More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeh_2599 on replicon NC_007760
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_1595  glutaminyl-tRNA synthetase  57.64 
 
 		 562 aa  636    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000811863  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3366  glutaminyl-tRNA synthetase  58.21 
 
 		 554 aa  662    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2904  glutaminyl-tRNA synthetase  56.34 
 
 		 567 aa  641    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.781654 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0681  glutaminyl-tRNA synthetase  44.26 
 
 		 748 aa  674    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.480313  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1300  glutaminyl-tRNA synthetase  45.83 
 
 		 794 aa  647    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.91877 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3743  glutaminyl-tRNA synthetase  56.36 
 
 		 569 aa  652    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0260392  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1734  glutaminyl-tRNA synthetase  56.55 
 
 		 564 aa  650    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.112324  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1755  glutaminyl-tRNA synthetase  45.73 
 
 		 802 aa  642    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4167  glutaminyl-tRNA synthetase  55.42 
 
 		 568 aa  636    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3799  glutaminyl-tRNA synthetase  55.07 
 
 		 565 aa  641    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.105698  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1263  glutaminyl-tRNA synthetase  75.13 
 
 		 781 aa  1164    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.578242  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3639  glutaminyl-tRNA synthetase  56.47 
 
 		 566 aa  649    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.193855 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0101  glutaminyl-tRNA synthetase  57.37 
 
 		 572 aa  657    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0189  glutaminyl-tRNA synthetase  54.76 
 
 		 561 aa  645    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.360973  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0536  glutaminyl-tRNA synthetase  56.14 
 
 		 556 aa  638    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0058  glutaminyl-tRNA synthetase  57.3 
 
 		 553 aa  654    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0626  glutaminyl-tRNA synthetase  57.84 
 
 		 568 aa  650    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.16998  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0917  glutaminyl-tRNA synthetase  57.43 
 
 		 580 aa  659    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000234027  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4500  glutaminyl-tRNA synthetase  58.68 
 
 		 563 aa  642    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.111687  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0267  glutaminyl-tRNA synthetase  56.65 
 
 		 587 aa  637    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2599  glutaminyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 778 aa  1543    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0790772  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1350  glutaminyl-tRNA synthetase  94.34 
 
 		 777 aa  1271    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0295693  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2811  glutaminyl-tRNA synthetase  58.87 
 
 		 561 aa  645    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.129668  normal  0.859959 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2787  glutaminyl-tRNA synthetase  56.34 
 
 		 567 aa  641    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1249  glutaminyl-tRNA synthetase  94.22 
 
 		 777 aa  1310    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2879  glutaminyl-tRNA synthetase  56.52 
 
 		 567 aa  646    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2406  glutaminyl-tRNA synthetase  56.34 
 
 		 567 aa  637    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0417  glutaminyl-tRNA synthetase  59.74 
 
 		 570 aa  654    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2459  glutaminyl-tRNA synthetase  56.47 
 
 		 589 aa  638    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2363  glutaminyl-tRNA synthetase  56.55 
 
 		 570 aa  638    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.621285 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3791  glutaminyl-tRNA synthetase  57.07 
 
 		 565 aa  639    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3882  glutaminyl-tRNA synthetase  54.98 
 
 		 565 aa  643    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3516  glutaminyl-tRNA synthetase  58.86 
 
 		 564 aa  659    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.953083  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1485  glutaminyl-tRNA synthetase  58.47 
 
 		 569 aa  657    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3486  glutaminyl-tRNA synthetase  57.5 
 
 		 565 aa  648    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.409047  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1843  glutaminyl-tRNA synthetase  57.82 
 
 		 559 aa  635  1e-180  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.311784  normal  0.481089 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2452  glutaminyl-tRNA synthetase  57.77 
 
 		 559 aa  631  1e-179  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.930191  normal  0.727818 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2841  glutaminyl-tRNA synthetase  57.59 
 
 		 561 aa  629  1e-179  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.602815 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4241  glutaminyl-tRNA synthetase  53.64 
 
 		 564 aa  632  1e-179  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1384  glutaminyl-tRNA synthetase  55.22 
 
 		 563 aa  629  1e-179  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.559394 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0850  glutaminyl-tRNA synthetase  55.73 
 
 		 565 aa  625  1e-178  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.750586 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3251  glutaminyl-tRNA synthetase  57.04 
 
 		 560 aa  627  1e-178  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0818  glutaminyl-tRNA synthetase  55.13 
 
 		 582 aa  625  1e-178  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0602034 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0242  glutaminyl-tRNA synthetase  54.05 
 
 		 555 aa  627  1e-178  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3509  glutaminyl-tRNA synthetase  56.86 
 
 		 561 aa  628  1e-178  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.271227  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1845  glutaminyl-tRNA synthetase  53.87 
 
 		 559 aa  625  1e-178  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2572  glutaminyl-tRNA synthetase  56.12 
 
 		 555 aa  625  1e-177  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0923139  hitchhiker  0.00019462 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2188  glutaminyl-tRNA synthetase  46 
 
 		 816 aa  622  1e-177  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00249648  normal  0.613425 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23520  glutaminyl-tRNA synthetase  56.5 
 
 		 555 aa  624  1e-177  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41380  glutaminyl-tRNA synthetase  56.31 
 
 		 556 aa  625  1e-177  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.423392 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0832  glutaminyl-tRNA synthetase  53.28 
 
 		 552 aa  619  1e-176  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.551071  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0833  glutaminyl-tRNA synthetase  55.15 
 
 		 609 aa  621  1e-176  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.227422  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2907  glutaminyl-tRNA synthetase  54.11 
 
 		 555 aa  618  1e-175  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.483628  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0517  glutaminyl-tRNA synthetase  54.95 
 
