More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_2572 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_1533  glutaminyl-tRNA synthetase  59.64 
 
 		 556 aa  683    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.208966  normal  0.486812 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1595  glutaminyl-tRNA synthetase  60.22 
 
 		 562 aa  686    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000811863  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00637  glutaminyl-tRNA synthetase  61.64 
 
 		 554 aa  706    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2957  glutaminyl-tRNA synthetase  61.64 
 
 		 554 aa  706    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.690706  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3509  glutaminyl-tRNA synthetase  88.65 
 
 		 561 aa  1040    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.271227  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0189  glutaminyl-tRNA synthetase  60.32 
 
 		 561 aa  697    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.360973  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3366  glutaminyl-tRNA synthetase  63.73 
 
 		 554 aa  747    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2904  glutaminyl-tRNA synthetase  83.39 
 
 		 567 aa  992    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.781654 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0832  glutaminyl-tRNA synthetase  61.52 
 
 		 552 aa  699    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.551071  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0326  glutaminyl-tRNA synthetase  61.93 
 
 		 555 aa  699    Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000088467  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0791  glutaminyl-tRNA synthetase  56.94 
 
 		 580 aa  637    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00535923  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2572  glutaminyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 555 aa  1153    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0923139  hitchhiker  0.00019462 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3240  glutaminyl-tRNA synthetase  60.4 
 
 		 556 aa  705    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.00746606  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2907  glutaminyl-tRNA synthetase  61.93 
 
 		 555 aa  699    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.483628  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2406  glutaminyl-tRNA synthetase  82.86 
 
 		 567 aa  990    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1786  glutaminyl-tRNA synthetase  60.44 
 
 		 556 aa  686    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3743  glutaminyl-tRNA synthetase  83.48 
 
 		 569 aa  986    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0260392  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0421  glutaminyl-tRNA synthetase  58.29 
 
 		 559 aa  657    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1270  glutaminyl-tRNA synthetase  57.35 
 
 		 551 aa  669    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1269  glutaminyl-tRNA synthetase  57.17 
 
 		 551 aa  665    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1619  glutaminyl-tRNA synthetase  60.98 
 
 		 556 aa  688    Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00308456  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0706  glutaminyl-tRNA synthetase  61.64 
 
 		 554 aa  706    Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000238299  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1734  glutaminyl-tRNA synthetase  83.66 
 
 		 564 aa  988    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.112324  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0694  glutaminyl-tRNA synthetase  55.28 
 
 		 579 aa  656    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.450969  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0841  glutaminyl-tRNA synthetase  61.82 
 
 		 555 aa  709    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0833  glutaminyl-tRNA synthetase  58.15 
 
 		 609 aa  678    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.227422  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2828  glutaminyl-tRNA synthetase  57.68 
 
 		 569 aa  637    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.531779  normal  0.0114243 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0850  glutaminyl-tRNA synthetase  59.21 
 
 		 565 aa  660    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.750586 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1843  glutaminyl-tRNA synthetase  62.03 
 
 		 559 aa  709    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.311784  normal  0.481089 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2689  glutaminyl-tRNA synthetase  59.53 
 
 		 556 aa  678    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00133273  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2128  glutaminyl-tRNA synthetase  63.2 
 
 		 558 aa  740    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.116661  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3639  glutaminyl-tRNA synthetase  82.86 
 
 		 566 aa  985    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.193855 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0517  glutaminyl-tRNA synthetase  61.13 
 
 		 556 aa  694    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1216  glutaminyl-tRNA synthetase  60.8 
 
 		 555 aa  686    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0101  glutaminyl-tRNA synthetase  61.62 
 
 		 572 aa  719    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1482  glutaminyl-tRNA synthetase  60.62 
 
 		 556 aa  688    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.348011  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0792  glutaminyl-tRNA synthetase  61.82 
 
 		 555 aa  710    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.674612  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0058  glutaminyl-tRNA synthetase  63.93 
 
 		 553 aa  738    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01337  glutaminyl-tRNA synthetase  59.64 
 
 		 556 aa  684    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0626  glutaminyl-tRNA synthetase  60.94 
 
 		 568 aa  684    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.16998  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2787  glutaminyl-tRNA synthetase  83.57 
 
 		 567 aa  994    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0922  glutaminyl-tRNA synthetase  58.16 
 
 		 559 aa  656    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0907  glutaminyl-tRNA synthetase  56.96 
 
 		 573 aa  650    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.47238  normal  0.116742 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2083  glutaminyl-tRNA synthetase  60.22 
 
 		 565 aa  682    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0417  glutaminyl-tRNA synthetase  62.04 
 
 		 570 aa  697    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2665  glutaminyl-tRNA synthetase  56.89 
 
 		 569 aa  635    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0180309  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0773  glutaminyl-tRNA synthetase  61.82 
 
 		 554 aa  707    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0411639  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0733  glutaminyl-tRNA synthetase  61.82 
 
 		 555 aa  710    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2811  glutaminyl-tRNA synthetase  63.47 
 
 		 561 aa  725    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.129668  normal  0.859959 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0694  glutaminyl-tRNA synthetase  56.13 
 
 		 580 aa  650    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.352024  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4500  glutaminyl-tRNA synthetase  64.53 
 
 		 563 aa  728    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.111687  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0725  glutaminyl-tRNA synthetase  61.64 
 
