More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_2413 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009801  EcE24377A_0706  glutaminyl-tRNA synthetase  72.1 
 
 		 554 aa  845    Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000238299  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1595  glutaminyl-tRNA synthetase  57.89 
 
 		 562 aa  647    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000811863  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00637  glutaminyl-tRNA synthetase  72.1 
 
 		 554 aa  845    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0702  glutaminyl-tRNA synthetase  72.1 
 
 		 554 aa  845    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.237561  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0326  glutaminyl-tRNA synthetase  72.1 
 
 		 555 aa  832    Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000088467  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2957  glutaminyl-tRNA synthetase  72.1 
 
 		 554 aa  845    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.690706  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0725  glutaminyl-tRNA synthetase  72.1 
 
 		 554 aa  845    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.769137  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3366  glutaminyl-tRNA synthetase  57.04 
 
 		 554 aa  651    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2904  glutaminyl-tRNA synthetase  62.98 
 
 		 567 aa  705    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.781654 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0917  glutaminyl-tRNA synthetase  58.08 
 
 		 580 aa  645    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000234027  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1229  glutaminyl-tRNA synthetase  71.2 
 
 		 554 aa  835    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0152842  normal  0.0951842 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2976  glutaminyl-tRNA synthetase  72.1 
 
 		 554 aa  845    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0733  glutaminyl-tRNA synthetase  72.64 
 
 		 555 aa  856    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3240  glutaminyl-tRNA synthetase  70.71 
 
 		 556 aa  835    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.00746606  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2689  glutaminyl-tRNA synthetase  84.14 
 
 		 556 aa  1010    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00133273  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1786  glutaminyl-tRNA synthetase  85.59 
 
 		 556 aa  1022    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3743  glutaminyl-tRNA synthetase  61.16 
 
 		 569 aa  693    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0260392  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3126  glutaminyl-tRNA synthetase  71.87 
 
 		 552 aa  845    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.0016183  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0841  glutaminyl-tRNA synthetase  72.64 
 
 		 555 aa  855    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01892  glutaminyl-tRNA synthetase  70.16 
 
 		 555 aa  817    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00449379  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23520  glutaminyl-tRNA synthetase  60.91 
 
 		 555 aa  687    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1533  glutaminyl-tRNA synthetase  84.3 
 
 		 556 aa  1006    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.208966  normal  0.486812 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1734  glutaminyl-tRNA synthetase  61.16 
 
 		 564 aa  691    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.112324  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2940  glutaminyl-tRNA synthetase  71.92 
 
 		 552 aa  846    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0919452  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1585  glutaminyl-tRNA synthetase  86.49 
 
 		 571 aa  1025    Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000343871  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2758  glutaminyl-tRNA synthetase  86.49 
 
 		 556 aa  1024    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.112039  normal  0.0252505 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0570  glutaminyl-tRNA synthetase  72.1 
 
 		 554 aa  844    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.011441  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1596  glutaminyl-tRNA synthetase  86.67 
 
 		 556 aa  1025    Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00615688  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3639  glutaminyl-tRNA synthetase  61.48 
 
 		 566 aa  692    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.193855 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2572  glutaminyl-tRNA synthetase  60.87 
 
 		 555 aa  692    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0923139  hitchhiker  0.00019462 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2516  glutaminyl-tRNA synthetase  84.84 
 
 		 556 aa  1006    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0318208  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0805  glutaminyl-tRNA synthetase  72.64 
 
 		 555 aa  856    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.112626  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0492  glutaminyl-tRNA synthetase  66.79 
 
 		 553 aa  793    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0995744  normal  0.607402 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1216  glutaminyl-tRNA synthetase  83.96 
 
 		 555 aa  1001    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0517  glutaminyl-tRNA synthetase  72.1 
 
 		 556 aa  848    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0626  glutaminyl-tRNA synthetase  59.27 
 
 		 568 aa  657    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.16998  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1482  glutaminyl-tRNA synthetase  86.31 
 
 		 556 aa  1025    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.348011  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0922  glutaminyl-tRNA synthetase  68.49 
 
 		 559 aa  814    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1205  glutaminyl-tRNA synthetase  72.78 
 
 		 552 aa  854    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00285651  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2879  glutaminyl-tRNA synthetase  63.16 
 
 		 567 aa  707    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3882  glutaminyl-tRNA synthetase  58.08 
 
 		 565 aa  665    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4167  glutaminyl-tRNA synthetase  56.26 
 
 		 568 aa  642    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1902  glutaminyl-tRNA synthetase  58.18 
 
 		 590 aa  661    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000991205  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3799  glutaminyl-tRNA synthetase  58.62 
 
 		 565 aa  668    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.105698  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2406  glutaminyl-tRNA synthetase  62.25 
 
 		 567 aa  703    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2413  glutaminyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 556 aa  1169    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000218793  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3121  glutaminyl-tRNA synthetase  84.48 
 
 		 556 aa  1009    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000496067 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0536  glutaminyl-tRNA synthetase  56.94 
 
 		 556 aa  653    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3509  glutaminyl-tRNA synthetase  60.36 
 
 		 561 aa  686    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.271227  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2052  glutaminyl-tRNA synthetase  57.91 
 
 		 576 aa  654    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.26884  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0094  glutaminyl-tRNA synthetase  62.16 
 
 		 556 aa  724    Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004127  glutaminyl-tRNA synthetase  72.46 
 