 		 556 aa  617  1e-175  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2083  glutaminyl-tRNA synthetase  55.66 
 
 		 565 aa  617  1e-175  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2994  glutaminyl-tRNA synthetase  54.11 
 
 		 555 aa  618  1e-175  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1710  glutaminyl-tRNA synthetase  57.89 
 
 		 558 aa  616  1e-175  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0326  glutaminyl-tRNA synthetase  54.11 
 
 		 555 aa  618  1e-175  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000088467  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2503  glutaminyl-tRNA synthetase  56.12 
 
 		 556 aa  617  1e-175  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00970277  normal  0.785784 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00637  glutaminyl-tRNA synthetase  53.24 
 
 		 554 aa  614  9.999999999999999e-175  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2957  glutaminyl-tRNA synthetase  53.24 
 
 		 554 aa  614  9.999999999999999e-175  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.690706  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0702  glutaminyl-tRNA synthetase  53.06 
 
 		 554 aa  613  9.999999999999999e-175  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.237561  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0706  glutaminyl-tRNA synthetase  53.24 
 
 		 554 aa  614  9.999999999999999e-175  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000238299  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0773  glutaminyl-tRNA synthetase  52.88 
 
 		 554 aa  613  9.999999999999999e-175  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0411639  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0421  glutaminyl-tRNA synthetase  55.04 
 
 		 559 aa  613  9.999999999999999e-175  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6655  glutaminyl-tRNA synthetase  57.25 
 
 		 583 aa  613  9.999999999999999e-175  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.204769  normal  0.445852 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2128  glutaminyl-tRNA synthetase  54.55 
 
 		 558 aa  612  9.999999999999999e-175  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.116661  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1195  glutaminyl-tRNA synthetase  52.88 
 
 		 555 aa  615  9.999999999999999e-175  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.068426  decreased coverage  0.0000265755 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2665  glutaminyl-tRNA synthetase  54.98 
 
 		 569 aa  612  9.999999999999999e-175  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0180309  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004127  glutaminyl-tRNA synthetase  54.59 
 
 		 556 aa  612  9.999999999999999e-175  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000085379  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2976  glutaminyl-tRNA synthetase  53.24 
 
 		 554 aa  614  9.999999999999999e-175  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0725  glutaminyl-tRNA synthetase  53.24 
 
 		 554 aa  614  9.999999999999999e-175  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.769137  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0612  glutaminyl-tRNA synthetase  53.21 
 
 		 552 aa  614  9.999999999999999e-175  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000113459  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0570  glutaminyl-tRNA synthetase  52.97 
 
 		 554 aa  615  9.999999999999999e-175  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.011441  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00628  hypothetical protein  53.24 
 
 		 554 aa  614  9.999999999999999e-175  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1419  glutaminyl-tRNA synthetase  54.63 
 
 		 569 aa  609  1e-173  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0892  glutaminyl-tRNA synthetase  54.63 
 
 		 569 aa  609  1e-173  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.522948  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0792  glutaminyl-tRNA synthetase  52.88 
 
 		 555 aa  610  1e-173  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.674612  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0733  glutaminyl-tRNA synthetase  52.88 
 
 		 555 aa  610  1e-173  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0737  glutaminyl-tRNA synthetase  54.69 
 
 		 576 aa  609  1e-173  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.705767 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1655  glutaminyl-tRNA synthetase  54.63 
 
 		 569 aa  610  1e-173  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.434975  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0701  glutaminyl-tRNA synthetase  54.63 
 
 		 569 aa  609  1e-173  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1812  glutaminyl-tRNA synthetase  54.63 
 
 		 596 aa  608  1e-173  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0624978  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0805  glutaminyl-tRNA synthetase  52.88 
 
 		 555 aa  610  1e-173  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.112626  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1633  glutaminyl-tRNA synthetase  54.63 
 
 		 569 aa  609  1e-173  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0234579  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0841  glutaminyl-tRNA synthetase  52.88 
 
 		 555 aa  609  1e-173  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0459  glutaminyl-tRNA synthetase  54.63 
 
 		 569 aa  609  1e-173  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.200352  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0626  glutaminyl-tRNA synthetase  53.04 
 
 		 552 aa  612  1e-173  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00799923  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0745  glutaminyl-tRNA synthetase  52.88 
 
 		 555 aa  610  1e-173  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.794095  normal  0.613987 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0791  glutaminyl-tRNA synthetase  54.16 
 
 		 580 aa  607  9.999999999999999e-173  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00535923  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0907  glutaminyl-tRNA synthetase  53.83 
 
 		 573 aa  606  9.999999999999999e-173  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.47238  normal  0.116742 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01337  glutaminyl-tRNA synthetase  53.51 
 
 		 556 aa  604  1.0000000000000001e-171  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1229  glutaminyl-tRNA synthetase  53.78 
 
 		 554 aa  605  1.0000000000000001e-171  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0152842  normal  0.0951842 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1307  glutaminyl-tRNA synthetase  54.09 
 
 		 569 aa  603  1.0000000000000001e-171  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.518903 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0807  glutaminyl-tRNA synthetase  54.34 
 
 		 576 aa  603  1.0000000000000001e-171  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1725  glutaminyl-tRNA synthetase  55.03 
 
 		 565 aa  604  1.0000000000000001e-171  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.153622  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1205  glutaminyl-tRNA synthetase  52.97 
 
 		 552 aa  599  1e-170  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00285651  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1116  glutaminyl-tRNA synthetase  51.99 
 
 		 552 aa  599  1e-170  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4882  glutaminyl-tRNA synthetase  53.35 
 
 		 540 aa  599  1e-170  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2828  glutaminyl-tRNA synthetase  54.27 
 
 		 569 aa  599  1e-170  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.531779  normal  0.0114243 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>