 		 554 aa  706    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.769137  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1845  glutaminyl-tRNA synthetase  67.03 
 
 		 559 aa  769    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1229  glutaminyl-tRNA synthetase  61.64 
 
 		 554 aa  691    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0152842  normal  0.0951842 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2994  glutaminyl-tRNA synthetase  61.93 
 
 		 555 aa  699    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1902  glutaminyl-tRNA synthetase  66.61 
 
 		 590 aa  764    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000991205  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1585  glutaminyl-tRNA synthetase  61.16 
 
 		 571 aa  690    Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000343871  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2452  glutaminyl-tRNA synthetase  63.99 
 
 		 559 aa  723    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.930191  normal  0.727818 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2879  glutaminyl-tRNA synthetase  83.39 
 
 		 567 aa  992    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0702  glutaminyl-tRNA synthetase  61.45 
 
 		 554 aa  704    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.237561  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1307  glutaminyl-tRNA synthetase  57.68 
 
 		 569 aa  640    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.518903 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2413  glutaminyl-tRNA synthetase  60.87 
 
 		 556 aa  692    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000218793  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0682  glutaminyl-tRNA synthetase  60.39 
 
 		 582 aa  684    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.613732  normal  0.476969 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04610  glutaminyl-tRNA synthetase  58.67 
 
 		 579 aa  683    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.959469  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2841  glutaminyl-tRNA synthetase  64.38 
 
 		 561 aa  732    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.602815 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0613  glutaminyl-tRNA synthetase  55.77 
 
 		 587 aa  645    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.794454  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2052  glutaminyl-tRNA synthetase  69.03 
 
 		 576 aa  785    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.26884  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2109  glutaminyl-tRNA synthetase  65.64 
 
 		 557 aa  752    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.831991  hitchhiker  0.000255722 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1710  glutaminyl-tRNA synthetase  62.03 
 
 		 558 aa  704    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0665  glutaminyl-tRNA synthetase  55.63 
 
 		 579 aa  657    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0340381  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0818  glutaminyl-tRNA synthetase  58.12 
 
 		 582 aa  664    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0602034 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3799  glutaminyl-tRNA synthetase  62.07 
 
 		 565 aa  711    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.105698  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0492  glutaminyl-tRNA synthetase  61.5 
 
 		 553 aa  701    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0995744  normal  0.607402 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1910  glutaminyl-tRNA synthetase  57.14 
 
 		 569 aa  640    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.125081  normal  0.474008 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2976  glutaminyl-tRNA synthetase  61.64 
 
 		 554 aa  706    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1195  glutaminyl-tRNA synthetase  60.73 
 
 		 555 aa  698    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.068426  decreased coverage  0.0000265755 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0745  glutaminyl-tRNA synthetase  61.82 
 
 		 555 aa  709    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.794095  normal  0.613987 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3251  glutaminyl-tRNA synthetase  66.06 
 
 		 560 aa  744    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2184  glutaminyl-tRNA synthetase  59.96 
 
 		 558 aa  680    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.213652  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1596  glutaminyl-tRNA synthetase  61.16 
 
 		 556 aa  689    Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00615688  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3121  glutaminyl-tRNA synthetase  60.36 
 
 		 556 aa  684    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000496067 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0626  glutaminyl-tRNA synthetase  59.2 
 
 		 552 aa  665    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00799923  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0612  glutaminyl-tRNA synthetase  59.56 
 
 		 552 aa  666    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000113459  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0895  glutaminyl-tRNA synthetase  60.8 
 
 		 548 aa  689    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2503  glutaminyl-tRNA synthetase  60.44 
 
 		 556 aa  687    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0137132  hitchhiker  0.0018216 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2571  glutaminyl-tRNA synthetase  60.44 
 
 		 556 aa  686    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.838936  normal  0.0268819 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1725  glutaminyl-tRNA synthetase  62.45 
 
 		 565 aa  712    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.153622  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2615  glutaminyl-tRNA synthetase  60.69 
 
 		 556 aa  687    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.620395  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0570  glutaminyl-tRNA synthetase  61.45 
 
 		 554 aa  703    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.011441  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2459  glutaminyl-tRNA synthetase  59.07 
 
 		 589 aa  676    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0814  glutaminyl-tRNA synthetase  57.92 
 
 		 597 aa  669    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000834243  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2516  glutaminyl-tRNA synthetase  61.82 
 
 		 556 aa  699    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0318208  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0805  glutaminyl-tRNA synthetase  61.82 
 
 		 555 aa  710    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.112626  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41380  glutaminyl-tRNA synthetase  88.83 
 
 		 556 aa  1039    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.423392 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3475  glutaminyl-tRNA synthetase  57.12 
 
 		 580 aa  642    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.675011  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4167  glutaminyl-tRNA synthetase  62.77 
 
 		 568 aa  727    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01892  glutaminyl-tRNA synthetase  60 
 
 		 555 aa  681    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00449379  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3516  glutaminyl-tRNA synthetase  60.93 
 
 		 564 aa  713    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.953083  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2669  glutaminyl-tRNA synthetase  60.62 
 
 		 556 aa  689    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0864702  normal  0.0642035 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0917  glutaminyl-tRNA synthetase  60.55 
 
 		 580 aa  706    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000234027  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>