 aa  736    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3639  glutaminyl-tRNA synthetase  58.61 
 
 
566 aa  687    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.193855 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0417  glutaminyl-tRNA synthetase  100 
 
 
570 aa  1186    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0101  glutaminyl-tRNA synthetase  64.96 
 
 
572 aa  778    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2787  glutaminyl-tRNA synthetase  59.47 
 
 
567 aa  688    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4549  glutaminyl-tRNA synthetase  58.88 
 
 
569 aa  680    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1419  glutaminyl-tRNA synthetase  59.23 
 
 
569 aa  687    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0058  glutaminyl-tRNA synthetase  62.05 
 
 
553 aa  701    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0733  glutaminyl-tRNA synthetase  58.48 
 
 
555 aa  661    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0626  glutaminyl-tRNA synthetase  74.34 
 
 
568 aa  894    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.16998  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1263  glutaminyl-tRNA synthetase  59.38 
 
 
781 aa  657    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.578242  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0922  glutaminyl-tRNA synthetase  55.83 
 
 
559 aa  642    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2907  glutaminyl-tRNA synthetase  59.13 
 
 
555 aa  665    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.483628  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0737  glutaminyl-tRNA synthetase  58.32 
 
 
576 aa  661    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.705767 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2083  glutaminyl-tRNA synthetase  62.28 
 
 
565 aa  722    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0682  glutaminyl-tRNA synthetase  55.4 
 
 
582 aa  654    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.613732  normal  0.476969 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2665  glutaminyl-tRNA synthetase  59.75 
 
 
569 aa  696    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0180309  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2599  glutaminyl-tRNA synthetase  59.85 
 
 
778 aa  650    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0790772  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2811  glutaminyl-tRNA synthetase  63.96 
 
 
561 aa  736    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.129668  normal  0.859959 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0917  glutaminyl-tRNA synthetase  66.73 
 
 
580 aa  772    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000234027  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0570  glutaminyl-tRNA synthetase  58.92 
 
 
554 aa  664    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.011441  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1910  glutaminyl-tRNA synthetase  59.4 
 
 
569 aa  695    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.125081  normal  0.474008 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2406  glutaminyl-tRNA synthetase  59.82 
 
 
567 aa  694    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1316  glutaminyl-tRNA synthetase  59.23 
 
 
569 aa  684    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.110897 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2452  glutaminyl-tRNA synthetase  63.02 
 
 
559 aa  706    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.930191  normal  0.727818 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0189  glutaminyl-tRNA synthetase  65.77 
 
 
561 aa  768    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.360973  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2082  glutaminyl-tRNA synthetase  56.99 
 
 
596 aa  640    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3475  glutaminyl-tRNA synthetase  58.68 
 
 
580 aa  666    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.675011  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1307  glutaminyl-tRNA synthetase  59.22 
 
 
569 aa  679    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.518903 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2828  glutaminyl-tRNA synthetase  59.57 
 
 
569 aa  674    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.531779  normal  0.0114243 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1012  glutaminyl-tRNA synthetase  56.83 
 
 
705 aa  646    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2841  glutaminyl-tRNA synthetase  64.48 
 
 
561 aa  730    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.602815 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2879  glutaminyl-tRNA synthetase  59.65 
 
 
567 aa  691    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2052  glutaminyl-tRNA synthetase  59.06 
 
 
576 aa  663    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.26884  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0459  glutaminyl-tRNA synthetase  59.23 
 
 
569 aa  687    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.200352  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1710  glutaminyl-tRNA synthetase  63.9 
 
 
558 aa  728    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3674  glutaminyl-tRNA synthetase  55.05 
 
 
606 aa  636    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.620823  normal  0.300613 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0818  glutaminyl-tRNA synthetase  59.47 
 
 
582 aa  683    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0602034 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3799  glutaminyl-tRNA synthetase  62.17 
 
 
565 aa  728    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.105698  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0326  glutaminyl-tRNA synthetase  59.13 
 
 
555 aa  665    Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000088467  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2109  glutaminyl-tRNA synthetase  58.35 
 
 
557 aa  671    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.831991  hitchhiker  0.000255722 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0745  glutaminyl-tRNA synthetase  58.66 
 
 
555 aa  662    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.794095  normal  0.613987 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0923  glutaminyl-tRNA synthetase  58.88 
 
 
569 aa  680    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2994  glutaminyl-tRNA synthetase  59.13 
 
 
555 aa  664    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2184  glutaminyl-tRNA synthetase  56.86 
 
 
558 aa  659    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.213652  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0701  glutaminyl-tRNA synthetase  59.23 
 
 
569 aa  687    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2976  glutaminyl-tRNA synthetase  58.92 
 
 
554 aa  663    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0626  glutaminyl-tRNA synthetase  56.52 
 
 
552 aa  647    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00799923  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0612  glutaminyl-tRNA synthetase  56.7 
 
 
552 aa  652    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000113459  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0895  glutaminyl-tRNA synthetase  57.25 
 
 
548 aa  643    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1195  glutaminyl-tRNA synthetase  58.84 
 
 
555 aa  668    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.068426  decreased coverage  0.0000265755 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0792  glutaminyl-tRNA synthetase  58.48 
 
 
555 aa  661    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.674612  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0832  glutaminyl-tRNA synthetase  57.79 
 
 
552 aa  667    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.551071  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0725  glutaminyl-tRNA synthetase  58.92 
 
 
554 aa  663    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.769137  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1249  glutaminyl-tRNA synthetase  59.67 
 
 
777 aa  650    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1655  glutaminyl-tRNA synthetase  59.05 
 
 
569 aa  685    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.434975  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2459  glutaminyl-tRNA synthetase  61.71 
 
 
589 aa  725    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1282  glutaminyl-tRNA synthetase  59.4 
 
 
569 aa  687    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41380  glutaminyl-tRNA synthetase  61.01 
 
 
556 aa  689    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.423392 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1405  glutaminyl-tRNA synthetase  59.05 
 
 
569 aa  682    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.681017  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1383  glutaminyl-tRNA synthetase  59.23 
 
 
569 aa  684    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.21862 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3509  glutaminyl-tRNA synthetase  60.65 
 
 
561 aa  686    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.271227  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2128  glutaminyl-tRNA synthetase  57.91 
 
 
558 aa  665    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.116661  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3516  glutaminyl-tRNA synthetase  67.26 
 
 
564 aa  788    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.953083  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0773  glutaminyl-tRNA synthetase  58.92 
 
 
554 aa  664    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0411639  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0841  glutaminyl-tRNA synthetase  58.48 
 
 
555 aa  660    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1725  glutaminyl-tRNA synthetase  61.04 
 
 
565 aa  693    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.153622  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>