More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_2489 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008782  Ajs_1608  glutaminyl-tRNA synthetase  82.71 
 
 		 613 aa  1048    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0558752  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1314  glutaminyl-tRNA synthetase  72.95 
 
 		 609 aa  905    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3366  glutaminyl-tRNA synthetase  54.21 
 
 		 554 aa  638    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2300  glutaminyl-tRNA synthetase  84.46 
 
 		 604 aa  1066    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.775495  hitchhiker  0.00472002 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0791  glutaminyl-tRNA synthetase  64.44 
 
 		 580 aa  775    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00535923  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0892  glutaminyl-tRNA synthetase  59.46 
 
 		 569 aa  721    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.522948  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1316  glutaminyl-tRNA synthetase  59.73 
 
 		 569 aa  715    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.110897 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3447  glutaminyl-tRNA synthetase  60.1 
 
 		 601 aa  738    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.183021  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0833  glutaminyl-tRNA synthetase  62.76 
 
 		 609 aa  788    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.227422  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1440  glutaminyl-tRNA synthetase  56.86 
 
 		 590 aa  690    Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0850  glutaminyl-tRNA synthetase  59.32 
 
 		 565 aa  704    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.750586 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1956  glutaminyl-tRNA synthetase  70.74 
 
 		 619 aa  888    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1812  glutaminyl-tRNA synthetase  59.46 
 
 		 596 aa  721    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0624978  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1722  glutaminyl-tRNA synthetase  56.45 
 
 		 590 aa  689    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4549  glutaminyl-tRNA synthetase  59.9 
 
 		 569 aa  712    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0737  glutaminyl-tRNA synthetase  64.91 
 
 		 576 aa  785    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.705767 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1351  glutaminyl-tRNA synthetase  72.5 
 
 		 625 aa  893    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.22682 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0701  glutaminyl-tRNA synthetase  59.46 
 
 		 569 aa  721    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2489  glutaminyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 628 aa  1307    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.348207  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2083  glutaminyl-tRNA synthetase  56.48 
 
 		 565 aa  667    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2665  glutaminyl-tRNA synthetase  59.39 
 
 		 569 aa  718    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0180309  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2828  glutaminyl-tRNA synthetase  59.73 
 
 		 569 aa  713    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.531779  normal  0.0114243 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1823  glutaminyl-tRNA synthetase  72.25 
 
 		 620 aa  888    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.236444  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0807  glutaminyl-tRNA synthetase  65.25 
 
 		 576 aa  788    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2082  glutaminyl-tRNA synthetase  63.44 
 
 		 596 aa  780    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3350  glutaminyl-tRNA synthetase  70.65 
 
 		 612 aa  876    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.446012  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1307  glutaminyl-tRNA synthetase  59.56 
 
 		 569 aa  717    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.518903 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0907  glutaminyl-tRNA synthetase  57.85 
 
 		 573 aa  701    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.47238  normal  0.116742 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0421  glutaminyl-tRNA synthetase  53.43 
 
 		 559 aa  639    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3615  glutaminyl-tRNA synthetase  66.83 
 
 		 604 aa  812    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0818  glutaminyl-tRNA synthetase  64.12 
 
 		 582 aa  776    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0602034 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0459  glutaminyl-tRNA synthetase  59.46 
 
 		 569 aa  721    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.200352  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1910  glutaminyl-tRNA synthetase  59.9 
 
 		 569 aa  714    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.125081  normal  0.474008 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0923  glutaminyl-tRNA synthetase  60.24 
 
 		 569 aa  715    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2106  glutaminyl-tRNA synthetase  82.87 
 
 		 620 aa  1051    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4234  glutaminyl-tRNA synthetase  71.26 
 
 		 628 aa  900    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.512355  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1655  glutaminyl-tRNA synthetase  59.46 
 
 		 569 aa  720    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.434975  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1282  glutaminyl-tRNA synthetase  59.73 
 
 		 569 aa  714    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1383  glutaminyl-tRNA synthetase  60.07 
 
 		 569 aa  714    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.21862 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1405  glutaminyl-tRNA synthetase  60.24 
 
 		 569 aa  716    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.681017  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1419  glutaminyl-tRNA synthetase  59.46 
 
 		 569 aa  721    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1633  glutaminyl-tRNA synthetase  59.46 
 
 		 569 aa  721    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0234579  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3475  glutaminyl-tRNA synthetase  58.59 
 
 		 580 aa  699    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.675011  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2128  glutaminyl-tRNA synthetase  51.26 
 
 		 558 aa  616  1e-175  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.116661  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4167  glutaminyl-tRNA synthetase  52.19 
 
 		 568 aa  617  1e-175  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004127  glutaminyl-tRNA synthetase  52.16 
 
 		 556 aa  618  1e-175  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000085379  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0682  glutaminyl-tRNA synthetase  52.92 
 
 		 582 aa  613  9.999999999999999e-175  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.613732  normal  0.476969 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1725  glutaminyl-tRNA synthetase  52.27 
 
 		 565 aa  614  9.999999999999999e-175  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.153622  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3639  glutaminyl-tRNA synthetase  52.3 
 
 		 566 aa  608  1e-173  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.193855 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0058  glutaminyl-tRNA synthetase  52.1 
 
 		 553 aa  609  1e-173  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0517  glutaminyl-tRNA synthetase  53.11 
 
 		 556 aa  611  1e-173  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1220  glutaminyl-tRNA synthetase  51.99 
 
 		 573 aa  611  1e-173  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01337  glutaminyl-tRNA synthetase  52.33 
 
