More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_2184 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009801  EcE24377A_0706  glutaminyl-tRNA synthetase  75.49 
 
 		 554 aa  900    Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000238299  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1595  glutaminyl-tRNA synthetase  57.4 
 
 		 562 aa  651    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000811863  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00637  glutaminyl-tRNA synthetase  75.49 
 
 		 554 aa  900    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1633  glutaminyl-tRNA synthetase  56.15 
 
 		 569 aa  640    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0234579  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1596  glutaminyl-tRNA synthetase  69.91 
 
 		 556 aa  824    Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00615688  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2957  glutaminyl-tRNA synthetase  75.49 
 
 		 554 aa  900    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.690706  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01337  glutaminyl-tRNA synthetase  75.04 
 
 		 556 aa  890    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3366  glutaminyl-tRNA synthetase  57.53 
 
 		 554 aa  660    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2904  glutaminyl-tRNA synthetase  60.14 
 
 		 567 aa  681    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.781654 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0570  glutaminyl-tRNA synthetase  75.49 
 
 		 554 aa  902    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.011441  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1229  glutaminyl-tRNA synthetase  74.55 
 
 		 554 aa  888    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0152842  normal  0.0951842 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0517  glutaminyl-tRNA synthetase  73.43 
 
 		 556 aa  872    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1419  glutaminyl-tRNA synthetase  56.15 
 
 		 569 aa  640    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3882  glutaminyl-tRNA synthetase  57.53 
 
 		 565 aa  682    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3240  glutaminyl-tRNA synthetase  71.02 
 
 		 556 aa  844    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.00746606  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1485  glutaminyl-tRNA synthetase  59.53 
 
 		 569 aa  680    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2907  glutaminyl-tRNA synthetase  74.05 
 
 		 555 aa  874    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.483628  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1786  glutaminyl-tRNA synthetase  69.91 
 
 		 556 aa  827    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3743  glutaminyl-tRNA synthetase  60.69 
 
 		 569 aa  687    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0260392  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0892  glutaminyl-tRNA synthetase  56.15 
 
 		 569 aa  640    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.522948  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1270  glutaminyl-tRNA synthetase  54.22 
 
 		 551 aa  635    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3486  glutaminyl-tRNA synthetase  56.4 
 
 		 565 aa  641    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.409047  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1619  glutaminyl-tRNA synthetase  70.09 
 
 		 556 aa  825    Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00308456  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1533  glutaminyl-tRNA synthetase  69.91 
 
 		 556 aa  830    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.208966  normal  0.486812 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1734  glutaminyl-tRNA synthetase  59.96 
 
 		 564 aa  685    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.112324  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0733  glutaminyl-tRNA synthetase  75.49 
 
 		 555 aa  904    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01892  glutaminyl-tRNA synthetase  78.85 
 
 		 555 aa  935    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00449379  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0833  glutaminyl-tRNA synthetase  55.32 
 
 		 609 aa  641    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.227422  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3509  glutaminyl-tRNA synthetase  59.14 
 
 		 561 aa  668    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.271227  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0792  glutaminyl-tRNA synthetase  75.49 
 
 		 555 aa  904    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.674612  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0536  glutaminyl-tRNA synthetase  57.27 
 
 		 556 aa  658    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2940  glutaminyl-tRNA synthetase  72.97 
 
 		 552 aa  868    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0919452  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1812  glutaminyl-tRNA synthetase  56.15 
 
 		 596 aa  641    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0624978  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3639  glutaminyl-tRNA synthetase  60.76 
 
 		 566 aa  689    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.193855 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2572  glutaminyl-tRNA synthetase  59.96 
 
 		 555 aa  680    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0923139  hitchhiker  0.00019462 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0101  glutaminyl-tRNA synthetase  56.68 
 
 		 572 aa  650    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0459  glutaminyl-tRNA synthetase  56.15 
 
 		 569 aa  640    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.200352  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0832  glutaminyl-tRNA synthetase  75.09 
 
 		 552 aa  893    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.551071  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004127  glutaminyl-tRNA synthetase  75.04 
 
 		 556 aa  890    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000085379  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0626  glutaminyl-tRNA synthetase  60 
 
 		 568 aa  689    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.16998  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2758  glutaminyl-tRNA synthetase  70.09 
 
 		 556 aa  826    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.112039  normal  0.0252505 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0922  glutaminyl-tRNA synthetase  67.81 
 
 		 559 aa  799    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2787  glutaminyl-tRNA synthetase  59.78 
 
 		 567 aa  678    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0189  glutaminyl-tRNA synthetase  57.63 
 
 		 561 aa  657    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.360973  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00628  hypothetical protein  75.49 
 
 		 554 aa  900    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2665  glutaminyl-tRNA synthetase  55.79 
 
 		 569 aa  638    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0180309  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3126  glutaminyl-tRNA synthetase  73.65 
 
 		 552 aa  875    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.0016183  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2689  glutaminyl-tRNA synthetase  70.99 
 
 		 556 aa  833    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00133273  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1205  glutaminyl-tRNA synthetase  73.83 
 
 		 552 aa  874    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00285651  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2109  glutaminyl-tRNA synthetase  60.07 
 