 		 556 aa  855    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000085379  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00628  hypothetical protein  72.1 
 
 		 554 aa  845    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1195  glutaminyl-tRNA synthetase  70.65 
 
 		 555 aa  836    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.068426  decreased coverage  0.0000265755 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2994  glutaminyl-tRNA synthetase  71.92 
 
 		 555 aa  830    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0745  glutaminyl-tRNA synthetase  72.64 
 
 		 555 aa  855    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.794095  normal  0.613987 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1845  glutaminyl-tRNA synthetase  57.82 
 
 		 559 aa  650    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2184  glutaminyl-tRNA synthetase  71.94 
 
 		 558 aa  848    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.213652  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0895  glutaminyl-tRNA synthetase  71.69 
 
 		 548 aa  840    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1619  glutaminyl-tRNA synthetase  86.13 
 
 		 556 aa  1021    Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00308456  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2503  glutaminyl-tRNA synthetase  85.77 
 
 		 556 aa  1025    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0137132  hitchhiker  0.0018216 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2571  glutaminyl-tRNA synthetase  85.77 
 
 		 556 aa  1026    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.838936  normal  0.0268819 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0792  glutaminyl-tRNA synthetase  72.64 
 
 		 555 aa  856    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.674612  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2615  glutaminyl-tRNA synthetase  88.49 
 
 		 556 aa  1055    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.620395  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2109  glutaminyl-tRNA synthetase  59.86 
 
 		 557 aa  676    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.831991  hitchhiker  0.000255722 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2907  glutaminyl-tRNA synthetase  72.1 
 
 		 555 aa  832    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.483628  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0832  glutaminyl-tRNA synthetase  72.05 
 
 		 552 aa  850    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.551071  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0189  glutaminyl-tRNA synthetase  57.07 
 
 		 561 aa  644    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.360973  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41380  glutaminyl-tRNA synthetase  60.71 
 
 		 556 aa  690    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.423392 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0773  glutaminyl-tRNA synthetase  72.1 
 
 		 554 aa  845    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0411639  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2787  glutaminyl-tRNA synthetase  62.79 
 
 		 567 aa  704    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01337  glutaminyl-tRNA synthetase  72.1 
 
 		 556 aa  850    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2669  glutaminyl-tRNA synthetase  85.59 
 
 		 556 aa  1024    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0864702  normal  0.0642035 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1116  glutaminyl-tRNA synthetase  73.37 
 
 		 552 aa  858    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1725  glutaminyl-tRNA synthetase  56.88 
 
 		 565 aa  650    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.153622  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3791  glutaminyl-tRNA synthetase  57.32 
 
 		 565 aa  626  1e-178  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2128  glutaminyl-tRNA synthetase  55.92 
 
 		 558 aa  627  1e-178  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.116661  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1485  glutaminyl-tRNA synthetase  55.54 
 
 		 569 aa  625  1e-178  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2459  glutaminyl-tRNA synthetase  55.86 
 
 		 589 aa  627  1e-178  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0058  glutaminyl-tRNA synthetase  55.39 
 
 		 553 aa  622  1e-177  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0833  glutaminyl-tRNA synthetase  54.48 
 
 		 609 aa  619  1e-176  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.227422  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0101  glutaminyl-tRNA synthetase  53.77 
 
 		 572 aa  618  1e-176  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0242  glutaminyl-tRNA synthetase  56.32 
 
 		 555 aa  619  1e-176  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4241  glutaminyl-tRNA synthetase  55.23 
 
 		 564 aa  619  1e-176  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1710  glutaminyl-tRNA synthetase  56.15 
 
 		 558 aa  620  1e-176  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0267  glutaminyl-tRNA synthetase  54.64 
 
 		 587 aa  619  1e-176  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1384  glutaminyl-tRNA synthetase  55.42 
 
 		 563 aa  619  1e-176  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.559394 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0626  glutaminyl-tRNA synthetase  55.86 
 
 		 552 aa  619  1e-176  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00799923  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0612  glutaminyl-tRNA synthetase  55.86 
 
 		 552 aa  620  1e-176  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000113459  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1596  glutaminyl-tRNA synthetase  55.35 
 
 		 557 aa  619  1e-176  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4882  glutaminyl-tRNA synthetase  54.79 
 
 		 540 aa  617  1e-175  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3251  glutaminyl-tRNA synthetase  54.76 
 
 		 560 aa  615  1e-175  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2083  glutaminyl-tRNA synthetase  55.74 
 
 		 565 aa  617  1e-175  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3516  glutaminyl-tRNA synthetase  55.05 
 
 		 564 aa  617  1e-175  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.953083  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1843  glutaminyl-tRNA synthetase  55.86 
 
 		 559 aa  612  9.999999999999999e-175  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.311784  normal  0.481089 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0417  glutaminyl-tRNA synthetase  53.9 
 
 		 570 aa  613  9.999999999999999e-175  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1655  glutaminyl-tRNA synthetase  55.12 
 
 		 569 aa  612  9.999999999999999e-175  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.434975  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0701  glutaminyl-tRNA synthetase  55.48 
 
 		 569 aa  612  9.999999999999999e-175  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1307  glutaminyl-tRNA synthetase  55.14 
 
 		 569 aa  614  9.999999999999999e-175  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.518903 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1633  glutaminyl-tRNA synthetase  55.48 
 
 		 569 aa  612  9.999999999999999e-175  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0234579  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>