 		 556 aa  607  9.999999999999999e-173  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2406  glutaminyl-tRNA synthetase  53.21 
 
 		 567 aa  603  1.0000000000000001e-171  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2572  glutaminyl-tRNA synthetase  53.64 
 
 		 555 aa  602  1.0000000000000001e-171  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0923139  hitchhiker  0.00019462 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1734  glutaminyl-tRNA synthetase  52.62 
 
 		 564 aa  601  1e-170  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.112324  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3509  glutaminyl-tRNA synthetase  52.57 
 
 		 561 aa  598  1e-170  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.271227  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0832  glutaminyl-tRNA synthetase  50.51 
 
 		 552 aa  597  1e-169  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.551071  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3743  glutaminyl-tRNA synthetase  51.95 
 
 		 569 aa  597  1e-169  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0260392  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0702  glutaminyl-tRNA synthetase  51.43 
 
 		 554 aa  595  1e-169  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.237561  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1229  glutaminyl-tRNA synthetase  50.42 
 
 		 554 aa  595  1e-169  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0152842  normal  0.0951842 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0773  glutaminyl-tRNA synthetase  51.6 
 
 		 554 aa  597  1e-169  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0411639  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0570  glutaminyl-tRNA synthetase  51.18 
 
 		 554 aa  596  1e-169  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.011441  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0536  glutaminyl-tRNA synthetase  51.78 
 
 		 556 aa  598  1e-169  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41380  glutaminyl-tRNA synthetase  53.06 
 
 		 556 aa  595  1e-169  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.423392 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0706  glutaminyl-tRNA synthetase  51.43 
 
 		 554 aa  595  1e-168  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000238299  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00637  glutaminyl-tRNA synthetase  51.43 
 
 		 554 aa  595  1e-168  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2957  glutaminyl-tRNA synthetase  51.43 
 
 		 554 aa  595  1e-168  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.690706  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0725  glutaminyl-tRNA synthetase  51.43 
 
 		 554 aa  595  1e-168  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.769137  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2904  glutaminyl-tRNA synthetase  52.53 
 
 		 567 aa  593  1e-168  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.781654 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2879  glutaminyl-tRNA synthetase  52.53 
 
 		 567 aa  595  1e-168  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2787  glutaminyl-tRNA synthetase  52.53 
 
 		 567 aa  593  1e-168  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2363  glutaminyl-tRNA synthetase  51.24 
 
 		 570 aa  592  1e-168  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.621285 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00628  hypothetical protein  51.43 
 
 		 554 aa  595  1e-168  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1195  glutaminyl-tRNA synthetase  50.76 
 
 		 555 aa  593  1e-168  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.068426  decreased coverage  0.0000265755 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2976  glutaminyl-tRNA synthetase  51.43 
 
 		 554 aa  595  1e-168  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0805  glutaminyl-tRNA synthetase  51.09 
 
 		 555 aa  591  1e-167  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.112626  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1596  glutaminyl-tRNA synthetase  51.79 
 
 		 556 aa  588  1e-167  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00615688  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3882  glutaminyl-tRNA synthetase  51.69 
 
 		 565 aa  592  1e-167  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1585  glutaminyl-tRNA synthetase  51.79 
 
 		 571 aa  589  1e-167  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000343871  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1619  glutaminyl-tRNA synthetase  51.96 
 
 		 556 aa  590  1e-167  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00308456  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04610  glutaminyl-tRNA synthetase  50.25 
 
 		 579 aa  590  1e-167  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.959469  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3799  glutaminyl-tRNA synthetase  51.68 
 
 		 565 aa  591  1e-167  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.105698  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0733  glutaminyl-tRNA synthetase  51.09 
 
 		 555 aa  591  1e-167  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0745  glutaminyl-tRNA synthetase  51.09 
 
 		 555 aa  591  1e-167  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.794095  normal  0.613987 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3126  glutaminyl-tRNA synthetase  51.26 
 
 		 552 aa  588  1e-167  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.0016183  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0792  glutaminyl-tRNA synthetase  51.09 
 
 		 555 aa  591  1e-167  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.674612  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0326  glutaminyl-tRNA synthetase  50.59 
 
 		 555 aa  590  1e-167  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000088467  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23520  glutaminyl-tRNA synthetase  52.46 
 
 		 555 aa  590  1e-167  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0841  glutaminyl-tRNA synthetase  50.92 
 
 		 555 aa  589  1e-167  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2907  glutaminyl-tRNA synthetase  50.59 
 
 		 555 aa  590  1e-167  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.483628  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2994  glutaminyl-tRNA synthetase  50.42 
 
 		 555 aa  588  1e-167  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0101  glutaminyl-tRNA synthetase  50 
 
 		 572 aa  586  1e-166  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1116  glutaminyl-tRNA synthetase  50.84 
 
 		 552 aa  587  1e-166  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2940  glutaminyl-tRNA synthetase  50.76 
 
 		 552 aa  585  1e-166  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0919452  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1485  glutaminyl-tRNA synthetase  51.16 
 
 		 569 aa  585  1e-166  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2758  glutaminyl-tRNA synthetase  51.79 
 
 		 556 aa  588  1e-166  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.112039  normal  0.0252505 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1205  glutaminyl-tRNA synthetase  51.1 
 
 		 552 aa  583  1.0000000000000001e-165  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00285651  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1482  glutaminyl-tRNA synthetase  51.45 
 
 		 556 aa  582  1.0000000000000001e-165  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.348011  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1216  glutaminyl-tRNA synthetase  51.61 
 
 		 555 aa  584  1.0000000000000001e-165  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>