 		 557 aa  682    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.831991  hitchhiker  0.000255722 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2516  glutaminyl-tRNA synthetase  72.07 
 
 		 556 aa  842    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0318208  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3121  glutaminyl-tRNA synthetase  70.04 
 
 		 556 aa  826    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000496067 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2406  glutaminyl-tRNA synthetase  59.96 
 
 		 567 aa  682    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1902  glutaminyl-tRNA synthetase  59.03 
 
 		 590 aa  670    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000991205  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23520  glutaminyl-tRNA synthetase  59.42 
 
 		 555 aa  670    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0267  glutaminyl-tRNA synthetase  58.21 
 
 		 587 aa  672    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0745  glutaminyl-tRNA synthetase  75.31 
 
 		 555 aa  902    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.794095  normal  0.613987 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0702  glutaminyl-tRNA synthetase  75.49 
 
 		 554 aa  900    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.237561  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6655  glutaminyl-tRNA synthetase  54.63 
 
 		 583 aa  649    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.204769  normal  0.445852 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2413  glutaminyl-tRNA synthetase  71.94 
 
 		 556 aa  848    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000218793  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1116  glutaminyl-tRNA synthetase  73.1 
 
 		 552 aa  871    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1012  glutaminyl-tRNA synthetase  55.97 
 
 		 705 aa  635    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1482  glutaminyl-tRNA synthetase  70.32 
 
 		 556 aa  826    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.348011  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0242  glutaminyl-tRNA synthetase  58.2 
 
 		 555 aa  657    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2052  glutaminyl-tRNA synthetase  58.91 
 
 		 576 aa  667    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.26884  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1710  glutaminyl-tRNA synthetase  56.2 
 
 		 558 aa  636    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0805  glutaminyl-tRNA synthetase  75.49 
 
 		 555 aa  904    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.112626  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0818  glutaminyl-tRNA synthetase  55.32 
 
 		 582 aa  641    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0602034 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0094  glutaminyl-tRNA synthetase  63.22 
 
 		 556 aa  751    Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2994  glutaminyl-tRNA synthetase  73.87 
 
 		 555 aa  872    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0326  glutaminyl-tRNA synthetase  74.05 
 
 		 555 aa  874    Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000088467  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0725  glutaminyl-tRNA synthetase  75.49 
 
 		 554 aa  900    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.769137  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0701  glutaminyl-tRNA synthetase  56.15 
 
 		 569 aa  640    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0841  glutaminyl-tRNA synthetase  75.49 
 
 		 555 aa  903    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2184  glutaminyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 558 aa  1170    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.213652  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0917  glutaminyl-tRNA synthetase  57.75 
 
 		 580 aa  665    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000234027  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2128  glutaminyl-tRNA synthetase  56.55 
 
 		 558 aa  647    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.116661  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0895  glutaminyl-tRNA synthetase  70.63 
 
 		 548 aa  825    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2503  glutaminyl-tRNA synthetase  70.09 
 
 		 556 aa  830    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0137132  hitchhiker  0.0018216 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2571  glutaminyl-tRNA synthetase  70.09 
 
 		 556 aa  830    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.838936  normal  0.0268819 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1655  glutaminyl-tRNA synthetase  56.15 
 
 		 569 aa  642    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.434975  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2615  glutaminyl-tRNA synthetase  71.1 
 
 		 556 aa  839    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.620395  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2976  glutaminyl-tRNA synthetase  75.49 
 
 		 554 aa  900    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0773  glutaminyl-tRNA synthetase  75.49 
 
 		 554 aa  902    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0411639  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4241  glutaminyl-tRNA synthetase  55.68 
 
 		 564 aa  647    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1384  glutaminyl-tRNA synthetase  56.42 
 
 		 563 aa  644    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.559394 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41380  glutaminyl-tRNA synthetase  59.32 
 
 		 556 aa  669    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.423392 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3799  glutaminyl-tRNA synthetase  57.71 
 
 		 565 aa  684    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.105698  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1585  glutaminyl-tRNA synthetase  70.09 
 
 		 571 aa  826    Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000343871  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3516  glutaminyl-tRNA synthetase  56.68 
 
 		 564 aa  644    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.953083  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2669  glutaminyl-tRNA synthetase  70.27 
 
 		 556 aa  832    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0864702  normal  0.0642035 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1195  glutaminyl-tRNA synthetase  73.88 
 
 		 555 aa  889    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.068426  decreased coverage  0.0000265755 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1725  glutaminyl-tRNA synthetase  55.73 
 
 		 565 aa  639    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.153622  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2879  glutaminyl-tRNA synthetase  60.33 
 
 		 567 aa  684    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4167  glutaminyl-tRNA synthetase  57.53 
 
 		 568 aa  658    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1216  glutaminyl-tRNA synthetase  70.81 
 
 		 555 aa  826    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0492  glutaminyl-tRNA synthetase  63.67 
 
 		 553 aa  749    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0995744  normal  0.607402 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1845  glutaminyl-tRNA synthetase  55.6 
 
 		 559 aa  639    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0417  glutaminyl-tRNA synthetase  56.86 
 
 		 570 aa  659    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0907  glutaminyl-tRNA synthetase  54.75 
 
 		 573 aa  632  1e-180  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.47238  normal  0.116742 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>